检索结果-内蒙古大学图书馆

南京林业大学学报(自然科学版) 2022年第5期46卷 185-191页

作者：王玉宸王欣玉彭龙袁志林林木遗传育种国家重点实验室中国林业科学研究院南京林业大学林学院中国林业科学研究院亚热带林业研究所

【目的】笔者前期从栎树外生菌根根尖组织中分离得1株真菌：荷伯生氏斜盖伞(Clitopilus hobsonii),发现其对苗木具有促生效应。研究旨在获得该菌的同核体菌株，为荷伯生氏斜盖伞高质量基因组数据的获得及其对植物的促生作用机制研究奠... 详细信息

【目的】笔者前期从栎树外生菌根根尖组织中分离得1株真菌：荷伯生氏斜盖伞(Clitopilus hobsonii),发现其对苗木具有促生效应。研究旨在获得该菌的同核体菌株，为荷伯生氏斜盖伞高质量基因组数据的获得及其对植物的促生作用机制研究奠定基础。【方法】通过原生质体再生技术得到候选菌株，基于候选菌株与出发菌株的生长性状及菌落形态特征比较、RNA聚合酶Ⅱ基因(RNA polymeraseⅡgene,rpb2)和翻译延伸因子基因(translation elongation factor 1-α gene,tef)两个单拷贝保守基因片段的杂合性分析，以及DAPI(4′,6-二脒基-2-苯基吲哚)细胞核荧光染色观察，确定获得的再生菌株为同核体。【结果】经分离培养发现：其中一类再生菌株与出发菌株的菌落形态特性相比差异明显，且该再生菌株生长速度较慢；镜检结果表明，再生菌株与出发菌株均不存在锁状联合结构；DAPI细胞核荧光染色结果表明出发菌株菌丝细胞中均含有两个细胞核，而再生菌株初生菌丝中可观察到仅含1个细胞核的细胞结构，后期则发生双核化；rpb2和tef片段序列比对结果进一步表明出发菌株存在多个杂合位点，而在再生菌株中则未发现。【结论】本研究制备的再生菌株为荷伯生氏斜盖伞同核体菌株，具有单一、稳定的遗传信息，可为异核体真菌基因组数据的获得提供材料基础。

关键词：担子菌原生质体同核体杂合度斜盖伞属

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PEG和NaCl胁迫下毛竹萌发种子中环状RNA特征及其表达研究

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南京林业大学学报(自然科学版) 2023年第6期47卷 17-24页

作者：王晓静王涛杨凯李潞滨中国林业科学研究院林业研究所林木遗传育种国家重点实验室国家林业和草原局林木培育重点实验室运城学院北京植物园北京市花卉园艺工程技术研究中心/城乡生态环境北京实验室北京农学院植物科学与技术学院

【目的】环状RNA（circRNAs）是一类由转录本反向可变剪接产生的内源非编码RNA,在植物生长发育过程中具有重要作用。通过鉴定毛竹（Phyllostachys edulis）萌发期种子中的circRNAs,探究其在干旱和盐胁迫条件下的表达，为深入开展非生物... 详细信息

【目的】环状RNA（circRNAs）是一类由转录本反向可变剪接产生的内源非编码RNA,在植物生长发育过程中具有重要作用。通过鉴定毛竹（Phyllostachys edulis）萌发期种子中的circRNAs,探究其在干旱和盐胁迫条件下的表达，为深入开展非生物胁迫条件下竹类植物种子萌发的分子调控机制提供基础。【方法】分别使用聚乙二醇（PEG）和NaCl模拟干旱和盐胁迫，构建H2O、10%（质量分数，下同）PEG、15%PEG、50 mmol/L NaCl和100 mmol/L NaCl处理下毛竹种皮破裂阶段种子的链特异性文库，通过高通量测序和生物信息学分析揭示样本中的circRNAs及其表达谱。【结果】所有样本中共鉴定了1 446个circRNAs, 76.34%的circRNAs来源于外显子区；不同处理下毛竹萌发种子中表达量最高的circRNA分别为plant＿circ＿0001703、plant＿circ＿0001728、plant＿circ＿0000358、plant＿circ＿0001236和plant＿circ＿0001728;与对照相比，524、505、467和474个circRNAs在4个胁迫处理下萌发的种子中显著差异表达；差异表达circRNAs的源基因显著富集在不同的GO条目和KEGG途径中。【结论】1 446个circRNAs能够在毛竹萌发期种子中表达，其中有1 056个circRNAs在种子萌发阶段响应了PEG或NaCl胁迫；作用于酸酐的水解酶活性和鞘脂代谢途径的基因可能对circRNAs调控PEG或NaCl胁迫下的毛竹种子萌发有重要意义。

