检索结果-内蒙古大学图书馆

植物遗传资源学报 2021年第2期22卷 293-303页

作者：张磊曹德美胡建军林木遗传育种国家重点实验室/国家林业和草原局林木培育重点实验室/中国林业科学研究院林业研究所北京100091

彩叶植物具有色彩鲜艳、观赏期长等特点,有助于提高城市绿化的观赏性。叶绿素、类胡萝卜素和花青素等天然色素的含量变化使叶片产生绿色、黄色、白色和紫红色等颜色,3种色素在光反应、响应生物和非生物胁迫中发挥重要作用。本文对影响... 详细信息

彩叶植物具有色彩鲜艳、观赏期长等特点,有助于提高城市绿化的观赏性。叶绿素、类胡萝卜素和花青素等天然色素的含量变化使叶片产生绿色、黄色、白色和紫红色等颜色,3种色素在光反应、响应生物和非生物胁迫中发挥重要作用。本文对影响叶绿素、类胡萝卜素和花青素生物合成途径遗传调控和外部环境因子综述,为解释叶片呈色机制提供理论基础。现有研究表明,光(光周期、光照强度及光质)、温度、干旱和盐等环境因子及激素变化均会刺激HY5、PIFs、DELLA等转录因子和结构基因转录,同时甲基化、乙酰化等染色质修饰和miRNAs、lncRNAs等转录后表观遗传修饰也会直接或间接调控3种色素生物合成途径基因的表达。虽然目前3种色素生物合成途径已较清晰,但有关彩叶林木3种色素代谢与环境信号、体内激素的具体调控模式仍有待进一步研究。未来可构建彩叶植物杂交群体和种质资源库,并利用基因组、转录组、蛋白组、代谢组和表型组等多组学技术为创制彩叶新种质提供可能。

关键词：叶色形成叶绿素类胡萝卜素花青素转录调控

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刀状黑黄檀基因组特征与种群遗传变异分析

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林业科学研究 2022年第4期35卷 44-53页

作者：刘宇郑勇奇李长红林富荣黄平林木遗传育种国家重点实验室中国林业科学研究院林业研究所国家林业和草原局森林培育重点实验室北京100091 温州市资源植物创新利用重点实验室浙江省农业科学院浙江省亚热带作物研究所浙江温州325005

[目的]本研究旨在分析刀状黑黄檀基因组基本特征,发掘一套多态性好、重现性高的基因组SSR分子标记并用于评估其野生种群遗传变异程度。[方法]利用二代测序(NGS)方法初步评估刀状黑黄檀基因组大小、杂合度和重复序列;利用MISA对基因组上... 详细信息

[目的]本研究旨在分析刀状黑黄檀基因组基本特征,发掘一套多态性好、重现性高的基因组SSR分子标记并用于评估其野生种群遗传变异程度。[方法]利用二代测序(NGS)方法初步评估刀状黑黄檀基因组大小、杂合度和重复序列;利用MISA对基因组上潜在的SSR位点进行检索,解析SSR类型与特征;利用Primer Premier v 5.0设计合成300对引物,通过琼脂糖凝胶电泳、非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳对潜在的SSR位点进行初筛与复筛,最后采用荧光标记毛细管电泳进行SSR位点多态性与种群遗传多样性分析。[结果]刀状黑黄檀基因组特征分析结果显示:其基因组大小约为706.92 Mb,杂合度为1.26%,重复序列比率为55.74%。通过筛选实验,发掘了27个具有良好多态性的SSR标记,并进行了验证。结果显示27个SSR位点共扩增得到117个等位基因,多态性信息含量(PIC)介于0.149~0.803。对3个野生种群遗传多样性分析结果显示:种群水平的平均期望杂合度(H_(e))为0.504,遗传分化系数(F_(ST))为0.034;AMOVA分析显示:种群间变异占比3.46%,种群内变异占比96.54%,这表明遗传变异主要来源于种群内。[结论]刀状黑黄檀基因组属于高杂合、高重复的复杂基因组,研究结果为制定基因组精细组装策略提供了参考依据;发掘与验证的27个SSR标记具有较好的多态性与扩增稳定性;3个野生种群具有中等遗传多样性和较低的遗传分化,本研究为开展刀状黑黄檀的种质资源收集保存与分析评价提供科学依据。

