检索结果-内蒙古大学图书馆

梅山猪氨肽酶基因N(pAPN)cDNA克隆、序列分析及重要变异位点的筛选

农业生物技术学报 2014年第9期22卷 1141-1148页

作者：刘颖董文华孙寿永吴正常夏芃芃朱国强包文斌吴圣龙扬州大学动物科学与技术学院/江苏省动物遗传繁育与分子设计重点实验室扬州大学兽医学院

氨肽酶N（aminopeptidase N,APN）蛋白是猪（Sus scrofa）传染性胃肠炎病毒（Transmissible gastroenteritis virus,TGEV）和猪的流行性腹泻病毒（Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV）等一系列冠状病毒的受体蛋白。为探讨梅山猪APN基因的分子结构特征以及重要的变异位点,本研究通过PCR扩增和测序技术,结合生物信息学分析梅山猪APN基因功能区域和重要变异位点,对其蛋白质结构进行预测和分析。结果表明,梅山猪APN基因cDNA全长2 886 bp（GenBank登录号:KF280271）,含有20个外显子,编码961个氨基酸。与GenBank数据库公布的标准序列（登录号:NM;14277.1）相比,梅山猪APN基因编码区变异共引起10处氨基酸突变与2处氨基酸缺失,其中Phe82Asn、Leu107Phe、Leu108 Ile、Ser330Pro、Trp399Arg和Glu465 Gly等6处突变位于APN酶催化活性区域,Gln747His突变、748Tyr和749Ser缺失突变位于APN病毒结合区域。蛋白结构和编码产物功能分析发现,pAPN为不稳定的亲水性蛋白,无信号肽,具有1个跨膜螺旋(跨膜区位于12;4氨基酸,二级结构元件以α螺旋和β折叠为主,编码产物主要参与细胞被膜（cell envelope）、中央中间代谢（central intermediary metabolism）、辅酶因子生物合成（biosynthesis of cofactors）等功能。Gln747His、748Tyr和749Ser缺失突变可能与氨肽酶N结合病毒能力有关。本研究对梅山猪pAPN基因功能的分析及变异位点的筛选,为今后筛选猪抗病毒性腹泻的有效遗传标记提供理论基础。

关键词：猪流行性腹泻氨肽酶N基因(APN) 变异位点

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Myf5基因8个SNPs位点与京海黄鸡生长和繁殖性状的关联分析

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畜牧兽医学报 2014年第6期45卷 863-870页

作者：唐莹王金玉张跟喜樊庆灿陈学森张涛魏岳施会强扬州大学动物科学与技术学院扬州225009 江苏省动物遗传繁育与分子设计重点实验室扬州225009 江苏京海集团南通226103

旨在探讨Myf5基因与鸡生长繁殖性状的关联性。本研究采用PCR-SSCP方法,检测Myf5基因在京海黄鸡群体中的多态性,并对这些多态位点进行单倍型关联分析。结果表明:在Myf5基因外显子处共检测到8个SNPs位点。在379只京海黄鸡的群体中形成了9... 详细信息

旨在探讨Myf5基因与鸡生长繁殖性状的关联性。本研究采用PCR-SSCP方法,检测Myf5基因在京海黄鸡群体中的多态性,并对这些多态位点进行单倍型关联分析。结果表明:在Myf5基因外显子处共检测到8个SNPs位点。在379只京海黄鸡的群体中形成了9种单倍型。最小二乘分析结果显示,在生长性状方面,单倍型组合H1H5对8和12周龄体重影响显著(P<0.05),单倍型组合H2H6则对12和14周龄体重影响显著(P<0.05);在繁殖性状方面,单倍型组合H1H5在开产体重上为优势单倍型组合,显著高于单倍型组合H1H4和H2H4(P<0.05),极显著高于单倍型组合H1H3(P<0.01)。就300d蛋重均值来说,单倍型组合H1H3为劣势单倍型组合;对300d的产蛋数数据分析显示,单倍型组合H1H3的300d产蛋数极显著高于H1H4(P<0.01)。因此,京海黄鸡Myf5基因外显子的多态性对其生长和繁殖性状都有一定影响,为探索鸡育种过程中的标记辅助选择提供了参考资料。

关键词：京海黄鸡 Myf5基因生长和繁殖性状 SNPs 单倍型

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扬州鹅及其4个杂交配套组合肌肉组织学特性研究

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扬州大学学报（农业与生命科学版） 2014年第3期35卷 33-37页

作者：王剑锋崔璐璐谢恺舟陈书琴刘建宇戴国俊李拥军赵万里扬州大学动物科学与技术学院/江苏省动物遗传繁育与分子设计重点实验室江苏扬州225009

为研究扬州鹅及其杂交配套组合肌肉组织学性状对肉品质的影响,以70日龄扬州鹅(A×A)及其4个杂交配套组合(K×B、K×A、C×A和S×A)为研究对象,检测不同群体扬州鹅胸肌、腿肌的肌纤维结构和肌肉剪切力。结果表明:5... 详细信息

