三维表型结构信息在灵芝生长过程监测和精准育种中发挥着重要作用。为快速、无损、精准地获取灵芝表型信息,本研究提出了一种基于多视角图像三维重构的灵芝子实体三维表型参数提取方法。使用智能手机获取待测子实体的网格模型;将网格模型转化为点云模型,对其进行尺寸校正;沿Z轴进行点云切片,根据切片位置提取子实体点云,使用基于颜色的区域分割算法提取粗糙孔口表面部件;使用DBSCAN(density-based spatial clustering of applications with noise)算法和最近邻分配算法分割精细菌盖、孔口表面和菌柄部件;最后从不同部件中提取菌盖厚度、菌盖横轴、菌柄长度、子实体体积、菌盖颜色、孔口表面颜色、菌盖投影面积等表型参数。结果表明,与真实值相比,使用本研究方法计算的菌盖厚度、菌盖横轴、菌柄长度和子实体体积的均方根误差(root mean squared error,RMSE)分别为1.10 mm、4.55 mm、1.53 mm和0.038 L,决定系数(R^(2))分别为0.995、0.972、0.986和0.981。所提方法可以精准提取灵芝子实体三维表型结构信息,并有望拓展应用至其他食药用菌子实体。
整合多组学策略为中药安全性评价开辟了新的研究视角，单细胞转录组学、蛋白质修饰组学、代谢组学、影像组学等前沿组学技术实现了从分子、细胞、组织到系统乃至整体不同层面揭示中药的毒性效应机制，帮助识别中药潜在毒性成分并发现特征生物标志物。基于中国知网、PubMed、Web of Science等权威数据库检索近10年与多组学技术和中药安全性评价/毒性研究的相关文献并进行梳理归纳。回顾中药毒性研究现状，系统阐述并总结各类组学新技术在中药毒性研究中的应用进展，为推动多组学联合应用作为中药毒性研究新策略提供参考。未来高通量数据处理技术的进步有望推动多组学技术为中药安全性评价体系的完善作出更大贡献。
暂无评论