检索结果-内蒙古大学图书馆

江苏农业科学 2019年第24期47卷 213-216页

作者：朱镇赵庆勇张亚东陈涛姚姝周丽慧赵凌赵春芳梁文化路凯王才林江苏省农业科学院粮食作物研究所/江苏省优质水稻工程技术研究中心/国家水稻改良中心南京分中心

以2014年、2015年分别在江苏省18个地区种植的南粳9108稻谷为材料,测定其稻米直链淀粉含量和快速黏度仪(apid visco-analyzer,简称RVA)谱特征值,对不同地点南粳9108稻米直链淀粉含量和RVA谱特征值的变异及相关性进行分析。结果表明,2年... 详细信息

以2014年、2015年分别在江苏省18个地区种植的南粳9108稻谷为材料,测定其稻米直链淀粉含量和快速黏度仪(apid visco-analyzer,简称RVA)谱特征值,对不同地点南粳9108稻米直链淀粉含量和RVA谱特征值的变异及相关性进行分析。结果表明,2年不同地点种植的南粳9108稻米直链淀粉含量的差异明显。纬度最高的东海地区其直链淀粉含量最高,纬度最低的南京地区其直链淀粉含量最低,其他地区的均在10%左右。RVA谱特征值分析结果表明,RVA谱特征值在不同地点和不同年份间也存在差异,2015年RVA谱特征值的变异系数除糊化温度外均明显高于2014年。不同地点RVA谱各特征值变化不一致,糊化温度和峰值时间基本比较稳定,差异较小,其他特征值差异均较大,消减值的变异系数最大,2014年变异系数从大到小依次为消减值、回复值、崩解值、最低黏度、最终黏度、峰值黏度、糊化温度、峰值时间,2015年的排序为消减值、最低黏度、最终黏度、崩解值、回复值、峰值黏度、峰值时间、糊化温度。2年36个地点种植的南粳9108稻米AC与RVA谱特征值的相关性分析结果表明,直链淀粉含量与糊化温度呈极显著负相关,与回复值、峰值时间呈显著正相关,与峰值黏度、最低黏度、最终黏度、消减值等呈正相关,与崩解值呈负相关,但均未达显著水平。

关键词：南粳9108 种植地点直链淀粉含量 RVA谱特征值相关性分析变异系数

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杂交中籼新组合宁香优2号的选育和应用

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江苏农业科学 2019年第21期47卷 148-151页

作者：赵庆勇张亚东陈涛朱镇周丽慧姚姝赵凌赵春芳梁文化王才林江苏省农业科学院粮食作物研究所/江苏省优质水稻工程技术研究中心/国家水稻改良中心南京分中心

宁香优2号是用三系不育系宁香1A和恢复系镇恢42配组而成的优质、高产杂交中籼新组合。该组合具有丰产稳产性好、米质优良、抗性好等特点,于2017年通过江苏省农作物品种审定委员会审定,适宜在江苏省中籼稻地区种植。本文介绍了其选育过... 详细信息

宁香优2号是用三系不育系宁香1A和恢复系镇恢42配组而成的优质、高产杂交中籼新组合。该组合具有丰产稳产性好、米质优良、抗性好等特点,于2017年通过江苏省农作物品种审定委员会审定,适宜在江苏省中籼稻地区种植。本文介绍了其选育过程、产量水平、特征特性、栽培技术及制种技术要点。

关键词：杂交稻宁香优2号特征特性栽培技术选育应用

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支链淀粉分支结构影响南粳9108食味品质

支链淀粉分支结构影响南粳9108食味品质

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江苏省遗传学会2019年学术研讨会

作者：张亚东赵春芳周丽慧赵庆勇陈涛朱镇姚姝赵凌路凯梁文化王才林江苏省农业科学院粮食作物研究所/江苏省优质水稻工程技术研究中心/国家水稻改良中心南京分中心

近年来,优良食味型粳稻品种南粳9108在江苏省推广面积逐步加大,但不同地域、不同栽培方式下种植的南粳9108食味品质有明显差异。为进一步探明南粳9108食味品质差异分子机制,对江苏境内19个市县点(S1-S19)南粳9108食味品质进行分析,发现... 详细信息