为研究扬州鹅及其杂交配套组合肌肉组织学性状对肉品质的影响,以70日龄扬州鹅(A×A)及其4个杂交配套组合(K×B、K×A、C×A和S×A)为研究对象,检测不同群体扬州鹅胸肌、腿肌的肌纤维结构和肌肉剪切力。结果表明:5个群体中,无论公母鹅,胸肌肌纤维面积、肌纤维直径极显著小于腿肌;K×B群体的肌肉组织形状(肌纤维面积、肌纤维直径、A带、H带、I带和肌节长度)在5个群体的公、母鹅中具有显著的优越性,同时肌肉嫩度也显著优于其他群体。综合而言,不同群体组织之间虽然存在显著或极显著差异,但K×B群体的组织学特性相对优于其他4个群体,在5个鹅群体中肉品质最好。

关键词：扬州鹅杂交配套组合肌肉组织学性状

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不同获能液及不同处理方法对兔精子获能的影响

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中国畜牧杂志 2014年第9期50卷 32-35页

作者：张光景张佳慧杨波张静蔡缪荧郝同杨李拥军扬州大学动物科学与技术学院江苏省动物遗传繁育与分子设计重点实验室江苏扬州225009

本研究主要是为了探讨体外受精过程中不同获能液及不同处理方法对精子获能的影响。本实验采用BO液和TCM199液2种获能液,分别使用上游法和洗涤法对精子进行获能处理,通过分析各组的精子存活时间、活精子百分率和顶体反应率,从而选择最佳... 详细信息

本研究主要是为了探讨体外受精过程中不同获能液及不同处理方法对精子获能的影响。本实验采用BO液和TCM199液2种获能液,分别使用上游法和洗涤法对精子进行获能处理,通过分析各组的精子存活时间、活精子百分率和顶体反应率,从而选择最佳的精子获能组合方法。结果表明:采用BO液和TCM199液2种获能液,分别使用上游法和洗涤法对精子获能处理,其对精子存活时间的影响差异均不显著(P>0.05);在相同获能液的条件下,2种不同的精子获能方法对活精子百分率的影响差异均不显著(P>0.05);在相同的精子获能处理方法条件下,采用BO液对活精子百分率的影响均显著高于TCM199液培养组(P<0.05);采用BO液培养,2种不同的精子获能方法对精子顶体反应率的影响差异显著(P<0.05),采用上游法处理时,2种不同获能培养液对精子顶体反应率的影响差异显著(P<0.05)。

关键词：精子获能上游法洗涤法精子存活时间顶体反应兔

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京海黄鸡GnRHR基因克隆、生物信息学及组织表达分析

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华北农学报 2014年第5期29卷 45-53页

作者：张涛张跟喜王金玉樊庆灿王文浩韩昆鹏王永娟扬州大学动物科学与技术学院江苏省动物遗传繁育与分子设计重点实验室江苏扬州225009 江苏京海集团江苏南通226103

旨在根据GenBank上公布的原鸡GnRHR基因序列设计2对引物,采用RT-PCR方法,从京海黄鸡肌肉组织中克隆GnRHR基因的编码区序列,并使用多种生物软件和在线工具对目的序列进行生物信息学分析,分析GnRHR基因与其他物种的同源性、蛋白质的理化... 详细信息

旨在根据GenBank上公布的原鸡GnRHR基因序列设计2对引物,采用RT-PCR方法,从京海黄鸡肌肉组织中克隆GnRHR基因的编码区序列,并使用多种生物软件和在线工具对目的序列进行生物信息学分析,分析GnRHR基因与其他物种的同源性、蛋白质的理化性质、蛋白质序列的跨膜区、亚细胞定位、亲水性、潜在的磷酸化位点、保守结构域及该基因编码蛋白的二级结构、三级结构等。同时为GnRHR基因和β-actin基因各设计1对引物,采用RT-qPCR的方法研究GnRHR基因在京海黄鸡12个组织和器官中的表达情况。最终成功克隆了京海黄鸡GnRHR基因完整的编码区序列和部分侧翼序列,Blast结果显示,京海黄鸡GnRHR基因与原鸡、番鸭、藏羚羊、野猪、马、小鼠、大鼠、家兔、绵羊、人、牛、黑猩猩和斑马鱼的同源性分别为99.7%,86.7%,55.7%,54.6%,52%,51.6%,50.8%,50%,49.9%,49.6%,49.4%,47.4%和39.3%,并成功构建系统发育树。蛋白质结构分析显示,GnRHR蛋白分子量为45.432 kDa,理论等电点为9.55,包含20种氨基酸,其中,亮氨酸含量最高,占13.8%,赖氨酸含量最低,占0.7%;不稳定系数为65.35,显示该蛋白不稳定;脂溶指数为95.54,总平均疏水指数为0.312,为非水溶性蛋白;该蛋白不属于分泌型蛋白,主要存在于胞膜上,没有信号肽结构,存在16个潜在磷酸化位点和11个糖基化位点;保守结构域分析显示存在2个低复杂度序列和7段跨膜结构,跨膜分析显示该蛋白为7次跨膜蛋白,二级结构预测结果显示,在GnRHR二级结构中,α-螺旋占29.83%,β-折叠占17.18%,无规则卷曲占52.98%,GnRHR蛋白三级结构为复杂的7次跨膜螺旋结构,且为单链蛋白。组织表达分析显示,GnRHR基因主要在垂体中高表达,表达量显著高于其他组织,在其他11个组织和器官中表达量较低。

