检索结果-内蒙古大学图书馆

水产学杂志 2022年第3期35卷 73-79页

作者：肖善势张爱菊刘金殿王俊罗伟郝雅宾周志明浙江省淡水水产研究所中国水产科学研究院东海水产研究所浙江研究中心农业农村部淡水渔业健康养殖重点实验室浙江省淡水水产遗传育种重点实验室浙江湖州313001

为揭示分类地位相近、发育阶段和生活环境相同的肉食性鱼类肠道微生物群落结构的异同,采用高通量测序技术分析了丽水市千峡湖翘嘴鲌(Culter alburnus)、达氏鲌(***)和红鳍原鲌(Cultrichthys erythropterus)(平均体质量分别为57.6 g、53.... 详细信息

为揭示分类地位相近、发育阶段和生活环境相同的肉食性鱼类肠道微生物群落结构的异同,采用高通量测序技术分析了丽水市千峡湖翘嘴鲌(Culter alburnus)、达氏鲌(***)和红鳍原鲌(Cultrichthys erythropterus)(平均体质量分别为57.6 g、53.4 g和63.5 g)三种肉食性鱼类的肠道微生物群落结构。结果共获得有效序列943949条,单个样品平均有效序列78662条,归属1094个feature特征序列,其中翘嘴鲌、达氏鲌和红鳍原鲌分别为407个、666个和392个;三种鱼类的共有feature特征序列为73个,占feature特征序列总数的6.67%。物种注释分析显示,门水平上翘嘴鲌以变形菌门(Proteobacteria)、梭杆菌门(Fusobacteria)和厚壁菌门(Firmicutes)为优势菌门,达氏鲌肠道优势菌门为变形菌门和梭杆菌门,红鳍原鲌以变形菌门、梭杆菌门和螺旋菌门(Spirochaetes)为优势菌门;属水平上鲸杆菌属(Cetobacterium)、邻单胞菌属(Plesiomonas)和气单胞菌属(Aeromonas)是三种鱼类肠道共有优势菌属,假单胞菌属(Pseudomonas)和Brevinema分别是达氏鲌和红鳍原鲌的优势菌属。研究发现:翘嘴鲌和达氏鲌肠道中严格梭菌属(Clostridium_sensu_stricto_1)和梭菌属(Clostridium)相对丰度差异显著(P<0.05),但其他菌属组间差异不显著(P>0.05)。α多样性分析显示:三种鱼类肠道微生物的丰度和多样性无显著性差异(P>0.05)。属水平上的聚类热图显示:翘嘴鲌和红鳍原鲌的肠道微生物群落结构更为相似。本研究认为分类地位相近,在相同的发育阶段和水域环境下的肉食性鱼类具有相似的肠道菌群结构。

关键词：翘嘴鲌达氏鲌红鳍原鲌肉食性肠道微生物

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营养强化对红螯螯虾抱卵及胚胎营养成分影响研究

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饲料工业 2023年第21期44卷 25-32页

作者：刘漫程顺郑连宝张旭章美芳沈佳迟美丽李飞浙江省淡水水产研究所农业农村部淡水渔业健康养殖重点实验室浙江省淡水水产遗传育种重点实验室浙江湖州313001 德清县食品药品检验检测中心浙江湖州313200

红螯螯虾抱卵量少、孵化率低,导致其出苗量不足,这是制约其产业化发展的瓶颈之一。营养强化有助于提高亲本抱卵效果及胚胎质量。试验设置3组(1组:每日投喂亲虾两次配合饲料;2组:一周轮流投喂带鱼—配合饲料+胡萝卜—螺蛳肉—配合饲料—... 详细信息