近年来,优良食味型粳稻品种南粳9108在江苏省推广面积逐步加大,但不同地域、不同栽培方式下种植的南粳9108食味品质有明显差异。为进一步探明南粳9108食味品质差异分子机制,对江苏境内19个市县点(S1-S19)南粳9108食味品质进行分析,发现不同地点种植的南粳9108的直链淀粉含量差异不明显;食味特征值、RVA谱各特征值和食味感官品尝参数存在较大变异;支链淀粉分支结构存在明显差异,食味值高的S5、S6具有更高的短链(A)、更低的B1和B2链,而食味值低的S8、S16具有更低的A链、更高的长链;支链淀粉A链和B1链间与RVA谱特征值的BDV、FV、SBV、PeT相关,其中BDV与A链呈正相关,与B1链呈负相关;食味特征值与支链淀粉分支链长DP9、DP10呈显著正相关关系,与DP18、DP43呈显著负相关关系。研究证实,A和B1链对南粳9108食味品质及回生性起重要作用,不同地区或栽培方式导致品种支链淀粉分支结构变异进而影响了南粳9108稻米食味品质,DP9、DP10、DP18和DP43可能在决定南粳9108稻米食味品质上具有重要作用。

关键词：食味品质 RVA谱特征值支链淀粉分支结构链长

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水稻粒型基因GS3、qGL3和GW2等基因系构建及遗传效应

水稻粒型基因GS3、qGL3和GW2等基因系构建及遗传效应

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江苏省遗传学会2019年学术研讨会

作者：孙旭超梁文化田铮赵春芳陈涛赵庆勇旦巴张亚东王才林江苏省农业科学院粮食作物研究所/江苏省优质水稻工程技术研究中心/国家水稻改良中心南京分中心

粒型是影响水稻产量的重要因素,粒型基因的遗传效应分析对水稻增产有重要意义。以大粒粳稻TD70为供体亲本和小粒籼稻Kasalath为受体亲本,通过连续回交与多代自交,结合标记辅助分别构建了GS3,q GL3和GW2单基因的近等基因系,并通过单基因... 详细信息

粒型是影响水稻产量的重要因素,粒型基因的遗传效应分析对水稻增产有重要意义。以大粒粳稻TD70为供体亲本和小粒籼稻Kasalath为受体亲本,通过连续回交与多代自交,结合标记辅助分别构建了GS3,q GL3和GW2单基因的近等基因系,并通过单基因系两两杂交制备获得了双基因纯合植株,本研究以此为材料分析了单基因及双基因组合对粒重的遗传效应,进一步阐述两两基因间的互作关系。结果表明,含有纯合GS3基因和杂合GS3基因的籽粒比无GS3基因的籽粒粒长分别增加12.63%和1.59%,千粒重分别增加14.68%和5.03%,纯合q GL3和杂合q GL3的籽粒比无q GL3基因的籽粒粒长别增加13.71%和8.00%,千粒重分别增加23.23%和11.28%。在GW2粒宽基因背景下,含GS3和qGL3粒长基因的籽粒比不含该基因籽粒的粒长和千粒重均增加,GS3-GW2双基因系比GS3单基因系籽粒的粒宽增加17.86%,千粒重增加36.10%;在GS3和qGL3粒长基因背景下,含有GW2基因的籽粒比不含该基因的籽粒的粒宽和千粒重也均增加,说明双基因组合具有累加效应。在双基因组合籽粒中,GS3和q GL3组合的粒长和千粒重最大,分别比单基因系GS3和q GL3籽粒长度增加19.76%和11.81%、千粒重增加33.10%和16.48%,是改造小粒型品种的良好基因组合。因此,在未来的育种过程中,可以利用不同的粒型基因来培育理想籽粒大小的水稻品种,为水稻株型的分子设计育种提供借鉴。

关键词：水稻粒型基因粒重 GS3 GW2 qGL3

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近等基因系转录组的比较分析深入揭示水稻小穗的发育

近等基因系转录组的比较分析深入揭示水稻小穗的发育

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江苏省遗传学会2019年学术研讨会

作者：梁文化孙旭超岳红亮田铮陈涛赵庆勇朱镇赵凌赵春芳周丽慧姚姝张亚东王才林江苏省农业科学院粮食作物研究所/江苏省优质水稻工程技术研究中心/国家水稻改良中心南京分中心

