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海南医学院学报 2024年第20期30卷 1521-1526页

作者：汤婷田秀颖邓宛心李子涵杨聘雷胜杜江尹飞飞崔秀吉海南医学院基础医学与生命科学学院热带病转化医学教育部重点实验室海南医学院-香港大学热带传染病联合实验室海南医学院第一附属医院重大疾病生物样本资源海南省工程研究中心海南海口571199 中国医学科学院病原生物学研究所北京100005

目的:戊型肝炎病毒(hepatitis E virus,HEV)属于戊型肝炎病毒科(Hepeviridae),包括四个属,即HEV-A、-B、-C和-D。HEV是一种正单链,长约7 kb的裸露RNA病毒,可以引起急、慢性戊型肝炎,特别是孕妇感染HEV后死亡率较高。目前,普遍认为只有HE... 详细信息

目的:戊型肝炎病毒(hepatitis E virus,HEV)属于戊型肝炎病毒科(Hepeviridae),包括四个属,即HEV-A、-B、-C和-D。HEV是一种正单链,长约7 kb的裸露RNA病毒,可以引起急、慢性戊型肝炎,特别是孕妇感染HEV后死亡率较高。目前,普遍认为只有HEV-A对人类具有致病性。然而,近期在中国香港、西班牙和中非等地区陆续报告由HEV-C,即鼠戊型肝炎病毒感染引起的戊型肝炎病例,说明HEV-C也是一种人兽共患病毒,可传染于人类。在前期工作中,课题组从海南省澄迈县捕获的褐家鼠粪便中检测到了HEV-C基因部分片段。为进一步了解海南HEV-C基因分子特征,本研究中扩增了HEV-C全长基因,并对其进行了系统发育分析。方法:使用Trizol试剂从海南省澄迈县捕获的褐家鼠粪便中分离HEV RNA,并利用Oligo dT引物进一步转录合成cDNA。接着用PCR方法扩增HEV的四个ORF区,并用Sanger法测序,拼接全长HEV基因。利用MEGA X软件的Clustal W方法与参考序列进行比对,并构建系统进化树。结果:通过系统进化树分析发现本研究中扩增的HEV-C为C1型,与广东省湛江市褐家鼠中发现的HEV-C1(基因号:LC549184)的同源性是93.1%,但与我国云南省、香港特别行政区和湖北省等地区的同源性比较远,分别为65.7%、65.9%、85.4%。结论:本研究首次针对海南省褐家鼠携带HEV-C1全长基因进行了系统进化分析。该研究结果提示海南省存在HEV-C的鼠-人传播的潜在风险。因此,应继续控制鼠类的同时,也应预防鼠HEV传染人类的风险。

关键词：肝炎啮齿类动物鼠戊型肝炎病毒海南

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基于illumina测序技术分析小泡巨鼠肠道微生物多样性

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中华预防医学杂志 2022年第4期56卷 512-518页

作者：轩断断黎元莉张冠男丁林威曹佩佩贾瑞杰郑玉爱周晓君潘良源胡守奎牛莉娜海南医学院热带病转化医学教育部重点实验室海南医学院-香港大学热带传染病联合实验室海南医学院病原生物学教研室海口571101 三亚市人民医院检验科三亚572000 北京大学首钢医院检验科北京100144

为探讨海南岛的小泡巨鼠肠道微生物群落组成及其菌群多样性。2019年12月于海南医学院-香港大学热带传染病联合实验室提取25只海南岛的成年小泡巨鼠(14只雄和11只雌性)粪便样本DNA,基于IonS5TMXL测序平台,利用单端测序(Single-End)的方法... 详细信息