关键词：毛竹种子萌发聚乙二醇(PEG) NaCl circRNAs

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林木重要性状形成的分子基础研究进展

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中国农业科技导报 2022年第12期24卷 48-58页

作者：张守攻中国林业科学研究院林业研究所林木遗传育种国家重点实验室林木培育国家林业和草原局重点实验室北京100091

林业是国民经济的重要产业之一,深入研究以人类需求为目的的林木重要性状,解析其形成的分子基础,是建立高效育种技术体系的基本保障,对培育满足国家重大需求的突破性良种,保障我国林业可持续发展,服务国家木材安全、粮食安全、生态安全... 详细信息

林业是国民经济的重要产业之一,深入研究以人类需求为目的的林木重要性状,解析其形成的分子基础,是建立高效育种技术体系的基本保障,对培育满足国家重大需求的突破性良种,保障我国林业可持续发展,服务国家木材安全、粮食安全、生态安全和乡村振兴等重大战略具有重要意义。随着生物技术的快速发展,针对林木性状形成的分子基础研究也更加深入。综述了国内外林木性状形成的分子基础,聚焦木材形成、林木经济性状和林木抗逆性的形成与调控机制,对当前的研究进展进行了梳理,并对未来林木性状研究趋势与技术发展进行了展望。

关键词：林木性状形成分子基础研究进展

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林木新种质创制研究进展

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中国农业科技导报 2022年第12期24卷 129-141页

作者：王军辉中国林业科学研究院林业研究所林木遗传育种国家重点实验室林木培育国家林业和草原局重点实验室北京100091

林以种为本,种以质为先。林木种质创新是林木种业振兴的基础,是保障国家木材安全、粮油安全和生态安全的坚实根基。随着仪器设备的更新换代和多组学、智能与信息等技术的发展及相关理论水平的提升,我国林木种质的研究由传统的经验性收... 详细信息

林以种为本,种以质为先。林木种质创新是林木种业振兴的基础,是保障国家木材安全、粮油安全和生态安全的坚实根基。随着仪器设备的更新换代和多组学、智能与信息等技术的发展及相关理论水平的提升,我国林木种质的研究由传统的经验性收集和粗放式评价,向现代、定向、高效的新种质创制及规模化、精准化及系统化评价和挖掘转变。从林木新种质的创制现状、核心关键技术、规模化繁育和未来发展方向4个方面综述我国林木新种质创制进展,并提出传统杂交育种与现代生物技术相结合,加快开发林木表型和基因型高通量精准评价、全基因组选择、基因组精准操作、合成生物学和细胞工厂等种质创制及繁育新技术,支撑优质种质创制和突破性新品种培育。

关键词：林木新种质创制进展

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毛果杨CNGC家族全基因组鉴定及胁迫响应分析

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植物研究 2022年第4期42卷 613-625页

作者：王雪莹王瑞琪张洋刘聪夏德安魏志刚林木遗传育种国家重点实验室东北林业大学哈尔滨150040 国家林业与草原局盐碱地研究中心中国林业科学研究院北京100091

植物环核苷酸门控离子通道(cyclic nucleotide-gated channels,CNGC)家族具有多种生物学功能,尤其是在植物的生长发育及逆境胁迫响应中发挥着重要的作用。本研究通过生物信息学方法及qRT-PCR对PtrCNGC家族成员蛋白的基本理化性质与结构... 详细信息

植物环核苷酸门控离子通道(cyclic nucleotide-gated channels,CNGC)家族具有多种生物学功能,尤其是在植物的生长发育及逆境胁迫响应中发挥着重要的作用。本研究通过生物信息学方法及qRT-PCR对PtrCNGC家族成员蛋白的基本理化性质与结构特征、系统发育、基因结构和保守基序、启动子顺式作用元件,以及基因表达模式进行分析。结果表明:在毛果杨(Populus trichocarpa)全基因组中共鉴定出19个PtrCNGC基因,PtrCNGC家族成员可分为4个亚群(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ亚群),其中第Ⅳ亚群分为2个亚组(Ⅳa组和Ⅳb组)。PtrCNGC基因编码的蛋白均为碱性蛋白,此外,该家族仅有1个成员为疏水性蛋白,其余成员全部为亲水性蛋白。19个PtrCNGC不均匀地分布于毛果杨的11条染色体上,剩余8条染色体上没有成员分布。PtrCNGC家族包含7对同源基因且它们之间的Ka/Ks值均远小于1。PtrCNGC家族各亚群成员之间的基因结构、蛋白保守基序分布差异较小。启动子顺式作用元件预测分析发现,PtrCNGC基因序列启动子区域存在响应多种激素以及逆境胁迫相关的作用元件。qRT-PCR结果表明,PtrCNGC家族在不同组织中的表达具有特异性,在茎中的表达量较高,在根和叶中的表达量较低;在盐胁迫和干旱胁迫下,PtrCNGC家族同一分支上的多数成员表现出相似的表达模式。本研究结果为进一步研究毛果杨CNGC家族在非生物胁迫中的功能提供参考。