水稻粒型包括粒长、粒宽和粒厚三个基本要素,是影响产量和品质的重要农艺性状。GS3是水稻中控制粒长和粒重的主效QTL,对粒宽和粒厚也有一定的影响。大粒品种GS3基因第二外显子发生SNP突变导致翻译提前终止,表明GS3编码的蛋白对粒长和粒... 详细信息

水稻粒型包括粒长、粒宽和粒厚三个基本要素,是影响产量和品质的重要农艺性状。GS3是水稻中控制粒长和粒重的主效QTL,对粒宽和粒厚也有一定的影响。大粒品种GS3基因第二外显子发生SNP突变导致翻译提前终止,表明GS3编码的蛋白对粒长和粒重是负调控作用,其N端OSR结构域失去功能是形成长籽粒的原因。然而,GS3基因功能的缺失对幼穗时期表达谱的影响并不清晰。本研究以大粒粳稻TD70为供体,小粒籼稻Kasalath为背景构建了粒型基因GS3的近等基因系NIL-GS3和NIL-gs3,对等基因系NIL-GS3和NIL-gs3孕穗期的S (1-3cm),M (4-6cm) and L (8-10cm)三时期的幼穗取样,每个时期样品取三个生物学重复,共计18个小穗的样品深度测序,共获得59.48G的clean reads,平均每个样本3.3G的clean reads。利用软件Tophat将reads比对到参考基因组,特异性比对(unique alignment)到基因组中的比例介于82.5%-85.2%之间,平均为84.05%。组装后获得了116,184个转录本,来自58,658个基因,其中4,758个为新的转录本。对NIL-GS3和NIL-gs3相同时期的差异表达基因情况分析,结果显示,在S期一共有900个差异表达基因,491个在G404中上调表达,409个下调表达;M期共有1739个差异表达基因,其中759个上调表达,980个下调表达;L期有1895个差异表达基因,960个上调表达,935个下调表达,随着小穗的发育差异基因数目逐渐增多,暗示GS3基因影响了小穗发育后期更多基因的表达。近等基因系相同发育时期小穗的表达谱比较发现,在S、M和L三个时期均差异表达的基因为163个。为探究差异基因的生物学功能,我们对近等基因系小穗发育三个时期的差异基因进行显著富集的GO类别进行特征分析。按照三个主要的GO类别(生物进程、细胞组分和分子功能)对NIL-GS3和NIL-gs3三个时期(S、M、L)比较获得的差异表达基因(900、1739、1895)进行GO分析,一共注释到683个GO terms,每个功能组包含5-1175个基因,在小穗发育的S、M和L阶段分别得到399、646和466个GO terms。碳水化合物代谢进程、脂类代谢进程、膜系统、转录调节等12个Pathway在三个时期均显著富集到。细胞进程的调节、RNA代谢进程的调节、DNA依赖的转录调节等在S期和M期两个时期都富集到。由此可见GS3基因影响了幼穗发育过程中很多重要的代谢途径。通过RNA-Seq我们发现GS3基因引起了水稻幼穗发育相关基因的表达水平发生了剧烈变化,富集分析进一步揭示膜系统、转录调节、离子结合等代谢通路均受到GS3基因的影响,推测,GS3基因可能通过调节这些代谢通路的而影响水稻的籽粒大小。

关键词：水稻近等基因系 RNA-Seq GS3 幼穗

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江苏半糯粳稻与东北粳稻食味品质特性比较

江苏半糯粳稻与东北粳稻食味品质特性比较

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江苏省遗传学会2019年学术研讨会

作者：王才林张亚东赵春芳朱镇陈涛赵庆勇姚姝周丽慧赵凌路凯梁文化江苏省农业科学院粮食作物研究所/江苏省优质水稻工程技术研究中心/国家水稻改良中心南京分中心

东北地区灌浆期气温低、昼夜温差大、有机质含量高、施氮量低等有利的自然条件,促进了优质粳稻的生产。但江苏粳稻由于灌浆期间温度高、施氮量多,其外观品质和食味品质往往较差。近年来,江苏省水稻育种家利用Wx突变基因选育了一批低直... 详细信息

