目的支气管哮喘是严重影响全球公众健康的重大慢病之一,通过使用GEO数据集和孟德尔随机化方法确定哮喘新的遗传靶点,为临床治疗和机制研究提供依据。方法通过基因表达综合数据库(GEO)获得相关数据集,获得数据后进行差异基因的表达数量性状位点(expression quantitative trait locus,eQTL)分析和孟德尔随机化(mendelian randomization,MR)分析,确定潜在靶点;再通过基因集合富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)和基因本体论(gene ontology,GO)/京都基因和基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析来探索这些基因的功能和富集通路;通过免疫浸润方法探索靶点与相关免疫细胞的关联;利用医学本体信息检索平台Coremine Medical数据库,筛选核心基因相关治疗中药并进行归纳分析,最后设立外部验证集进行验证。结果共鉴定出280个高表达基因和1127个低表达基因;MR分析确定了12个与哮喘显著相关的核心基因靶点:PGAP3、FAM177A1、UGDH、AASDH、CREB1、ZNF429、CCNG2、SKAP2、ANKRD10、DR1、ISOC1以及LPAR6;预测出人参、五味子、麻黄、杜仲、北沙参等67味靶向中药,主要涉及补虚药、活血化瘀药;MR分析结果与外部验证集的结果一致,强调了本研究的可靠性。结论筛选并验证了12个哮喘潜在靶点,并对相关干预中药进行了预测,为进一步深入探究哮喘的发病机制、早期筛查诊断、早期预防、靶向治疗以及中医药临床诊疗提供了新的线索。
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