检索结果-内蒙古大学图书馆

林业科学研究 2024年第3期37卷 24-36页

作者：郝心怡王哲舒范志斌王丽娟中国林业科学研究院林业研究所林木遗传育种全国重点实验室国家林业和草原局林木培育重点实验室北京100091 南京林业大学南方现代林业协同创新中心江苏南京210037

[目的]基于RNA-Seq测序技术,初步探究了杨树-腐皮镰刀菌互作过程中相关基因的表达、主要信号通路和代谢途径,筛选了杨树防御腐皮镰刀菌侵染的关键基因,为进一步揭示此类病害的分子机制奠定基础。[方法]以生长2个月的银腺杨84K为材料,用1... 详细信息

[目的]基于RNA-Seq测序技术,初步探究了杨树-腐皮镰刀菌互作过程中相关基因的表达、主要信号通路和代谢途径,筛选了杨树防御腐皮镰刀菌侵染的关键基因,为进一步揭示此类病害的分子机制奠定基础。[方法]以生长2个月的银腺杨84K为材料,用1×10^(7)个·mL^(-1)的腐皮镰刀菌孢子液侵染根系,于侵染0h(对照组)、48 h和72 h(接菌组)后取根组织进行转录组测序,挖掘杨树响应腐皮镰刀菌侵染的相关基因。[结果](1)与对照组0 h相比,侵染48 h和72 h分别检测到8 939个和8 246个DEGs(Differentially Expressed Genes)。(2)GO分析发现,差异表达基因主要富集在单一生物体过程、对刺激反应、碳水化合物代谢、生物调节和对激素响应等过程。(3)KEGG分析表明,糖酵解/糖异生、碳代谢、植物激素信号转导和苯丙烷生物合成等途径在病原菌侵染后发生显著变化。(4)杨树糖转运蛋白SWEETs家族中21个成员的表达受腐皮镰刀菌侵染诱导。乙烯受体ETR、乙烯信号通路主要基因EIN3、ERF1、ERF2上调表达,木质素合成关键酶基因CCR、4CL、C3’H、COMT表达量显著升高。[结论]杨树可能通过调节体内糖代谢和转运,激活乙烯信号通路,促进木质素积累、细胞壁增厚等策略,响应腐皮镰刀菌的侵染。

关键词：杨树腐皮镰刀菌侵染过程转录组

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大花蕙兰转齿兰环斑病毒外壳蛋白基因及检测

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林业科学研究 2016年第2期29卷 234-237页

作者：彭博魏莉杨凯李潞滨中国林业科学研究院林业研究所林木遗传育种国家重点实验室北京100091 邯郸市环境监测中心站河北邯郸056002 北京农学院农业应用新技术北京市重点实验室北京102206

[目的]通过植物转基因技术获得抗病毒大花蕙兰种质资源,优化转化体系和鉴定方法。[方法]本研究克隆了齿兰环斑病毒外壳蛋白基因,并构建了该基因的p BI121表达载体,用根癌农杆菌介导法转化大花蕙兰,尝试以巢式PCR方法检测转基因再生植株... 详细信息

[目的]通过植物转基因技术获得抗病毒大花蕙兰种质资源,优化转化体系和鉴定方法。[方法]本研究克隆了齿兰环斑病毒外壳蛋白基因,并构建了该基因的p BI121表达载体,用根癌农杆菌介导法转化大花蕙兰,尝试以巢式PCR方法检测转基因再生植株。[结果]优化了大花蕙兰遗传转化体系,建立了利用巢式PCR技术检测转基因大花蕙兰植株的方法,获得了32株转基因株(系)。[结论]优化了以类原球茎为外植体的农杆菌介导转化大花蕙兰的方法,确定以5%10%类原球茎存活时的抗生素(卡那霉素)浓度为筛选浓度;获得了转ORSV CP基因大花蕙兰植株;对大花蕙兰转基因植株检测时,巢式PCR较普通PCR更灵敏、准确。

