检索结果-内蒙古大学图书馆

江苏农业学报 2020年第4期36卷 801-813页

作者：梁文化孙旭超岳红亮田铮陈涛赵庆勇朱镇赵凌赵春芳姚姝路凯王才林张亚东江苏省农业科学院粮食作物研究所/江苏省优质水稻工程技术研究中心/国家水稻改良中心南京分中心江苏南京210014

以特大粒水稻品系TD70和小粒籼稻品种Kasalath不同发育时期的幼穗为材料,进行转录组测序。将获得的干净读长(Clean read)以日本晴(Nipponbare)基因组序列为参考序列进行比对得到唯一读长(即特异比对到参考基因组的read),利用FPKM(Fragme... 详细信息

以特大粒水稻品系TD70和小粒籼稻品种Kasalath不同发育时期的幼穗为材料,进行转录组测序。将获得的干净读长(Clean read)以日本晴(Nipponbare)基因组序列为参考序列进行比对得到唯一读长(即特异比对到参考基因组的read),利用FPKM(Fragments per kilobase of transcript per million fragments mapped)法计算基因的表达水平,用GO和KEGG数据库对差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs)进行功能注释、富集和代谢通路分析。结果表明,在水稻幼穗发育的早、中、后3个时期分别获得3618个、4183个和5254个差异表达基因,共有4374个差异表达基因得到基因本体(Gene ontology,GO)功能注释,主要涉及DNA结合、细胞进程、信号转导、细胞增殖、物质转运等方面。KEGG数据库分析结果显示,差异表达基因共涉及119条代谢通路,主要包括淀粉和蔗糖代谢通路、内质网中的蛋白质加工通路、激素信号转导通路、细胞周期蛋白通路等。

关键词：水稻粒型 RNA-Seq 幼穗转录组

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水稻GLW7基因功能标记的开发和基因效应分析

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江苏农业学报 2020年第2期36卷 257-264页

作者：梁文化孙旭超陈涛岳红亮田铮赵凌赵庆勇赵春芳朱镇张亚东王才林江苏省农业科学院粮食作物研究所/江苏省优质水稻工程技术研究中心/国家水稻改良中心南京分中心江苏南京210014

根据水稻粒长和粒质量调控基因GLW7已知功能位点的核苷酸差异设计分子标记,并对国内外搜集的315份籼、粳稻品种资源进行基因型检测,分析其不同基因型的分布。同时,通过粒型性状的测定,分析该基因的遗传效应,评估其育种利用价值。结果表... 详细信息

根据水稻粒长和粒质量调控基因GLW7已知功能位点的核苷酸差异设计分子标记,并对国内外搜集的315份籼、粳稻品种资源进行基因型检测,分析其不同基因型的分布。同时,通过粒型性状的测定,分析该基因的遗传效应,评估其育种利用价值。结果表明,设计的功能标记能准确、有效地区分出201 bp和190 bp 2种带型,即大粒(Large grain haplotype,LGH)和小粒(Small grain haplotype,SGH)2种等位变异。从籼、粳亚种间的基因型分布来看,籼亚种中LGH和SGH的比例分别为95.65%和4.35%,而粳亚种中LGH和SGH比例分别为25.50%和74.50%,2种等位变异的分布在籼粳亚种间存在明显差异。粒型的测定结果表明,含不同等位变异的品种在粒长、粒厚、长宽比和千粒质量上存在显著或极显著差异,而粒宽则没有明显差异。进一步通过籼、粳分类分析发现,亚种间2种等位变异对粒型的效应并不完全一致,但都具有提高籽粒质量的作用。

关键词：水稻粒型 GLW7基因功能分子标记

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稻瘟病广谱抗性基因Pigm特异性分子标记的开发和应用

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中国水稻科学 2020年第1期34卷 28-36页

作者：陈涛孙旭超张善磊梁文化周丽慧赵庆勇姚姝赵凌赵春芳朱镇张亚东王才林江苏省农业科学院粮食作物研究所/江苏省优质水稻工程技术研究中心/国家水稻改良中心南京分中心南京210014 扬州大学江苏省粮食作物现代产业技术协同创新中心江苏扬州225009