红螯螯虾抱卵量少、孵化率低,导致其出苗量不足,这是制约其产业化发展的瓶颈之一。营养强化有助于提高亲本抱卵效果及胚胎质量。试验设置3组(1组:每日投喂亲虾两次配合饲料;2组:一周轮流投喂带鱼—配合饲料+胡萝卜—螺蛳肉—配合饲料—带鱼—配合饲料+胡萝卜—配合饲料;3组:一周轮流投喂带鱼—配合饲料+胡萝卜—带鱼—螺蛳肉—带鱼—配合饲料+胡萝卜—螺蛳肉),30 d后检测各组抱卵指标及黄卵期(原肠期至5对附肢期,呈黄色)、桔卵期(7对附肢期至18对附肢期,呈桔色)胚胎的营养成分。结果表明:①2、3组红螯螯虾的抱卵率、相对怀卵量均显著高于1组。②黄卵期胚胎的总蛋白含量显著低于桔卵期胚胎,总脂含量则显著高于桔卵期胚胎;桔卵期胚胎1组的总蛋白含量显著低于2、3组(P<0.05)。③黄卵期胚胎的必需氨基酸含量显著低于桔卵期胚胎,桔卵期胚胎3组的必需氨基酸含量显著高于其他两组(P<0.05);非必需氨基酸中,黄卵期胚胎的天冬氨酸、谷氨酸、丙氨酸、脯氨酸、酪氨酸、胱氨酸含量均显著低于桔卵期胚胎(P<0.05),1组黄卵期胚胎的胱氨酸含量显著低于2、3组,1、2组中的酪氨酸含量显著低于3组(P<0.05),3组桔卵期胚胎的天冬氨酸、谷氨酸、丝氨酸、精氨酸、胱氨酸含量显著高于1、2组(P<0.05),3组的甘氨酸、脯氨酸、酪氨酸含量显著高于1组(P<0.05)。④黄卵期胚胎的C15∶0、C18∶3n-6、C20∶5n-3(EPA)显著高于桔卵期胚胎(P<0.05);3组黄卵期胚胎的EPA、C22∶6n-3(DHA)显著高于其他两组(P<0.05);桔卵期胚胎中1组的C17∶0、C17∶1n-7、C18∶0、C18∶1n-9、C18∶2n-6、C18∶3n-3、C20∶4n-6、C20∶3n-3、EPA显著低于其他两组(P<0.05)。总之,胚胎从黄卵期发育为桔卵期,总蛋白含量升高,总脂含量降低,可能与器官的生成及之后胚体发育与胚胎孵化有关。同时,使用带鱼、螺蛳肉、胡萝卜进行营养强化可提高亲虾的抱卵率、相对怀卵量、胚胎总蛋白含量、大部分氨基酸与脂肪酸含量,促进亲虾的性腺发育。

关键词：红螯螯虾营养强化抱卵胚胎营养成分

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应用生物完整性指数评价钱塘江流域—浙江段水生态系统健康

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水产科学 2021年第5期40卷 740-749页

作者：肖善势郝雅宾刘金殿张爱菊王俊罗伟何海生周志明浙江省淡水水产研究所中国水产科学研究院东海水产研究所浙江研究中心农业农村部淡水渔业健康养殖重点实验室浙江省淡水水产遗传育种重点实验室浙江湖州313001

生物完整性指数是一种评估水生态系统健康的指数。为查明钱塘江流域—浙江段水生态系统健康状况,于2018年5月、7月、9月和12月,共4次对16个断面(3个参照断面、13个受损断面)进行浮游植物及水质数据的采集及分析。采用分布范围分析、Mann... 详细信息

生物完整性指数是一种评估水生态系统健康的指数。为查明钱塘江流域—浙江段水生态系统健康状况,于2018年5月、7月、9月和12月,共4次对16个断面(3个参照断面、13个受损断面)进行浮游植物及水质数据的采集及分析。采用分布范围分析、Mann-Whitney非参数检验及Spearman相关性分析从37个候选参数中筛选得到5个核心参数:甲藻和隐藻丰度、硅藻相对丰度、硅藻商、硅藻和绿藻相对丰度、桥弯藻属相对丰度。通过比值法计算各参数的得分,构建适于钱塘江流域—浙江段的浮游植物生物完整性指数。结果显示,16个采样断面中有1个断面处于“健康”状态,3个断面处于“中等健康”状态,9个断面健康等级为“一般”,3个断面健康等级为“差”。由此可见,钱塘江流域—浙江段水生态系统受损程度轻,但受损面较大,应进一步提高工业、农业和生活污水的处理能力,并利用水生植物进行水体修复,避免其水体进一步恶化。该评价体系能够较好地反映钱塘江流域—浙江段水体的健康状况,但由于浮游植物生物完整性指数受气候及地理区域影响较大,导致其适用水域类型范围较小。因此,针对生境差异较大的研究水域,应建立不同的浮游植物生物完整性指数。

