检索结果-内蒙古大学图书馆

环境科学 2025年第1期46卷 409-418页

作者：刘昕悦程建华唐翔宇浙江农林大学林业与生物技术学院亚热带森林培育国家重点实验室杭州311300

吸附和迁移是抗生素在土壤中的重要环境行为,能够决定粪肥源抗生素在环境中的去向,然而以长期施用粪肥土壤为对象的相关研究却较为缺乏.因此,以浙江省长期施用不同粪肥(鸡粪和猪粪)的红壤、黄壤以及石灰土为对象,通过批量平衡吸附实验... 详细信息

吸附和迁移是抗生素在土壤中的重要环境行为,能够决定粪肥源抗生素在环境中的去向,然而以长期施用粪肥土壤为对象的相关研究却较为缺乏.因此,以浙江省长期施用不同粪肥(鸡粪和猪粪)的红壤、黄壤以及石灰土为对象,通过批量平衡吸附实验和填装土柱穿透实验,研究4种常用兽用抗生素(磺胺二甲基嘧啶、氟苯尼考、强力霉素和恩诺沙星)在土壤中吸附和迁移行为.结果表明,线性和Freundlich模型均能较好地拟合目标抗生素的等温吸附线;线性模型对弱吸附性抗生素(磺胺二甲基嘧啶和氟苯尼考)的拟合效果更好,而Freundlich模型对强吸附性抗生素(强力霉素和恩诺沙星)的拟合效果则更好.抗生素的吸附特征受到土壤类型和粪肥种类的双重影响.磺胺二甲基嘧啶和氟苯尼考的线性吸附常数(Kd)与土壤有机碳含量、pH值均呈显著的线性正相关,其吸附主要受控于土壤有机质,非静电作用(氢键、疏水相互作用等)在吸附中起主导作用;强力霉素和恩诺沙星的吸附参数则与土壤pH、有机碳含量和阳离子交换量均未表现出显著的相关性,多种吸附机制(疏水相互作用、氢键、静电相互作用等)共同起作用.磺胺二甲基嘧啶和氟苯尼考在土柱中表现出高穿透率(分别在37.5%~92.3%和45.8%~112.6%范围内),易于淋失;强力霉素和恩诺沙星在土柱中则未发生穿透,几乎完全为土壤所滞留.磺胺二甲基嘧啶和氟苯尼考的最大相对浓度、穿透率均与Kd呈显著的线性负相关,因此,利用基于批量平衡实验和土柱实验建立的回归方程,可由吸附常数预测抗生素淋失潜力.

关键词：土壤粪肥抗生素吸附迁移

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杉木GRF和GIF基因家族鉴定、表达与互作分析

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核农学报 2024年第7期38卷 1224-1233页

作者：邱姗王文新江梅黄华宏林二培浙江农林大学林业与生物技术学院/亚热带森林培育国家重点实验室浙江杭州311300

生长调节因子(GRF)和GRF相互作用因子(GIF)在植物的生长发育和逆境胁迫响应中发挥重要作用。为研究GRF和GIF基因在杉木生长发育和逆境胁迫响应中的功能,本研究基于杉木全长转录组数据,利用生物信息学手段共鉴定获得5个ClGRFs基因和2个Cl... 详细信息

生长调节因子(GRF)和GRF相互作用因子(GIF)在植物的生长发育和逆境胁迫响应中发挥重要作用。为研究GRF和GIF基因在杉木生长发育和逆境胁迫响应中的功能,本研究基于杉木全长转录组数据,利用生物信息学手段共鉴定获得5个ClGRFs基因和2个ClGIFs基因。分析结果显示,ClGRFs氨基酸残基数目范围为386(ClGRF4)~723 aa(ClGRF3),等电点为7.07(ClGRF4)~9.26(ClGRF5);2个ClGIFs蛋白氨基酸数目分别为242和258 aa,等电点均在6左右,蛋白质分子质量分别为25.64和27.96 kDa。保守结构域和基序分析发现ClGRFs蛋白均含QLQ和WRC结构域,ClGIFs蛋白均含SSXT结构域,且高度保守。进一步分析结果显示,ClGRFs分别属于进化枝Ⅲ和进化枝Ⅵ,且均受miR396调控。表达分析结果表明,ClGRFs基因的表达具有一定的组织特异性,而ClGIFs在不同组织呈组成性表达,且ClGRFs和ClGIFs基因均能响应赤霉素(GA3)和水杨酸(SA)的处理。酵母双杂交结果表明5个ClGRFs蛋白和2个ClGIFs蛋白均存在互作关系。本研究结果为进一步研究杉木GRF和GIF基因的功能提供了理论基础。