关键词：刀状黑黄檀下一代测序技术基因组SSR 多态性遗传多样性

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基于硝态氮或铵态氮条件下杨树根尖miRNAs特征分析

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林业科学研究 2021年第4期34卷 1-12页

作者：阚东旭逯岩吴江婷陈昕石文广周婧林木遗传育种国家重点实验室国家林业和草原局森林培育重点实验室中国林业科学研究院林业研究所北京100091 林木遗传育种国家重点实验室东北林业大学黑龙江哈尔滨150040

目的通过小RNAs高通量测序技术,在硝态氮或铵态氮处理下,对杨树根尖差异表达miRNAs及其靶基因调控机制进行了研究,分析和描述了杨树根尖生长和形态特征的规律,为进一步筛选和鉴定硝态氮或铵态氮吸收利用效率高的林木新品种提供依据。方... 详细信息

目的通过小RNAs高通量测序技术,在硝态氮或铵态氮处理下,对杨树根尖差异表达miRNAs及其靶基因调控机制进行了研究,分析和描述了杨树根尖生长和形态特征的规律,为进一步筛选和鉴定硝态氮或铵态氮吸收利用效率高的林木新品种提供依据。方法以灰杨水培苗根尖为研究对象,应用高通量测序技术进行小RNA文库构建,获得miRNAs表达谱,鉴定差异表达miRNAs,同时利用降解组测序技术鉴定miRNAs靶基因,并对差异表达靶基因进行功能注释以及代谢通路富集等分析。最后通过联合分析,阐明不同氮形态处理下,灰杨根尖miRNA-靶基因调控网络。结果从2种不同氮形态处理杨树根尖miRNAs文库中鉴定出523个已知miRNAs和42个新miRNAs,其中,有96个miRNAs显著差异表达。与硝态氮处理相比,铵态氮处理下有44个miRNAs上调表达,52个下调表达,其中,vvi-MIR399d-p3_1ss13GA上调倍数最大,新的miRNA PC-5p-35885_222下调最显著。对miRNAs靶基因进行KEGG通路富集分析表明,部分显著差异表达靶基因参与杨树根尖氮响应,从而影响杨树根尖生长发育和形态特征。利用RT-qPCR对7组随机挑选的miRNA-靶基因进行验证,结果与测序数据一致,说明测序结果可靠。结论miRNAs及其靶基因在不同氮形态处理后对杨树根尖氮响应起着重要的调控作用,从而使硝态氮处理下的灰杨根长比铵态氮处理的几乎长1倍。

关键词：硝态氮 /铵态氮 /miRNA /mRNA /杨树 /根

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多组学技术在红豆杉研究中的应用

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分子植物育种 2022年第3期20卷 840-846页

作者：丰美静张恺恺陈段芬贺磊邱德有杨艳芳中国林业科学研究院林业研究所林木遗传育种国家重点实验室国家林业局林木培育重点实验室北京100091 河北农业大学园艺学院保定071001

组学技术及多组学联合分析已成为动植物分子生物学研究常用的技术手段,以转录组学、蛋白质组学及代谢组学为基础的组学技术,已被广泛应用于红豆杉的各项研究中。综述了近年来国内外有关基因组、转录组、蛋白质组与代谢组等组学技术在红... 详细信息

组学技术及多组学联合分析已成为动植物分子生物学研究常用的技术手段,以转录组学、蛋白质组学及代谢组学为基础的组学技术,已被广泛应用于红豆杉的各项研究中。综述了近年来国内外有关基因组、转录组、蛋白质组与代谢组等组学技术在红豆杉分子标记开发、紫杉醇生物合成、功能基因、抗寒能力以及紫杉醇生物合成相关代谢物中的应用,讨论了这些工作对红豆杉研究的重要意义,为红豆杉分子育种、功能基因挖掘及紫杉醇生物合成分子机理研究提供理论依据,并为今后的研究工作提供思路。

