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第十次中国生物物理学术大会

作者：周云王瑞李立夏雪峰孙之荣清华大学生物科学与技术系生物信息学教育部重点实验室杜克大学计算生物学与生物信息学研究所清华大学生物科学与技术系生物信息学教育部重点实验室清华大学生物科学与技术系生物信息学教育部重点实验室清华大学生物科学与技术系生物信息学教育部重点实验室

＜正＞如何在网络层次上理解蛋白质的功能是当前系统生物学所面临的一个重要问题。本文描述了一个预测蛋白质功能联系的新方法。这个方法的基本假设是,功能相关的蛋白因为承受着相同的进化压力,因而比功能不相关的蛋白具有更加相似的进...

＜正＞如何在网络层次上理解蛋白质的功能是当前系统生物学所面临的一个重要问题。本文描述了一个预测蛋白质功能联系的新方法。这个方法的基本假设是,功能相关的蛋白因为承受着相同的进化压力,因而比功能不相关的蛋白具有更加相似的进化模式。这里所指的蛋白质的进化模式是指蛋白质（包括它们的同源蛋白）在各个基因组形成的

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超分辨质谱分析浓香型白酒洋河梦之蓝(手工班)生物活性物质的研究

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酿酒科技 2019年第6期 30-34页

作者：杜然郭律均闫建斌清华大学生命科学学院生物信息学教育部重点实验室合成与系统生物学研究中心

中国白酒的独特酿造方法有利于增加酒体的微量成分,其中不仅包含呈香呈味物质,而且还包括大量生物活性成分。本研究利用气相色谱质谱(GC-MS)和高分辨串联液相质谱(UPLC/Q-ExactiveOrbitrap)分析了高端绵柔型白酒洋河梦之蓝(手工班)的生... 详细信息

中国白酒的独特酿造方法有利于增加酒体的微量成分,其中不仅包含呈香呈味物质,而且还包括大量生物活性成分。本研究利用气相色谱质谱(GC-MS)和高分辨串联液相质谱(UPLC/Q-ExactiveOrbitrap)分析了高端绵柔型白酒洋河梦之蓝(手工班)的生物活性物质,发现该酒除含有脂肪酸和酯类等常见活性物质外,还发现酚类化合物、呋喃类、吡嗪类、萜类和核苷类似物等组分。其中,虫草素和圣草酚两种生物活性成分在白酒中鲜有报道,定量分析显示二者的含量分别为1.78mg/L和1.81mg/L。

关键词：微量成分虫草素圣草酚白酒生物活性洋河

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质谱分析浓香型白酒洋河梦之蓝(手工班)微量成分的研究

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酿酒科技 2019年第5期 55-60页

作者：杜然郭律均闫建斌清华大学生命科学学院生物信息学教育部重点实验室合成与系统生物学研究中心北京100084

洋河梦之蓝(手工班)是洋河集团近年来推出的高端绵柔型白酒。为了分析其微量成分组成,利用色谱-质谱联用技术,鉴定出454种微量成分。其中,酯、脂肪酸、醇、醛、酚、酮类等是中国传统白酒中主要的呈味物质,在该酒中超过300余种;呋喃、核... 详细信息

洋河梦之蓝(手工班)是洋河集团近年来推出的高端绵柔型白酒。为了分析其微量成分组成,利用色谱-质谱联用技术,鉴定出454种微量成分。其中,酯、脂肪酸、醇、醛、酚、酮类等是中国传统白酒中主要的呈味物质,在该酒中超过300余种;呋喃、核苷类似物、萜烯、吡唑和吡嗪等具有潜在生物活性功能的物质,在该酒中检出48种。这些结果为研究绵柔型白酒风味和滋味来源及健康功效奠定了基础。

关键词：中国白酒洋河梦之蓝(手工班) 固相微萃取气质联用微量成分

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从病毒细胞遗传进化的生物循环选育到新基因识别与验证

从病毒细胞遗传进化的生物循环选育到新基因识别与验证

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2003年中国科协“生物信息学与进化计算”青年科学家论坛

作者：张德礼李衍达黄高升方福德季梁朱关福北京大学医学部公共卫生学院营养与食品卫生学系，北京大学人类疾病基因研究中心，北京，100083 清华大学信息科学与技术国家实验室生物信息学研究部，清华大学生物信息学研究所生物信息学教育部重点实验室，清清华大学信息科学与技术国家实验室生物信息学研究部，清华大学生物信息学研究所生物信息学教育部重点实验室，清华大学信息科学技术学院自动化系智能技术与系统国家重点实验室，北京，100084 第四军医大学基础部病理学教研室，西京医院病理科，中国癌症研究基金会肿瘤研究所，西安，710032 中国医学科学院基础医学研究所，中国协和医科大学基础医学院医学分子生物学国家重点实验室，北京，710032

