检索结果-内蒙古大学图书馆

微生物学报 2025年第2期65卷 524-536页

作者：唐雅碧吴佳玲李晓谢宁深圳大学生命与海洋科学学院深圳市微生物基因工程重点实验室广东深圳

丝状真菌的衰老是一个涉及多种生理生化变化的复杂过程,受外部环境和遗传的共同影响,且伴随细胞功能退化与生理损伤。丝状真菌因其遗传操作容易、生命周期短、便于量化的衰老特征等优势被广泛用于衰老机制研究。本研究对丝状真菌的衰老... 详细信息

丝状真菌的衰老是一个涉及多种生理生化变化的复杂过程,受外部环境和遗传的共同影响,且伴随细胞功能退化与生理损伤。丝状真菌因其遗传操作容易、生命周期短、便于量化的衰老特征等优势被广泛用于衰老机制研究。本研究对丝状真菌的衰老特征进行综述,并归纳环境因素、线粒体稳定性、氧化应激和代谢水平等影响衰老的因素,解析衰老过程的调控机制,进一步挖掘丝状真菌在工业应用中的应用价值,期望能为人类衰老的研究提供新的研究思路。

关键词：丝状真菌衰老线粒体DNA(mtDNA)稳定性自噬遗传调控机制

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纳升液相色谱-高分辨串联质谱分析尿液多肽组及其翻译后修饰

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分析化学 2016年第5期44卷 716-722页

作者：洪晓愉李水明王勇深圳大学生命与海洋科学学院深圳市微生物基因工程重点实验室深圳大学生命与海洋科学学院深圳市海洋生物资源与生态环境重点实验室

多肽组是指生物体表达的所有多肽,尿液等体液的多肽组是生物标记物的重要来源。本研究采用氧化石墨烯-磷酸镧纳米磁性复合材料分离富集尿液多肽,进行纳升液相色谱-高分辨串联质谱分析,从单一样本中鉴定了归属于123个蛋白质的790条肽段... 详细信息

多肽组是指生物体表达的所有多肽,尿液等体液的多肽组是生物标记物的重要来源。本研究采用氧化石墨烯-磷酸镧纳米磁性复合材料分离富集尿液多肽,进行纳升液相色谱-高分辨串联质谱分析,从单一样本中鉴定了归属于123个蛋白质的790条肽段。研究表明,这些肽段在蛋白质水平上不是平均分布的。此外,本研究检测到了肽段的氧化、磷酸化和脱氨化等翻译后修饰现象,观察到了尿液多肽的阶梯序列性,从蛋白水平上对尿液多肽组进行了生物信息学分析,结果表明,这些多肽所归属的大部分蛋白质之间存在相互作用。本方法可为在尿液中寻找疾病的标志物提供方法学支持。

关键词：多肽组纳升液相色谱-高分辨串联质谱尿液翻译后修饰

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PSTI1可提高大肠杆菌应答胁迫能力

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深圳大学学报（理工版） 2011年第4期28卷 347-355页

作者：刘士德陈汗英张建华田生礼李水明李慧丽李明华邢苗深圳大学生命科学学院深圳市微生物基因工程重点实验室深圳518060

指出含典型34肽重复序列结构域(tetratricopeptide repeat,TPR)的胁迫诱导蛋白(stress-in-ducible protein-1,STI1)是真核生物特有的一类与胁迫应答有关的分子伴侣蛋白.作者从多头绒泡菌分离出一个STI1类似蛋白cDNA,因其编码蛋白含有两... 详细信息

指出含典型34肽重复序列结构域(tetratricopeptide repeat,TPR)的胁迫诱导蛋白(stress-in-ducible protein-1,STI1)是真核生物特有的一类与胁迫应答有关的分子伴侣蛋白.作者从多头绒泡菌分离出一个STI1类似蛋白cDNA,因其编码蛋白含有两个非典型的TPR结构域,命名为PSTI1.为了解PSTI1对原核生物胁迫应答功能的影响,观察表达PSTI1的大肠杆菌(Escherichia coli,***)与原菌株的增殖差异,发现PSTI1表达菌耐受盐、渗透压、重金属离子、氧化、缺氧和酸碱变化胁迫的能力均增强,但对高温敏感.PSTI1保守结构域TPR1能提高***耐受渗透压胁迫的能力,但TPR2会使***对盐和渗透压胁迫敏感,说明TPR1和TPR2在PSTI1调控胁迫应答中可能扮演不同角色.通过pull-down和质谱分析技术检测了与PSTI1作用的***蛋白,发现PSTI1能与***的HtpG(Hsp90)、La蛋白酶和过氧化氢酶HpII等作用,说明PSTI1具有原核生物非典型TPR结构域蛋白的类似功能,是类似STI1的胁迫应答蛋白.