关键词：红豆杉(Taxus spp.) 转录组学蛋白质组学代谢组学

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毛白杨次生维管系统再生过程的基因表达

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林业科学 2021年第9期57卷 52-65页

作者：唐芳赵树堂王丽娟宋学勤卢孟柱中国林业科学研究院林业研究所林木遗传育种国家重点实验室国家林业和草原局林木培育重点实验室北京 100091 南京林业大学南方现代林业协同创新中心南京 210037 中国林业科学研究院林业研究所林木遗传育种国家重点实验室国家林业和草原局林木培育重点实验室北京 100091 南京林业大学南方现代林业协同创新中心南京 210037 浙江农林大学林业与生物技术学院省部共建亚热带森林培育国家重点实验室杭州 311300

[目的] 次生维管系统再生能够在树干维管系统丧失后通过去分化、再分化或转分化等组织修复手段实现维管组织的再生.为了鉴定和研究次生维管系统发育相关的重要基因和调控元件,本文利用毛白杨次生维管再生系统,分析了不同再生时期的基因... 详细信息

[目的] 次生维管系统再生能够在树干维管系统丧失后通过去分化、再分化或转分化等组织修复手段实现维管组织的再生.为了鉴定和研究次生维管系统发育相关的重要基因和调控元件,本文利用毛白杨次生维管再生系统,分析了不同再生时期的基因表达模式,为进一步揭示木材形成的基因调控机制奠定基础.[方法] 将 4年生毛白杨无性系在形成层活动旺盛期进行环剥取样.对剥皮后的树皮内侧和树干表面的样本,以及再生第 7、10、14、18和21天5个不同时期获取的再生材料进行高通量转录组分析,并利用基因共表达分析( WGCNA)方法,得到与不同再生时期密切相关的模块,并对这些特异表达的基因进行表达网络和生物学功能分析.[结果] 将第0天(剥皮当天)树皮内侧样本与树干表面样本、再生第 7 天样本与树干表面样本,以及相邻再生时期的样本进行表达差异分析.对得到的14 202个差异基因进行 WGCNA分析,构建基因共表达网络,获得与维管再生过程相关的10个共表达模块.其中,Grey60模块的基因在再生第 7 天样本和树皮内侧样本中特异表达,主要涉及 DNA 复制、有丝分裂、细胞分裂和微管运动等功能;该模块还含有大量与表观遗传调控、细胞周期相关的基因,它们在再生第7天的高表达可能激活了脱分化木质部细胞的增殖和组织类型的改变,使其获得再分化能力.此外,Pink 模块的基因在第0天成熟维管组织样本中的表达量极低,但在再生过程中表达呈上升趋势,到第 21天达到最高值;这些基因主要参与细胞分裂、细胞壁修饰、韧皮部发育、碳水化合物代谢、 DNA 的转录调控等相关的生物学途径.Pink模块中与韧皮部分化相关的标记基因,比如 APL、NAC45/86、DOF、BSPA、PP2 和 SUS 的表达被重新激活,与调节形成层细胞增殖和分化的 CLE41/44和 CLV1一样,表达量都是从再生第 10 天开始逐渐增加.到次生维管系统再生后期的第18天和第21天,形成层已经完成了结构重构并能进行细胞的分裂、分化,此时木质部标记基因和次生壁调控因子有较高的表达.[结论] 毛白杨次生维管系统再生早期,脱分化的木质部细胞通过表观遗传和细胞周期调控重新获得细胞分生能力;之后,韧皮部的细胞分化程序被启动,再生形成层开始细胞增殖和分化;到再生后期,通过相关基因调控,形成层再分化木质部和韧皮部.通过对次生维管组织再生过程中基因的表达分析和调控模块的鉴定,进一步验证了次生维管再生的遗传调控基础,也可为揭示植物维管组织再生的调控机制奠定基础.

