检索结果-内蒙古大学图书馆

热带作物学报 2021年第7期42卷 1860-1867页

作者：张郎织李季肤黄杰王志勇陈志坚海南大学林学院/热带特色林木花卉遗传与种质创新教育部重点实验室海南海口570228 中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所/农业农村部华南作物基因资源与种质创制重点实验室海南海口571101

铝毒被认为是酸性土壤上抑制植物根系生长的重要胁迫因素之一。多药及毒性化合物外排转运蛋白(multidrug and toxic compound extrusion,MATE)在根系柠檬酸转运耐铝毒中起重要作用。以地毯草(Axonopus compressus)为材料,对AcMATE1基因... 详细信息

铝毒被认为是酸性土壤上抑制植物根系生长的重要胁迫因素之一。多药及毒性化合物外排转运蛋白(multidrug and toxic compound extrusion,MATE)在根系柠檬酸转运耐铝毒中起重要作用。以地毯草(Axonopus compressus)为材料,对AcMATE1基因进行克隆、生物信息学和基因表达分析。结果表明:铝处理抑制了地毯草根系的生长,包括总根长、根表面积和根体积。通过PCR克隆到地毯草AcMATE1基因,该基因cDNA全长1602 bp,编码433个氨基酸残基。AcMATE1蛋白分子量为45.9 kDa,属于疏水性蛋白。AcMATE1蛋白包含MatE保守结构域和9个跨膜结构域。亚细胞定位预测分析结果表明,AcMATE1定位于细胞膜上。实时荧光定量PCR结果表明,金属铝(Al)和镉(Cd)处理显著增强AcMATE1基因在地毯草根系中的表达,而镧(La)处理则抑制AcMATE1基因的表达。并且不同铝浓度和时间处理进一步验证Al可增强AcMATE1基因在地毯草根中的表达。此外,AcMATE1基因在地毯草根、茎和叶中均有表达,且在0~1 cm根段中的表达量高于其他根段中的表达量。本研究结果为解析地毯草响应铝毒害的机理提供候选基因资源。

关键词：地毯草铝毒 MATE转运蛋白根系基因表达

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铁皮石斛热激蛋白HSP70家族基因鉴定及温度胁迫下的表达分析

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园艺学报 2021年第9期48卷 1743-1754页

作者：赵溪张婷婷邢文婷王健宋希强周扬海南大学园艺学院海南省热带园艺作物品质调控重点实验室海南省热带特色花木资源生物学重点实验室海南省耐盐作物生物技术重点实验室海口570228 海南大学林学院热带特色林木花卉遗传与种质创新教育部重点实验室海口570228 海南省林业科学研究院海口571000

为研究铁皮石斛(Dendrobium catenatum Lindl.)应对温度胁迫的响应机制,利用生物信息学方法对其热激蛋白HSP70家族基因进行鉴定。荧光定量PCR技术分析它们的组织表达特性,以及在高温(42℃)和低温(4℃)胁迫下的表达模式。从其基因组中鉴... 详细信息

为研究铁皮石斛(Dendrobium catenatum Lindl.)应对温度胁迫的响应机制,利用生物信息学方法对其热激蛋白HSP70家族基因进行鉴定。荧光定量PCR技术分析它们的组织表达特性,以及在高温(42℃)和低温(4℃)胁迫下的表达模式。从其基因组中鉴定出10个家族成员,其编码的氨基酸数在628~702之间,分子量在69.65~75.15 kD,理论等电点在5.12~6.18之间。进化树分析可将这10个蛋白分为4个亚族,且每个亚族蛋白的保守基元相似。基因结构分析表明,HSP70的内含子数量为1~7不等。HSP70在铁皮石斛中的表达具有组织特异性,在合蕊柱中最高。低温处理铁皮石斛组培苗后,DcHSP70-1和DcHSP70-7呈上调表达,推测其响应低温胁迫;高温胁迫下,DcHSP70-2、DcHSP70-3、DcHSP70-5和DcHSP70-7的表达量上调比较明显,推测它们在响应高温胁迫中起主要作用。

关键词：铁皮石斛 HSP70家族基因特征分析温度胁迫表达分析

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邓恩桉根茎叶的转录组比较和AP2/ERF基因家族分析

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分子植物育种 2023年

作者：周韬蔡兴奇陈英转李智虓蒋钢蒋华蒋年高郭东强邓紫宇海南大学热带特色林木花卉遗传与种质创新教育部重点实验室海南省热带特色花木资源生物学重点实验室海南五指山森林生态系统国家定位观测研究站海南大学林学院广西林业集团有限公司全州县咸水林场广西壮族自治区林业科学研究院广西南宁桉树森林生态系统定位观测研究站广西优良用材林资源培育重点实验室

