利用微卫星技术监测大耳白黑眼兔(white hair black eyes rabbits,WHBE兔)近交培育中第五代(F5)、第六代(F6)和第七代(F7)的遗传多样性。选取21个微卫星座位,筛选出扩增产物稳定并且具有多态性的11对微卫星引物用于本研究。结果表明,F5...
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利用微卫星技术监测大耳白黑眼兔(white hair black eyes rabbits,WHBE兔)近交培育中第五代(F5)、第六代(F6)和第七代(F7)的遗传多样性。选取21个微卫星座位,筛选出扩增产物稳定并且具有多态性的11对微卫星引物用于本研究。结果表明,F5代WHBE兔在每个座位上的等位基因数(Na)为3~9个不等,11个座位的平均有效等位基因数(Ne)为1.81个,平均观察杂合度(Ho)和平均多态信息含量(PIC)分别为0.381和0.524,累积个体识别率(CDP)达到100%,累积非父排除概率(CPE)在双亲信息都是未知情况下的为0.926,而在得知任一亲本信息的情况下,CPE值为0.993。F6代WHBE兔在每个座位上的Na为3~8个不等,11个座位的平均Ne为1.68个,平均Ho和PIC值分别为0.356和0.548,CDP达到100%,CPE在双亲信息都是未知情况下的为0.931,而在得知任一亲本信息的情况下,CPE值为0.994。F7代WHBE兔在每个座位上的Na为2~6个不等,11个座位的Ne为1.51个,平均Ho和PIC值分别为0.287和0.498,CDP达到100%,CPE在双亲信息都是未知情况下的为0.891,而在得知任一亲本信息的情况下,CPE值为0.986。在近交系培育过程中,从F5代到F7代,WHBE兔的平均Ne和平均Ho都呈下降趋势,提示随着近交代数的增加,WHBE兔的基因纯合度越来越高。
目的从肠道菌群途径分析雄性日本大耳白兔黑眼系(white hair and black eyes rabbit,WHBE兔)和日本大耳白兔胆固醇代谢的差异性。方法各取4~5月龄雄性WHBE兔和日本大耳白(JW)兔6只,取血检测血脂水平,并取结肠内容物提取DNA后进行16S rRN...
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目的从肠道菌群途径分析雄性日本大耳白兔黑眼系(white hair and black eyes rabbit,WHBE兔)和日本大耳白兔胆固醇代谢的差异性。方法各取4~5月龄雄性WHBE兔和日本大耳白(JW)兔6只,取血检测血脂水平,并取结肠内容物提取DNA后进行16S rRNA微生物测序,观察肠道菌群结构与功能的变化。结果雄性WHBE兔血清总胆固醇(TC)和低密度脂蛋白-胆固醇水平(LDL-C)均明显低于JW兔(P<0.05)。多样性分析显示,两品系兔的肠道微生物群分离明显,WHBE兔Chao1指数显著低于JW兔(P<0.05)。在门水平,WHBE兔梭杆菌门、软壁菌门和蓝藻菌门的丰度低于JW兔(P<0.05,P<0.01),且厚壁菌门/拟杆菌门比值亦低于JW兔(P>0.05)。在属水平,WHBE兔中有24个菌属的相对丰度与JW兔存在显著性差异(P<0.05,P<0.01)。LEFSe分析显示,WHBE兔中发现了5个关键菌属,以理研菌科RC9群(Rikenellaceae_RC9_gut_group)最多;JW兔中发现了10个关键菌属,以瘤胃球菌科UCG-014(Ruminococcaceae_UCG_014)最多。PICRUSt功能预测显示,两品系兔肠道菌群中的花生四烯酸代谢和醚脂代谢途径存在显著差异(P<0.05,P<0.01)。相关性分析显示,TC和LDL-C水平与短波单胞菌属(Brevundimonas)、回肠杆菌属(Ileibacterium)、梭杆菌属(Fusobacterium)、罗尔斯顿菌属(Ralstonia)、Mollicutes_RF39_unclassified呈正相关,与Coriobacteriaceae_unclassified、厌氧菌属(Anaerovorax)、梭菌属(Clostridium)、DTU014_unclassified、Barnesiellaceae_unclassified、瘤胃球菌科UCG-009(Ruminococcaceae_UCG_009)、Clostridiales_vadinBB60_group_unclassified呈负相关。结论雄性WHBE兔和JW兔胆固醇代谢的差异性与宿主的肠道菌群结构与功能差异有关,其中肠道菌群中的花生四烯酸代谢和醚脂代谢途径尤为关键。
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