东北地区灌浆期气温低、昼夜温差大、有机质含量高、施氮量低等有利的自然条件,促进了优质粳稻的生产。但江苏粳稻由于灌浆期间温度高、施氮量多,其外观品质和食味品质往往较差。近年来,江苏省水稻育种家利用Wx突变基因选育了一批低直链淀粉含量的粳稻品种(即半糯粳稻)。虽然已有研究证实它们具有良好的食味品质,但半糯粳稻与东北粳稻的在食味品质特性上究竟有哪些差异尚不清楚。为阐明两种粳稻的食味品质特征,以16个包括五优稻4号、绥粳18、吉粳515、吉农大823、沈农1103、辽粳337在内的东北优质粳稻和16个包括南粳46、苏香粳100、宁粳8号、南粳9108、徐稻9号、南粳5718在内的江苏半糯型优良食味粳稻为材料,分析了两种类型粳稻在理化指标、淀粉糊化特性和感官食味评价上的差异。与东北粳稻相比,江苏半糯粳稻的直链淀粉含量明显较低,胶稠度显著提高,蛋白质含量和糊化温度略高。两种类型粳稻的RVA特征值差异较大。与东北粳稻相比,江苏半糯粳稻的峰值时间较短、峰值黏度相似,但热浆黏度和冷浆黏度显著降低,因而江苏半糯粳稻的崩解值显著大于东北粳稻,而消减值和回复值显著低于东北粳稻。感官评价结果,江苏半糯粳稻与东北粳稻的综合评分相似,但江苏半糯粳稻的气味值较高、外观和味道值较低、黏性值较高、回生度分值明显高于东北粳稻。直链淀粉含量较低是导致江苏半糯粳稻食味品质提高的主要原因,但优良食味品质的本质特性仍有待进一步研究。研究结果为进一步提高江苏半糯粳稻的食味品质提供了依据。

关键词：食味品质 RVA谱特征值半糯粳稻东北粳稻

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Wxmp基因背景下SSIIa和PUL基因蒸煮食味品质性状的遗传效应

Wxmp基因背景下SSIIa和PUL基因蒸煮食味品质性状的遗传效应

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江苏省遗传学会2019年学术研讨会

作者：姚姝张亚东刘燕清赵春芳周丽慧陈涛赵庆勇朱镇路凯梁文化王才林江苏省农业科学院粮食作物研究所/江苏省优质水稻工程技术研究中心/国家水稻改良中心南京分中心

本研究分析在同一主效基因（Wx）背景下可溶性淀粉合酶基因SSIIa和去分支酶基因PUL对稻米蒸煮食味品质性状的遗传效应,以期为水稻品质遗传改良提供依据。通过广泛筛选淀粉合成酶相关基因分子标记多态性,选择在淀粉合酶基因SSIIa和去分... 详细信息

本研究分析在同一主效基因（Wx）背景下可溶性淀粉合酶基因SSIIa和去分支酶基因PUL对稻米蒸煮食味品质性状的遗传效应,以期为水稻品质遗传改良提供依据。通过广泛筛选淀粉合成酶相关基因分子标记多态性,选择在淀粉合酶基因SSIIa和去分支酶基因PUL存在多态性差异的半糯品系宁0145和粳稻品种武运粳21号进行杂交,获得F2单株与F3株系。利用分子标记,选择含有Wxmp基因的F单株与F株系,将这些F单株与F株系分成SSIIaPUL、SSIIa PULb、SSIIab PUL和SSIIab PULb4种基因型（mp和b分别表示该基因来源于宁0145和武运粳21）,分析不同基因型的蒸煮食味品质性状及其差异,探讨同一Wxmp基因背景下SSIIa和PUL基因对蒸煮食味品质性状的遗传效应。不同基因型间蒸煮食味品质性状均存在显著差异,来源于武运粳21号的SSIIa基因和PUL基因分别使直链淀粉含量增加0.29%～1.00%和0.62%～1.18%,且PUL的效应大于SSIIa,两者间存在互作效应。SSIIab基因和PUL基因对GC（gel consistency, GC）、崩解值（breakdown viscosity,BDV）起降低作用,对最高粘度（peak viscosity, PKV）、冷胶粘度（cool paste viscosity, CPV）、消减值（setback viscosity,SBV）、回复值（consistency viscosity,CSV）起升高作用,对GT（gelatinization temperature, GT）、PKV和峰值时间（peak time,PeT）的作用较小。该研究结果为分子标记辅助改良稻米品质提供了育种材料和理论依据。

