检索结果-内蒙古大学图书馆

分子植物育种 2017年第5期15卷 1655-1662页

作者：任逸秋贾会霞郭英华徐向东李建波卢孟柱樊军锋胡建军西北农林科技大学林学院杨凌712100 林木遗传育种国家重点实验室国家林业局林木培育重点实验室中国林业科学研究院林业研究所北京100091

F-box蛋白在泛素-蛋白酶体途径中能够特异识别底物蛋白,调节多种激素的信号转导途径,并响应多种非生物胁迫,参与植物抗逆途径。胡杨(Populus euphratica)是中国西北沙漠唯一能成林的高大乔木树种,对盐碱、干旱、极端温度等抵抗能力较强... 详细信息

F-box蛋白在泛素-蛋白酶体途径中能够特异识别底物蛋白,调节多种激素的信号转导途径,并响应多种非生物胁迫,参与植物抗逆途径。胡杨(Populus euphratica)是中国西北沙漠唯一能成林的高大乔木树种,对盐碱、干旱、极端温度等抵抗能力较强,是研究林木抗逆机理的候选模式树种。本研究对胡杨耐盐性状关联分析获得的F-box基因进行克隆、表达特性分析、亚细胞定位和转化胡杨原生质体的耐盐性测定,旨在研究胡杨F-box基因的功能特性。胡杨F-box基因全长1 086 bp,编码361个氨基酸,含有一个F-box domain和一个F-box associated domain。q RT-PCR表明胡杨F-box基因在各组织中均有表达,无组织特异性,其表达受盐、高温、低温、干旱和ABA胁迫诱导。PEG介导的胡杨原生质体瞬时表达发现F-box蛋白定位于细胞核上,流式细胞术证实过表达F-box基因能够提高胡杨原生质体的耐盐性。研究初步揭示了胡杨F-box基因的表达特性和耐盐性,为进一步解析胡杨F-box基因的功能及胡杨抗逆分子机理提供帮助。

关键词： F-box 亚细胞定位表达特性原生质体转化耐盐性

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基于MaxEnt生态软件划分澳洲坚果的潜在地理适生区

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林业科学研究 2017年第3期30卷 444-449页

作者：王伟田荣荣那立妍杨颖许新桥林木遗传育种国家重点实验室国家林业局林木培育重点实验室中国林业科学研究院林业研究所北京100091 北京城市学院生物医药学部北京100094 山东省食品药品检验研究院山东济南250101

[目的]对澳洲坚果在中国的潜在分布区进行预测,并对其适生区进行分析和划分。[方法]通过收集澳洲坚果的地理信息数据,利用最大熵模型(MaxEnt)与地理信息系统(ArcGIS),综合相关19项气候因子,预测划定澳洲坚果在世界以及我国的潜在地理分... 详细信息

[目的]对澳洲坚果在中国的潜在分布区进行预测,并对其适生区进行分析和划分。[方法]通过收集澳洲坚果的地理信息数据,利用最大熵模型(MaxEnt)与地理信息系统(ArcGIS),综合相关19项气候因子,预测划定澳洲坚果在世界以及我国的潜在地理分布区。[结果]该物种生长区域狭窄,对环境要求苛刻。世界范围内,澳洲坚果的较适宜生长区在澳洲东部、南美洲东南部和马达加斯加岛东部以及亚洲地区23°26'~30°N,73°~122°E范围内。在我国,澳洲坚果适宜分布区主要集中在西藏、台湾、广西、广东和云南等地,其高适宜区面积依次为西藏(15 359km^2),台湾(14 054 km^2),广西(7 372 km^2),广东(6 147 km^2)和云南(3 776 km^2)。刀切法(Jackknife)分析显示,澳洲坚果分布主要受到极端最高温、年均气温变化范围、最干月降雨量、温度季节性变化和等温性等气象因子的影响。[结论]本研究用MaxEnt模拟澳洲坚果的潜在地理分布有一定的准确性,划分出了澳洲坚果基本的地理分布格局和潜在分布区域,并阐明了主导其地理分布的生物气候因子,为澳洲坚果尤其是在我国的引种和推广应用提供了参考。