关键词：杉木 GRF基因 GIF基因表达分析互作

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巨桉SNAC基因家族的鉴定及其在非生物逆境下的表达分析

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农业生物技术学报 2024年第1期32卷 115-131页

作者：洪家都倪晓祥俞键烽吴梦洁赵爽程龙军浙江农林大学林业与生物技术学院/亚热带森林培育国家重点实验室

巨桉(Eucalyptus grandis)是我国南方重要用材树种，但其抗逆性较差，限制了其栽培范围的扩大和栽培效益的提高。NAC类转录因子是植物特有的转录因子家族，广泛参与植物生长、发育、代谢和逆境响应，其中非生物逆境响应相关的NAC被称为S... 详细信息

巨桉(Eucalyptus grandis)是我国南方重要用材树种，但其抗逆性较差，限制了其栽培范围的扩大和栽培效益的提高。NAC类转录因子是植物特有的转录因子家族，广泛参与植物生长、发育、代谢和逆境响应，其中非生物逆境响应相关的NAC被称为SNAC(stress-related NAC)。本研究在巨桉全基因组范围鉴定的166个NAC和文献报道的74个SNAC的基础上，通过进化分析，筛选EgrSNAC家族成员，并分析其基因、蛋白序列结构、染色体定位、共线性关系、基因重复情况和启动子的顺式作用元件，以及不同组织中的表达模式，并对巨桉幼苗进行低温、干旱、高盐、脱落酸(abscisic acid, ABA)和茉莉酸甲酯(methyl jasmonate, MeJA)处理，利用qPCR分析EgrSNAC基因在这些逆境处理下的表达。结果表明，巨桉中共有22个EgrSNAC基因，分别属于ATAF、NAP和AtNAC3亚家族。除EgrSNAC20外，这些基因编码的蛋白均包含典型的NAM结构域的5个子域，对应Motif1～Motif5。22个基因分布在9条染色体上，有4个共线性基因对以及由11个EgrSNAC基因组成的2个串联重复基因区段。启动子顺式作用元件分析显示，EgrSNAC启动子上分布有多种逆境响应元件。EgrSNAC中串联重复基因的组织特异性表达模式类似。4℃低温处理不同时间的qPCR分析表明，除EgrSNAC1、EgrSNAC3和EgrSNAC22外，其他19个EgrSNAC表达均受低温诱导；对干旱有响应的有19个EgrSNAC，除EgrSNAC2、EgrSNAC5、EgrSNAC14和EgrSNAC21表达被抑制外，其他均被干旱诱导；高盐处理下，有19个EgrSNAC表达发生变化，且仅EgrSNAC21被高盐抑制。另外响应ABA(100μmol/L)处理的14个基因均被诱导；而MeJA(100μmol/L)处理下表达有变化的基因有13个为诱导型，4个为抑制型。本研究结果揭示了不同EgrSNAC基因与低温、干旱、高盐和ABA、MeJA等非生物逆境因子之间的关系，为进一步研究巨桉EgrSNAC基因资源提供了参考。

关键词：巨桉 SNAC基因家族非生物逆境表达

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巨桉C2H2锌指蛋白基因家族EgrZFP-EARs鉴定及其在非生物逆境下的表达模式分析

