检索结果-内蒙古大学图书馆

化学研究与应用 2024年第3期36卷 572-580页

作者：鲁文凤路嘉瑞韩迪高云龙徐永涛新乡医学院医学工程学院河南新乡453003 新乡市生物医学信息研究重点实验室河南新乡453003 河南省神经信息分析与药物智能设计国际联合实验室河南新乡453003

本研究选择前期设计出来的6个白藜芦醇衍生物LSD1抑制剂R1~R6,通过分子对接、分子动力学模拟、分子力学/广义玻恩表面积(MM/GBSA)等计算模拟方法探索了这些衍生物与HDAC8的相互作用模式以及结合自由能。以HDAC8的共晶配体CRA-A作为参考... 详细信息

本研究选择前期设计出来的6个白藜芦醇衍生物LSD1抑制剂R1~R6,通过分子对接、分子动力学模拟、分子力学/广义玻恩表面积(MM/GBSA)等计算模拟方法探索了这些衍生物与HDAC8的相互作用模式以及结合自由能。以HDAC8的共晶配体CRA-A作为参考,结果显示,白藜芦醇衍生物R1~R6均能以双齿配位的形式与Zn^(2+)结合,与HDAC8有效结合。在分子动力学模拟的过程中,小分子的羟肟酸基团的两个氧原子始终与Zn^(2+)双齿配位,且6个白藜芦醇衍生物始终在HDAC8的疏水腔内。R1~R6与HDAC8的结合自由能计算结果表明,R1和R3与HDAC8的结合能力最强(分别为-200.00 kcal·mol^(-1)和-202.62 kcal·mol^(-1)),和其与LSD1的结合能力一致。其中,静电相互作用是主要的稳定因素。能量分解结果揭示ASP164、ASP253和HIS166是小分子与HDAC8结合过程中的关键氨基酸。

关键词：组蛋白去乙酰化酶白藜芦醇衍生物分子对接分子动力学模拟双靶点抑制剂

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

基于丁酸钠的新型HDAC4抑制剂的设计与模拟

引用

化学研究与应用 2023年第7期35卷 1556-1564页

作者：贾梦珠韩迪路嘉瑞高云龙徐永涛新乡医学院医学工程学院河南新乡453003 河南省临床与生物医学大数据融合技术工程实验室河南新乡453003 河南省神经信息分析与药物智能设计国际联合实验室河南新乡453003

组蛋白的乙酰化水平异常与多种癌症相关。研究表明,与组蛋白乙酰化水平调控相关的组蛋白去乙酰化酶4(Histone deacetylase 4,HDAC4)在鼻咽癌、胃癌、直肠癌等癌症患者体内的表达明显高于正常水平。本研究以对HDAC4具有一定活性的丁酸钠(... 详细信息

组蛋白的乙酰化水平异常与多种癌症相关。研究表明,与组蛋白乙酰化水平调控相关的组蛋白去乙酰化酶4(Histone deacetylase 4,HDAC4)在鼻咽癌、胃癌、直肠癌等癌症患者体内的表达明显高于正常水平。本研究以对HDAC4具有一定活性的丁酸钠(Sodium Butyrate,NaBu)为结构基础,采用基于片段的药物设计方法(Fragment-based drug design,FBDD)设计出五个小分子化合物SBD1、SBD2、SBD3、SBD4和SBD5,进而综合利用分子对接、分子动力学模拟以及ADMET预测等分子模拟方法对这些化合物与HDAC4的作用模式进行了探索。结合自由能结果显示在丁酸钠的结构基础上适当延长linker并在尾部引入芳香环,可以有效增强此类抑制剂与HDAC4的结合强度。通过能量分解和氢键分析考察了新抑制剂与HDAC4之间的关键相互作用。此外,通过ADMET预测,所有新设计的丁酸钠衍生物均具有良好的类药性和药代动力学特性,可以作为潜在的HDAC4抑制剂。研究结论可以为新型HDAC4抑制剂的设计提供理论基础。

关键词：组蛋白去乙酰化酶4抑制剂基于片段的药物设计分子动力学模拟分子力学/广义波恩模型表面积 ADMET预测

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

光声换能器的材料组成及应用进展

引用

传感器技术与应用 2022年第4期10卷 528-537页

作者：王甲琼谢凯任武蒋文帅于毅范晓峰新乡医学院医学工程学院河南省神经传感与控制工程技术研究中心河南省神经信息分析与药物智能设计国际联合实验室河南新乡

光声换能器是近年来迅速发展的一种新型器件,它可以将吸收的光能转换为声能并以超声波的形式发射出去。相比于传统压电型超声换能器,光声换能器具有灵敏度高、带宽大、制作工艺简单等优点,在工业无损检测和医学成像领域具有巨大的应用... 详细信息

光声换能器是近年来迅速发展的一种新型器件,它可以将吸收的光能转换为声能并以超声波的形式发射出去。相比于传统压电型超声换能器,光声换能器具有灵敏度高、带宽大、制作工艺简单等优点,在工业无损检测和医学成像领域具有巨大的应用潜力。本文就近年光声换能器的材料组成、制作方法和应用进展进行了综述。