关键词：浮游植物生物完整性指数钱塘江生态系统健康

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环境DNA技术在鱼类资源研究中的应用

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生物技术通报 2018年第12期34卷 56-62页

作者：郝雅宾张爱菊刘金殿顾志敏浙江省淡水水产研究所农业农村部淡水渔业健康养殖重点实验室浙江省淡水水产遗传育种重点实验室中国水产科学研究院东海水产研究所浙江研究中心湖州313001

环境DNA(Environmental DNA,eDNA)是指从生物体生活环境中直接提取到的不同物种DNA片段的总和,eDNA在鱼类资源研究上越来越热,主要是在鱼类的特异性基因识别片段的基础上,与利用分子手段检测eDNA所获得的识别片段进行比对,进而确定水环... 详细信息

环境DNA(Environmental DNA,eDNA)是指从生物体生活环境中直接提取到的不同物种DNA片段的总和,eDNA在鱼类资源研究上越来越热,主要是在鱼类的特异性基因识别片段的基础上,与利用分子手段检测eDNA所获得的识别片段进行比对,进而确定水环境中鱼类是否存在的一种技术,是一种新型的生物资源调查手段。与传统方法相比,eDNA技术具高灵敏、低成本、无损伤等优点,能够快速的检测出入侵种、濒危种及稀有种等种类,但也存在一些不足之处,如不能获得目标物种存在或不存在的实时数据、不能获得物种各生长阶段等的生物学特征以及种群结构、不能将"纯种"与杂交种区分开来。eDNA技术对于鱼类资源研究具有颠覆性意义,并展现出良好的发展势头。主要综述了基于eDNA技术在鱼类物种多样性研究、资源量估算和种群分布等研究中的应用进展,以期为渔业资源研究提供一些思考。可以预期,eDNA技术与传统调查方法相结合将成为鱼类资源研究的一个发展趋势。

关键词：环境DNA eDNA技术鱼类资源

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千岛湖国家级水产种质资源保护区(梓桐核心区)鱼类群落结构

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上海海洋大学学报 2019年第4期28卷 587-596页

作者：郝雅宾刘金殿郭爱环张爱菊原居林练青平顾志敏浙江省淡水水产研究所浙江湖州313001 农业农村部淡水渔业健康养殖重点实验室浙江湖州313001 中国水产科学研究院东海水产研究所浙江研究中心浙江湖州313001 浙江省淡水水产遗传育种重点实验室浙江湖州313001

2016年3月—2017年11月对梓桐核心区水域的鱼类资源按季度进行采样调查,对该水域鱼类群落种类组成、生态类型、优势种、多样性指数和ABC曲线进行分析。共采集鱼类43种,隶属4目8科30属,其中,鲤科鱼类种类最多(65.12%);以中上层、杂食性... 详细信息

2016年3月—2017年11月对梓桐核心区水域的鱼类资源按季度进行采样调查,对该水域鱼类群落种类组成、生态类型、优势种、多样性指数和ABC曲线进行分析。共采集鱼类43种,隶属4目8科30属,其中,鲤科鱼类种类最多(65.12%);以中上层、杂食性、湖泊定居性鱼类为主;优势种为黄尾鲴(Xenocypris davidi)、银飘鱼(Pseudolaubuca sinensis)和鳙(Aristichthys nobilis);Margalef、 Simpson、 Shannon-Wiener和Pielou指数两年的变化范围分别为3.17~5.01、0.68~0.89、1.79~2.55和0.61~0.84;鱼类群落结构季节变化呈显著差异,且在多数情况下受到中度干扰。研究结果不仅有助于了解千岛湖保护区内的鱼类群落和资源的状况,而且可为兴建水利工程对鱼类群落结构影响提供参考的资料。