关键词：水稻半糯基因直链淀粉含量 SSIIa PUL 遗传效应

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稻瘟病广谱抗性基因Pigm特异性分子标记的开发和应用

稻瘟病广谱抗性基因Pigm特异性分子标记的开发和应用

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江苏省遗传学会2019年学术研讨会

作者：陈涛孙旭超张善磊梁文化周丽慧赵庆勇姚姝赵凌赵春芳朱镇张亚东王才林江苏省农业科学院粮食作物研究所/江苏省优质水稻工程技术研究中心/国家水稻改良中心南京分中心

来自籼稻品种谷梅4号中Pigm是一个对稻瘟病菌具有广谱、持久抗性的重要基因,开发具有特异性的共显性分子标记进行辅助选择,能有效提高抗病育种的选择效率。本研究在对谷梅4号与测序籼、粳品种Pigm位点基因组序列比对的基础上,寻找特异... 详细信息

来自籼稻品种谷梅4号中Pigm是一个对稻瘟病菌具有广谱、持久抗性的重要基因,开发具有特异性的共显性分子标记进行辅助选择,能有效提高抗病育种的选择效率。本研究在对谷梅4号与测序籼、粳品种Pigm位点基因组序列比对的基础上,寻找特异性核苷酸变异位点,利用Tetraprimer ARMS-PCR和KASP两种不同的基因分型技术开发分子标记对不同品种(品系)以及淮稻9号/谷梅4号的F2分离群体进行基因型检测,并结合穗颈瘟人工接种鉴定对标记的准确性进行评价。序列比对分析表明,谷梅4号Pigm位点中Pigm-Nbs2基因起始密码子上游515 bp处存在一个特殊的单核苷酸变异。利用已开发的两种类型的分子标记可以有效区分3种不同的基因型,且基因型与穗颈瘟人工接种鉴定的表型完全一致。利用Tetra-primer ARMS-PCR和KASP两种不同的分子标记技术,可以实现对Pigm基因型的快速、准确的检测,加快抗稻瘟病水稻新品种的选育进程。

关键词：稻瘟病 Pigm 特异性标记四引物扩增受阻突变体系PCR 竞争性等位基因特异性PCR

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近等基因系转录组的比较分析深入揭示水稻小穗的发育

近等基因系转录组的比较分析深入揭示水稻小穗的发育

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2019年中国作物学会学术年会

作者：梁文化孙旭超岳红亮赵春芳陈涛朱镇赵庆勇赵凌周丽慧姚姝张亚东江苏省农业科学院粮食作物研究所/江苏省优质水稻工程技术研究中心/国家水稻改良中心南京分中心

【研究背景】水稻粒型包括粒长、粒宽和粒厚三个基本要素,是影响产量和品质的重要农艺性状。GS3是水稻中控制粒长和粒重的主效QTL,对粒宽和粒厚也有一定的影响。大粒品种GS3基因第二外显子发生SNP突变导致翻译提前终止,表明GS3编码的蛋... 详细信息