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农业生物技术学报 2024年第8期32卷 1792-1808页

作者：俞键烽洪家都赵爽李笑眉温丹丹程龙军浙江农林大学林业与生物技术学院/亚热带森林培育国家重点实验室

桉树(Eucalyptus spp.)是我国南方栽培的重要速生用材树种，但其抗逆性较差。含有乙烯响应元件结合因子相关两亲抑制(ethylene-responsive element binding factor-associated amphiphilic repression,EAR)基序的锌指蛋白(zinc finger protein, ZPF)转录因子成员被证明广泛参与植物对低温、高温、干旱和高盐等非生物逆境响应。本研究在全基因组范围内鉴定巨桉(Eucalyptus grandis) C2H2型ZFP的基础上，进一步分析含有EAR基序的EgrZFP-EAR成员。对这些基因的进化关系，所含EAR基序类型、数量，染色体定位和基因复制情况，以及基因、蛋白序列结构，启动子上的顺式作用元件等进行了分析。并利用转录组数据及qRT-PCR分析了EgrZFP-EAR在不同组织及低温(4℃)、高温(42℃)、干旱、NaCl (300 mmol/L)、ABA (100μmol/L)和MeJA (100μmol/L)处理下的表达模式。结果表明，巨桉中共含有118个C2H2型ZFP，其中57个为EgrZFP-EAR成员，包括54个Q-型和3个非Q-型C2H2型ZFP;EgrZFP-EAR中所含EAR基序有3种类型：LxLxL、DLNx(x)P及二者的重叠型。其中含LxLxL类型的EAR基序数量最多，共98个。基因组复制、串联重复及区段重复在这些基因扩张过程中都发挥了作用。EgrZFP-EAR启动子上分布着如逆境响应元件(stress responsive element, STRE)、干旱响应元件(dehydration responsive element,DRE)、干旱诱导的MYB结合位点(MYB-binding site, MBS)和低温响应元件(low temperature responsive element, LTRE)等多种逆境响应元件以及ABA响应元件(ABA-responsive element, ABRE)和MeJA响应元件CGTCA-motif、TGACG-motif等激素响应元件。组织表达模式大致分为4个类型：茎尖和幼叶高表达型、韧皮部高表达型、成熟木质部高表达型以及韧皮部、未成熟和成熟木质部均高表达型。而在4℃不同时间(2, 6,12, 24, 48 h)处理的巨桉幼苗叶片中，EgrZFP-EAR基因的表达分为3种类型：持续诱导型、先升后降型和低温抑制型。高温、干旱、NaCl和ABA、MeJA处理的巨桉幼苗叶片中，来自于不同亚类的12个EgrZFP-EAR基因对不同逆境因子也有不同响应。总之，EgrZFP-EAR基因响应逆境的种类和模式有很大差异，表明了其在非生物逆境胁迫下功能的复杂性。本研究结果为进一步揭示桉树的抗逆分子机制，挖掘抗逆基因资源，进行分子辅助育种提供参考。

关键词：巨桉锌指蛋白(ZFP) 乙烯响应元件结合因子相关两亲抑制(EAR)基序非生物逆境基因表达

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当年和越年生香榧叶片的光合效率及抗氧化特性的季节性变化

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南京林业大学学报(自然科学版) 2024年第2期48卷 45-50页

作者：赵晓龙沈家怡刘涛吴家胜胡渊渊亚热带森林培育国家重点实验室浙江农林大学林业与生物技术学院杭州市原种场

【目的】通过比较分析香榧（Torreya grandis‘Merrillii’）主要功能叶的叶绿素荧光参数、抗氧化酶活性及丙二醛（MDA）含量等参数的季节性变化，初步探讨香榧叶片光合特性对高温、低温的温度变化的适应机制。【方法】以人工林中16年... 详细信息