关键词：毛果杨 CNGC家族生物信息学分析逆境胁迫

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巨桉EgrWAT1基因克隆和功能初步分析

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植物研究 2023年第4期43卷 601-611页

作者：张昊楠陈珊珊徐建民罗萍王晓萍许志茹范春节东北林业大学生命科学学院哈尔滨150040 国家林业和草原局热带林木培育重点实验室中国林业科学研究院热带林业研究所广州510520 林木遗传育种国家重点实验室东北林业大学/中国林业科学研究院哈尔滨/北京150040/100091

为探究WALLS ARE THIN(WAT1)在木本植物中木材形成以及响应胁迫中的作用,利用生物信息学工具进行分析,并以巨桉(Eucalyptus grandis)为材料克隆EgrWAT1S及其另一转录本EgrWAT1L,通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)探究其在不同组织、节间以... 详细信息

为探究WALLS ARE THIN(WAT1)在木本植物中木材形成以及响应胁迫中的作用,利用生物信息学工具进行分析,并以巨桉(Eucalyptus grandis)为材料克隆EgrWAT1S及其另一转录本EgrWAT1L,通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)探究其在不同组织、节间以及响应胁迫时的表达模式。结果表明:EgrWAT1S在韧皮部表达量较高,而EgrWAT1L主要表达在根部。在茉莉酸甲酯(MeJA)、水杨酸(SA)处理和盐胁迫以及缺磷、缺硼处理时,其表达存在着明显不同的模式,在MeJA、SA处理时甚至存在着相反的表达模式。这些结果表明EgrWAT1L基因可能通过转录调控来影响EgrWAT1S表达和进一步的蛋白翻译来响应激素和胁迫处理。为进一步研究WAT1基因在巨桉生长发育过程中的作用和调控方式提供基础,也为将来桉树的分子育种提供可能。

关键词：巨桉 WAT1 可变剪切基因克隆表达模式

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板栗坚果营养物质和抗氧化成分综合评价

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林业科学研究 2022年第6期35卷 12-22页

作者：武妍妍史文石石新如陈荣荣赵悦赵佳冰江泽平王志伟史胜青中国林业科学研究院林业研究所国家林业和草原局林木培育重点实验室林木遗传育种国家重点实验室北京100091 中国林业科学研究院成果转化与产业开发处北京100091 中国林业科学研究院森林生态环境与自然保护研究所林木遗传育种国家重点实验室北京100091 河北省秦皇岛市青龙满族自治县娄杖子镇小鹿沟村河北秦皇岛066508

[目的]探讨抗氧化酶作为种质评价指标的可行性,完善板栗优良种质资源评价体系。[方法]在河北省燕山地区收集18份板栗(Castanea mollissima)种质,测定外观特征、营养物质及抗氧化成分(4种酶指标:超氧化物歧化酶(SOD)、多酚氧化酶(PPO)、... 详细信息

[目的]探讨抗氧化酶作为种质评价指标的可行性,完善板栗优良种质资源评价体系。[方法]在河北省燕山地区收集18份板栗(Castanea mollissima)种质,测定外观特征、营养物质及抗氧化成分(4种酶指标:超氧化物歧化酶(SOD)、多酚氧化酶(PPO)、过氧化物酶(POD)、过氧化氢酶(CAT)和3种非酶指标:总多酚、总黄酮和维生素C),并在有或无抗氧化酶时进行基于隶属函数-因子分析相结合的综合评价,筛选优良种质资源。[结果]18份板栗种质单果鲜质量TPZ的最大(12.51 g),QTC的最小(7.88 g),平均为9.65 g;含水量TPZ的最高(51.59%),LJT的最低(45.95%),平均为48.85%;淀粉含量LJT的最高(53.69%),JCY-1最低(38.28%),平均为46.81%;可溶性糖含量ZQ1的最高(11.62%),YHZ的最低(4.51%),平均为7.96%;SOD活性TPZ的最高(1310.42 U·g^(−1)),ZQ1的最低(717.40 U·g^(−1)),平均为1012.37 U·g^(−1);POD活性JIH的最高(5965.33 U·g^(−1)),JCY-3的最低(3009.33 U·g^(−1)),平均为4168.67 U·g^(−1)。[结论]根据有或无4种抗氧化酶,现有4份栽培品种综合得分排名都是:QX107>QL3113>QX3113>HHZ20。除3个良种外,ZJ2和ZQ1可作为候选优良种质深入挖掘;抗氧化指标SOD、POD、CAT和PPO可考虑作为板栗种质评价的指标。

