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中国人兽共患病学报 2019年第12期35卷 1139-1143页

作者：赵威周换换徐柳莲马天明吕刚海南医学院病原生物学教研室海南医学院-香港大学热带传染病联合实验室

毕氏肠微孢子虫是一种新现的人兽共患病原体,以前被认为是一种肠道原虫,最近被划分为真菌。该病原体主要侵染宿主小肠上皮细胞引起腹泻等临床症状,并且可通过食物和水源传播,具有重要公共卫意义。研究表明,啮齿动物可感染或携带多种毕... 详细信息

毕氏肠微孢子虫是一种新现的人兽共患病原体,以前被认为是一种肠道原虫,最近被划分为真菌。该病原体主要侵染宿主小肠上皮细胞引起腹泻等临床症状,并且可通过食物和水源传播,具有重要公共卫意义。研究表明,啮齿动物可感染或携带多种毕氏肠微孢子虫基因型,对人类健康构成威胁。本文就近年来啮齿动物毕氏肠微孢子虫感染率、基因型、人兽共患风险等进行综述。

关键词：毕氏肠微孢子虫人兽共患基因型啮齿动物

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基于illumina测序技术分析小泡巨鼠肠道微生物多样性

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中华预防医学杂志 2022年第4期56卷 512-518页

作者：轩断断黎元莉张冠男丁林威曹佩佩贾瑞杰郑玉爱周晓君潘良源胡守奎牛莉娜海南医学院热带病转化医学教育部重点实验室海南医学院-香港大学热带传染病联合实验室海南医学院病原生物学教研室海口571101 三亚市人民医院检验科三亚572000 北京大学首钢医院检验科北京100144

为探讨海南岛的小泡巨鼠肠道微生物群落组成及其菌群多样性。2019年12月于海南医学院-香港大学热带传染病联合实验室提取25只海南岛的成年小泡巨鼠(14只雄和11只雌性)粪便样本DNA,基于IonS5TMXL测序平台,利用单端测序(Single-End)的方法... 详细信息

为探讨海南岛的小泡巨鼠肠道微生物群落组成及其菌群多样性。2019年12月于海南医学院-香港大学热带传染病联合实验室提取25只海南岛的成年小泡巨鼠(14只雄和11只雌性)粪便样本DNA,基于IonS5TMXL测序平台,利用单端测序(Single-End)的方法,构建小片段文库进行单端测序。通过对测序片段剪切过滤,操作分类单元(Operational Taxonomic Units,OTUs)聚类,利用mothur方法与SSUrRNA数据库对OTUs进行物种注释及丰度分析,并进一步开展α多样性分析(Alpha Diversity)和β多样性分析(Beta Diversity)。结果显示,从25只小泡巨鼠肠道粪便样本中共得到高质量序列1481842条,归属为14个门、85个科、186个属。从门分类水平上,小泡巨鼠的主要核心生物群有厚壁菌门(Firmicutes,46.04%),拟杆菌门(Bacteroidetes,25.34%);随后依次为变形菌门(Proteobacteria,17.09%),柔壁菌门(Tenericutes,7.38%),放线菌门(Actinobacteria,1.67%);这5个门占所有菌门的97.52%。属水平上螺杆菌属(Helicobacter)所占比例最大,为12.44%;其次为乳杆菌属(Lactobacillus,11.39%),梭菌属(Clostridium,6.19%),支原体属(Mycoplasma,4.23%),黄杆菌属(Flavonifractor,3.52%)。综上,高通量测序分析表明海南岛小泡巨鼠肠道菌群结构复杂,菌种多样,具有进一步研究的意义。

关键词：肠道微生物高通量测序操作分类单元小泡巨鼠

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海南省琼中黎族苗族自治县2019年恙虫病东方体分子流行病学及遗传进化分析

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中国热带医学 2022年第7期22卷 591-596页

作者：王寒强王高玉林璋礼许乾雁黄艺彭箬岩胡小媛杜江唐川宁张丽媛尹飞飞文书海南省琼中黎族苗族自治县人民医院检验科海南琼中572900 海南医学院海南医学院热带病转化医学教育部重点实验室海南海口571199 海南医学院海南医学院-香港大学热带传染病联合实验室海南海口571199 海南医学院海南医学院病原生物学教研室海南海口571199 海南医学院第二附属医院热带病科海南海口570216