为探讨海南岛的小泡巨鼠肠道微生物群落组成及其菌群多样性。2019年12月于海南医学院-香港大学热带传染病联合实验室提取25只海南岛的成年小泡巨鼠(14只雄和11只雌性)粪便样本DNA,基于IonS5TMXL测序平台,利用单端测序(Single-End)的方法,构建小片段文库进行单端测序。通过对测序片段剪切过滤,操作分类单元(Operational Taxonomic Units,OTUs)聚类,利用mothur方法与SSUrRNA数据库对OTUs进行物种注释及丰度分析,并进一步开展α多样性分析(Alpha Diversity)和β多样性分析(Beta Diversity)。结果显示,从25只小泡巨鼠肠道粪便样本中共得到高质量序列1481842条,归属为14个门、85个科、186个属。从门分类水平上,小泡巨鼠的主要核心生物群有厚壁菌门(Firmicutes,46.04%),拟杆菌门(Bacteroidetes,25.34%);随后依次为变形菌门(Proteobacteria,17.09%),柔壁菌门(Tenericutes,7.38%),放线菌门(Actinobacteria,1.67%);这5个门占所有菌门的97.52%。属水平上螺杆菌属(Helicobacter)所占比例最大,为12.44%;其次为乳杆菌属(Lactobacillus,11.39%),梭菌属(Clostridium,6.19%),支原体属(Mycoplasma,4.23%),黄杆菌属(Flavonifractor,3.52%)。综上,高通量测序分析表明海南岛小泡巨鼠肠道菌群结构复杂,菌种多样,具有进一步研究的意义。

关键词：肠道微生物高通量测序操作分类单元小泡巨鼠

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海南省琼中黎族苗族自治县2019年恙虫病东方体分子流行病学及遗传进化分析

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中国热带医学 2022年第7期22卷 591-596页

作者：王寒强王高玉林璋礼许乾雁黄艺彭箬岩胡小媛杜江唐川宁张丽媛尹飞飞文书海南省琼中黎族苗族自治县人民医院检验科海南琼中572900 海南医学院海南医学院热带病转化医学教育部重点实验室海南海口571199 海南医学院海南医学院-香港大学热带传染病联合实验室海南海口571199 海南医学院海南医学院病原生物学教研室海南海口571199 海南医学院第二附属医院热带病科海南海口570216

目的通过分析海南省琼中黎族苗族自治县(简称“琼中”)98例不明原因发热患者的恙虫病流行特点,了解该地区恙虫病东方体菌株流行的情况,为该地区制定恙虫病防治策略和控制措施提供科学依据。方法收集2019年1月1日至2019年12月31日琼中黎... 详细信息

目的通过分析海南省琼中黎族苗族自治县(简称“琼中”)98例不明原因发热患者的恙虫病流行特点,了解该地区恙虫病东方体菌株流行的情况,为该地区制定恙虫病防治策略和控制措施提供科学依据。方法收集2019年1月1日至2019年12月31日琼中黎族苗族自治县人民医院诊断为疑似恙虫病和不明原因发热患者血液样本,利用胶体金免疫层析法和巢式PCR方法对样本进行恙虫病东方体特异性IgM、IgG抗体和恙虫病东方体56kD型特异性抗原基因检测,同时使用预先设计的样本信息表收集患者的临床表现及流行病学信息。针对巢式PCR检测结果为阳性的样本,进行克隆及Sanger测序。对获得的患者临床信息及检测结果进行流行病学分析,将测序得到的序列进行基因遗传进化分析。结果98例样本中,恙虫病IgM抗体阳性率为24.49%(24/98),恙虫病IgG抗体阳性率为46.94%(46/98),恙虫病PCR阳性率26.53%(26/98),焦痂或皮疹13.27%(13/98)。根据诊断标准,最终诊断为恙虫病的患者为33例。感染人群主要以31~50岁的青壮年为主,职业主要为农民。该地区恙虫病的流行以营根镇、长征镇和红毛镇为主并涉及9个乡镇。流行时间有明细的季节性,以7月和11月为主要高发期。流行的基因型主要为Karp型和Gilliam型。结论琼中为恙虫病的自然疫源地,该地区流行的恙虫病东方体基因型主要为Karp和Gilliam型,具有基因多态性。

关键词：恙虫病恙虫病东方体流行病学基因型

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海南省680例不明原因发热患者恙虫病东方体感染调查

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中国热带医学 2022年第10期22卷 930-934页

作者：薛莉颖谢晓菲王高玉黄艺张丽媛何昌华贾毅博文书杜江尹飞飞海南医学院海南医学院热带病转化医学教育部重点实验室海南海口571199 海南医学院海南医学院-香港大学热带传染病联合实验室海南海口571199 海南医学院海南医学院病原生物学教研室海南海口571199 海南医学院第二附属医院热带病科海南海口570216 海南省疾病预防控制中心海南海口570203 琼中黎族苗族自治县人民医院检验科海南琼中572900