【目的】通过比较分析香榧（Torreya grandis‘Merrillii’）主要功能叶的叶绿素荧光参数、抗氧化酶活性及丙二醛（MDA）含量等参数的季节性变化，初步探讨香榧叶片光合特性对高温、低温的温度变化的适应机制。【方法】以人工林中16年生香榧的当年生叶片和越年生叶片为研究对象，测定5、6、8、11月和次年1月中旬香榧叶片的叶绿素荧光参数、比叶质量（SLW）、抗氧化酶活性及可溶性蛋白含量的变化。【结果】（1）与5月中旬相比，8月中旬香榧当年生和越年生叶片光系统Ⅱ（PSⅡ）的实际最大光化学量子效率(ΦPSⅡ)均明显上调，而PSⅡ处调节的能量耗散量子效率(ΦNPQ)均明显下调，其PSⅡ处非调节性能量热耗散量子效率(ΦNO)未发生明显变化；香榧当年生叶片的超氧化物歧化酶（SOD）和过氧化氢酶（CAT）活性均明显增强，过氧化物酶（POD）活性则明显减弱，丙二醛（MDA）含量则无明显变化。（2）与11月中旬相比，次年1月的平均温度约降低了近10℃,香榧当年生和越年生叶片的ΦPSⅡ和ΦNPQ均显著降低，而其ΦNO呈明显增加趋势，且MDA含量均呈显著增加趋势。【结论】与5月中旬相比，8月中旬温度较高，香榧叶片可以吸收较多光能，并用于电子传递，以热的形式耗散能量较少，其光合机构未发生光抑制，其较强的抗氧化酶体系能协调地助其适应高温高光环境，因此其当年生叶片和越年生叶片的ΦPSⅡ明显增强；与11月中旬相比，次年1月中旬香榧当年生叶片和越年生叶片在越冬期间受到了冷害，叶片光合机构受到光损伤。综上所述，香榧叶片对环境表现为耐热不耐冷，这可能是其分布北扩的限制因素。

关键词：香榧叶龄抗氧化酶光合特性季节性变化

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毛竹SLAC家族基因鉴定及PheSLAC1功能分析

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园艺学报 2024年第3期51卷 545-559页

作者：刘晋红王峥于昊辛依睿亓果宁柳参奎任慧敏浙江农林大学林业与生物技术学院亚热带森林培育国家重点实验室杭州311300

为了研究S型阴离子通道蛋白(slow type anion channel,SLAC)基因家族在毛竹(Phyllostachys edulis)响应干旱胁迫中的作用,利用生物信息方法以拟南芥和水稻中的SLAC/SLAH家族蛋白序列为模板对毛竹中SLAC家族成员进行鉴定,对其基因结构、... 详细信息

为了研究S型阴离子通道蛋白(slow type anion channel,SLAC)基因家族在毛竹(Phyllostachys edulis)响应干旱胁迫中的作用,利用生物信息方法以拟南芥和水稻中的SLAC/SLAH家族蛋白序列为模板对毛竹中SLAC家族成员进行鉴定,对其基因结构、进化关系和组织表达等进行分析,并对PheSLAC1的保守功能位点以及在干旱胁迫中的功能进行初步研究。结果表明:毛竹中包含15个SLAC家族基因,其中PheSLAC1.1(PH02Gene01933.t1)和Phe SLAC1.2(PH02Gene00592.t1)在叶片中表达量最高,基因编码区(coding sequence,CDS)序列长度分别为1 716和1 677 bp,分别编码572和559个氨基酸,且包含保守的关键功能位点。亚细胞定位结果表明,PheSLAC1.1和Phe SLAC1.2均定位于细胞质膜中。PheSLAC1.1和Phe SLAC1.2在拟南芥slac1-3突变体中的表达结果表明,其能够部分减轻突变体的干旱敏感表型,表明两者均能够通过调控气孔关闭在毛竹响应干旱胁迫中发挥重要作用。

关键词：毛竹 SLAC基因家族干旱胁迫功能鉴定

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换锦花LsMYB7基因克隆与功能研究

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浙江农林大学学报 2024年第3期41卷 586-596页