【研究背景】水稻粒型包括粒长、粒宽和粒厚三个基本要素,是影响产量和品质的重要农艺性状。GS3是水稻中控制粒长和粒重的主效QTL,对粒宽和粒厚也有一定的影响。大粒品种GS3基因第二外显子发生SNP突变导致翻译提前终止,表明GS3编码的蛋白对粒长和粒重是负调控作用,其N端OSR结构域失去功能是形成长籽粒的原因。然而,GS3基因功能的缺失对幼穗时期表达谱的变化并不清晰;【材料与方法】本研究以大粒粳稻TD70为供体,小粒籼稻Kasalath为背景构建了粒型基因GS3的近等基因系NIL-GS3和NIL-gs3,对等基因系NIL-GS3和NIL-gs3孕穗期的S (1-3cm),M (4-6cm) and L (8-10cm)三时期的幼穗取样,每个时期样品取三个生物学重复,共计18个小穗的样品深度测序。以日本晴基因组序列为参考,利用软件包Tophat和Cufflinks进行数据分析。通过ClusterProfile程序包利用GO(Geneontology)数据库和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)代谢数据库进行富集分析;【结果与分析】近等基因系NIL-GS3和NIL-gs3的小穗发育不同时期的18个测序文库,共获得59.48G的cleanreads,平均每个样本3.3G的clean reads。利用软件Tophat将reads成功比对到参考基因组,特异性比对(unique alignment)到基因组中的比例位于82.5%-85.2%之间,平均为84.05%。组装后获得了116,184个转录本,来自58,658个基因,其中发现4,758为新的转录本。对NIL-GS3和NIL-gs3相同时期的差异表达基因情况分析,结果显示,在S期一共有900个差异表达基因,491个在G404中上调表达,409个下调表达;M期共有1739个差异表达基因,其中759个上调表达,980个下调表达;L期有1895个差异表达基因,960个上调表达,935个下调表达,随着小穗的发育差异基因数目逐渐增多,暗示GS3基因影响了小穗发育后期更多基因的表达。近等基因系相同时期比较发现,在S、M和L三个时期均差异表达的基因为163个。为探究差异基因的生物学功能,我们对近等基因系小穗发育三个时期的差异基因进行显著富集的GO类别进行特征分析。按照三个主要的GO类别(生物进程、细胞组分和分子功能)对NIL-GS3和NIL-gs3三个时期(S、M、L)比较获得的差异表达基因(900、1739、1895)进行GO分析,一共注释到683个GOterms,每个功能组包含5-1175个基因,在小穗发育的S、M和L阶段分别得到399、646和466个GOterms。碳水化合物代谢进程、脂类代谢进程、膜系统、转录调节等12个Pathway在三个时期均显著富集到。细胞进程的调节、RNA代谢进程的调节、DNA依赖的转录调节等在S期和M期两个时期都富集到。由此可见GS3基因影响了幼穗发育过程中很多重要的代谢途径;【结论】通过RNA-Seq我们发现GS3基因引起了水稻幼穗中大量的基因表达水平发送了变化,富集分析进一步揭示了膜系统、转录调节、离子结合等代谢通路均受到GS3基因的影响,推测,GS3基因可能通过调节这些代谢通路的而影响水稻的籽粒大小。

关键词：水稻近等基因系 RNA-Seq GS3 幼穗

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不同地点南粳9108稻米直链淀粉含量及RVA谱特征值分析

不同地点南粳9108稻米直链淀粉含量及RVA谱特征值分析

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江苏省遗传学会2019年学术研讨会

以2014年和2015年分别在江苏省18个地区种植的南粳9108稻谷为材料,测定其稻米直链淀粉含量和RVA谱特征值,对不同地点南粳9108稻米直链淀粉含量和RVA谱特征值的变异及相关性进行分析。结果表明:两年不同地点种植的南粳9108稻米直链淀粉... 详细信息

以2014年和2015年分别在江苏省18个地区种植的南粳9108稻谷为材料,测定其稻米直链淀粉含量和RVA谱特征值,对不同地点南粳9108稻米直链淀粉含量和RVA谱特征值的变异及相关性进行分析。结果表明:两年不同地点种植的南粳9108稻米直链淀粉含量的差异均达极显著水平。纬度最高的东海直链淀粉含量最高(10.76%、10.95%),纬度最低的南京地区最低(8.42%、9.61%),其余地区均在10%左右徘徊。RVA谱特征值分析显示,RVA谱特征值在不同地点和不同年份间也存在差异,2015年RVA谱特征值的变异系数均明显高于2014年。不同地点RVA谱各特征值变化不一致,糊化温度和峰值时间基本比较稳定,差异较小,其余特征值差异均较大,消减值的变异最大,2014年变异系数从大到小排序分别为消减值、回复值、崩解值、最低黏度、最终黏度、峰值黏度、糊化温度和峰值时间,2015年排序为消减值、最低黏度、最终黏度、崩解值、回复值、峰值黏度、峰值时间和糊化温度。两年36个地点种植的南粳9108稻米AC与RVA谱特征值进行相关分析显示,直链淀粉含量与糊化温度呈极显著负相关,与回复值、峰值时间呈显著正相关,与峰值黏度、最低黏度、最终黏度、消减值正相关,与崩解值负相关,但均未达显著水平。

关键词：南粳9108 种植地点直链淀粉含量 RVA谱特征值

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