关键词：京海黄鸡 GnRHR 克隆生物信息学分析组织表达

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鸡抗球虫病的研究进展

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中国畜牧兽医 2014年第8期41卷 210-214页

作者：林雨鑫孙明明戴国俊张菁菁扬州大学动物科学与技术学院江苏扬州225009 江苏省动物遗传繁育与分子设计重点实验室江苏扬州225009

随着分子生物学和基因工程的发展,减少疾病损失、提高畜禽产品质量、实施无公害生产的抗病育种研究已成为趋势。文章就目前鸡球虫病的防制现状,鸡球虫病预防的药物和疫苗的研究开发,特别是对鸡球虫病抗病育种研究进展进行了综述。尽管... 详细信息

随着分子生物学和基因工程的发展,减少疾病损失、提高畜禽产品质量、实施无公害生产的抗病育种研究已成为趋势。文章就目前鸡球虫病的防制现状,鸡球虫病预防的药物和疫苗的研究开发,特别是对鸡球虫病抗病育种研究进展进行了综述。尽管鸡球虫病的预防目前仍以药物和疫苗为主,但从长远来看,通过鸡球虫病的抗病育种,从而培育抗病鸡新品种或新品系将成为疾病防控的新途径。

关键词：鸡球虫药物免疫抗病育种

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溧阳鸡线粒体DNA D-loop区遗传多样性研究

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黑龙江畜牧兽医 2014年第9期 72-74页

作者：钮广林刘靖张跟喜王金玉龚道清扬州大学动物科学与技术学院江苏扬州225009 江苏省动物遗传繁育与分子设计重点实验室江苏扬州225009

为了研究溧阳鸡线粒体DNA(mtDNA)D-loop区遗传多样性,试验采用PCR产物直接测序法对30只溧阳鸡mtDNA的D-loop区序列进行分析。结果表明:溧阳鸡549 bp D-loop区序列的T、C、A、G平均含量分别为30.0%、29.9%、27.1%、13.0%,共检测到19个突... 详细信息

为了研究溧阳鸡线粒体DNA(mtDNA)D-loop区遗传多样性,试验采用PCR产物直接测序法对30只溧阳鸡mtDNA的D-loop区序列进行分析。结果表明:溧阳鸡549 bp D-loop区序列的T、C、A、G平均含量分别为30.0%、29.9%、27.1%、13.0%,共检测到19个突变位点,其中单一多态位点3个,简约多态位点16个;序列的核苷酸多样性为0.007 63,单倍型多样性为0.662;共获得7种单倍型,其中Hap单倍型占56.7%,群体内遗传距离为0.008。结合NJ系统发生树发现,溧阳鸡存在3个分支,揭示溧阳鸡在遗传组成上具有3个母系来源。

关键词：溧阳鸡单倍型线粒体DNA(mtDNA) 遗传多样性

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京海黄鸡MyoG基因密码子特性分析

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华北农学报 2014年第4期29卷 71-79页

作者：张涛张跟喜韩昆鹏王金玉樊庆灿李婷婷段炼王永娟扬州大学动物科学与技术学院江苏扬州225009 江苏省动物遗传繁育与分子设计重点实验室江苏扬州225009 江苏京海集团江苏南通226103

为了解鸡MyoG基因的密码子特性,以便于为MyoG基因的表达选择合适的外源表达系统,使用在线工具CUSP和CHIPS以及codonW软件对鸡MyoG基因进行分析,并与鸡基因、模式动物基因组和其他动物MyoG基因进行比较。结果表明,MyoG基因偏好于G/C结尾... 详细信息