作者：郑正权赵梦婧高燕会浙江农林大学林业与生物技术学院/亚热带森林培育国家重点实验室浙江杭州311300

【目的】研究转录因子LsMYB7基因对换锦花Lycoris sprengeri花色苷积累的调控作用。【方法】采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)方法从换锦花花瓣中克隆获得花色苷形成相关R2R3-MYB转录因子LsMYB7基因,并进行生物信息学分析,再通过病毒介导... 详细信息

【目的】研究转录因子LsMYB7基因对换锦花Lycoris sprengeri花色苷积累的调控作用。【方法】采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)方法从换锦花花瓣中克隆获得花色苷形成相关R2R3-MYB转录因子LsMYB7基因,并进行生物信息学分析,再通过病毒介导的基因沉默(VIGS)技术研究LsMYB7基因对花色苷积累的调控作用。【结果】克隆到1条长951 bp的LsMYB7基因cDNA序列,开放阅读框(ORF)为825 bp,编码274个氨基酸,LsMYB7蛋白含有2个R2和R3结构域,属R2R3-MYB转录因子家族;系统进化分析表明LsMYB7与拟南芥Arabidopsis thaliana S22亚族基因聚为一类;LsMYB7亚细胞定位于细胞核,在不同花发育阶段和不同花色无性系中,LsMYB7基因表达与花色苷合成相关基因的表达趋势一致,主要在败花期和花色苷含量较高的H1无性系中表达;LsMYB7基因沉默后,换锦花花瓣明显变短,颜色变深,且LsCHS、LsF3'H、LsANS、LsUFGT1和LsUFGT2等花色苷形成相关基因的表达显著下调。【结论】LsMYB7属R2R3-MYB转录因子家族S22亚族,通过正向调控LsCHS、LsF3'H、LsANS、LsUFGT1和LsUFGT2花色苷生物合成相关基因的表达促进花色苷积累。

关键词：换锦花 R2R3-MYB转录因子花色苷积累病毒介导的基因沉默调控作用

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植物钙信号指示剂的研究进展

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浙江农林大学学报 2025年第1期42卷 202-209页

作者：陆雯艳刘金枝沈钰琪亓果宁柳参奎任慧敏浙江农林大学林业与生物技术学院/省部共建亚热带森林培育国家重点实验室浙江杭州311300

钙离子(Ca^(2+))是植物信号传递中重要的第二信使,对植物的生长发育和胁迫响应起着至关重要的作用。近年来,随着生物化学和分子生物学技术的不断进步,钙信号指示剂在植物研究中的应用取得了显著进展。本文综述了关于钙信号指示剂在植物... 详细信息

钙离子(Ca^(2+))是植物信号传递中重要的第二信使,对植物的生长发育和胁迫响应起着至关重要的作用。近年来,随着生物化学和分子生物学技术的不断进步,钙信号指示剂在植物研究中的应用取得了显著进展。本文综述了关于钙信号指示剂在植物应用中的发展情况,包括钙指示剂的分类、钙信号检测原理及其在植物应用中的发展。钙信号指示剂的应用提供了可视化观察植物细胞内钙离子动态变化的有效手段,将植物细胞内的钙离子浓度转化为荧光信号。随着指示剂的发展,从最早的化学荧光指示剂逐步向基因编码钙指示剂过渡,能更加精确、实时、生物友好地观察到植物钙信号,对植物应对外界刺激时分子水平的应激手段有了更加深入的认识,成为研究植物应激分子水平上的重要生理指标。同时,本文还对钙信号指示剂在植物研究中存在的挑战和未来发展方向进行了讨论,指出了植物钙信号研究的特殊性与植物细胞中孵育钙指示剂的挑战性,以期为进一步推动该领域的研究提供参考和启示。

关键词：钙离子钙信号指示剂植物生长发育胁迫响应

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CRISPR/Cas基因组编辑在木本植物性状改良中的应用

