检索结果-内蒙古大学图书馆

科学通报 2024年第30期69卷 4415-4431页

作者：李润泽陈旭杨雪瑞生物信息学教育部重点实验室合成与系统生物学中心清华大学生命科学学院北京100084

作为近年来快速发展的新兴技术,空间转录组学已经极大地改变了生物和医学多个领域的研究范式.这一技术保留了复杂组织中细胞的空间定位信息,并且以多细胞团、单细胞或亚细胞分辨率进行转录组分析.细胞空间定位信息与其分子特征谱的耦合... 详细信息

作为近年来快速发展的新兴技术,空间转录组学已经极大地改变了生物和医学多个领域的研究范式.这一技术保留了复杂组织中细胞的空间定位信息,并且以多细胞团、单细胞或亚细胞分辨率进行转录组分析.细胞空间定位信息与其分子特征谱的耦合产生了新型的多模态高通量数据资源,这对高效的数据挖掘分析方法的开发提出了新的挑战.由于生理组织样本的复杂性与技术的局限性,空间转录组数据具有高度的非理想性.其数据结构复杂、信噪比低、稀疏性强且覆盖度不均一,给数据的深度分析和生物学信息的解析带来了一系列挑战,目前许多困难尚未解决.此外,多个技术路线的空间转录组学正在快速迭代发展,需要现有数据分析理论的发展和创新技术工具的开发.本文概述了当前空间转录组数据的常用解析方法,针对不同角度与层面的信息挖掘需求,讨论了现有方法的设计思路与潜在的局限性,并对未来方法学设计的方向和策略进行了展望,以期激发对新的数据分析理论、模型和算法的讨论和开发.

关键词：空间转录组生物信息学人工智能机器学习数据挖掘

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人体与哺乳动物的生物钟同步机制及疾病

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科学通报 2017年第25期62卷 2857-2866页

作者：黄海鹏傅肃能清华大学生命科学学院清华大学-北京大学生命科学联合中心生物信息学教育部重点实验室合成与系统生物学研究中心北京100084

由于地球的自转,地球表面的光照和温度会产生以24 h为周期的节律性波动.与之相适应地,近地表生物的新陈代谢、生长发育、细胞周期等也会随着昼夜更替而改变,形成稳定的昼夜节律.昼夜节律是生命体在自然环境中经过漫长的演化而产生的,但... 详细信息

由于地球的自转,地球表面的光照和温度会产生以24 h为周期的节律性波动.与之相适应地,近地表生物的新陈代谢、生长发育、细胞周期等也会随着昼夜更替而改变,形成稳定的昼夜节律.昼夜节律是生命体在自然环境中经过漫长的演化而产生的,但它并不是简单的被动适应,而是由内在的生物钟驱动的,主动与环境进行匹配的过程.那么,生物钟到底是什么?它是如何运作的?生物钟重置的机理是什么?生物钟紊乱对人类的健康又有什么样的影响?这些都是我们关心并期待解答的问题.

关键词：昼夜节律生物钟分子振荡系统视交叉上核肾上腺生物钟同步机制生物钟紊乱

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复杂疾病中多组学多模态数据的生物信息学研究进展

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科学通报 2024年第30期69卷 4432-4446页

作者：刘晓帆鲁志清华大学生命科学学院合成和系统生物学中心教育部生物信息学重点实验室北京100084 清华大学精准医学研究所北京100084

随着高通量测序技术的发展,多组学多模态数据的整合已成为复杂疾病研究的重要趋势,为深入理解疾病的发生发展提供了新视角,为实现复杂疾病的精准诊疗提供了重要支持.本文首先介绍了复杂疾病研究中的不同组学类型,如基因组学、转录组学... 详细信息

随着高通量测序技术的发展,多组学多模态数据的整合已成为复杂疾病研究的重要趋势,为深入理解疾病的发生发展提供了新视角,为实现复杂疾病的精准诊疗提供了重要支持.本文首先介绍了复杂疾病研究中的不同组学类型,如基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、微生物组学、影像组学等,以及相应的多组学数据库.然后本文对多组学、多模态数据的整合方法进行了系统的分类,详细阐述了基于关联分析和网络的方法,以及基于数据矩阵和机器学习的方法中早期整合、中期整合和后期整合方法.此外,本文还讨论了多组学整合模型在疾病筛查、分型、预后和药物反应预测等方面的应用.最后,本文总结了当前多组学整合面临的挑战,分为样本层面、数据层面和模型层面三类,并展望了未来的发展方向.本文为复杂疾病中多组学、多模态数据整合研究提供了系统的梳理,对该领域的进一步发展具有重要意义.

关键词：多组学数据多模态数据生物信息复杂疾病整合模型

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质谱分析浓香型白酒洋河梦之蓝(手工班)微量成分的研究

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酿酒科技 2019年第5期 55-60页

作者：杜然郭律均闫建斌清华大学生命科学学院生物信息学教育部重点实验室合成与系统生物学研究中心北京100084

洋河梦之蓝(手工班)是洋河集团近年来推出的高端绵柔型白酒。为了分析其微量成分组成,利用色谱-质谱联用技术,鉴定出454种微量成分。其中,酯、脂肪酸、醇、醛、酚、酮类等是中国传统白酒中主要的呈味物质,在该酒中超过300余种;呋喃、核... 详细信息

洋河梦之蓝(手工班)是洋河集团近年来推出的高端绵柔型白酒。为了分析其微量成分组成,利用色谱-质谱联用技术,鉴定出454种微量成分。其中,酯、脂肪酸、醇、醛、酚、酮类等是中国传统白酒中主要的呈味物质,在该酒中超过300余种;呋喃、核苷类似物、萜烯、吡唑和吡嗪等具有潜在生物活性功能的物质,在该酒中检出48种。这些结果为研究绵柔型白酒风味和滋味来源及健康功效奠定了基础。

关键词：中国白酒洋河梦之蓝(手工班) 固相微萃取气质联用微量成分

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超分辨质谱分析浓香型白酒洋河梦之蓝(手工班)生物活性物质的研究

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酿酒科技 2019年第6期 30-34页

作者：杜然郭律均闫建斌清华大学生命科学学院生物信息学教育部重点实验室合成与系统生物学研究中心

中国白酒的独特酿造方法有利于增加酒体的微量成分,其中不仅包含呈香呈味物质,而且还包括大量生物活性成分。本研究利用气相色谱质谱(GC-MS)和高分辨串联液相质谱(UPLC/Q-ExactiveOrbitrap)分析了高端绵柔型白酒洋河梦之蓝(手工班)的生... 详细信息

中国白酒的独特酿造方法有利于增加酒体的微量成分,其中不仅包含呈香呈味物质,而且还包括大量生物活性成分。本研究利用气相色谱质谱(GC-MS)和高分辨串联液相质谱(UPLC/Q-ExactiveOrbitrap)分析了高端绵柔型白酒洋河梦之蓝(手工班)的生物活性物质,发现该酒除含有脂肪酸和酯类等常见活性物质外,还发现酚类化合物、呋喃类、吡嗪类、萜类和核苷类似物等组分。其中,虫草素和圣草酚两种生物活性成分在白酒中鲜有报道,定量分析显示二者的含量分别为1.78mg/L和1.81mg/L。

关键词：微量成分虫草素圣草酚白酒生物活性洋河

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