关键词：大花蕙兰齿兰环斑病毒外壳蛋白基因转基因巢式PCR

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红松转录组SSR分析及EST-SSR标记开发

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林业科学 2015年第8期51卷 114-120页

作者：张振张含国莫迟张磊东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室哈尔滨150040 中国林业科学研究院亚热带林业研究所杭州311400

【目的】红松已开发的分子标记缺乏共显性的遗传标记，尚不能满足分子标记辅助育种的需要。利用转录组数据开发 SSR标记目前仍然是较为经济高效的 DNA分子标记开发策略，本研究利用高通量测序技术开发红松 EST-SSR标记，掌握其在转录组... 详细信息

【目的】红松已开发的分子标记缺乏共显性的遗传标记，尚不能满足分子标记辅助育种的需要。利用转录组数据开发 SSR标记目前仍然是较为经济高效的 DNA分子标记开发策略，本研究利用高通量测序技术开发红松 EST-SSR标记，掌握其在转录组序列中的分布类型及特征，为红松的 SSR多样性分析及变异分析提供基础。【方法】利用 SSR检索程序从红松转录组41476条 Unigenes中筛选得到1757个 SSR 位点，并对 SSR 位点的数量、分布特征进行统计分析。设计合成101对 SSR引物，采用琼脂糖电泳初步检查和聚丙烯酰胺凝胶电泳分离检测方法确定引物的多态性，并收集扩增产物，送测序验证，最终开发出16对 SSR引物。合成6对荧光引物，采用荧光标记技术对来自黑龙江省鹤岗、林口、铁力、苇河4个种子园的53份自由授粉子代进行遗传多样性分析。【结果】基于转录组序列开发出的 EST-SSR的分布频率（ SSR 的个数与总 Unigene 的数量比）为4.24%。单、二、三核苷酸重复单元分别占总SSR的46.90%，17.12%和34.66%； SSR重复单元的重复次数分布在5～24次之间。参试的101对引物中有21对引物扩增可检测出多态性位点，占引物总数的20.8%；重测序验证，有16对引物能够扩增出目标序列。6对荧光引物共检测出18个等位基因，多态性信息量（PIC）为0.0363～0.6674，平均为0.325。【结论】红松属于基因组序列比较庞大的裸子植物，本研究可扩增出多态性位点的引物重复单元以二、三核苷酸重复为主。所研究红松种子园子代属于中等多态性水平。本研究印证了利用红松转录组数据开发 SSR标记的可行性，同时采用荧光标记技术检测红松自由授粉子代材料，为红松种质资源的多样性水平分析及变异水平的研究提供基础。

关键词：红松转录组遗传多样性

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斜盖伞诱导子促进灵芝三萜积累及其调控机制

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菌物学报 2023年第6期42卷 1370-1385页

作者：张宇薇廖望仪宋荣孝彭龙袁志林中国林业科学研究院林木遗传育种国家重点实验室北京100091 南京林业大学林学院江苏南京210037 中国林业科学研究院亚热带林业研究所浙江杭州311400 浙江物产长乐创龄生物科技有限公司浙江杭州311400

近年来,灵芝产业高速发展,但其主要药效成分灵芝三萜的含量较低,是影响其品质的重要原因,因此探索一种提高灵芝三萜含量的生物技术手段极具应用前景。本研究以6株斜盖伞Clitopilus spp.真菌为材料分别制备多种类型的真菌诱导子,将其添... 详细信息