目的通过分析海南省琼中黎族苗族自治县(简称“琼中”)98例不明原因发热患者的恙虫病流行特点,了解该地区恙虫病东方体菌株流行的情况,为该地区制定恙虫病防治策略和控制措施提供科学依据。方法收集2019年1月1日至2019年12月31日琼中黎... 详细信息

目的通过分析海南省琼中黎族苗族自治县(简称“琼中”)98例不明原因发热患者的恙虫病流行特点,了解该地区恙虫病东方体菌株流行的情况,为该地区制定恙虫病防治策略和控制措施提供科学依据。方法收集2019年1月1日至2019年12月31日琼中黎族苗族自治县人民医院诊断为疑似恙虫病和不明原因发热患者血液样本,利用胶体金免疫层析法和巢式PCR方法对样本进行恙虫病东方体特异性IgM、IgG抗体和恙虫病东方体56kD型特异性抗原基因检测,同时使用预先设计的样本信息表收集患者的临床表现及流行病学信息。针对巢式PCR检测结果为阳性的样本,进行克隆及Sanger测序。对获得的患者临床信息及检测结果进行流行病学分析,将测序得到的序列进行基因遗传进化分析。结果98例样本中,恙虫病IgM抗体阳性率为24.49%(24/98),恙虫病IgG抗体阳性率为46.94%(46/98),恙虫病PCR阳性率26.53%(26/98),焦痂或皮疹13.27%(13/98)。根据诊断标准,最终诊断为恙虫病的患者为33例。感染人群主要以31~50岁的青壮年为主,职业主要为农民。该地区恙虫病的流行以营根镇、长征镇和红毛镇为主并涉及9个乡镇。流行时间有明细的季节性,以7月和11月为主要高发期。流行的基因型主要为Karp型和Gilliam型。结论琼中为恙虫病的自然疫源地,该地区流行的恙虫病东方体基因型主要为Karp和Gilliam型,具有基因多态性。

关键词：恙虫病恙虫病东方体流行病学基因型

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两株形态不同脓肿分枝杆菌的鉴定与分析

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中华检验医学杂志 2021年第9期44卷 860-863页

作者：周晓君轩断断张冠男黄涛王旭明牛莉娜林明冠邓垂文海南省人民医院检验科海南医学院附属海南医院海口570311 海南医学院病原生物学教研室海南医学院-香港大学热带传染病联合实验室海口571199 海南医学院第二附属医院检验科海口570311 中国医学科学院北京协和医院国家皮肤与免疫疾病临床医学研究中心北京协和医院风湿免疫科北京100730

分析比较临床1例重症肺炎患者痰标本培养出的平滑型脓肿分枝杆菌(Mab^(S))和粗糙型脓肿分枝杆菌(Mab^(R)),并进行药敏试验研究,为临床诊断治疗提供科学依据。对Mab^(S)和MabR进行菌体形态观察、基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-... 详细信息

分析比较临床1例重症肺炎患者痰标本培养出的平滑型脓肿分枝杆菌(Mab^(S))和粗糙型脓肿分枝杆菌(Mab^(R)),并进行药敏试验研究,为临床诊断治疗提供科学依据。对Mab^(S)和MabR进行菌体形态观察、基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)和16S rRNA基因序列测序比对,构建系统发育进化树进行同源性分析,并采用比例法和肉汤法进行体外药敏试验。Mab^(S)和Mab^(R)菌落形态不同,MALDI-TOF MS分析MabR有223个蛋白峰,Mab^(S)有147个蛋白峰。16s RNA基因测序MabS为1 397 bp,Mab^(R)为1 402 bp,药敏试验显示二者对抗结核药几乎耐药,对绝大部分抗菌药物敏感。Mab^(S)和Mab^(R)对抗结核治疗药物普遍耐药,而对抗菌药物几乎敏感,联合使用抗菌药物治疗有较好的疗效,可供临床参考。