关键词：千岛湖鱼类资源群落结构优势种生物多样性

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浙江老虎潭水库后生浮游动物群落组成及其环境影响因子

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水生态学杂志 2016年第1期37卷 62-69页

作者：张爱菊丁新新刘金殿杨元杰郝雅宾辛建美浙江省淡水水产研究所浙江湖州313001 农业部淡水渔业健康养殖重点实验室浙江湖州313001 浙江省淡水水产遗传育种重点实验室浙江湖州313001 浙江省湖州市老虎潭水库水源地管理处浙江湖州313001

为探究老虎潭水库后生浮游动物群落多样性变化,2014年5月至2015年2月按季度分4次对水库6个采样站点的后生浮游生物种类组成、密度与生物量、多样性指数以及9项水质理化指标进行了调查。结果表明,老虎潭水库共鉴定出后生浮游动物20属、34... 详细信息

为探究老虎潭水库后生浮游动物群落多样性变化,2014年5月至2015年2月按季度分4次对水库6个采样站点的后生浮游生物种类组成、密度与生物量、多样性指数以及9项水质理化指标进行了调查。结果表明,老虎潭水库共鉴定出后生浮游动物20属、34种,其中轮虫10属、22种,枝角类4属、6种,桡足类6属、6种;主要优势种为长肢多肢轮虫(Polyarthra dolichoptera)、裂足臂尾轮虫(Brachionus diversicornis)、萼花臂尾轮虫(Brachionus calyciflorus)、角突臂尾轮虫(Brachionus angularis)、圆筒异尾轮虫(Trichocerca cylindrica)、罗氏异尾轮虫(Trichocerca rousseleti)、长圆疣毛轮虫(Synchaeta oblonga)和长额象鼻溞(Bomina longirostris),且优势种的季节更替明显;密度和生物量季节差异显著,年均密度为27.79个/L,年均生物量为0.23 mg/L;丰富度指数和Shannon-Wiener多样性指数在4个季节间差异显著,夏季略高于其他3个季节;TLI指数显示,老虎潭水库全年各站点均处于中营养水平;冗余分析(RDA)表明,透明度、溶解氧、水温、高锰酸钾指数和p H是影响后生浮游动物群落动态变化的重要环境因子。

关键词：老虎潭水库后生浮游动物群落结构生物多样性

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一种三角帆蚌肌浆网Ca^(2+)-ATP酶基因cDNA的全长克隆与表达分析

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浙江农业学报 2019年第4期31卷 545-555页

作者：张爱菊刘士力刘金殿张根芳周志明浙江省淡水水产研究所中国水产科学研究院东海水产研究所浙江研究中心农业农村部淡水渔业健康养殖重点实验室浙江省淡水水产遗传育种重点实验室浙江湖州313001 金华职业技术学院浙江金华321000

采用RACE技术,从三角帆蚌(Hyriopsis cumingii)鳃组织中成功克隆得到一种肌浆网Ca^(2+)-ATP酶(sarco/endoplasmic reticulum calcium ATPase,SERCA)基因的全长cDNA序列,共3 326 bp,包含201-bp 5’-UTR区域、3 060-bp编码框(ORF)和65-bp 3’-UTR。ORF共编码1 019个氨基酸,预测无信号肽。该基因氨基酸序列呈现出典型的Ca^(2+)-ATP酶特征,由Cation_ATPase_N、E1-E2_ATPase、Hydrolase、Cation_ATPase_C四种类型结构域组成,其内含SERCAs的常见结构组成包括磷酸化区域、异硫氰酸荧光素位点、FSBA结合位点、受磷蛋白结合区以及毒胡萝卜素位点。分析显示,该基因序列高度保守且与海洋软体动物具有最高同源性。荧光定量PCR检测,该基因在三角帆蚌外套膜、斧足、鳃、肝胰腺、性腺等5个组织中均有表达,且在鳃、外套膜、肝胰腺组织中表达较高。不同Ca^(2+)浓度处理试验的结果表明,随水体中Ca^(2+)浓度逐渐升高,该基因在外套膜中的表达水平呈先下降后上升趋势,并在Ca^(2+)浓度为60 mg·L^(-1)时达到最低值,80 mg·L^(-1)时达到最高值。同时在60 mg·L^(-1) Ca^(2+)浓度条件下,外套膜中SERCA基因的表达量随时间推移先上升,并于48 h时达到最高,而后逐渐下降。上述结果为进一步深入研究SERCA基因的功能及其调控机理奠定了基础。