为了解析邓恩桉的遗传基础，本研究通过Hiseq平台对邓恩桉的根、茎和叶进行转录组测序，对序列进行了组装注释和生物信息学分析，对比分析了各组织中的Unigene表达差异，鉴定了AP2/ERF转录因子家族的成员。结果表明，获得38 925个Unigen... 详细信息

为了解析邓恩桉的遗传基础，本研究通过Hiseq平台对邓恩桉的根、茎和叶进行转录组测序，对序列进行了组装注释和生物信息学分析，对比分析了各组织中的Unigene表达差异，鉴定了AP2/ERF转录因子家族的成员。结果表明，获得38 925个Unigene，在8个数据库中共注释了29 906个Unigene。膜组成部分和ATP结合的GO注释结果最多。KOG注释结果最多的为一般功能预测和翻译后修饰。KEGG注释结果表明，有3 315个序列参与了113条代谢通路，参与基因最多的为核糖体和植物激素信号转导通路。此外，共检测到了8 407个SSR位点和119 250个SNP位点。对比分析了邓恩桉根部和茎的转录差异，发现了5 629个差异表达基因，主要富集的GO条目为细胞外区域，主要富集的KEGG通路为苯丙烷生物合成。对比分析了根部和叶之间的转录差异，发现了6 793个差异表达基因，主要富集的GO条目为细胞外区域，主要富集的KEGG通路为光合作用。对胁迫相关基因进行了聚类分析，分为3个类别，分别在根、茎、叶中高表达。邓恩桉的根、茎和叶组织中最主要胁迫相关基因分别为普遍胁迫蛋白、热激蛋白和热激蛋白。鉴定出AP2/ERF家族基因99个，其中AP2家族含有10个基因，RAV家族含有2个基因，ERF家族包含87个基因，分为10个类别，各基因家族在根茎叶中的表达模式有所差异。本研究为邓恩桉的功能基因研究和分子标记开发提供参考。

关键词：邓恩桉转录组比较分析胁迫基因 AP2/ERF基因家族

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文心兰炭疽病生防潜力菌的鉴定及其抑菌性的测定

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热带生物学报 2021年第2期12卷 236-243页

作者：汪玉玲宋希强郭向阳王洪星郭梨锦海南大学热带特色林木花卉遗传与种质创新教育部重点实验室/林学院海口570228

为获得对文心兰(Oncidium hybridum)炭疽病具有生物防治潜力的菌株,前期从健康文心兰"博大1号"叶片中分离得到1株内生菌株WB75,通过平板对峙法和发酵液抑菌性判定该菌具有防治炭疽病的生防潜力。平板对峙结果表明,菌株WB75对... 详细信息

为获得对文心兰(Oncidium hybridum)炭疽病具有生物防治潜力的菌株,前期从健康文心兰"博大1号"叶片中分离得到1株内生菌株WB75,通过平板对峙法和发酵液抑菌性判定该菌具有防治炭疽病的生防潜力。平板对峙结果表明,菌株WB75对胶孢炭疽菌的抑制率为58.79%。菌株WB75的发酵原液和高温处理后的发酵液对胶孢炭疽菌的抑制率分别为77.69%和41.26%,由此推测WB75抑菌活性物质的热稳定性较差。菌株WB75对8种(热带生炭疽菌Colletotrichum tropicicola、鹰嘴豆枯萎镰刀菌Fusarium delphinoides、腐皮镰孢菌Fusarium solani、隔孢假壳科真菌Paraconiothyrium thysanolaenae、尖孢镰刀菌Fusarium oxysporum、画眉草弯孢菌Curvularia eragrostidis、芒果球座菌Guignardia mangiferae、巨座壳科真菌Muyocopron alcornii)文心兰致病菌(12株)均有较好的抑制作用,抑制率38.42%~91.53%。通过生理生化特性和16S rDNA、gyrA和gyrB多基因序列比对,鉴定菌株WB75为解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)。这株解淀粉芽孢杆菌是对文心兰病害具有拮抗作用的潜在生防菌。

关键词：文心兰炭疽病解淀粉芽孢杆菌生物防治

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本科生科研创新能力培养模式探索——以交叉学科生物信息学为例

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中国教育技术装备 2021年第8期 102-103页

作者：谢尚潜季凯凯邢剑锋赵莹宋希强海南大学林学院热带特色林木花卉遗传与种质创新教育部重点实验室 570228

生物信息学是涉及生命科学、计算机、数学、大数据等多领域交叉型学科。依托海南大学林学院生物信息平台,以海南大学开设的生物信息学课程为例,探讨在交叉学科背景下的本科培养中,如何更有针对性地提高学生的科研创新能力,从而满足多学... 详细信息