关键词：板栗营养物质抗氧化酶因子分析综合评价

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基于表型性状和SSR标记的樟子松核心种质构建

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中南林业科技大学学报 2024年

作者：尹明宇吴波乌云塔娜庞营军张学利中国林业科学研究院生态保护与修复研究所荒漠生态系统与全球变化国家林业和草原局重点实验室中国林业科学研究院经济林研究所林木遗传育种国家重点实验室辽宁省沙地治理与利用研究所辽宁章古台科尔沁沙地生态系统国家定位观测研究站

【目的】基于表型性状和SSR标记构建樟子松核心种质，为樟子松种质资源有效管理和利用奠定基础。【方法】以科尔沁沙地31年生517份樟子松种质为材料，探究其表型性状（胸径、树高、枝下高、冠幅、单株材积、冠形、干形和分枝）变异规律... 详细信息

【目的】基于表型性状和SSR标记构建樟子松核心种质，为樟子松种质资源有效管理和利用奠定基础。【方法】以科尔沁沙地31年生517份樟子松种质为材料，探究其表型性状（胸径、树高、枝下高、冠幅、单株材积、冠形、干形和分枝）变异规律，应用12对SSR引物分析其遗传多样性。结合表型和SSR数据，依据等位基因数目最大化策略与表型极值和稀有等位基因优先原则构建核心种质。通过表型变异和遗传多样性相关参数差异检验以及主坐标分析评价核心种质的代表性和有效性。【结果】樟子松种质资源具有丰富的表型变异和遗传多样性，各性状变异系数为13.01%～48.21%，表型多样性指数（H′）为0.913～2.064;12个SSR位点共检测到97个等位基因（Na），各位点有效等位基因数（Ne）、Shannon-Wiener多样性指数（I）、观测杂合度（H_o）、期望杂合度（He）和多态性信息含量（PIC）的平均值分别为3.324、1.189、0.511、0.556和0.512。以8.90%的取样比例得到46份核心种质，其均值差异百分率（MD）、方差差异百分率（VD）、极差符合率（CR）和变异系数变化率（VR）分别为1.42%、46.33%、100.00%、135.34%；核心种质的H′、Ne、I、He和PIC均显著高于原有种质且在原有种质中呈均匀分布。应用11个SSR位点构建了46份核心种质的唯一性DNA指纹图谱。【结论】构建的46份樟子松核心种质，能够有效代表樟子松种质资源的表型变异和遗传多样性。

关键词：樟子松核心种质表型 SSR标记 DNA指纹图谱

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不同树龄侧柏古树扦插生根过程中的生理响应

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植物研究 2023年第4期43卷 582-590页

作者：常二梅董遥刘建锋贾子瑞李香赵秀莲郭伟林木遗传育种国家重点实验室国家林业和草原局林木培育重点实验室中国林业科学研究院林业研究所北京100091 中国林业科学研究院森林生态环境与自然保护研究所国家林业和草原局森林生态环境重点实验室北京100091 北京市绿地养护管理事务中心北京102211 泰安市泰山林业科学研究院泰安271000

为探讨树龄对侧柏(Platycladus orientalis)古树扦插生根的影响及扦插过程中的生理机制,从树龄分别为5、100、300、700天的侧柏母树上取插穗进行扦插繁殖,以4个不同生根阶段(0 d(S1,扦插前)、35 d(S2,愈伤组织形成期)、65 d(S3,不定根... 详细信息