关键词：光声换能器复合薄膜光声效应医学成像无损检测

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

生物医学工程领域研究生课程虚拟仿真教学实践——以《生物医学仪器分析》课程为例

引用

教育进展 2023年第10期13卷 7343-7349页

作者：范晓峰蒋文帅秦鑫高智贤赵宗亚任武于毅新乡医学院医学工程学院河南省神经传感与控制工程技术研究中心河南省神经信息分析与药物智能设计国际联合实验室河南新乡

生物医学工程是理、工、医多学科高度融合的交叉性学科,在进行虚拟仿真实验项目建设时必须考虑其学科特点。该文分析了生物医学工程领域研究生实验课程存在的问题,提出了在实验教学过程中实施虚拟仿真实验教学的必要性,并介绍了本校生... 详细信息

生物医学工程是理、工、医多学科高度融合的交叉性学科,在进行虚拟仿真实验项目建设时必须考虑其学科特点。该文分析了生物医学工程领域研究生实验课程存在的问题,提出了在实验教学过程中实施虚拟仿真实验教学的必要性,并介绍了本校生物医学工程研究生培养中综合性虚拟仿真实验教学项目建设的实践经验。

关键词：生物医学工程研究生课程虚拟仿真实验

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

基于图卷积神经网络和拓扑特征的微核糖核酸-疾病关联预测模型

引用

生物医学工程研究 2023年第2期42卷 122-130页

作者：畅豫霄董亚东徐永涛新乡医学院医学工程学院新乡453003 河南省临床与生物医学大数据融合技术工程实验室新乡453003 郑州大学第一附属医院互联网医疗系统与应用国家工程实验室郑州450052 河南省神经信息分析与药物智能设计国际联合实验室新乡453003

针对在微核糖核酸(micro ribonucleic acid,miRNA)-疾病关联性研究中信息使用不充分,且过度依赖网络节点的相似度信息,预测准确率较低的问题,本研究提出了基于图卷积神经网络(graph convolutional neural networks,GCN)及拓扑特征的miRN... 详细信息

针对在微核糖核酸(micro ribonucleic acid,miRNA)-疾病关联性研究中信息使用不充分,且过度依赖网络节点的相似度信息,预测准确率较低的问题,本研究提出了基于图卷积神经网络(graph convolutional neural networks,GCN)及拓扑特征的miRNA和疾病的关联预测计算模型GTMDA。该模型综合miRNA相似度矩阵、疾病语义相似度网络和miRNA-疾病关联关系矩阵,首先使用GCN和随机游走算法,分别获取miRNA和疾病的子图顶点嵌入特征及miRNA与疾病相似性网络的拓扑结构特征;然后将其输入多层感知器(multilayer perceptron,MLP),预测潜在关联性。结果表明,该模型的AUC值达到0.9475±0.0106,优于其他方法。此外,预测的前50个miRNA中,84%的乳腺恶性肿瘤、90%的食管癌和94%的肺癌得到了独立数据库的验证。因此,本研究模型可作为预测miRNA-疾病潜在关联的可靠模型。

关键词：链路预测高斯相互作用谱核相似性卷积运算分类特征图迭代无向图特征十折交叉验证

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

基于碳纳米管和聚二甲基硅氧烷的光声换能器研究

引用

生物医学工程研究 2024年第3期43卷 238-245页

作者：王甲琼赵攀云李梦雨赵树林蒋文帅任武赵宗亚于毅范晓峰新乡医学院医学工程学院新乡453003 青岛农业大学网络信息管理处青岛266109 新乡医学院河南省神经信息分析与药物智能设计国际联合实验室新乡453003 新乡医学院河南省神经传感与控制工程技术研究中心新乡453003

为探究激光参数、光声转换层厚度对光声换能器输出声压的影响,本研究通过COMSOL仿真软件建立了光声换能器的物理模型。首先,基于聚二甲基硅氧烷(polydimethylsiloxane, PDMS)和碳纳米管(carbon nanotube, CNT)分别建立CNT、CNT-PDMS转... 详细信息

为探究激光参数、光声转换层厚度对光声换能器输出声压的影响,本研究通过COMSOL仿真软件建立了光声换能器的物理模型。首先,基于聚二甲基硅氧烷(polydimethylsiloxane, PDMS)和碳纳米管(carbon nanotube, CNT)分别建立CNT、CNT-PDMS转换层模型;其次,改变激光脉冲持续时间和转换层厚度,对转换层输出声压进行测量;最后,对激光脉冲持续时间和转换层厚度所引起换能器输出声压强度的改变进行分析。结果表明,当CNT和CNT-PDMS转换层的厚度均为200μm、激光脉冲持续时间分别在10~30 ns和50 ns左右时,换能器能输出较高声压强度的超声波。仿真结果对光声换能器的研究有一定的指导意义。

关键词：复合薄膜光声效应有限元模拟光吸收热膨胀激光能量密度

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：

通借通还

建议与咨询 留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

请选择保存的检索档案： 新增检索档案 确定 取消

请选择收藏分类： 新增自定义分类 确定 取消

通借通还

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：