关键词：脓肿分枝杆菌基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱药物敏感性

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海南省白沙黎族自治县中小学生芽囊原虫分子遗传特征分析

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中国热带医学 2022年第10期22卷 909-912,934页

作者：强钰余永娟任广旭李佳琦赖秀仪王媛雷胜张云李婷婷周云飞吕刚海南医学院热带病转化医学重点实验室海南海口571199 海南医学院-香港大学热带传染病联合实验室海南海口571199 白沙黎族自治县人民医院检验科海南白沙572800 海南医学院基础医学与生命科学学院病原生物学教研室海南海口571199

目的为了解海南省白沙黎族自治县中小学生芽囊原虫感染情况及其亚型分布特征,对该地两所中小学的学生进行了调查研究。方法2021年3—11月,收集海南白沙黎族自治县两所中小学学生的粪便样本。采用PCR方法扩增芽囊原虫核糖体小亚基基因(sm... 详细信息

目的为了解海南省白沙黎族自治县中小学生芽囊原虫感染情况及其亚型分布特征,对该地两所中小学的学生进行了调查研究。方法2021年3—11月,收集海南白沙黎族自治县两所中小学学生的粪便样本。采用PCR方法扩增芽囊原虫核糖体小亚基基因(small subunit ribosomal RNA gene,SSU rDNA),通过序列分析确定芽囊原虫的感染情况和亚型,使用Mega 7软件构建系统发育进化树。同时对不同年级、性别的中小学生芽囊原虫的感染情况进行分析,评估感染相关因素。结果海南省白沙黎族自治县中小学生芽囊原虫感染率为4.1%(13/314),不同年级和性别的中小学生感染率差异无统计学意义(P>0.05)。经序列分析,共鉴定出3种芽囊原虫亚型,分别是ST3(n=7)、ST7(n=4)和ST1(n=2),这些亚型均具有人兽共患特性。结论本研究首次从分子水平对海南地区人群进行芽囊原虫研究,为该地区芽囊原虫病的防控提供了基础数据。多个人兽共患亚型的检出,提示未来需要进一步对该区域的人和动物进行芽囊原虫感染情况进行研究,以探究芽囊原虫可能感染的来源,为该地区芽囊原虫的防控提供科学依据。

关键词：芽囊原虫感染中小学生海南

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非人灵长类动物毕氏肠微孢子虫分子流行病学研究进展

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热带医学杂志 2019年第7期19卷 937-940页

作者：周换换马天明吕刚赵威海南医学院病原生物学教研室海南医学院-香港大学热带传染病联合实验室

毕氏肠微孢子虫是引起人体和多种动物腹泻的新发人兽共患病原体。种内呈现遗传多样性,已经鉴定出400多种毕氏肠微孢子虫基因型。迄今为止,在非人类灵长类动物中报道了73种基因型,其中51种基因型归聚在具有人兽共患传播特性的群组1,表明... 详细信息

毕氏肠微孢子虫是引起人体和多种动物腹泻的新发人兽共患病原体。种内呈现遗传多样性,已经鉴定出400多种毕氏肠微孢子虫基因型。迄今为止,在非人类灵长类动物中报道了73种基因型,其中51种基因型归聚在具有人兽共患传播特性的群组1,表明非人灵长类动物携带的毕氏肠微孢子虫具有人畜共患的可能性。本文就毕氏肠微孢子虫在非人灵长类动物中的感染率、基因型、人畜共患风险和致病性进行综述。

关键词：毕氏肠微孢子虫基因型人畜共患非人灵长类

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海南省680例不明原因发热患者恙虫病东方体感染调查

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中国热带医学 2022年第10期22卷 930-934页

作者：薛莉颖谢晓菲王高玉黄艺张丽媛何昌华贾毅博文书杜江尹飞飞海南医学院海南医学院热带病转化医学教育部重点实验室海南海口571199 海南医学院海南医学院-香港大学热带传染病联合实验室海南海口571199 海南医学院海南医学院病原生物学教研室海南海口571199 海南医学院第二附属医院热带病科海南海口570216 海南省疾病预防控制中心海南海口570203 琼中黎族苗族自治县人民医院检验科海南琼中572900