目的了解海南省不明原因发热患者的恙虫病东方体检感染情况,为不明原因发热患者恙虫病防治提供指导。方法收集2018—2021年海南医学院第一附属医院、海南医学院第二附属医院、海口市人民医院和琼中黎族苗族自治县人民医院临床诊断为不... 详细信息

目的了解海南省不明原因发热患者的恙虫病东方体检感染情况,为不明原因发热患者恙虫病防治提供指导。方法收集2018—2021年海南医学院第一附属医院、海南医学院第二附属医院、海口市人民医院和琼中黎族苗族自治县人民医院临床诊断为不明原因发热患者血液样本,利用胶体金免疫层析法和PCR方法分别对样本进行恙虫病东方体特异性IgM、IgG抗体和恙虫病东方体56kD型特异性抗原基因检测,同时收集样本的临床及流行病学信息,并进行流行病学分析。结果共收集临床不明原因发热患者血样680份,恙虫病东方体IgM、IgG抗体和56kD型特异性抗原PCR阳性率分别为23.97%(163/680)、36.62%(249/680)和20.88%(142/680),焦痂或皮疹率为12.06%(82/680)。根据诊断标准,最终诊断为恙虫病的患者为223例,其中男性111例(49.78%),女性109例(48.88%),平均年龄(53.14±15.12)岁,其中40~<60岁98例(占43.95%),感染人群民族中汉族136例(占60.99%),农民93例(41.70%),秋季发病114例(51.12%)。临床表现以非特异性症状与体征为主,36.77%患者出现皮肤特异性溃疡或焦痂。结论海南省是恙虫病的疫源地,流行时间有明显的季节性,预防重点应是秋季的农村地区,临床特征以高热和焦痂或溃疡为主。

关键词：恙虫病不明原因发热恙虫病东方体56kD型特异性抗原流行病特征

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啮齿动物芽囊原虫的流行病学研究进展

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热带医学杂志 2023年第2期23卷 267-273页

作者：李佳琦任广旭赖秀仪王媛吕刚海南医学院热带转化医学教育部重点实验室海南海口571199 海南医学院热带病防治国家卫生健康委员会重点实验室海南海口571199 海南医学院—香港大学热带传染病联合实验室海南海口571199 海南医学院病原生物学教研室海南海口571199 海南医学院公共卫生与全健康国际学院海南海口571199

芽囊原虫是一种常见的人兽共患肠道寄生虫,呈世界性分布且动物宿主广泛,多数研究认为该虫具有机会致病性,低免疫人群感染可能会引起腹泻等症状。啮齿动物是地球上最大的且与人类生活密切相关的哺乳动物种群,具有种类多、分布广和适应性... 详细信息

芽囊原虫是一种常见的人兽共患肠道寄生虫,呈世界性分布且动物宿主广泛,多数研究认为该虫具有机会致病性,低免疫人群感染可能会引起腹泻等症状。啮齿动物是地球上最大的且与人类生活密切相关的哺乳动物种群,具有种类多、分布广和适应性强的特点,是芽囊原虫重要的宿主,是多种人兽共患病原体的传播媒介,具有重要的公共卫生学意义。本文对全球啮齿动物芽囊原虫的流行病学情况进行综述,旨在为芽囊原虫病防控提供参考。

关键词：芽囊原虫啮齿动物人兽共患亚型

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非人灵长类动物隐孢子虫分子流行病学研究进展

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海南医学院学报 2022年第5期28卷 390-393,400页

作者：马天明强钰任广旭吕刚热带转化医学教育部重点实验室热带病防治国家卫生健康委员会重点实验室海南医学院‐香港大学热带传染病联合实验室海南医学院病原生物学教研室海南海口571199

隐孢子虫是一种新现的单细胞人兽共患病原体。通过侵犯人和动物的小肠上皮细胞,导致宿主产生以腹泻为主的多种临床症状,可通过水源性、食物源性以及宿主间相互传播,具有重要的公共卫生学意义。研究显示,非人灵长类动物可感染多种隐孢子... 详细信息