【目的】来自籼稻品种谷梅4号的Pigm是一个对稻瘟病菌具有广谱和持久抗性的重要基因。为有效提高Pigm基因的选择效率,有必要开发具有特异性的共显性分子标记进行辅助育种。【方法】本研究根据谷梅4号Pigm位点存在的特异性核苷酸变异,利... 详细信息

【目的】来自籼稻品种谷梅4号的Pigm是一个对稻瘟病菌具有广谱和持久抗性的重要基因。为有效提高Pigm基因的选择效率,有必要开发具有特异性的共显性分子标记进行辅助育种。【方法】本研究根据谷梅4号Pigm位点存在的特异性核苷酸变异,利用Tetra-primerARMS-PCR和KASP两种不同的基因分型技术开发出分子标记T-Pigm和K-Pigm,对不同品种(品系)以及淮稻9号/谷梅4号的F2分离群体进行基因型检测,并结合穗颈瘟人工接种鉴定,对标记的准确性进行评价。【结果】序列比对分析表明,谷梅4号Pigm位点中Pigm-Nbs2基因起始密码子上游515 bp处存在一个特殊的单核苷酸变异。利用已开发的两种类型的分子标记能够有效区分3种不同的基因型,且基因型与穗颈瘟人工接种鉴定结果完全一致。【结论】利用分子标记T-Pigm和K-Pigm可以实现对Pigm基因型快速、准确的检测,加快抗稻瘟病水稻新品种的选育进程。

关键词：稻瘟病 Pigm 特异性标记四引物扩增受阻突变体系PCR 竞争性等位基因特异性PCR

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高代转玉米C_(4)-pepc基因水稻株系形态和产量特性及其聚类分析

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江苏农业科学 2021年第17期49卷 91-95,106页

作者：王净周兴雅张金飞曹悦吴博晗李霞南京林业大学生物与环境学院江苏南京210037 江苏省农业科学院粮食作物研究所/江苏省优质水稻工程技术研究中心/国家水稻改良中心南京分中心江苏南京210014 江苏省粮食作物现代产业技术协同创新中心江苏扬州225009 南京农业大学生命科学学院江苏南京210095 江苏大学环境与安全工程学院江苏镇江212013

为获得高光效的转C_(4)型PEPC(磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶phosphoenolpyruvate carboxylase,PEPC,EC.1.1.31)基因水稻(简称PC)高代的稳定株系,选取2019—2020年种植的同一株系的PC材料,分析PC材料的形态、光合参数、酶活性以及产量构成因... 详细信息

为获得高光效的转C_(4)型PEPC(磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶phosphoenolpyruvate carboxylase,PEPC,EC.1.1.31)基因水稻(简称PC)高代的稳定株系,选取2019—2020年种植的同一株系的PC材料,分析PC材料的形态、光合参数、酶活性以及产量构成因子等的变化特点,并将各参数进行聚类分析。结果表明,PC高代材料的PEPC酶活性、净光合速率以及产量构成因子等指标的确存在年度间和株系间的变化,其中变异系数表现为产量构成因子<净光合速率

关键词：水稻 PEPC酶净光合速率产量因子聚类分析

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水稻光温敏核不育基因tms5与pms3的互作效应

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作物学报 2020年第3期46卷 317-329页

作者：王芳权范方军夏士健宗寿余郑天清王军李文奇许扬陈智慧蒋彦婕陶亚军仲维功杨杰江苏省农业科学院粮食作物研究所/国家水稻改良中心南京分中心/江苏省优质水稻工程技术研究中心江苏南京210014 扬州大学江苏省粮食作物现代产业技术协同创新中心江苏扬州225009 中国农业科学院作物科学研究所北京100081

tms5与pms3是水稻的光温敏核不育基因,其功能位点已经明确,然而它们在两系不育系中的效应尚不清楚。本研究针对tms5与pms3基因功能位点,分别设计了功能标记AS-TMS5和CAPS-PMS3。经鉴定发现,这2个功能标记能准确区分不育、可育性状对应... 详细信息