近年来,灵芝产业高速发展,但其主要药效成分灵芝三萜的含量较低,是影响其品质的重要原因,因此探索一种提高灵芝三萜含量的生物技术手段极具应用前景。本研究以6株斜盖伞Clitopilus spp.真菌为材料分别制备多种类型的真菌诱导子,将其添加到灵芝菌丝体液体摇瓶中,研究对灵芝菌丝体生物量和灵芝三萜积累的影响。其中,Clitopilus ***-YX-7-A的高压灭菌发酵液(HSLFB)、*** NL-19的菌丝干粉(NL-19DMP)、*** 84496的发酵液提取物(84496 FBE)和Clitopilus ***-YX-7-A的菌丝提取物(HSL ME)显著提高了灵芝菌丝体生物量和灵芝三萜含量,相对于对照组,生物量分别提高了450.09%、64.64%、46.97%和66.14%,灵芝三萜分别提高了53.01%、25.58%、25.17%和20.47%,灵芝三萜总产量则分别提高了585.15%、104.65%、86.43%和110.45%。进一步研究表明,经HSL FB、NL-19 DMP和HSL ME处理后,灵芝三萜生物合成途径关键酶基因hmgs、hmgr、mvd、fps、sqs和osc的表达量显著上调;但84496 FBE处理之后仅上调了hmgs和sqs的表达量。且6个基因的平均表达量与灵芝三萜总产量的提升率呈显著的正相关性(R^(2)=0.972,P<0.05)。本研究证实了斜盖伞诱导子能够有效提升灵芝菌丝体生物量和灵芝三萜含量,其中*** NL-19和Clitopilus ***-YX-7-A均为栎类树种的根系共生菌。本研究进一步为开发斜盖伞真菌作为微生物菌剂提供了基础,同时为提高栎树人工林的生产力和创建“以菌养菌”的药用真菌品质提升技术体系提供了重要策略。

关键词：斜盖伞真菌真菌诱导子灵芝三萜生物合成诱导机制

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基于B/S结构的胡杨转化基因组数据库管理信息系统研建分析

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林业资源管理 2014年第4期 125-130页

作者：石焱梁宝君周婧陈加飞戴慧国家林业局管理干部学院中国林业科学研究院林业研究所林木遗传育种国家重点实验室

基于B/S体系三层结构实现了胡杨转化基因组数据库管理系统,系统使用SQL数据库提供基因数据管理和查询功能。数据库管理采用在线方式及时、有效地管理数据库。对实现分子育种方法,培育高抗、优质林木新品种提供数据管理,可为研究人员提... 详细信息

基于B/S体系三层结构实现了胡杨转化基因组数据库管理系统,系统使用SQL数据库提供基因数据管理和查询功能。数据库管理采用在线方式及时、有效地管理数据库。对实现分子育种方法,培育高抗、优质林木新品种提供数据管理,可为研究人员提供信息服务,并对相关数据库的建设有借鉴作用。

关键词：胡杨转化基因组数据库 B/S体系信息管理

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楸树苗期优良家系及单株的配合选择

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西北林学院学报 2012年第3期27卷 68-71页

作者：翟文继麻文俊王秋霞王平王军辉河南省南阳市林业科学研究所河南南阳473000 林木遗传育种国家重点实验室中国林业科学研究院林业研究所北京100091

以河南南阳地区楸树优树子代为研究对象,分析苗期苗高、地径、单叶面积等6个性状。结果表明:家系间苗高、地径、叶长、叶宽、单叶面积和叶片数差异极显著,说明楸树半同胞家系间存在较大的变异,具有较大的选育潜力。各性状遗传力差异较大... 详细信息

以河南南阳地区楸树优树子代为研究对象,分析苗期苗高、地径、单叶面积等6个性状。结果表明:家系间苗高、地径、叶长、叶宽、单叶面积和叶片数差异极显著,说明楸树半同胞家系间存在较大的变异,具有较大的选育潜力。各性状遗传力差异较大,但都属于中度以上遗传控制,苗高和地径的遗传力分别为0.581和0.663,单叶面积、叶片数的遗传力为0.683和0.874。以综合育种值为标准,选出9个苗期优良家系,苗高和地径的遗传增益分别达到6.32%和11.38%。从入选的9个优良家系内选择36株优良单株,其树高平均增加25.87%,遗传增益为15.03%,这些优良单株可作为营建楸树无性系试验林的材料。

关键词：楸树苗期遗传变异配合选择

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巨桉EgrWAT1基因克隆和功能初步分析

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植物研究 2023年第4期43卷 601-611页

作者：张昊楠陈珊珊徐建民罗萍王晓萍许志茹范春节东北林业大学生命科学学院哈尔滨150040 国家林业和草原局热带林木培育重点实验室中国林业科学研究院热带林业研究所广州510520 林木遗传育种国家重点实验室东北林业大学/中国林业科学研究院哈尔滨/北京150040/100091