隐孢子虫是一种新现的单细胞人兽共患病原体。通过侵犯人和动物的小肠上皮细胞,导致宿主产生以腹泻为主的多种临床症状,可通过水源性、食物源性以及宿主间相互传播,具有重要的公共卫生学意义。研究显示,非人灵长类动物可感染多种隐孢子虫基因型,且该物种与人类基因相似度高,故需引起高度重视。本文就隐孢子虫在非人灵长类动物中的感染率、基因型、人兽共患风险进行综述。

关键词：隐孢子虫非人灵长类动物基因型人兽共患

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海口市居民蚊媒防治知识态度行为现状调查

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中国热带医学 2019年第8期19卷 731-737页

作者：钟赛凤解婉桢陈济丽符发兴彭耀飞吴丽榕林梦园王鑫窦成茵李奕基海南医学院病原生物学教研室海南医学院热带病转化医学教育部重点实验室

目的了解海口市居民有关蚊媒防制知识、态度和行为情况,为今后更好地开展有针对性的干预措施提供依据。方法采用统一设计的调查问卷,于2017年7-9月在海口市4个区各随机选择两个调查点,每个调查点随机抽取约150个家庭,每个家庭选一位18... 详细信息

目的了解海口市居民有关蚊媒防制知识、态度和行为情况,为今后更好地开展有针对性的干预措施提供依据。方法采用统一设计的调查问卷,于2017年7-9月在海口市4个区各随机选择两个调查点,每个调查点随机抽取约150个家庭,每个家庭选一位18岁以上的成人作为调查对象进行答卷。结果本次调查共发放问卷1 020份,回收有效问卷988份,有效问卷回收率为96.9%。居民蚊虫防治知识总知晓率为54.8%,其中城区居民总知晓率为58.9%,郊区居民为50.6%,城区居民知晓率显著高于郊区(P<0.05)。不同人口特征(性别、地区、文化程度、年龄和职业)的居民对蚊媒防治知识的知晓率差异有统计学意义(P<0.05)。81.2%的居民意识到蚊虫叮咬会传播疾病,分别有67.1%、52.7%及31.5%知道登革热、疟疾和寨卡病毒病由蚊虫传播。63.8%知道蚊子有雌雄之分,33.6%知道雌蚊吸血。防治态度方面,51.1%的居民迫切希望政府和社区增加灭蚊次数,86.1%的居民认为非常有必要防蚊灭蚊。结论目前海口市居民的蚊媒防治知识需要进一步提高,卫生防疫部门与地方政府应重视开展蚊媒及其传播疾病的健康教育活动。

关键词：蚊虫媒介防制知识态度行为调查

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实验兔源隐孢子虫分子鉴定和gp60亚型分型

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热带医学杂志 2019年第12期19卷 1459-1462页

作者：陈锦龙周换换吕刚赵威海南医学院病原生物学教研室热带转化医学教育部重点实验室海南海口571199

目的为了解实验兔隐孢子虫的自然感染情况,评估兔在隐孢子虫病流行病学中所起的重要作用。方法收集海南医学院用于实验教学的291份兔子粪便样本,利用PCR扩增隐孢子虫核糖体小亚基部分序列对隐孢子虫进行检测,同时对兔隐孢子虫阳性的样... 详细信息

目的为了解实验兔隐孢子虫的自然感染情况,评估兔在隐孢子虫病流行病学中所起的重要作用。方法收集海南医学院用于实验教学的291份兔子粪便样本,利用PCR扩增隐孢子虫核糖体小亚基部分序列对隐孢子虫进行检测,同时对兔隐孢子虫阳性的样本进行gp60亚型分型。结果共检测出阳性样品10份,平均感染率为3.4%。分子鉴定发现获得的隐孢子虫均为兔隐孢子虫,并且都被成功的亚型分型确定为VbA32和VbA29,这两个亚型均有人体报道。结论人和兔体内的兔隐孢子虫交叉亚型发现表明感染隐孢子虫的兔对人体健康构成威胁。

关键词：兔隐孢子虫基因分型 gp60

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曼氏迭宫绦虫cathepsin L样蛋白酶的生物信息学分析

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分子诊断与治疗杂志 2017年第5期9卷 328-333,346页