关键词：杨树次生维管系统再生基因表达 WGCNA

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基于因子分析的不同楸树无性系耐锑综合评价

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林业科学研究 2022年第6期35卷 151-160页

作者：刘振华王军辉童方平孙良李贵陈瑞吴敏刘作群麻文俊中国林业科学研究院林业研究所林木遗传育种国家重点实验室国家林业和草原局林木培育重点实验室楸树国家创新联盟北京100091 湖南省林业科学院湖南长沙410004 浏阳市浏阳湖国有林场湖南浏阳410300 宁乡市园林绿化维护中心湖南宁乡410600

[目的]为了评价10个不同无性系楸树的耐锑能力,为锑污染土壤的修复提供植物材料。[方法]在不同锑胁迫浓度下,通过对生长量、生物量、叶片叶绿素含量、根茎叶中锑元素含量、叶片解剖结构、叶片中过氧化氢含量(H_(2)O_(2))、超氧阴离子(O_... 详细信息

[目的]为了评价10个不同无性系楸树的耐锑能力,为锑污染土壤的修复提供植物材料。[方法]在不同锑胁迫浓度下,通过对生长量、生物量、叶片叶绿素含量、根茎叶中锑元素含量、叶片解剖结构、叶片中过氧化氢含量(H_(2)O_(2))、超氧阴离子(O_(2)^(−)﹒)含量、谷胱甘肽(GSH)、过氧化氢酶(CAT)活性、过氧化物酶(POD)和抗坏血酸过氧化物酶(APX)活性的测定,并利用因子分析法对10个不同无性系楸树耐锑能力进行综合评价。[结果]不同浓度锑胁迫下,除8402无性系根生物量差异不显著外,其余无性系地上和根生物量在不同锑浓度间存在差异;随锑胁迫浓度的升高,大部分无性系株高和地径增长量均表现为先升高后降低的趋势;除8402和72无性系在2000 mg·kg^(−1)锑胁迫下根生物量比对照高外,其它无性系在较低浓度锑胁迫下促进了生物量增加,到了一定浓度随着锑浓度的增加,生物量逐渐减少。楸树对锑的富集主要在根部,600 mg·kg^(−1)锑胁迫下,63无性系根、叶中锑含量最高,8402无性系茎中锑含量最高;1200 mg·kg^(−1)锑胁迫下,5-2无性系根中锑含量最高,1-1无性系茎和叶中锑含量最高;2000 mg·kg^(−1)锑胁迫下,5-8无性系根中锑含量最高,8402无性系茎中锑含量最高,72无性系叶中锑含量最高。在一定胁迫压力内,抗氧化酶活性和植物体内的活性氧物质的浓度呈正相关性。[结论]对各指标进行综合分析表明,在0~2000 mg·kg^(−1)锑胁迫下,10个楸树无性系耐锑能力大小排序为5-8>0>20-01>2-8>5-2>63>8402>1>72>1-1。研究结果为锑污染土壤修复提供了植物材料,在土壤锑污染2000 mg·kg^(−1)以下,能够利用锑耐受能力强的楸树无性系进行修复。

关键词：因子分析无性系楸树锑

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沙柳SpWRKY33基因的克隆、表达及启动子分析

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分子植物育种 2022年

作者：刁科豪孟会静赵金娜郑广顺李涛李建波山西农业大学林学院中国林业科学研究院华北林业实验中心北京九龙山暖温带森林国家长期科研基地中国林业科学研究院林木遗传育种国家重点实验室

WRKY转录因子是高等植物所特有的一类转录调控因子，对植物生长发育以及应对各种胁迫具有重要作用。通过初步探究SpWRKY33基因在沙柳应对各种非生物胁迫中的作用，以期为揭示WRKY转录因子的功能机制以及培育新型抗逆植株提供理论依据。... 详细信息

WRKY转录因子是高等植物所特有的一类转录调控因子，对植物生长发育以及应对各种胁迫具有重要作用。通过初步探究SpWRKY33基因在沙柳应对各种非生物胁迫中的作用，以期为揭示WRKY转录因子的功能机制以及培育新型抗逆植株提供理论依据。以温室培育的二月龄沙柳为材料，克隆SpWRKY33全长编码序列，对其进行生物信息学分析，并通过RT-qPCR分析不同组织以及不同胁迫处理下基因的表达水平。克隆SpWRKY33启动子序列，并对其顺式作用元件进行分析，预测SpWRKY33基因可能的调控机制。结果表明，SpWRKY33编码序列全长1 776 bp，编码591个氨基酸，蛋白质的相对分子质量约为65.00 kD，理论等电点为6.91，属于亲水性不稳定蛋白；该蛋白在进化关系上与簸箕柳、银白杨、毛果杨等杨柳科植物亲缘关系最近。RT-qPCR结果显示，该基因在叶片和雄花中表达量最高，其次为雌花、根和茎，基因的表达还受干旱、盐、冷、高温等非生物胁迫以及ABA的诱导。启动子顺式元件参与了光信号以及多种植物激素的调控过程。这些结果表明，SpWRKY33是一个能响应多种非生物胁迫且可能参与ABA激素信号通路的重要基因，这为进一步探究SpWRKY33在植物抗逆机理中的作用机制提供了参考依据。