初步建立了病毒细胞遗传进化的优劣环境交替性生物循环选育作用的理论与技术体系并得到实际应用。发现细小病毒超高增殖的交替选育规律又在不同实验体系基因与染色体水平分别得到验证，从而发现了病毒细胞遗传进化的优劣环境交替性生物... 详细信息

初步建立了病毒细胞遗传进化的优劣环境交替性生物循环选育作用的理论与技术体系并得到实际应用。发现细小病毒超高增殖的交替选育规律又在不同实验体系基因与染色体水平分别得到验证，从而发现了病毒细胞遗传进化的优劣环境交替性生物循环的选育规律，提出了相关选育机制与方法，初步建立了这种选育作用的理论与技术体系并得到实际应用，它正是联系高效水貂细小病毒疫苗研制、痘苗病毒重组质粒转染技术创新、细胞系致癌毒理学安全性评价、异类肿瘤在体实验转化现象确立与横纹肌样瘤起源之谜初步揭示的纽带与桥梁，具有广泛的科学指导和实用意义。实际应用：(1)安全高效的水貂肠炎病毒细胞培养灭活疫苗的首次研制成功和长期广泛应用;(2)在对痘苗病毒重组质粒转染技术的探索性研究中首次简化了基因转染技术;(3)恶性横纹肌样瘤(MRT)在模型动物体内的首次发现和成功复制，为阐明其起源之谜提供了机会。从染色体遗传变异角度初步阐明了MRT的发生、发展规律，从比较医学角度揭示了MRT的组织细胞起源;(4)解了传代细胞(CCL)致癌毒理实验的难题，揭示了遗传变异率与致癌(瘤)的关系。在基因识别新方法与功能基因分离方面取得重要进展。建立了从计算机软件分析、人工干预分析及与实验生物学相结合角度来发现人类新基因的方法，并证明它是加速基因克隆和鉴定的一条有效途径。电子克隆百余人类新基因(还用合作开发的软件计算机识别800个人类新基因候选对象)，部分基因编码序列已被实验证实和引用，其中几个新克隆基因已在动物实验中显示出明显的生物学功能活性。发现了美国国家生物技术信息中心(NCBI)基因组注释项目公布的人类基因模式参考序列(REFSEQ)存在各种类型的多种/处错误，这一结果提示应慎重使用NCBI的REFSEQ数据库。

关键词：病毒细胞生物循环基因识别遗传进化

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优劣环境交替性生物循环选育的理论与技术体系和应用

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科技导报 2003年第11期21卷 11-17,10页

作者：张德礼李衍达黄高升朱关福方福德清华大学信息科学技术学院自动化系智能技术与系统国家重点实验室清华大学生物信息学研究所生物信息学教育部重点实验室北京100084 第四军医大学基础部病理学教研室中国癌症研究基金会肿瘤学研究所西安710032 中国医学科学院基础医学研究所/中国协和医科大学基础医学院医学分子生物学国家重点实验室北京710032

不同环境条件下的交替选育作用[1-6]虽已有成功的应用,但在恶劣环境下筛选后再回归到同类优越环境下培育,并反复循环选育的优良生物品种,特别是选育强毒高免疫原性的超高增殖病毒株,经体内外环境交替培育获得高变异率肿瘤细胞系并实现... 详细信息

不同环境条件下的交替选育作用[1-6]虽已有成功的应用,但在恶劣环境下筛选后再回归到同类优越环境下培育,并反复循环选育的优良生物品种,特别是选育强毒高免疫原性的超高增殖病毒株,经体内外环境交替培育获得高变异率肿瘤细胞系并实现异类肿瘤在体实验转化的现象,尚未见报道.

关键词：病毒疫苗交替选育恶性横纹肌样瘤制备水貂细小病毒致癌安全性

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Identifying Gene-Specific Motifs and Condition-Dependent Regulatory Patterns in Saccharomyces cerevisiae

Identifying Gene-Specific Motifs and Condition-Dependent Reg...

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第四届全国生物信息学与系统生物学学术大会

作者：罗洁郑家顺李雯孙之荣生物信息和系统生物学研究所生物信息学教育部重点实验室生物膜和膜技术国家重点实验室清华大学浙江省农业科学院数字农业研究所加州大学物理系

For understanding transcriptional regulation mechanisms more deeply,a great deal of excellent work has been *** the past few years,various algorithms for identifying TFBS have been developed,regardless of external ***,transcription factors' regulation of gene expression levels through binding DNA elements are in fact responses to simulations from outside cells. Gasch et *** variations of gene

关键词： Identifying Gene-Specific Motifs and Condition-Dependent Regulatory Patterns in Saccharomyces cerevisiae

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