关键词：微生物细胞生物学多头绒泡菌 STI1类似蛋白 cDNA文库大肠杆菌胁迫应答真菌基因工程基因编码

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铜离子与SALI3-2蛋白的相互作用

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高等学校化学学报 2013年第1期34卷 128-134页

作者：唐玉林高占徐宏贺建芝董一含郑易之深圳市微生物基因工程重点实验室深圳大学生命科学学院深圳518060 深圳市海洋生物资源与生态环境重点实验室

用1/2 MS固体培养基培养拟南芥幼苗,研究了CuCl2对转Sali3-2基因植株生长的影响,发现转基因植株Sali3-2的表达可提高其耐受Cu2+胁迫的能力.进一步克隆Sali3-2基因,表达并纯化了缺失信号肽的SALI3-2蛋白.利用固定金属离子亲和色谱(IMAC)... 详细信息

用1/2 MS固体培养基培养拟南芥幼苗,研究了CuCl2对转Sali3-2基因植株生长的影响,发现转基因植株Sali3-2的表达可提高其耐受Cu2+胁迫的能力.进一步克隆Sali3-2基因,表达并纯化了缺失信号肽的SALI3-2蛋白.利用固定金属离子亲和色谱(IMAC)分析发现,Cu2+能够与SALI3-2蛋白结合.通过荧光光谱及圆二色光谱(CD)进一步研究了Cu2+与SALI3-2蛋白间的键合机理.结果表明,Cu2+可引起SALI3-2蛋白内源性荧光猝灭,其猝灭机制为静态猝灭;Cu2+与SALI3-2蛋白的结合常数为8.89×106,结合位点数为***分析显示,Cu2+与SALI3-2蛋白的结合未使SALI3-2蛋白二级结构发生明显改变.由此推测,在高浓度铜离子胁迫下,SALI3-2蛋白通过结合一定数量的Cu2+使蛋白的构象发生改变,这可能是SALI3-2蛋白的表达使植物耐受Cu2+胁迫能力提高的分子机制之一.

关键词：铜离子 SALI3-2蛋白金属离子亲和层析荧光光谱圆二色光谱

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溶菌酶基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱分析中的不常见修饰及脱水反应

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分析化学 2013年第4期41卷 494-499页

作者：王勇李水明何曼文深圳大学生命科学学院深圳市海洋生物资源与生态环境重点实验室深圳大学生命科学学院深圳市微生物基因工程重点实验室

利用基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱(MALDI-TOF/TOF)分析了溶菌酶标准蛋白,在常规搜库条件下鉴定到6个独立肽段,Mascot得分420,鉴定覆盖率为54%。此外,经人工解析发现,肽段IVSDG-DGMNAWVAWR(98→112)在样品处理过程中发生了天... 详细信息

利用基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱(MALDI-TOF/TOF)分析了溶菌酶标准蛋白,在常规搜库条件下鉴定到6个独立肽段,Mascot得分420,鉴定覆盖率为54%。此外,经人工解析发现,肽段IVSDG-DGMNAWVAWR(98→112)在样品处理过程中发生了天冬酰胺脱氨化、天冬酰胺脱氨化+甲硫氨酸氧化、天冬酰胺脱氨化+甲硫氨酸氧化+色氨酸氧化等修饰,在激光解吸电离过程中发生脱水反应,脱水位点是脱氨后形成的第103位天冬氨酸。此外,还发现了部分肽段的丙酰胺化修饰。本研究表明,选择一级质谱中的极低丰度离子进行串联质谱分析和利用人工解析方法分析数据库未匹配数据,有可能发现一些特殊的蛋白质修饰,可增加数据利用度和分析结果的确定性。

关键词：溶菌酶基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱天冬酰胺脱氨化甲硫氨酸氧化

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串联飞行时间质谱中亚胺离子的断裂特征及其在肽段鉴定中的作用