关键词：沙柳 WRKY转录因子胁迫响应顺式作用元件

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修剪和摘芽对川西云杉采穗母树穗条产量和质量的影响

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中南林业科技大学学报 2023年第1期43卷 33-42页

作者：张保全胡勐鸿欧阳芳群吕寻王军辉甘肃省小陇山林业科学研究所甘肃省次生林重点培育实验室甘肃天水741022 甘肃省小陇山林业科学研究所甘肃小陇山森林生态系统国家定位观测研究站甘肃天水741022 北京市植物园管理处北京市花卉园艺工程技术研究中心北京100093 北京市植物园管理处城乡生态环境北京实验室北京100093 中国林业科学研究院林业研究所林木遗传育种国家重点实验室北京100091 中国林业科学研究院林业研究所国家林业和草原局林木培育重点实验室北京100091

【目的】通过采取栽培管理措施提高川西云杉Picea likiangensis ***幼龄采穗母树穗条产量和质量,为优化云杉幼龄母树栽培管理措施提供参考依据。【方法】在甘肃省小陇山沙坝国家云杉种质资源库川西云杉超级苗(实生苗)采穗圃,选择树势基... 详细信息

【目的】通过采取栽培管理措施提高川西云杉Picea likiangensis ***幼龄采穗母树穗条产量和质量,为优化云杉幼龄母树栽培管理措施提供参考依据。【方法】在甘肃省小陇山沙坝国家云杉种质资源库川西云杉超级苗(实生苗)采穗圃,选择树势基本一致的8年生采穗母树,于芽萌动前(4月中旬),采用随机区组试验设计,进行修剪、修剪+摘芽、修剪+保留枝条(1/3长、1/2长、2/3长)等处理,研究其对采穗母树穗条数量、质量和冬芽数的影响。11月调查试验母树上当年生长度≥5 cm的枝条数量、质量(基部直径和长度)和冬芽数(含可发育成枝条的隐芽)。【结果】不同处理对川西云杉母树当年顶层轮生枝主干上的长短枝数量的影响差异不显著(P>0.05),对其他枝条数量的影响差异显著(P<0.05)。不同处理后采穗母树当年生长度≥5 cm的总枝条数均显著低于对照,但母树当年新生枝条的增粗和伸长生长均被促进,随着新生枝条的伸长,枝条上的平均芽数增多。不同处理中,修剪+摘芽的处理效果最好,其枝条基部平均直径达到(5.29±1.22)mm,平均长度为(16.28±3.30)cm,枝条上的平均冬芽数为(7±2)个·条^(-1),枝条上的平均冬芽数是对照的2.33倍。修剪+摘芽处理和重度修剪保留枝条的处理能有效刺激母树隐芽发育,隐芽数分别是(27±6)和(18±3)个·株^(-1),是对照的5.4和3.6倍。修剪+摘芽处理的冬芽数最多,达到(381±27)个·株^(-1),其次是只进行修剪处理,为(351±14)个·株^(-1)。由于不同处理既减少了当年可萌发成枝条的芽数,同时刺激了部分隐芽发育形成枝条,不同处理对川西云杉采穗母树当年穗条产量和冬芽数的影响分别有正向和负向的作用。【结论】修剪+摘芽处理有效促进了川西云杉采穗母树当年枝条径向和纵向生长,母树当年可采穗条质量显著提高,母树冬芽数最多,是既有利于当年采穗扦插又有利于提高下年度穗条产量的川西云杉幼龄采穗母树修剪技术。