为探讨树龄对侧柏(Platycladus orientalis)古树扦插生根的影响及扦插过程中的生理机制,从树龄分别为5、100、300、700天的侧柏母树上取插穗进行扦插繁殖,以4个不同生根阶段(0 d(S1,扦插前)、35 d(S2,愈伤组织形成期)、65 d(S3,不定根形成期)、95 d(S4,不定根伸长期))插穗基部的韧皮部为材料,测定生理指标含量的动态变化,并统计生根率和生根数量。结果表明:取自侧柏古树插穗与幼树插穗相比,生根率显著降低、生根数量显著减少(P<0.05)。取自5年侧柏的插穗的营养物质(总糖、总蛋白)含量、抗氧化酶(酚氧化酶(PPO)、过氧化物酶(POD)、超氧化物歧化酶(SOD))活性、激素[内源吲哚乙酸(IAA)、玉米素核苷(ZR)]含量在4个扦插生根阶段显著高于侧柏古树(P<0.05),说明这些物质含量高有利于插穗生根。丙二醛(MDA)、脱落酸(ABA)、赤霉素(GA)含量随侧柏树龄的增长呈现显著增长的趋势(P<0.05),说明侧柏古树插穗的有害物质和抑制生根的激素含量较多。营养物质(总糖、总蛋白)、激素(IAA、GA)含量在4个生根阶段中呈现先增高后降低的趋势,在S3时最高(P<0.05)。相反,ABA含量在S3时显著低于其他3个阶段(P<0.05),说明不定根形成阶段(S3)是扦插过程中的关键阶段,ω(IAA)/ω(ABA)、ω(ZR)/ω(ABA)比值越大,越有利于不定根形成。树龄显著影响侧柏扦插生根率,但是,不同年龄的侧柏古树的扦插生根率差异不显著。而有利于扦插生根的营养物质(总糖、总蛋白)、抗氧化酶(PPO、POD、SOD)活性、激素(IAA、ZR)含量少是侧柏古树生根难的原因。

关键词：侧柏古树扦插生理生化生根

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日本落叶松木质部发育相关基因筛选及其共表达网络构建

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林业科学 2021年第1期57卷 40-52页

作者：李慧代新仁周再知李全梓中国林业科学研究院林木遗传育种国家重点实验室北京100091 中国林业科学研究院热带林业研究所广州510520

【目的】鉴定日本落叶松木质部发育相关基因,构建核心基因与木质部发育相关基因的共表达网络,为后期开展日本落叶松木材形成相关研究提供参考。【方法】对日本落叶松木质部、韧皮部和针叶3个组织进行二代和三代转录组测序,利用R软件的DE... 详细信息

【目的】鉴定日本落叶松木质部发育相关基因,构建核心基因与木质部发育相关基因的共表达网络,为后期开展日本落叶松木材形成相关研究提供参考。【方法】对日本落叶松木质部、韧皮部和针叶3个组织进行二代和三代转录组测序,利用R软件的DEseq2包筛选木质部相对韧皮部和木质部相对针叶的差异表达基因,通过整合2组差异基因获得木质部特异表达基因,借助GO、KEGG及BLASTN等生物信息学分析手段探索基因功能,利用WGCNA分析构建木质部特异表达基因共表达网络。【结果】共获得2596个木质部特异的高表达和低表达基因;GO分析结果显示这些基因在代谢过程、细胞过程、定位膜、细胞、细胞组件、催化活性、位点结合和转运活性等分类中显著富集;KEGG分析结果显示这些基因在淀粉和蔗糖代谢、类黄酮生物合成和代谢途径通路中显著富集,在苯丙烷代谢途径及淀粉和蔗糖代谢途径中分别富集到38个和196个基因;鉴定出木材形成相关基因,包括木质素合成相关基因PAL4、CCR1、C4H、HCT、COMT1、PER12、PER52、CYP98A3、LAC12和LAC17等,纤维素和半纤维素合成相关基因DEC、CEL1、Csl、CTL2和SPS3等;2596个木质部特异的高表达和低表达基因经WGCNA分析后筛选出与木质部发育相关基因关联度较高的17个核心基因。【结论】筛选的日本落叶松木质部发育相关基因参与半乳甘露聚糖合成、木葡聚糖合成、纤维素微纤丝形成、细胞壁纤维素合成、次生细胞壁形成过程、纤维伸长过程、调控合成木质素的碳代谢流、木质素生物合成及降解、木质素单体聚合、木质素单体甲基化和细胞程序化死亡等木材形成相关生物学过程;在共表达网络中筛选出的17个核心基因可作为今后研究的重点来探索其在木材形成过程中的具体功能。

关键词：日本落叶松木质部差异表达基因 GO KEGG 核心基因

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