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科学通报 2024年

作者：袁雪宁姚凤鸽安轶江成陈宁宁黄李超卢孟柱张进浙江农林大学林业与生物技术学院省部共建亚热带森林培育国家重点实验室

CRISPR是成簇的、规律间隔的短回文序列,存在于细菌、古细菌进化出的免疫防御系统中,由于其能利用RNA靶向引导Cas核酸酶对基因组中的目标序列进行编辑,成为基因组研究的重要工具.木本植物由于世代周期长,育种周期通常长达数十年,且存在... 详细信息

CRISPR是成簇的、规律间隔的短回文序列,存在于细菌、古细菌进化出的免疫防御系统中,由于其能利用RNA靶向引导Cas核酸酶对基因组中的目标序列进行编辑,成为基因组研究的重要工具.木本植物由于世代周期长,育种周期通常长达数十年,且存在近交衰退等问题,采用分子育种手段十分必要.以基因组编辑主导的分子设计育种为木本植物的遗传改良提供了新的思路.本文对目前在木本植物中涉及的CRISPR/Cas系统Cas9、Cas12、Cas13、Cas14、单碱基编辑器、引导编辑器等几种编辑技术展开描述,主要介绍了通过CRISPR/Cas9进行的单基因、多基因编辑在木本植物生长发育调控、胁迫抗性、品质调控等基因功能研究及性状改良中的应用进展,及启动子编辑、单碱基编辑器和基于dCas9的基因激活技术在木本植物性状改良中的应用潜力.此外,本文还探讨了木本植物基因组编辑技术在现阶段存在的问题及可能的解决方案.最后,对新型基因组编辑器在木本植物性状改良中的应用潜力进行了展望,旨在为木本植物分子设计育种提供参考.

关键词：木本植物性状改良基因组编辑 CRISPR/Cas系统碱基编辑器引导编辑器

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铁皮石斛WOX家族基因在生长发育中的功能分析

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遗传 2023年第8期45卷 700-714页

作者：陈凯王灏陈燚婷符可韩之刚李聪斯金平陈东红浙江农林大学林业与生物技术学院省部共建亚热带森林培育国家重点实验室临安311300

WUSCHEL-Related Homeobox(WOX)家族是植物特有的一类转录因子,在干细胞维持和器官形态建成等发育过程中发挥重要的调控作用。兰科珍稀名贵中药植物铁皮石斛(Dendrobium catenatum)具有独特的附生生活方式和生长发育特性,对其WOX家族基... 详细信息

WUSCHEL-Related Homeobox(WOX)家族是植物特有的一类转录因子,在干细胞维持和器官形态建成等发育过程中发挥重要的调控作用。兰科珍稀名贵中药植物铁皮石斛(Dendrobium catenatum)具有独特的附生生活方式和生长发育特性,对其WOX家族基因功能探究有助于进一步了解铁皮石斛发育的保守性和特异性。本研究对铁皮石斛WOX家族基因(DcWOX)进行了系统进化、组织表达模式、异源表达功能检测等分析。结果显示,铁皮石斛WOX家族基因可分为3个进化支,具有显著差异的组织表达谱;在转基因拟南芥中,DcWOX4过表达导致植株显著矮小,叶缘羽状深裂,花期推迟2周;DcWOX9过表达导致植株矮化,叶缘锯齿状,开花推迟1周,强表型植株雌雄蕊均不育;DcWOX11过表达导致叶缘向下卷曲;DcWOX4/9/11过表达拟南芥叶片形态建成异常与TCP家族基因和CUC家族基因的下调以及KNOX家族基因的上调有关;花期推迟与FT、SOC1和CO等早花基因的下调有关。因此,本研究表明铁皮石斛WOX家族基因在调控植株形态建成、叶发育、开花时间和育性等方面具有重要功能,进一步拓展了对WOX家族基因的功能了解,为深入探讨兰科植物进化与发育的保守性和独特性提供参考。

关键词：铁皮石斛 WOX基因家族转基因拟南芥生长发育

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