关键词：澳洲坚果潜在适生区 MaxEnt ArcGIS

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基于高通量测序的瑞香狼毒转录组数据分析

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中草药 2017年第22期48卷 4740-4747页

作者：杨艳芳刘洪伟邱德有中国林业科学研究院林业研究所林木遗传育种国家重点实验室国家林业局林木培育重点实验室北京100091 河北省科学院生物研究所河北省主要农作物病害微生物控制工程技术研究中心河北石家庄050081

目的获得瑞香狼毒Stellera chamaejasme转录组数据库代谢途径基因序列、SSR以及转座子等信息。方法以瑞香狼毒根作为受试材料,采用二代测序方法中的Illumina Hi Seq 2000进行转录组测序,并进行系统的生物信息学分析。结果共获得26 785 ... 详细信息

目的获得瑞香狼毒Stellera chamaejasme转录组数据库代谢途径基因序列、SSR以及转座子等信息。方法以瑞香狼毒根作为受试材料,采用二代测序方法中的Illumina Hi Seq 2000进行转录组测序,并进行系统的生物信息学分析。结果共获得26 785 872个Clean reads片段,拼接得到47 053条Unigenes,平均长度为419 nt。将拼装所得到的Unigene序列利用BLAST工具分别与Nr、Swiss-Prot、KEGG、COG和GO数据库进行比对,分别有11 138和24 744条Unigene在Nr和Swiss-Prot数据库中比对得到了注释信息,可归于36个GO分类,涉及119个KEGG标准代谢通路,进一步分析发现15条萜类生物合成途径的关键酶基因。利用MISA软件发现3 480个SSR,数量最高的SSR类型为单碱基重复,为1 986条,出现频率为57.07%,最少的是六碱基重复SSR,只有5条,出现频率仅为0.14%。利用Repeat Masker在线工具针对瑞香狼毒转录组序列进行转座子预测分析,结果共发现有1 497条转座子,其中E值<1×10-5的序列有827条,包含22种类型转座子,数目最多的为LINE/L1类型(405条),占比为48.97%,占比最少的为DNA/Ginger、DNA/h AT、DNA/PIF-ISL2EU和LINE/Jockey以及LTR/Lenti类型分别只有1条。结论对瑞香狼毒进行高通量测序,获得了大量基因序列信息以及SSR和转座子信息,为今后分离克隆瑞香狼毒中佛波酯等有效成分生物合成的关键酶基因以及开展相关分子机制研究提供了数据资源和理论基础。

关键词：瑞香狼毒转录组萜类佛波酯代谢通路

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小陇山林区引种黄檗人工林种群结构特征

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中南林业科技大学学报 2017年第6期37卷 75-82页

作者：胡勐鸿吕寻裴会明董菊兰王鹏王军辉林木遗传育种国家重点实验室中国林业科学研究院林业研究所北京100091 甘肃小陇山林业实验局林业科学研究所甘肃省栎类次生林生态系统重点实验室甘肃天水741020

对小陇山林区引种黄檗人工林种群结构特征进行了分析,结果显示:33年的黄檗人工林平均林层为2.8,上层分布株数占总体株数的80.3%;林分水平分布格局呈聚集分布,平均角尺度为0.531 4;混角度为0.242 5,处于零度和弱度混交的比例为79.34%;林... 详细信息

对小陇山林区引种黄檗人工林种群结构特征进行了分析,结果显示:33年的黄檗人工林平均林层为2.8,上层分布株数占总体株数的80.3%;林分水平分布格局呈聚集分布,平均角尺度为0.531 4;混角度为0.242 5,处于零度和弱度混交的比例为79.34%;林分出现了两极分化,平均大小比数为0.495 5,处于竞争优势和亚优势(40.72%)与竞争劣势和绝对劣势(40.42%)的比例基本相当;反映林分生长和经营空间大小的平均开敞度为0.18,生长空间严重不足;林分开始自然稀疏,枯死率9.57%。林下没有更新幼苗幼树,后备资源不足。应及时进行抚育间伐、采取人工促进天然更新措施,使引种黄檗人工林健康稳定生长。