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分析化学 2014年第7期42卷 1010-1016页

作者：王勇李水明何曼文深圳大学生命科学学院深圳市海洋生物资源与生态环境重点实验室深圳大学生命科学学院深圳市微生物基因工程重点实验室

基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱(MALDI-TOF/TOF)产生的亚胺离子可以提供丰富的肽段组成信息,该方法通常用于基于数据库搜索的蛋白质鉴定,或者结合化学衍生法用于从头测序,因而在一定程度上限制了对亚胺离子的认识及应用。本研... 详细信息

基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱(MALDI-TOF/TOF)产生的亚胺离子可以提供丰富的肽段组成信息,该方法通常用于基于数据库搜索的蛋白质鉴定,或者结合化学衍生法用于从头测序,因而在一定程度上限制了对亚胺离子的认识及应用。本研究利用239个串联质谱探索MALDI-TOF/TOF中亚胺离子的断裂特征以及它们在肽段鉴定中的应用,发现在高能碰撞诱导解离条件下组氨酸等14种氨基酸可产生较强的亚胺离子信号(>50%阳性率),氨基酸的化学结构、位置效应和氨基酸残基个数是影响碎片离子强度的主要因素。此外,探讨了亚胺离子应用过程中的假阳性问题,提出亚胺离子相对强度的比较可以降低假阳性和提高肽段鉴定确定度,有助于完善目前的数据库搜索算法和辅助从头测序分析。

关键词：亚胺离子基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱蛋白质鉴定肽段鉴定

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应用荧光光谱法研究植物LEA3蛋白11-氨基酸基序的保护功能

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光谱学与光谱分析 2011年第6期31卷 1579-1584页

作者：刘昀邓银霞张玉芹徐宏郑易之深圳大学生命科学学院深圳市微生物基因工程重点实验室广东深圳518060 深圳大学化学与化工学院广东深圳518060

胚胎晚期富集蛋白(late embryogenesis abundant,LEA)是增强生物抵抗干旱、低温和盐渍等多种胁迫的重要功能蛋白,但其保护机理仍不清楚。本文利用紫外光谱法证实,含多拷贝11-氨基酸基序的多肽(如PM2D和PM2E)可较好的保护经冻融的乳酸脱... 详细信息

胚胎晚期富集蛋白(late embryogenesis abundant,LEA)是增强生物抵抗干旱、低温和盐渍等多种胁迫的重要功能蛋白,但其保护机理仍不清楚。本文利用紫外光谱法证实,含多拷贝11-氨基酸基序的多肽(如PM2D和PM2E)可较好的保护经冻融的乳酸脱氢酶(LDH)活性。进一步通过荧光光谱法证实,含多拷贝11-氨基酸基序的多肽可通过多位点协同结合模式,稳定LDH酶的结构。而含低拷贝11-氨基酸基序的多肽(如PM2F和PM2G)与LDH酶只有一种结合位点,二者的结合强度较弱,因而不能表现出对LDH酶活性的保护作用。此外,含多拷贝11-氨基酸的多肽与海藻糖在保护LDH酶活性上存在协同作用,且二者有着不同的保护机理。

关键词：紫外光谱荧光光谱胚胎晚期富集蛋白 11-氨基酸基序 LDH酶保护作用

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基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱鉴定鲨鱼硒结合蛋白

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质谱学报 2013年第5期34卷 257-262页

作者：王勇李水明何曼文深圳大学生命科学学院深圳市海洋生物资源与生态环境重点实验室广东深圳518060 深圳大学生命科学学院深圳市微生物基因工程重点实验室广东深圳518060

利用基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱(MALDI-TOF/TOF)高置信度地鉴定了原核表达的白鳍鲨硒结合蛋白。实验表明,硒结合蛋白肽段之一被错误指认为胰酶自水解峰和混合谱是影响其未进行串联质谱分析或不能被数据库搜索匹配的主要原因... 详细信息

利用基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱(MALDI-TOF/TOF)高置信度地鉴定了原核表达的白鳍鲨硒结合蛋白。实验表明,硒结合蛋白肽段之一被错误指认为胰酶自水解峰和混合谱是影响其未进行串联质谱分析或不能被数据库搜索匹配的主要原因,同时还发现,虽然赖氨酸结尾肽段在MALDI源中信号强度普遍很低,但对它们进行串联质谱分析也可获得较好的谱图质量,部分数据可用于从头测序。考虑以上因素后,硒结合蛋白鉴定覆盖率由35%增至51%。