为了解鸡MyoG基因的密码子特性,以便于为MyoG基因的表达选择合适的外源表达系统,使用在线工具CUSP和CHIPS以及codonW软件对鸡MyoG基因进行分析,并与鸡基因、模式动物基因组和其他动物MyoG基因进行比较。结果表明,MyoG基因偏好于G/C结尾的密码子,CDS序列中,GC含量大于AT含量。MyoG基因与鸡其他31个基因密码子偏好性相似,均偏好于G/C结尾的密码子。与其他物种基因组密码子偏好性比较结果显示,密码子偏好性与小鼠差异最小,说明小鼠可以作为MyoG基因外源表达的宿主。与其他动物MyoG基因密码子偏好性比较显示,MyoG基因在包括京海黄鸡在内的32个物种中均有较高表达,几乎所有MyoG基因编码区对GC有较强的偏好性。基于RSCU值的聚类和基于CDS区系统发育树结果显示,亲缘关系近的物种之间倾向于拥有相似的密码子偏好性。

关键词：京海黄鸡 MyoG 密码子偏好性聚类分析

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京海黄鸡BMP-4基因突变位点的发现及其对生长和繁殖性状的遗传效应

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中国畜牧杂志 2014年第5期50卷 6-9页

作者：张跟喜邢世宇钮广林胡东胜张向前王金玉扬州大学动物科学与技术学院.江苏扬州225009 江苏省动物遗传繁育与分子设计重点实验室江苏扬州225009

本研究采用DNA池直接测序法寻找京海黄鸡BMP-4基因外显子4区域的多态位点,用PCR-SSCP技术检测发现的多态位点在京海黄鸡中的单核苷酸多态性,并分析其对京海黄鸡生长和繁殖性状的遗传效应。结果表明:在外显子4区域检测到2个突变位点(C701... 详细信息

本研究采用DNA池直接测序法寻找京海黄鸡BMP-4基因外显子4区域的多态位点,用PCR-SSCP技术检测发现的多态位点在京海黄鸡中的单核苷酸多态性,并分析其对京海黄鸡生长和繁殖性状的遗传效应。结果表明:在外显子4区域检测到2个突变位点(C701T,A967G);C701T位点经PCR-SSCP分析显示2种基因型(AA和AB),其中AA型为优势基因型。最小二乘分析表明,C701T位点对京海黄鸡的生长和繁殖性状均无显著影响(P>0.05)。

关键词：骨形态发生蛋白-4 多态性遗传效应京海黄鸡

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柔嫩艾美耳球虫感染对京海黄鸡不同组织中Zyxin、CD4和TNFRSF1A基因mRNA表达的影响

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畜牧兽医学报 2014年第8期45卷 1369-1374页

作者：孙明明林雨鑫戴国俊张菁菁张跟喜谢恺舟王金玉顾玉萍王永娟扬州大学动物科学与技术学院扬州225009 江苏省动物遗传繁育与分子设计重点实验室扬州225009 江苏京海禽业集团有限公司海门226103

为了探讨Zyxin、CD4、TNFRSF1A 3个球虫抗性相关基因在雏鸡感染柔嫩艾美耳球虫后表达量的变化,本研究以京海黄鸡为试验动物,对感染柔嫩艾美耳球虫雏鸡的10个组织进行了荧光定量分析,结果发现,Zyxin、CD4、TNFRSF1A基因在感染柔嫩艾美耳... 详细信息

为了探讨Zyxin、CD4、TNFRSF1A 3个球虫抗性相关基因在雏鸡感染柔嫩艾美耳球虫后表达量的变化,本研究以京海黄鸡为试验动物,对感染柔嫩艾美耳球虫雏鸡的10个组织进行了荧光定量分析,结果发现,Zyxin、CD4、TNFRSF1A基因在感染柔嫩艾美耳球虫后的雏鸡多数组织中表达量变化较大。感染组Zyxin基因在腺胃、小肠等组织表达量较高,除肺、肝、肾和心肌组织外,Zyxin基因表达量均极显著高于对照组(P<0.01);感染组雏鸡CD4基因在脾、肺、胸腺等免疫器官中的表达量极显著高于对照组(P<0.01);感染后TNFRSF1A基因在小肠和盲肠中表达量最高,且感染组小肠、盲肠、脾、腺胃和胸腺中的表达量与对照组差异也极显著(P<0.01)。但法氏囊中3个基因的表达量均较低,且仅Zyxin基因差异显著,提示法氏囊在球虫感染过程中可能并未起到重要作用。鸡柔嫩艾美耳球虫主要寄生在盲肠组织中,Zyxin和TNFRSF1A基因在感染后的盲肠组织中表达量的极显著升高(P<0.01),说明这2个基因与鸡球虫的感染关系密切,可能在雏鸡感染过程中起重要作用。

关键词：感染柔嫩艾美耳球虫基因表达京海黄鸡

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