目的了解海南省不明原因发热患者的恙虫病东方体检感染情况,为不明原因发热患者恙虫病防治提供指导。方法收集2018—2021年海南医学院第一附属医院、海南医学院第二附属医院、海口市人民医院和琼中黎族苗族自治县人民医院临床诊断为不... 详细信息

目的了解海南省不明原因发热患者的恙虫病东方体检感染情况,为不明原因发热患者恙虫病防治提供指导。方法收集2018—2021年海南医学院第一附属医院、海南医学院第二附属医院、海口市人民医院和琼中黎族苗族自治县人民医院临床诊断为不明原因发热患者血液样本,利用胶体金免疫层析法和PCR方法分别对样本进行恙虫病东方体特异性IgM、IgG抗体和恙虫病东方体56kD型特异性抗原基因检测,同时收集样本的临床及流行病学信息,并进行流行病学分析。结果共收集临床不明原因发热患者血样680份,恙虫病东方体IgM、IgG抗体和56kD型特异性抗原PCR阳性率分别为23.97%(163/680)、36.62%(249/680)和20.88%(142/680),焦痂或皮疹率为12.06%(82/680)。根据诊断标准,最终诊断为恙虫病的患者为223例,其中男性111例(49.78%),女性109例(48.88%),平均年龄(53.14±15.12)岁,其中40~<60岁98例(占43.95%),感染人群民族中汉族136例(占60.99%),农民93例(41.70%),秋季发病114例(51.12%)。临床表现以非特异性症状与体征为主,36.77%患者出现皮肤特异性溃疡或焦痂。结论海南省是恙虫病的疫源地,流行时间有明显的季节性,预防重点应是秋季的农村地区,临床特征以高热和焦痂或溃疡为主。

关键词：恙虫病不明原因发热恙虫病东方体56kD型特异性抗原流行病特征

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海南鼠戊型肝炎病毒基因遗传进化分析

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海南医学院学报 2024年第20期30卷 1521-1526页

作者：汤婷田秀颖邓宛心李子涵杨聘雷胜杜江尹飞飞崔秀吉海南医学院基础医学与生命科学学院热带病转化医学教育部重点实验室海南医学院-香港大学热带传染病联合实验室海南医学院第一附属医院重大疾病生物样本资源海南省工程研究中心海南海口571199 中国医学科学院病原生物学研究所北京100005

目的:戊型肝炎病毒(hepatitis E virus,HEV)属于戊型肝炎病毒科(Hepeviridae),包括四个属,即HEV-A、-B、-C和-D。HEV是一种正单链,长约7 kb的裸露RNA病毒,可以引起急、慢性戊型肝炎,特别是孕妇感染HEV后死亡率较高。目前,普遍认为只有HE... 详细信息

目的:戊型肝炎病毒(hepatitis E virus,HEV)属于戊型肝炎病毒科(Hepeviridae),包括四个属,即HEV-A、-B、-C和-D。HEV是一种正单链,长约7 kb的裸露RNA病毒,可以引起急、慢性戊型肝炎,特别是孕妇感染HEV后死亡率较高。目前,普遍认为只有HEV-A对人类具有致病性。然而,近期在中国香港、西班牙和中非等地区陆续报告由HEV-C,即鼠戊型肝炎病毒感染引起的戊型肝炎病例,说明HEV-C也是一种人兽共患病毒,可传染于人类。在前期工作中,课题组从海南省澄迈县捕获的褐家鼠粪便中检测到了HEV-C基因部分片段。为进一步了解海南HEV-C基因分子特征,本研究中扩增了HEV-C全长基因,并对其进行了系统发育分析。方法:使用Trizol试剂从海南省澄迈县捕获的褐家鼠粪便中分离HEV RNA,并利用Oligo dT引物进一步转录合成cDNA。接着用PCR方法扩增HEV的四个ORF区,并用Sanger法测序,拼接全长HEV基因。利用MEGA X软件的Clustal W方法与参考序列进行比对,并构建系统进化树。结果:通过系统进化树分析发现本研究中扩增的HEV-C为C1型,与广东省湛江市褐家鼠中发现的HEV-C1(基因号:LC549184)的同源性是93.1%,但与我国云南省、香港特别行政区和湖北省等地区的同源性比较远,分别为65.7%、65.9%、85.4%。结论:本研究首次针对海南省褐家鼠携带HEV-C1全长基因进行了系统进化分析。该研究结果提示海南省存在HEV-C的鼠-人传播的潜在风险。因此,应继续控制鼠类的同时,也应预防鼠HEV传染人类的风险。