为探究WALLS ARE THIN(WAT1)在木本植物中木材形成以及响应胁迫中的作用,利用生物信息学工具进行分析,并以巨桉(Eucalyptus grandis)为材料克隆EgrWAT1S及其另一转录本EgrWAT1L,通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)探究其在不同组织、节间以... 详细信息

为探究WALLS ARE THIN(WAT1)在木本植物中木材形成以及响应胁迫中的作用,利用生物信息学工具进行分析,并以巨桉(Eucalyptus grandis)为材料克隆EgrWAT1S及其另一转录本EgrWAT1L,通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)探究其在不同组织、节间以及响应胁迫时的表达模式。结果表明:EgrWAT1S在韧皮部表达量较高,而EgrWAT1L主要表达在根部。在茉莉酸甲酯(MeJA)、水杨酸(SA)处理和盐胁迫以及缺磷、缺硼处理时,其表达存在着明显不同的模式,在MeJA、SA处理时甚至存在着相反的表达模式。这些结果表明EgrWAT1L基因可能通过转录调控来影响EgrWAT1S表达和进一步的蛋白翻译来响应激素和胁迫处理。为进一步研究WAT1基因在巨桉生长发育过程中的作用和调控方式提供基础,也为将来桉树的分子育种提供可能。

关键词：巨桉 WAT1 可变剪切基因克隆表达模式

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杨树新品种的SSR指纹图谱构建和倍性检测

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林业科学 2015年第2期51卷 69-79页

作者：贾会霞姬慧娟胡建军卢孟柱林木遗传育种国家重点实验室国家林业局林木培育重点实验室中国林业科学研究院林业研究所北京100091 南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室南京210037

【目的】对24份杨树种质进行指纹图谱构建、系谱关系鉴定和遗传多样性分析，并进行倍性检测，为杨树新品种鉴定和知识产权保护提供科学的理论依据，同时为杨树的育种工作奠定坚实的基础。【方法】利用 TP-M13-SSR 技术对24份杨树种质进... 详细信息

【目的】对24份杨树种质进行指纹图谱构建、系谱关系鉴定和遗传多样性分析，并进行倍性检测，为杨树新品种鉴定和知识产权保护提供科学的理论依据，同时为杨树的育种工作奠定坚实的基础。【方法】利用 TP-M13-SSR 技术对24份杨树种质进行指纹图谱构建和系谱关系鉴定。从杨树 SSR 数据库中选取200对 SSR 引物，利用遗传背景差异大的 4份杨树种质进行引物筛选，选出19对扩增条带清晰、具有多态性且重复性好的引物对24份杨树种质进行扩增，利用 GeXP 毛细管电泳对 PCR 荧光产物进行检测，采用非加权组平均法（UPGMA）进行聚类分析，利用流式细胞术（FCM）进行倍性检测。【结果】19对 SSR 引物共扩增出102条条带，多态性条带97条，占95．10%，每个位点的等位基因数为2～11个，平均每对引物为5．37个。19对 SSR 引物均未检测到中林2025杨、中红杨和全红杨的条带差异，这3份种质相对于其他21份种质有特异的共同指纹条带；3对高效引物 ORPM_103，ORPM_180和 GCPM_1255可以将剩余21份杨树种质完全区分开。SSR 标记构建的指纹图谱与其系谱关系基本一致。对24份种质进行聚类分析，相似系数在0.50～1.00之间。当相似系数为0．56时，可分为5大类：第1类包括50号杨、中怀1号、中怀2号、I-69、帝国杨、中林2025杨、中红杨和全红杨；第2类包括青杨、森海 1号和森海 2号；第3类包括36号杨、丹红杨、南杨、239、1-116、中成 1号、中成 2号、中成3号、中成4号和中豫1号；第4类包括北抗杨和创新杨；第5类只有中林46杨。SSR 检测发现中怀 1号、森海 1号、森海 2号、青杨和中林46杨扩增出3个不同等位基因位点，其余19份杨树种质只出现 1个或2个等位基因位点；FCM 检测结果证实这5份种质均为三倍体，与 SSR 检测结果一致。【结论】本研究对24份杨树种质进行指纹图谱构建、遗传多样性分析和倍性测试，证实用 SSR标记可有效地检测亲本与子代之间的系谱关系，并准确地反映植物的倍性。筛选出 3对快速鉴别其中21份杨树种质的 SSR 引物，发现5个杨树种质为三倍体。本研究结果可为杨树新品种鉴定和知识产权保护提供理论依据。