关键词：黄檗引种种群结构特征

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滩地杨树人工林皆伐后蒸发散与产流变化

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林业科学研究 2017年第3期30卷 486-493页

作者：高升华汤玉喜唐洁唐学君田甜易洪波陈筑衢张旭东国家林业局林木培育重点实验室林木遗传育种国家重点实验室中国林业科学研究院林业研究所北京100091 湖南省林业科学院湖南长沙410004 国家林业局华东林业调查规划设计院浙江杭州310019 岳阳市君山区林业局湖南岳阳414000

[目的]揭示杨树人工林皆伐对滩地蒸发散和产流的影响。[方法]基于涡度相关系统对长江滩地杨树人工林皆伐前后水汽通量连续3年(2010―2012年)的观测数据,通过对比皆伐前、后气候条件相似的2个时段(1整年)的蒸发散,揭示皆伐后研究区蒸发... 详细信息

[目的]揭示杨树人工林皆伐对滩地蒸发散和产流的影响。[方法]基于涡度相关系统对长江滩地杨树人工林皆伐前后水汽通量连续3年(2010―2012年)的观测数据,通过对比皆伐前、后气候条件相似的2个时段(1整年)的蒸发散,揭示皆伐后研究区蒸发散的变化,并基于水量平衡反推研究区产流的变化。[结果]皆伐后土壤温度和水位上升,土壤表层含水量全年均值减小约0.03;研究区蒸发散皆伐前、后具有相似的日变化规律和季节动态特征,但皆伐后的全年蒸散量仅为皆伐前的66.3%;皆伐后研究区产流率(产流量/降雨量)从皆伐前的0.53上升至0.62;皆伐前、后7、8、12月的干旱指数(潜在蒸发散/降雨量)均大于1,其他时期均小于1。[结论]滩地杨树人工林皆伐后滩地蒸发散减少而产流率增加,加剧夏季干旱的可能性有所降低,但洪水爆发期间削减洪峰的能力也减弱。

关键词：杨树人工林长江滩地皆伐蒸发散涡度相关产流

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丹红杨×转BtCry1Ac欧洲黑杨杂交子代抗虫性及生长量测定

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分子植物育种 2017年第10期15卷 4101-4109页

作者：贾会霞孙佩李建波李喜林苏雪辉赵自成郑海宏卢孟柱胡建军中国林业科学研究院林业研究所林木遗传育种国家重点实验室国家林业局林木培育重点实验室北京100091 焦作市农林科学研究院焦作454000 九寨沟县环境保护和林业局四川623400

杨树是重要的速生丰产用材树种,其高产无性系人工林已经获得大规模营造。随着人工林集约化经营,舞毒蛾、杨尺蠖和天牛等高危森林害虫蔓延肆虐,造成巨大的经济和生态效益损失。因此,培育抗虫速生杨树已经成为亟待解决的问题。本研究以美... 详细信息

杨树是重要的速生丰产用材树种,其高产无性系人工林已经获得大规模营造。随着人工林集约化经营,舞毒蛾、杨尺蠖和天牛等高危森林害虫蔓延肆虐,造成巨大的经济和生态效益损失。因此,培育抗虫速生杨树已经成为亟待解决的问题。本研究以美洲黑杨速生良种丹红杨为母本、转Bt Cry1Ac基因欧洲黑杨为父本,利用人工控制授粉杂交手段获取的17株PCR检测呈阳性杂交子代为材料,进行舞毒蛾饲虫试验以及连续4年田间生长量测定。饲虫试验表明,相比于丹红杨和未转基因的欧洲黑杨,杂交子代的抗虫性明显提高,其中系号B3-8、B3-44、B3-45和B3-100的抗虫性最为显著,舞毒蛾死亡率高于90%。田间生长量测定显示,杂交子代系号B3-44、B3-102、B3-132和B3-153在树高和地径上表现出一定优势。研究证实了通过传统的杂交育种手段可将目的 Bt Cry1Ac基因导入优良品种中,并筛选出兼具抗虫和速生特性的杂交子代B3-44,为杨树生产应用以及种质创新提供理想的杨树资源。

关键词：杨树 BtCry1Ac基因抗虫性生长量

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皂荚EST-SSR分子标记开发与分析评价

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植物遗传资源学报 2017年第1期18卷 148-154页

作者：林富荣邢俊连孟艳琼黄平郑勇奇中国林业科学研究院林业研究所/国家林木遗传育种重点实验室/国家林业局植物新品种分子测试实验室/国家林业局林木培育重点实验室北京100091 安徽农业大学林学与园林学院合肥230036