tms5与pms3是水稻的光温敏核不育基因,其功能位点已经明确,然而它们在两系不育系中的效应尚不清楚。本研究针对tms5与pms3基因功能位点,分别设计了功能标记AS-TMS5和CAPS-PMS3。经鉴定发现,这2个功能标记能准确区分不育、可育性状对应的隐性纯合、杂合和显性纯合3种基因型。利用AS-TMS5和CAPS-PMS3对培矮64S/9311、广占63S/湘恢47和粤光S/宁恢108的F2群体单株的基因型及育性的关系分析发现,tms5基因是广占63S和粤光S控制光温敏不育性状的主效基因,而pms3基因在培矮64S和粤光S中并不能独立起作用,还需要与其他基因共同调控。进一步分析粤光S/宁恢108的F2:3群体基因型与育性的关系,发现在粤光S/宁恢108背景下,携带pms3基因的株系几乎都表现可育,而携带tms5基因的株系在较高气温条件下表现不育,但育性转换温度可能较高;而携带tms5与pms3基因的株系育性转换温度比仅携带tms5基因的株系低,这为聚合2个基因选育不育性状稳定的光温敏不育系提供了思路和方法。

关键词： tms5 pms3 功能标记光敏不育温敏不育

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Wx^mp基因背景下可溶性淀粉合成酶基因SSⅡa和去分支酶基因PUL对水稻蒸煮食味品质的影响

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中国水稻科学 2020年第3期34卷 217-227页

作者：姚姝张亚东刘燕清赵春芳周丽慧陈涛赵庆勇朱镇 Balakrishna PILLAY 王才林江苏省农业科学院粮食作物研究所/江苏省优质水稻工程技术研究中心/国家水稻改良中心南京分中心南京210014 夸祖鲁-纳塔尔大学(西维尔校区)农业工程科学院生命科学系南非德班

【目的】分析在同一主效基因(Wx^mp)背景下可溶性淀粉合成酶基因SSⅡa和去分支酶基因PUL对稻米蒸煮食味品质的影响,以期为水稻品质遗传改良提供依据。【方法】选择在SSⅡa和PUL存在多态性而其他淀粉合成酶相关基因没有多态性的半糯品系... 详细信息

【目的】分析在同一主效基因(Wx^mp)背景下可溶性淀粉合成酶基因SSⅡa和去分支酶基因PUL对稻米蒸煮食味品质的影响,以期为水稻品质遗传改良提供依据。【方法】选择在SSⅡa和PUL存在多态性而其他淀粉合成酶相关基因没有多态性的半糯品系宁0145和粳稻品种武运粳21进行杂交,获得F2群体与F3株系。利用分子标记,选择含有Wx^mp基因的F2单株与F3株系,将这些F2单株与F3株系分成SSⅡa^nPUL^n、SSⅡa^nPUL^w、SSⅡa^wPUL^n和SSⅡa^wPUL^w4种基因型(n和w分别表示该基因来源于宁0145和武运粳21),分析不同基因型蒸煮食味品质性状的差异,探讨同一Wxmp基因背景下不同SSⅡa和PUL等位基因对蒸煮食味品质性状的影响。【结果】不同基因型间蒸煮食味品质性状均存在显著差异,来源于武运粳21的SSⅡa^w基因和PUL^w基因分别使直链淀粉含量增加0.29%~1.00%和0.62%~1.18%,且PUL的效应大于SSⅡa,两者间存在互作效应。SSⅡa^w基因和PUL^w基因降低胶稠度和崩解值,提高了热浆黏度、冷胶黏度、消减值和回复值,对糊化温度、峰值黏度和峰值时间的作用较小。【结论】明确了Wx^mp背景下SSⅡa和PUL基因对稻米蒸煮食味品质的遗传效应,该研究结果为SSⅡa和PUL基因的分子标记辅助选择改良稻米品质提供了理论依据。