关键词：川西云杉摘芽修剪穗条质量穗条产量冬芽数量

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梓属5个种对干旱胁迫的生理响应

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植物研究 2021年第1期41卷 44-52页

作者：于晓池杨桂娟董菊兰王军辉麻文俊张鹏东北林业大学哈尔滨150040 中国林业科学研究院林业研究所林木遗传育种国家重点实验室国家林业和草原局林木培育重点实验室北京100091 甘肃省小陇山林业实验局林业科学研究所天水741022

为分析梓属5个种干旱胁迫响应程度,为梓属耐旱树种的筛选、抗旱育种及栽培工作提供理论依据。本研究选取梓属的黄金树、滇楸、灰楸、梓树和楸树为试材,将其在浇水量为700 mL和400 mL的水分条件下培养50 d,测量其苗高、地径、叶水势、叶... 详细信息

为分析梓属5个种干旱胁迫响应程度,为梓属耐旱树种的筛选、抗旱育种及栽培工作提供理论依据。本研究选取梓属的黄金树、滇楸、灰楸、梓树和楸树为试材,将其在浇水量为700 mL和400 mL的水分条件下培养50 d,测量其苗高、地径、叶水势、叶绿素相对含量、叶绿素荧光参数和比叶重等指标,并运用隶属函数法对其抗旱性进行综合评价。结果表明:在2种水分条件下,生长状态最好的为楸树,梓树相对较差。在干旱胁迫条件下,除黄金树外,其他各树种的叶片水势(ΨL)都降低,最大气孔导度(Gs)均增加。不同种的叶绿素相对含量(SPAD)值均在干旱胁迫条件下升高。除滇楸和楸树外,各树种的光系统Ⅱ最大光能转换效率(Fv/Fm)随干旱胁迫而增加。除灰楸外,干旱胁迫增加了其他树种的比叶重(LMA)。利用隶属函数法综合评价抗旱性的结果为:灰楸>梓树>滇楸>楸树>黄金树。说明梓属不同树种间有着不同的抗旱能力。综合分析,楸树和灰楸的抗旱能力较强,滇楸和梓树的抗旱能力次之,黄金树的抗旱能力最差。

关键词：梓属干旱胁迫生理响应差异

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毛果杨GATA基因家族全基因组水平鉴定及表达分析

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植物研究 2021年第1期41卷 107-118页

作者：任梦轩张洋王爽王瑞琪刘聪魏志刚林木遗传育种国家重点实验室东北林业大学哈尔滨150040 国家林业与草原局盐碱地研究中心中国林业科学研究院北京100091

GATA转录因子基因家族在植物生长发育、细胞分化以及响应环境变化中具有重要作用。然而,目前在木本植物中尚无该基因家族全基因组水平的分析报导。本项研究从基因组水平对毛果杨GATA家族成员的数量、基因结构、染色体定位、系统进化、... 详细信息

GATA转录因子基因家族在植物生长发育、细胞分化以及响应环境变化中具有重要作用。然而,目前在木本植物中尚无该基因家族全基因组水平的分析报导。本项研究从基因组水平对毛果杨GATA家族成员的数量、基因结构、染色体定位、系统进化、编码蛋白的理化特征和保守基序等信息进行了系统分析,结果表明,毛果杨GATA家族包含39个基因,共分布于15条染色体上,其中5号染色体上含有6个基因,9号、13号和19号染色体含有基因数量为1,其余染色上无基因分布。该家族各基因的结构与编码蛋白的基本特性均存在一定异性,可分成4个亚族。qRT-PCR研究表明,GATA家族各基因在不同发育阶段的茎部表达量存在明显差异,且盐胁迫对各基因的表达特性影响显著。以上结果表明,毛果杨GATA家族基因在复制后,基因的结构与功能产生了明显分化,其中部分基因在毛果杨次生生长与盐胁迫响应中可能具有重要作用。本项研究为全面解析毛果杨GATA家族各成员在其生长发育与盐胁迫响应中的生物学功能奠定了基础。

关键词：毛果杨 GATA基因盐胁迫表达模式

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