关键词：肝炎啮齿类动物鼠戊型肝炎病毒海南

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1株从败血症患者血液分离的念珠状链杆菌的生物学特征

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中华医院感染学杂志 2021年第8期31卷 1200-1204页

作者：周晓君轩断断张冠男王旭明苏屿邓垂文凌海青牛莉娜海南医学院病原生物学教研室海南医学院-香港大学热带传染病联合实验室海南海口571199 海南省人民医院检验科海南医学院附属海南医院海南海口570311 中国医学科学院国家皮肤与免疫疾病临床医学研究中心北京协和医院风湿免疫科北京100730 海南省白沙黎族自治县人民医院检验科海南白沙572800

目的采用形态学方法结合分子生物学方法分析1株临床败血症患者血液分离的念珠状链杆菌(Streptobacillus moniliformis),为临床罕见致病性病原菌的鉴定提供参考。方法采用革兰染色、DL-96E,VITEK2 Compact自动细菌鉴定仪、MALDI-TOF MS... 详细信息

目的采用形态学方法结合分子生物学方法分析1株临床败血症患者血液分离的念珠状链杆菌(Streptobacillus moniliformis),为临床罕见致病性病原菌的鉴定提供参考。方法采用革兰染色、DL-96E,VITEK2 Compact自动细菌鉴定仪、MALDI-TOF MS质谱仪结合16S rRNA基因序列进行细菌鉴定,同时采用E-test法开展药敏试验。结果传统方法和MALDI-TOF MS无法鉴定出该菌,16S rRNA鉴定出该菌为念珠状链杆菌,药敏试验结果显示该菌对青霉素、头孢噻肟、亚胺培南、四环素和环丙沙星敏感,对氨基糖苷类(妥布霉素)、阿米卡星、庆大霉素和磺胺甲噁唑/甲氧苄啶耐药。结论 16S rRNA分子生物学方法结合形态观察和生化反应可以很好地鉴定出念珠状链杆菌,青霉素、头孢噻肟、亚胺培南、四环素和环丙沙星可用于该菌临床治疗。

关键词：念珠状链杆菌 16S rRNA 药敏青霉素

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啮齿动物芽囊原虫的流行病学研究进展

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热带医学杂志 2023年第2期23卷 267-273页

作者：李佳琦任广旭赖秀仪王媛吕刚海南医学院热带转化医学教育部重点实验室海南海口571199 海南医学院热带病防治国家卫生健康委员会重点实验室海南海口571199 海南医学院—香港大学热带传染病联合实验室海南海口571199 海南医学院病原生物学教研室海南海口571199 海南医学院公共卫生与全健康国际学院海南海口571199

芽囊原虫是一种常见的人兽共患肠道寄生虫,呈世界性分布且动物宿主广泛,多数研究认为该虫具有机会致病性,低免疫人群感染可能会引起腹泻等症状。啮齿动物是地球上最大的且与人类生活密切相关的哺乳动物种群,具有种类多、分布广和适应性... 详细信息

芽囊原虫是一种常见的人兽共患肠道寄生虫,呈世界性分布且动物宿主广泛,多数研究认为该虫具有机会致病性,低免疫人群感染可能会引起腹泻等症状。啮齿动物是地球上最大的且与人类生活密切相关的哺乳动物种群,具有种类多、分布广和适应性强的特点,是芽囊原虫重要的宿主,是多种人兽共患病原体的传播媒介,具有重要的公共卫生学意义。本文对全球啮齿动物芽囊原虫的流行病学情况进行综述,旨在为芽囊原虫病防控提供参考。

关键词：芽囊原虫啮齿动物人兽共患亚型

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