目的通过对杜仲LBD基因家族进行全面鉴定,以期为EuLBDs基因功能深入研究提供依据。方法以杜仲基因组数据库为基础,利用生物信息学方法,对杜仲LBD基因家族进行全面鉴定和表达模式分析。结果从杜仲基因组中共鉴定到19个EuLBDs,分为Class I与Class II 2大类,进一步划分为6个亚家族(Ia、Ib、Ic、Id与IIa、IIb)。理化性质分析显示:EuLBDs编码152~293个氨基酸,理论等电点分布于4.62~9.91,相对分子质量区域为17420~31820,均为亲水性蛋白,以α-螺旋和不规则卷曲为主,亚细胞定位于细胞核中。EuLBD基因家族含有类锌指、亮氨酸拉链和甘氨酸-丙氨酸-丝氨酸(GAS)保守结构域。表达模式分析显示,EuLBDs参与杜仲叶片发育,随着叶片发育,水平逐渐降低,EuLBDs基因表达不受叶片胶含量的影响。结论从杜仲基因组水平对LBD基因家族进行了全面鉴定和生物信息学分析,为进一步研究杜仲LBDs基因功能奠定基础。
目前,泛癌图谱计划已实现从单个肿瘤类型的分子描述到跨越不同肿瘤类型的分子分析,在癌症易感性变异、致癌通路共现与互斥、生物调控网络紊乱和病毒感染对癌症的影响等方面均有不同程度的进展。泛癌计划的研究模式和研究内容是对癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据的整合和升华,与中医整体观念有一定程度的契合,尤其是与中医先天禀赋、五行理论、六淫外袭等理论有相通之处。但TCGA数据多来自原发肿瘤,而临床患者通常死于复发转移,故需进一步探讨癌前病变、首要病变、转移性肿瘤与药物治疗敏感性或耐药性的关系。
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