关键词：三角帆蚌 SERCA 克隆基因表达钙刺激

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泥鳅角蛋白18(K18)基因的克隆与表达分析

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生物技术通报 2016年第5期32卷 114-123页

作者：吴卫君刘士力李倩王雨辰练青平胡廷尖贾永义蒋文枰李喜莲浙江省淡水水产研究所农业部淡水渔业健康养殖重点实验室&浙江省淡水水产遗传育种重点实验室湖州313001 浙江省庆元县水利局水产技术推广站庆元323800 上海海洋大学上海201306

角蛋白18(K18)是角蛋白的一种,为中间纤维蛋白,是细胞骨架的组成部分。为了解泥鳅(Misgurnus anguillicaudatus)K18序列特征及其在不同组织中的表达,研究采用3'-和5'-RACE法克隆K18基因c DNA全长序列,并运用实时荧光定量PCR技... 详细信息

角蛋白18(K18)是角蛋白的一种,为中间纤维蛋白,是细胞骨架的组成部分。为了解泥鳅(Misgurnus anguillicaudatus)K18序列特征及其在不同组织中的表达,研究采用3'-和5'-RACE法克隆K18基因c DNA全长序列,并运用实时荧光定量PCR技术探讨其在不同组织中的表达。结果表明,泥鳅K18基因c DNA全长序列1 694 bp,其中包含开放阅读框1 299bp,编码432个氨基酸,其序列具有Ⅰ型角蛋白序列DGKVVS,以及非常相似序列DNA(R/K)LAADDF。相似度分析显示,泥鳅K18与大鳞副泥鳅(Paramisgurnus dabryanus)的相似度最高为98%,与其它物种K18也存在不同程度的相似度。系统进化分析表明,泥鳅与其他物种的K18系统发育同源,且同陆生脊椎动物和硬骨鱼类同源,并与大鳞副泥鳅的关系最为密切。通过定量分析,K18基因在泥鳅肠、肌肉、心脏、胃、肝脏、精巢、卵巢、脾脏等8种组织都有表达,其中,肠表达最高,心脏最低。统计学分析表明,K18基因的表达在不同组织间存在显著性差异。

关键词：角蛋白18(K18) c DNA克隆泥鳅(Misgurnus anguillicaudatus) 定量表达

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基于线粒体D-loop区序列的4个黄尾鲴养殖群体遗传多样性分析

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广东农业科学 2023年第11期50卷 139-145页

作者：刘士力陈大伟郑建波程顺蒋文枰迟美丽夏冯博李飞浙江省淡水水产研究所/农业农村部淡水渔业健康养殖重点实验室/浙江省淡水水产遗传育种重点实验室浙江湖州313001 上海海洋大学水产与生命学院/农业农村部淡水水产种质资源重点实验室上海201306 湖州师范学院生命科学学院浙江湖州313001

【目的】黄尾鲴(Xenocypris davidi)是以腐殖质、有机碎屑为饵料,兼食浮游生物和底栖动物的的淡水经济鱼类,是浙江省自然水域鱼类增殖放流的主要品种之一。了解人工繁育对黄尾鲴遗传多样性的影响,可为自然水域黄尾鲴的增殖放流策略设计... 详细信息