关键词：半糯基因蒸煮食味品质可溶性淀粉合成酶基因极限糊精酶基因等位基因效应

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镉对水稻及种植土壤影响的研究进展

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江苏农业科学 2021年第18期49卷 25-33页

作者：吴博晗吴向阳李霞曹悦王净江苏大学环境与安全工程学院江苏镇江212013 江苏省农业科学院粮食作物研究所/江苏省优质水稻工程技术研究中心/国家水稻改良中心南京分中心江苏南京210014 江苏省粮食作物现代产业技术协同创新中心江苏扬州225009 南京农业大学生命科学学院江苏南京210095 南京林业大学生物与环境学院江苏南京210037

稻米镉污染已成为影响全球粮食安全的重大问题,介绍镉对水稻的影响以及土壤承载镉的阈值2个方面的研究现状,从镉对水稻生长过程中的形态、生理特性、种植土壤及其微生物的影响、水稻在吸收镉过程中几个主要途径及参与水稻运输镉过程的... 详细信息

稻米镉污染已成为影响全球粮食安全的重大问题,介绍镉对水稻的影响以及土壤承载镉的阈值2个方面的研究现状,从镉对水稻生长过程中的形态、生理特性、种植土壤及其微生物的影响、水稻在吸收镉过程中几个主要途径及参与水稻运输镉过程的运输蛋白家族等方面,结合土壤对镉的钝化与解毒机制,分析了水稻镉污染的有效缓解途径,并整理了相关的土壤修复措施,并对未来研究进行展望。

关键词：镉污染水稻土壤环境运输蛋白

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江苏省半糯粳稻食味品质特征及其与感官评价的关系

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中国粮油学报 2020年第6期35卷 7-14,22页

作者：岳红亮赵庆勇赵春芳田铮陈涛梁文化张亚东王忠红王才林西藏农牧学院植物科学学院林芝860000 江苏省农业科学院粮食作物研究所江苏省优质水稻工程技术研究中心国家水稻改良中心南京分中心南京210014)

为了明确江苏省半糯粳稻稻米品质的理化基础,以34份江苏省粳稻为实验材料,对16个稻米品质性状进行了分析。结果表明,34份粳稻的感官评价值均较高。半糯粳稻在气味、黏性、口感、回生度、综合食味值上显著高于普通粳稻。与普通粳稻相比,... 详细信息

为了明确江苏省半糯粳稻稻米品质的理化基础,以34份江苏省粳稻为实验材料,对16个稻米品质性状进行了分析。结果表明,34份粳稻的感官评价值均较高。半糯粳稻在气味、黏性、口感、回生度、综合食味值上显著高于普通粳稻。与普通粳稻相比,半糯粳稻的直链淀粉含量(AC)和蛋白质含量(PC)较低,而胶稠度(GC)较大;在RVA谱上,半糯粳稻表现出更大的崩解值(BDV)和峰值黏度(PV)、更小的消减值(SBV)、热浆黏度(TV)和最终黏度(FV)、更短的峰值时间(Pet);在蒸煮特性上,半糯粳稻的米粒延伸性和延伸指数大于普通粳稻,而米汤碘蓝值、米汤pH值、米饭吸水率则小于普通粳稻。相关性和主成分分析表明,AC、PC、FV、SBV、Pet、米汤碘蓝值和米汤溶出物可作为筛选优质粳稻品种的参考指标。

关键词：粳稻蒸煮食味品质直链淀粉含量米粒延伸性米汤溶出物

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水稻Wxmp背景下SSⅡa和SSⅢa等位变异及其互作对蒸煮食味品质的影响

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作物学报 2020年第11期46卷 1690-1702页

作者：姚姝张亚东刘燕清赵春芳周丽慧陈涛赵庆勇朱镇 Balakrishna Pillay 王才林江苏省农业科学院粮食作物研究所/江苏省优质水稻工程技术研究中心/国家水稻改良中心南京分中心江苏南京210014 夸祖鲁-纳塔尔大学(西维尔校区)农业工程科学院生命科学系南非夸祖鲁-纳塔尔省德班市4000

