目的利用生物信息学技术分析跨膜7超家族成员2(transmembrane 7 superfamily member 2,TM7SF2)基因在结直肠癌中的表达及其与患者预后的关系。方法利用癌症基因组图谱数据库下载结直肠癌组织和正常组织的表达谱数据和临床资料,并对TM7SF...
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目的利用生物信息学技术分析跨膜7超家族成员2(transmembrane 7 superfamily member 2,TM7SF2)基因在结直肠癌中的表达及其与患者预后的关系。方法利用癌症基因组图谱数据库下载结直肠癌组织和正常组织的表达谱数据和临床资料,并对TM7SF2进行差异分析及临床相关性分析。通过单因素及多因素Cox回归分析,评估TM7SF2基因表达水平对患者预后的影响。下载基因集并用基因集变异分析(gene set variation analysis,GSVA)算法评分评估样本生物学功能变化;根据TM7SF2基因表达水平将患者分为高、低组,并用基因集合富集分析信号通路差异;运用CIBERSORT工具评估肿瘤免疫细胞浸润与TM7SF2关系;预测该基因的药物化疗敏感度,并分析TM7SF2基因表达与结直肠癌患者临床指标间的相关性。结果与正常组织比较,肿瘤组织的TM7SF2表达量上调,TM7SF2基因高表达与结直肠癌患者预后不良相关。通过单因素和多因素Cox回归模型分析,TM7SF2表达水平可作为结直肠癌患者预后的独立因素。通路富集分析结果显示,TM7SF2可能在DNA复制、Wnt信号通路及戊糖磷酸等途径中发挥作用。TM7SF2表达水平与调节性T细胞和CD8^(+)T细胞呈正相关,与记忆性CD4^(+)T细胞和中性粒细胞呈负相关。在药物敏感度方面,TM7SF2表达水平与喜树碱、顺铂、多西他赛、尼洛替尼、奥拉帕尼、阿昔替尼的敏感度具有相关性。结论TM7SF2在结直肠癌组织中高表达,与患者预后不良相关,可作为预后生物标志物。
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