【目的】黄尾鲴(Xenocypris davidi)是以腐殖质、有机碎屑为饵料,兼食浮游生物和底栖动物的的淡水经济鱼类,是浙江省自然水域鱼类增殖放流的主要品种之一。了解人工繁育对黄尾鲴遗传多样性的影响,可为自然水域黄尾鲴的增殖放流策略设计和实施提供参考。【方法】对浙江长兴、八里店、双浦和湖南醴陵4个黄尾鲴养殖群体的线粒体DNA(mtDNA)D-loop序列进行PCR扩增和测序,通过序列分析研究4个群体的遗传多样性。【结果】黄尾鲴线粒体D-loop序列长度为1038~1093 bp,碱基A+T含量(65.3%)显著高于C+G含量(34.7%),平均转换/颠换比值(TS/TV)为4.6。在128条黄尾鲴的D-loop序列中共检测到101个变异位点,包括97个简约信息位点;界定了19种单倍型,其中长兴、双浦、八里店和醴陵群体的单倍型数目分别为5、12、4和2;单倍型多样性(h)介于0.226~0.915之间,核苷酸多样性(π)介于0.00640~0.01433之间。4个黄尾鲴养殖群体的遗传多样性具有一定差异,不同养殖群体间遗传距离为0.03782~0.88756,遗传分化系数为0.78903(P<0.01),群体内变异占整个遗传变异的21.10%,其中长兴群体和八里店群体的遗传分化系数最低,双浦和醴陵群体的遗传分化系数最高,遗传变异主要发生在群体间。【结论】4个黄尾鲴养殖群体的遗传多样性具有一定差异。黄尾鲴遗传变异和种群结构的信息可为其遗传多样性变化的研究提供参考,有助于黄尾鲴的资源保护。

关键词：黄尾鲴线粒体DNA(mtDNA) D-loop序列遗传多样性遗传结构

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河川沙塘鳢DMRT1基因的克隆及其表达分析

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海洋渔业 2018年第5期40卷 569-580页

作者：张红燕朱文旭赵诚张宏叶王涛陈树桥尹绍武贾永义无南京师范大学生命科学学院海洋科学与工程学院南京210023 浙江省淡水水产研究所农业部淡水渔业健康养殖重点实验室浙江省淡水水产遗传育种重点实验室浙江湖州313001 南京市水产科学研究所

以河川沙塘鳢(Odontobutis potamophila)为研究对象,采用c DNA末端快速扩增(RACE)技术对DMRT1的全长基因进行了克隆,并利用生物信息学技术分析其结构和功能;采用实时荧光定量PCR(qRTPCR)技术检测了河川沙塘鳢DMRT1基因在8种组织(鳃、肠... 详细信息

以河川沙塘鳢(Odontobutis potamophila)为研究对象,采用c DNA末端快速扩增(RACE)技术对DMRT1的全长基因进行了克隆,并利用生物信息学技术分析其结构和功能;采用实时荧光定量PCR(qRTPCR)技术检测了河川沙塘鳢DMRT1基因在8种组织(鳃、肠、心、肌肉、脑、肝、脾、性腺)、胚胎发育的8个时期(受精卵期、桑椹胚期、原肠胚期、神经胚期、体节期、口裂期、出膜后1 d和出膜后3 d)以及性腺发育的4个时期(Ⅰ~Ⅳ期)中的表达变化。结果表明,河川沙塘鳢DMRT1基因c DNA序列的全长为2025 bp,编码297个氨基酸,其中包括894 bp的开放阅读框(ORF),73 bp的5'非编码区和1058 bp的3'非编码区。与已知物种的氨基酸序列比对后发现,河川沙塘鳢DMRT1的氨基酸序列与军曹鱼(Rachycentron canadum)、欧洲鲈鱼(Dicentrarchus labrax)的同源性最高。DMRT1基因在河川沙塘鳢的精巢组织大量表达,而在卵巢、肌肉、心以及肝4种组织中表达较少,在其它组织中几乎不表达; DMRT1基因在胚胎发育的各个时期都有表达,在原肠期的表达量最高;此外,DMRT1基因表达量在精巢发育的不同时期呈先下降后上升的趋势,在精子成熟期(Ⅳ期)达到最大值,而在卵巢发育的不同时期表达量较少且表达强度差异不明显,因而推测河川沙塘鳢DMRT1基因与精巢的发生和功能的维持有关。研究结果为解析河川沙塘鳢DMRT1基因的功能及其性别决定机制提供了基础资料,也为开展河川沙塘鳢单性育种奠定了基础。

关键词：河川沙塘鳢 DMRT1基因 qRT-PCR 基因克隆表达分析

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