本研究旨在开发皂荚EST-SSR分子标记,为今后皂荚种质资源评价与分析提供基础。首先通过对已公布的皂荚转录组数据进行拼接得到41003个Unigenes,总长度70.4 Mb,平均长度1716 bp,N50为2533 bp。进一步在7009个Unigenes中检测到8494个EST-... 详细信息

本研究旨在开发皂荚EST-SSR分子标记,为今后皂荚种质资源评价与分析提供基础。首先通过对已公布的皂荚转录组数据进行拼接得到41003个Unigenes,总长度70.4 Mb,平均长度1716 bp,N50为2533 bp。进一步在7009个Unigenes中检测到8494个EST-SSR位点,其中1200条Unigenes含有2个及以上的SSR位点,复合型SSRs有369个。针对所有EST-SSR位点设计得到6494条特异性引物,随机挑选60个位点进行试验验证与分析,其中44对引物可扩增出特异性片段,17对具有多态性,PIC值范围为0.195~0.742,均值为0.501,且大部分多态性位点位于UTR区域。通过对皂荚近缘种进行跨种PCR扩增试验,结果显示在开发的44对有效引物中,9个近缘种美国皂荚、日本皂荚、绒毛皂荚、滇皂荚、华南皂荚、小果皂荚、野皂荚、肥皂荚和美国肥皂荚分别有32、31、23、24、7、40、25、18和18对引物可获得有效扩增片段,说明EST-SSR标记在皂荚近缘种之间具有良好的通用性。研究表明利用转录组数据挖掘的EST-SSR位点具有扩增稳定、多态性良好、近缘种间通用等优点,是林木物种开发分子标记的有效途径之一。

关键词：皂荚转录组 EST-SSR 多态性通用性

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胡杨CBF基因家族的鉴定及表达特性分析

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分子植物育种 2017年第2期15卷 492-500页

作者：贾会霞李建波孙佩李开花胡建军卢孟柱南京林业大学南方现代林业协同创新中心南京210037 林木遗传育种国家重点实验室中国林业科学研究院林业研究所北京100091 新疆玛纳斯县林业局玛纳斯832200

CBF(C-repeat binding factor)基因家族是AP2转录因子家族的一类成员,在植物抵御低温胁迫与提高抗寒性中发挥着重要作用。为探究胡杨CBF基因家族的特性,本研究在胡杨基因组水平上共搜索到8个PeuCBFs成员,分布于6条scaffolds上,其中PeuC... 详细信息

CBF(C-repeat binding factor)基因家族是AP2转录因子家族的一类成员,在植物抵御低温胁迫与提高抗寒性中发挥着重要作用。为探究胡杨CBF基因家族的特性,本研究在胡杨基因组水平上共搜索到8个PeuCBFs成员,分布于6条scaffolds上,其中PeuCBF1和PeuCBF5的氨基酸和编码序列相同。对PeuCBFs在胡杨8个组织和5种非生物胁迫下的表达特性进行分析,发现PeuCBFs主要在幼叶或雌雄花序中表达;PeuCBFs的表达受低温胁迫的显著诱导,同时受盐、干旱和ABA胁迫诱导,但是受高温胁迫抑制。研究结果概括了胡杨CBF基因家族的基本特性,为进一步解析PeuCBFs的功能提供了参考。

关键词：胡杨 CBF 基因家族系统进化分析基因表达

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不同生长势美洲黑杨转录组差异分析

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林业科学 2016年第3期52卷 47-58页

作者：丁昌俊张伟溪高暝黄秦军褚延广苏晓华林木遗传育种国家重点实验室国家林业局林木培育重点实验室中国林业科学研究院林业研究所北京100091 中国林业科学研究院亚热带林业研究所富阳311400

【目的】研究美洲黑杨杂种F1的基因表达模式,从基因表达水平揭示杂种优势形成机制,为杨树杂种优势的深度开发利用提供有益参考。【方法】采用Illumina HiSeq 2000高通量测序技术对不同生长势美洲黑杨杂种F1(3个生长势超过双亲、2个生长... 详细信息