生物信息学是涉及生命科学、计算机、数学、大数据等多领域交叉型学科。依托海南大学林学院生物信息平台,以海南大学开设的生物信息学课程为例,探讨在交叉学科背景下的本科培养中,如何更有针对性地提高学生的科研创新能力,从而满足多学科交叉背景复合创新型人才的培养要求,为探索和实践多学科交叉背景下的本科生科研创新能力培养机制提供重要的模式参考,对推进本科生教育改革创新提供重要的范例。

关键词：本科生生物信息平台科研创新能力生物信息学交叉学科

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低磷胁迫对柱花草生长及抗氧化系统的影响

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热带作物学报 2021年第10期42卷 2875-2880页

作者：王金鹏廖丽刘国道罗丽娟刘攀道王志勇海南大学热带作物学院海南海口570228 中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所/农业农村部华南作物基因资源与种质创新重点实验室海南海口571101 热带特色林木花卉遗传与种质创新教育部重点实验室/海南大学林学院海南海口570228

以基因型TF291柱花草为供试材料,分析低磷处理(5μmol/L)对柱花草生长、抗氧化物质及抗氧化保护酶的影响,探索柱花草抗氧化系统在低磷胁迫下的响应机制。结果表明:(1)与对照磷处理(250μmol/L)相比,低磷处理抑制了柱花草生长,其叶绿素... 详细信息

以基因型TF291柱花草为供试材料,分析低磷处理(5μmol/L)对柱花草生长、抗氧化物质及抗氧化保护酶的影响,探索柱花草抗氧化系统在低磷胁迫下的响应机制。结果表明:(1)与对照磷处理(250μmol/L)相比,低磷处理抑制了柱花草生长,其叶绿素浓度、最大光化学效率、地上部和根部生物量均显著降低(P<0.05)。(2)随着低磷处理时间的增加,15 d时叶片CAT、POD、SOD、ASP、PAL活性和类黄酮含量显著提升(P<0.05);30 d时叶片CAT、SOD、ASP、PPO活性和MDA、H_(2)O_(2)含量显著提高(P<0.05)。本研究结果可为进一步探索低磷胁迫下柱花草抗氧化系统的分子响应机制提供重要依据。

关键词：柱花草活性氧低磷胁迫抗氧化系统

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海南引种睡莲表型多样性分析及评价

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热带作物学报 2021年第10期42卷 2777-2788页

作者：潘庆龙付瑛格谷佳盛玉辉李清雪饶英朱天龙周扬史佑海赵莹王健热带特色林木花卉遗传与种质创新教育部重点实验室/海南省热带特色花木资源生物学重点实验室/海南大学林学院海南海口570228 青岛恒星科技学院山东青岛266100 贵州大学贵州贵阳550025 海南佛渡莲源生态农业有限公司海南海口570228

以海南引种的86份睡莲资源作为研究对象,对45个表型性状进行多样性、相关性、聚类、主成分等分析。结果表明:86份睡莲表型性状存在着丰富的变异。13个数量性状的多样性指数范围为0.612~2.041,最高的是花瓣宽度(2.041),最低的是萼片枚数(... 详细信息

以海南引种的86份睡莲资源作为研究对象,对45个表型性状进行多样性、相关性、聚类、主成分等分析。结果表明:86份睡莲表型性状存在着丰富的变异。13个数量性状的多样性指数范围为0.612~2.041,最高的是花瓣宽度(2.041),最低的是萼片枚数(0.612);32个质量性状的多样性指数范围为0.259~1.648,最高的是花色(1.648),而柱头盘颜色(0.259)和中轴突颜色(0.259)两个性状的多样性指数最低。13个数量性状的变异系数范围为19.98%~122.06%,其中具有强变异的性状有两个,分别为雄蕊个数(122.06%)、花瓣总数(109.87%)。相关性分析表明,叶长与叶宽等6对性状呈极显著性正相关(P<0.01)。聚类分析将86份睡莲分为4个类群,依次为:广热带睡莲品种群、澳大利亚睡莲品种群、古热带睡莲品种群、广温带睡莲品种群。主成分分析共提取出特征值大于1.5的8个主成分,累积贡献率为60.838%。86份供试睡莲综合评分排名最高的为‘澳洲白巨’睡莲,最低的为‘小白子午莲’睡莲。

关键词：睡莲资源表型性状聚类分析主成分分析

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菠萝蜜叶绿素缺失突变体幼苗维管组织结构分析

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热带作物学报 2021年第7期42卷 1948-1956页