关键词：硒结合蛋白基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱(MALDI-TOF TOF) 蛋白质鉴定数据库搜索手工解析

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人脑中硒蛋白W与鞘脂激活蛋白原相互作用的筛选与验证

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生物化学与生物物理进展 2014年第8期41卷 755-764页

作者：陈平刘晴马孝杰王诗捷刘琼倪嘉缵深圳大学生命科学学院深圳市海洋生物资源与环境重点实验深圳市微生物基因工程重点实验室深圳508160

硒蛋白W(SelW)是人脑中一种重要的硒蛋白.在缺硒的条件下,SelW在脑中具有优先储备的特性,但其具体机制和在脑中的功能至今尚不清楚.本文以SelW突变体SelW′为"诱饵",采用酵母双杂交系统对人胎脑文库进行筛选,获得与SelW相互... 详细信息

硒蛋白W(SelW)是人脑中一种重要的硒蛋白.在缺硒的条件下,SelW在脑中具有优先储备的特性,但其具体机制和在脑中的功能至今尚不清楚.本文以SelW突变体SelW′为"诱饵",采用酵母双杂交系统对人胎脑文库进行筛选,获得与SelW相互作用的蛋白,其中一种为鞘脂激活蛋白原(PSAP).采用荧光共振能量转移技术中的受体漂白和敏化发射两种方法,验证了SelW与PSAP的相互作用.构建表达载体在大肠杆菌中成功表达出SelW′,利用Pull-down技术验证了SelW′与PSAP在细胞外的直接相互作用.采用免疫共沉淀的方法验证了上述两种蛋白在昆明小鼠脑组织中的内源性相互作用.基于SelW和PSAP的已知生物功能,推测SelW可能在脑部发育和神经退行性疾病形成过程中发挥着重要作用.

关键词：硒蛋白W 酵母双杂交,荧光共振能量转移,Pul-down技术免疫共沉淀鞘脂激活蛋白原

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亚胺及其相关离子在区分赖氨酸和谷氨酰胺残基中的应用

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质谱学报 2014年第3期35卷 256-261页

作者：李水明何曼文王勇深圳大学生命科学学院、深圳市海洋生物资源与生态环境重点实验室广东深圳518060 深圳大学生命科学学院、深圳市微生物基因工程重点实验室广东深圳518060

完全从头测序要求区分肽段中的同量异序氨基酸谷氨酰胺和赖氨酸,而这通常需要借助高分辨质谱。谷氨酰胺和赖氨酸都可以产生m/z 101亚胺离子和m/z 84亚胺相关离子,尽管已知赖氨酸亚胺离子m/z101有时强度较弱,以及m/z84离子可预示赖氨酸... 详细信息

完全从头测序要求区分肽段中的同量异序氨基酸谷氨酰胺和赖氨酸,而这通常需要借助高分辨质谱。谷氨酰胺和赖氨酸都可以产生m/z 101亚胺离子和m/z 84亚胺相关离子,尽管已知赖氨酸亚胺离子m/z101有时强度较弱,以及m/z84离子可预示赖氨酸的存在,但该特征能否用于区分赖氨酸和谷氨酰胺仍存在争议。本工作以合成肽段和蛋白质胰酶水解肽段为研究体系,利用基质辅助激光解吸电离的高能碰撞诱导解离模式产生的亚胺及其相关离子的相对强度区分这两种氨基酸。结果表明:谷氨酰胺更易产生m/z101离子,而赖氨酸更易产生m/z84和m/z129离子。对于不同时含有赖氨酸和谷氨酰胺的肽段,使用m/z84离子与亚胺离子m/z101的相对强度比值,而非它们的绝对强度,以及m/z101离子的测量值,可以直接判断序列中存在的是赖氨酸还是谷氨酰胺。对于含有谷氨酰胺,并以赖氨酸结尾或含有漏切赖氨酸的肽段,该强度比可为序列中谷氨酰胺的个数和位置提供参考。因此,低质量区提供的亚胺及其相关离子信息有助于区分赖氨酸和谷氨酰胺。

关键词：亚胺离子基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱赖氨酸谷氨酰胺同量异序氨基酸

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