作者：李奕基梁培海南医学院病原生物学教研室海南海口571199 海南医学院热带病转化医学教育部重点实验室海南海口571199

目的通过生物信息学预测曼氏迭宫绦虫cathepsin L样蛋白酶(Smcathepsin L样蛋白酶)的生物学特征及其潜在功能和结构,为下一步Smcathepsin L样蛋白酶参与寄生虫和宿主相互作用过程研究提供依据。方法通过NCBI的ORF finder工具对Smcatheps... 详细信息

目的通过生物信息学预测曼氏迭宫绦虫cathepsin L样蛋白酶(Smcathepsin L样蛋白酶)的生物学特征及其潜在功能和结构,为下一步Smcathepsin L样蛋白酶参与寄生虫和宿主相互作用过程研究提供依据。方法通过NCBI的ORF finder工具对Smcathepsin L样蛋白酶的开放阅读框(ORF)进行分析,利用Ex PASy网站进行蛋白的物理化学参数、信号肽、跨膜螺旋和潜在分子生物学功能的预测,通过NCBI/BLAST对蛋白保守功能域进行预测。从NCBI网站获取不同物种的cathepsin L样蛋白酶序列,并利用Vector NTI suit 8.0和Tree View软件进行分析。利用SWISS-MODEL网站和SPDBV4.10软件分析Smcathepsin L样蛋白酶的三维空间结构。结果 Smcathepsin L样蛋白酶是一个全长基因,编码336个氨基酸。蛋白由2个典型的cathepsin L样蛋白酶结构域组成,序列当中有信号肽,是一个稳定的可溶性蛋白分子。三维空间立体结构分析结果显示Smcathepsin L样蛋白酶是一个保守的蛋白。Smcathepsin L样蛋白酶编码氨基酸序列与细粒棘球绦虫、链状带绦虫、多房棘球绦虫和人的cathepsin L样蛋白酶基因的同源性分别是50%、50%、49%和46%。分子进化分析显示Smcathepsin L样蛋白酶与日本血吸虫、多房棘球绦虫和链状带绦虫亲源性更近,而与其他物种,例如原虫、线虫和哺乳动物亲源性较远。结论 Smcathepsin L样蛋白酶可能是一个潜在的分泌蛋白,该蛋白能在胞外发挥作用,即在寄生虫的消化、转移、入侵及宿主-寄生虫相互作用中起着重要的作用,是一个具有潜在研究价值的多功能分子。

关键词：曼氏迭宫绦虫 cathepsin L样蛋白酶生物信息学分析

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海口市区居民感染菲律宾毛细线虫风险评估

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海南医学 2017年第20期28卷 3411-3414页

作者：李斯周利民王延但彩虹张曦范雪敏王小霞孙倩张晓蕾符怀艺林桂芬范志刚海南职业技术学院心理学教研室海南海口570216 海南医学院科学实验中心海南海口571199 海南医学院热带医学与检验医学院病原生物学教研室海南海口571199 海南医学院第一附属医院住院部海南海口570102 海南医学院热带病转化医学重点实验室(筹备教育部重点实验室) 海南海口571199

目的评估海口市区居民感染菲律宾毛细线虫的风险。方法笔者2016年5~8月采用自制问卷对622名海口市区居民进行调查,并采用病原诊断技术检查海口市区4个菜市场淡水鱼1 768条鱼肠感染菲律宾毛细线虫情况。结果 86.8%的海口市区居民食鱼行... 详细信息

目的评估海口市区居民感染菲律宾毛细线虫的风险。方法笔者2016年5~8月采用自制问卷对622名海口市区居民进行调查,并采用病原诊断技术检查海口市区4个菜市场淡水鱼1 768条鱼肠感染菲律宾毛细线虫情况。结果 86.8%的海口市区居民食鱼行为有感染菲律宾毛细线虫的风险,10.3%的居民生食泥鳅,1.1%的居民生食其他淡水鱼,2.10%~10.8%的居民食泥鳅和菜市场之外淡水鱼有感染菲律宾毛细线虫的高风险。男性、文化程度是影响海口市区市民食鱼易感染菲律宾毛细线虫风险行为的主要因素(P<0.05)。结论海口双创降低了居民感染菲律宾毛细线虫的风险,但是居民感染菲律宾毛细线虫和其他各种鱼源性寄生虫的风险不容忽视。

关键词：菲律宾毛细线虫海口风险评估

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