关键词：杨树 TP-M13-SSR 指纹图谱系谱分析倍性检测

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东南景天耐镉相关基因SaFer的克隆与功能初步分析

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浙江农林大学学报 2015年第1期32卷 25-32页

作者：赵婷韩小娇刘明英乔桂荣蒋晶姜彦成卓仁英新疆大学生命科学与技术学院新疆乌鲁木齐830046 中国林业科学研究院亚热带林业研究所浙江富阳311400 中国林业科学研究院林木遗传育种国家重点实验室北京100091

铁蛋白(ferritin)是一种专门存储铁的重要胁迫相关蛋白,参与镉离子吸收的调控。从构建的东南景天Sedum alfredii c DNA文库中筛选出东南景天Ferritin基因c DNA全长,命名为Sa Fer,编码序列为1 117 bp,开放阅读框为759 bp,编码252个氨基... 详细信息

铁蛋白(ferritin)是一种专门存储铁的重要胁迫相关蛋白,参与镉离子吸收的调控。从构建的东南景天Sedum alfredii c DNA文库中筛选出东南景天Ferritin基因c DNA全长,命名为Sa Fer,编码序列为1 117 bp,开放阅读框为759 bp,编码252个氨基酸。以东南景天基因组DNA为模板分离到Sa Fer基因组序列,长度为1 702 bp,含有7个内含子。氨基酸序列同源性分析表明:Sa Fer与苹果Malus domestica Ferritin亲缘关系最近,同源性高达76%。实时荧光定量聚合酶链式反应(q RT-PCR)分析发现:根系中Sa Fer基因在镉胁迫12 h后表达显著上调。镉胁迫实验显示,转基因拟南芥Arabidopsis thaliana比野生型有更高的耐镉胁迫能力。Sa Fer基因的分离及其初步功能验证为研究东南景天耐镉机制和林木耐镉转基因育种提供了理论依据。

关键词：植物学东南景天铁蛋白(ferritin) 镉胁迫表达分析

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杨树PIF基因家族成员表达模式研究

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林业科学研究 2018年第2期31卷 19-25页

作者：徐向东任逸秋张利李煜王丽娟卢孟柱林木遗传育种国家重点实验室国家林业局林木培育重点实验室中国林业科学研究院林业研究所北京100091 西北农林科技大学林学院陕西杨凌712100 菏泽学院园林工程系山东菏泽274000

[目的]为探究光敏色素相互作用因子(PIF)基因在杨树生长发育中的功能。[方法]利用生物信息学方法预测了杨树基因组中的PIF基因家族成员并对各成员的基因结构、保守基序进行了系统分析;在此基础上,采用实时荧光定量PCR技术检测了PIF成员... 详细信息

[目的]为探究光敏色素相互作用因子(PIF)基因在杨树生长发育中的功能。[方法]利用生物信息学方法预测了杨树基因组中的PIF基因家族成员并对各成员的基因结构、保守基序进行了系统分析;在此基础上,采用实时荧光定量PCR技术检测了PIF成员在不同组织及低温、干旱和Na Cl胁迫下的表达模式。[结果]表明:杨树基因组中至少含有10个Pt PIF成员,这些成员在进化上相对保守,均具有典型的b HLH结构域。基因表达分析显示:Pt PIF基因在杨树不同组织及不同非生物胁迫条件下存在明显的表达差异。[结论]杨树Pt PIF基因家族包含10个成员参与不同的生物学过程,研究结果将为深入解析杨树Pt PIF基因的功能奠定了基础。

关键词：杨树光敏色素相互作用因子表达分析

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