为了明确Wxmp基因背景下不同半糯粳稻品质差异的原因,以淀粉合成酶基因SSⅡa和SSⅢa表现多态性而其他淀粉合成相关基因无多态性的武粳13和关东194 (Milky Princess)杂交后代衍生的64个半糯品系为材料,分析了Wxmp基因背景下, SSⅡa和SSⅢ... 详细信息

为了明确Wxmp基因背景下不同半糯粳稻品质差异的原因,以淀粉合成酶基因SSⅡa和SSⅢa表现多态性而其他淀粉合成相关基因无多态性的武粳13和关东194 (Milky Princess)杂交后代衍生的64个半糯品系为材料,分析了Wxmp基因背景下, SSⅡa和SSⅢa基因等位变异对直链淀粉含量(amylose content, AC)、胶稠度(gel consistency, GC)、糊化温度(gelatinization temperature,GT)及RVA谱特征值的影响。结果表明,SSⅡa和SSⅢa等位变异对AC、GC、GT和RVA谱特征值都有显著影响,且2个基因间存在互作效应。SSⅡa2和SSⅢa2 (2表示该基因来源于非半糯亲本武粳13)有使AC增高的趋势,分别使AC提高1.87%和1.23%, 2年结果基本接近。单个SSⅡa和SSⅢa等位变异对GT无显著影响,而基因型SSⅡa1SSⅢa1(1表示该基因来源于半糯亲本关东194)的GT比SSⅡa2SSⅢa2高1.34℃,达显著水平,表明2个基因的互作对GT有显著影响。GC在不同基因型间均存在极显著差异, SSⅡa2和SSⅢa1可分别使GC增加8.74mm和9.62mm。从2个基因的互作效应来看,基因型SSⅡa2SSⅢa1的GC比基因型SSⅡa1SSⅢa2和SSⅡa2SSⅢa2分别增加10.64 mm和16.95 mm。SSⅡa2使最高黏度、热浆黏度、冷胶黏度、崩解值增加,回复值和消减值下降;而SSⅢa2的效应则相反。2个基因的互作效应,最高黏度、热浆黏度和冷胶黏度均以SSⅡa2SSⅢa1最大,崩解值和回复值均以SSⅡa2SSⅢa2最大,消减值SSⅡa2SSⅢa1最小。本研究结果为半糯粳稻蒸煮食味品质的改良提供了一定的理论依据。

关键词：半糯粳稻 SSIIa SSⅢa 蒸煮食味品质等位基因效应互作

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优质高产糯稻新品种南粳糯3号的选育与特征特性

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大麦与谷类科学 2024年第6期41卷 63-68页

作者：赵庆勇朱镇陈涛李余生梁文化赵春芳赫磊王才林张亚东江苏省农业科学院粮食作物研究所/江苏省优质水稻工程技术研究中心/国家水稻改良中心南京分中心江苏南京210014

南粳糯3号是江苏省农业科学院粮食作物研究所利用抗病高产粳稻新品系JD7007与优质高产糯稻大华香糯杂交配组,利用常规育种与分子标记辅助选择相结合育成的早熟晚粳糯稻新品种。该品种具有株高适中、抗倒性好、穗型较大、丰产性稳产性好... 详细信息

南粳糯3号是江苏省农业科学院粮食作物研究所利用抗病高产粳稻新品系JD7007与优质高产糯稻大华香糯杂交配组,利用常规育种与分子标记辅助选择相结合育成的早熟晚粳糯稻新品种。该品种具有株高适中、抗倒性好、穗型较大、丰产性稳产性好、品质优、熟相好等优点。在2021—2022年江苏省水稻区域试验中南粳糯3号平均产量704.2 kg/667 m^(2),稻米品质达NY/T 593—2021《食用稻品种品质》标准1级,中感稻瘟病、条纹叶枯病和白叶枯病。2024年通过江苏省农作物品种审定委员会审定(审定编号:苏审稻20240088),适宜在江苏省沿江及苏南地区种植。

关键词：优质高产南粳糯3号选育特征特性

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