【目的】研究美洲黑杨杂种F1的基因表达模式,从基因表达水平揭示杂种优势形成机制,为杨树杂种优势的深度开发利用提供有益参考。【方法】采用Illumina HiSeq 2000高通量测序技术对不同生长势美洲黑杨杂种F1(3个生长势超过双亲、2个生长势低于亲本)及其亲本进行转录组测序和差异比较。【结果】转录组测序共产生171 154 127条Reads(平均长度200 bp,约31.32 Gb),将处理后Reads与毛果杨参考基因组数据库比对,有61.89%的Reads可以与参考基因组匹配。超亲杂种F1 Vs亲本中筛选出342个基因显著差异表达(上调表达87个,下调表达255个);低亲杂种F1 Vs亲本共筛选出577个基因差异表达(上调表达146个,下调表达431个);超亲杂种F1 Vs低亲杂种F1中共筛选出486个基因显著差异表达(上调表达200个,下调表达286个)。筛选出377个对杂种优势产生具有重要作用的差异表达基因,其中,有4个差异基因在超亲F1 Vs亲本、低亲F1 Vs亲本及超亲F1 Vs低亲F1中为下调表达;72个下调表达差异基因在超亲F1 Vs亲本及低亲F1 Vs亲本2个对比组中均显著差异表达;有129个差异基因仅在超亲F1 Vs亲本及超亲F1 Vs低亲F1 2个对比组中显著表达,包括19个差异基因显著上调表达,110个差异基因显著下调表达;有172个基因仅在低亲F1 Vs亲本及超亲F1 Vs低亲F1中显著差异表达。功能注释及代谢途径分析结果表明,超亲F1 Vs亲本、超亲F1 Vs低亲及低亲F1 Vs亲本3个对比组中分别有167个、233个及280个差异显著基因能被功能注释,分别涉及46个、45个及51个生物学功能,在分子功能、生物学过程、细胞组分3种GO分类中,其中差异基因主要富集在"催化活性"、"胺的代谢过程"及"氧化还原酶活性"等功能中,参与碳水化合物代谢、氨基酸代谢、能量代谢途径及外来物质的降解和代谢途径。【结论】杂种优势的形成,可能是由于相关基因的显著差异表达,调控光合作用、物质代谢吸收等与生长紧密联系的代谢活动,进而促进生长优势的产生。

关键词：美洲黑杨转录组差异表达杂种优势

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甘菊DlNAC1转录因子基因提高烟草耐高温能力

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植物研究 2017年第3期37卷 432-439页

作者：朱凯武剑杨艳芳陈发棣喻德跃南京农业大学大豆研究所国家大豆改良中心作物遗传与种质创新国家重点实验室南京210095 中国林业科学研究院林业研究所林木遗传育种国家重点实验室国家林业局林木培育重点实验室北京100091 南京农业大学园艺学院观赏园艺系南京210095

研究针对从甘菊中克隆获得的DlNAC1基因(Gen Bank登录号为EF602305)进行生物信息学分析,并利用根癌农杆菌介导的叶盘转化法将该基因在烟草中进行过表达研究。结果发现DlAC1蛋白具有较高亲水性,二级结构中占比最高的为无规则卷曲,并具有... 详细信息

研究针对从甘菊中克隆获得的DlNAC1基因(Gen Bank登录号为EF602305)进行生物信息学分析,并利用根癌农杆菌介导的叶盘转化法将该基因在烟草中进行过表达研究。结果发现DlAC1蛋白具有较高亲水性,二级结构中占比最高的为无规则卷曲,并具有N糖基化位点等6类潜在的模体结构和典型的由一个扭曲的反平行β片层和α螺旋组成的NAC结构域。将DlAC1基因在烟草中过表达后,通过PCR方法从55株转化植株中鉴定出36株为阳性植株,并且转基因烟草T_0代植株在45℃高温胁迫后,转35S:DlAC1基因阳性植株生长状况良好,而对照植株发生萎蔫,并且转基因植株叶片含水量显著高于对照植株。然而,在4℃低温胁迫后,发现转基因烟草T1代植株没有提高耐低温能力。甘菊DlAC1基因能够提高烟草植株耐高温能力,为今后菊花抗逆育种提供了科学依据。

关键词：菊花 NAC转录因子生物信息学高温胁迫转基因烟草

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