作者：董俊娜王之欣于旭东吴繁花付影罗佳佳蔡泽坪张涵海南大学林学院/热带特色林木花卉遗传与种质创新教育部重点实验室海南海口570228 海南大学生命科学与药学院海南海口570228 中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所海南海口571101

木本植物维管组织发育对木材形成意义重大。本研究利用石蜡切片法和光学显微技术,研究菠萝蜜(Artocarpus heterophyllus)叶绿素缺失突变体(chlorophyll deficient mutant,CDM)幼苗不同部位的维管组织结构,观察及测量导管分子、筛管分子... 详细信息

木本植物维管组织发育对木材形成意义重大。本研究利用石蜡切片法和光学显微技术,研究菠萝蜜(Artocarpus heterophyllus)叶绿素缺失突变体(chlorophyll deficient mutant,CDM)幼苗不同部位的维管组织结构,观察及测量导管分子、筛管分子的孔径和密度等,分析了维管组织和形成层的特点。结果表明,CDM幼苗的根、茎、叶柄和叶主脉维管组织中的木质部和韧皮部的结构均发生改变。与正常苗相比,CDM幼苗中次生木质部导管分子和韧皮部筛管分子的孔径和面积减小,密度增大;根和茎维管组织中形成层厚度减小,层数减少;CDM茎中的维管组织相比于根显示出更强的抑制作用。本研究为进一步探索木本植物维管组织发育提供了新材料。

关键词：菠萝蜜叶绿素缺失突变体幼苗维管组织

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基于PacBio平台的掌叶鱼黄草全长转录组分析

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分子植物育种 2022年第9期20卷 2939-2948页

作者：张守信陈英转郑奋薄文浩周韬龙文兴海南大学林学院海口570228 海南大学热带特色林木花卉遗传与种质创新教育部重点实验室海南省热带特色花木资源生物学重点实验室海南五指山森林生态系统定位观测生态站海口570228 文昌市林业科学研究所文昌571321 北京林业大学生物科学与技术学院北京100083

掌叶鱼黄草是一种药用植物,但其药用成分的合成途径和调控基因尚不明确。为了进一步了解掌叶鱼黄草的遗传信息,探寻次生代谢产物合成的分子基础,本研究通过PacBio平台对掌叶鱼黄草进行了全长转录组测序。组装测序结果获得17339个Unigene... 详细信息

掌叶鱼黄草是一种药用植物,但其药用成分的合成途径和调控基因尚不明确。为了进一步了解掌叶鱼黄草的遗传信息,探寻次生代谢产物合成的分子基础,本研究通过PacBio平台对掌叶鱼黄草进行了全长转录组测序。组装测序结果获得17339个Unigene,注释了17163个Unigene。有8606个Unigene参与了156条代谢通路。其中包含18条次生代谢产物合成通路,相关Unigene有395个。在这些通路中,苯丙素类、三萜类和叶酸等合成产物可能与掌叶鱼黄草的药用活性有关。本研究为掌叶鱼黄草后续次生代谢产物合成和药理机制研究工作提供基础,全长转录组序列信息可以为后续二代转录组测序结果拼接提供参考模板。

关键词：掌叶鱼黄草全长转录组基因功能注释次生代谢产物合成通路

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光照、油菜素内酯和乙烯在水稻根不对称生长中的相互作用

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分子植物育种 2021年第21期19卷 7186-7192页

作者：王紫璇姜庚博王玥于旭东罗佳佳蔡泽坪黄禛海南大学林学院热带特色林木花卉遗传与种质创新教育部重点实验室海口570228 中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所海口571101 海南大学热带作物学院海口570228

油菜素内酯(brassinolide, BL)和乙烯(Ethylene)可诱导植物根发生不对称生长,形成波浪形弯曲(Wave)或卷曲(Coiling)。光照是调控根生长的重要因素,其与BL和乙烯存在诸多联系,但三者在根不对称生长中的相互作用关系仍未知。为探究光照、B... 详细信息

油菜素内酯(brassinolide, BL)和乙烯(Ethylene)可诱导植物根发生不对称生长,形成波浪形弯曲(Wave)或卷曲(Coiling)。光照是调控根生长的重要因素,其与BL和乙烯存在诸多联系,但三者在根不对称生长中的相互作用关系仍未知。为探究光照、BL和乙烯在根不对称生长中的相互作用,本研究分别设置光暗、BL和乙烯抑制剂处理组,观察并统计水稻(Oryza sativa)根的不对称生长情况。结果表明:光照和BL在根不对称生长中具有协同促进作用,且此过程依赖于乙烯途径。此结果为探究环境因素与植物激素互作调控根不对称生长提供了具体的实验依据。

关键词：光油菜素内酯乙烯根不对称生长

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