检索结果-内蒙古大学图书馆

西安交通大学学报 2010年第10期44卷 1-7页

作者：李黎管晓宏赵千川王恒涛西安交通大学机械制造系统工程国家重点实验室西安710049 西安交通大学智能网络与网络安全教育部重点实验室西安710049 陕西师范大学计算机科学学院西安710062 清华大学自动化系北京10084 清华大学信息科学与技术国家实验室北京100084

为了更好地测度网络适应环境变化的能力,提出了一种简单的多目标量化评估网络生存适应性的方法.该方法将网络效率、网络鲁棒性和网络代价等多个优化目标结合起来,通过定量加权的方法对网络拓扑的生存适应性进行综合评估,避免了仅依靠网... 详细信息

为了更好地测度网络适应环境变化的能力,提出了一种简单的多目标量化评估网络生存适应性的方法.该方法将网络效率、网络鲁棒性和网络代价等多个优化目标结合起来,通过定量加权的方法对网络拓扑的生存适应性进行综合评估,避免了仅依靠网络平均路径长度、最大连通子图规模等单一度量指标进行评估的不足.仿真实验结果表明,综合了环型和星型结构优势的Hub型拓扑结构的生存适应性比较高,节点度分布较均匀的ARPA网络的生存适应性比较优,提高网络拓扑度分布的均匀性是改善网络拓扑生存适应性的有效措施.该评估方法不仅能够有效度量不同网络结构在动态环境下的生存适应能力,还能进一步为网络拓扑的优化、设计和重构提供有益的指导.

关键词：网络生存适应性评估多目标优化网络效率网络鲁棒性

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基于元强化学习的自动列车定速控制

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控制理论与应用 2022年第10期39卷 1807-1814页

作者：颜罡赵斐然叶锋吴俊博游科友中车株洲电力机车有限公司湖南株洲412000 大功率交流传动电力机车系统集成国家重点实验室湖南株洲412000 清华大学自动化系北京信息科学与技术国家研究中心北京100084

本文考虑自动列车在路况变化下的定速控制问题.由于铁路路况的复杂以及列车动力学的不确定性,基于模型的控制器难以稳定、快速、精确地进行定速控制.提出了一种无模型控制器,其只需要很少的列车运行数据即可适应新的路况.首先,本文将列... 详细信息

本文考虑自动列车在路况变化下的定速控制问题.由于铁路路况的复杂以及列车动力学的不确定性,基于模型的控制器难以稳定、快速、精确地进行定速控制.提出了一种无模型控制器,其只需要很少的列车运行数据即可适应新的路况.首先,本文将列车的定速控制问题建模为一系列转移概率未知的静态连续马尔可夫过程.然后,应用元强化学习去求解该马尔可夫过程,得到自适应神经网络控制器.仿真说明该无模型控制器能够高效地进行定速控制,并能迅速适应新的环境,同时满足系统约束.

关键词：定速控制马尔可夫过程强化学习元学习神经网络

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合成基因线路规模化设计面临的挑战

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生物工程学报 2017年第3期33卷 372-385页

作者：魏磊袁野汪小我清华大学合成与系统生物学研究中心生物信息学教育部重点实验室自动化系清华信息科学与技术国家实验室(筹)生物信息学研究部

随着合成基因线路规模的增加,传统的合成基因线路设计思路的瓶颈逐渐凸显,许多之前被忽略的因素对大规模基因线路的性能可能造成显著影响,这对合成基因线路的设计带来了新的挑战。本文重点梳理了基因表达噪声和竞争效应两方面对基因线... 详细信息

随着合成基因线路规模的增加,传统的合成基因线路设计思路的瓶颈逐渐凸显,许多之前被忽略的因素对大规模基因线路的性能可能造成显著影响,这对合成基因线路的设计带来了新的挑战。本文重点梳理了基因表达噪声和竞争效应两方面对基因线路性能的影响,阐释了二者间的紧密联系,并基于理性设计的思路,从模拟-数字运算设计、网络拓扑设计、基因线路中的信息传递理论和动态信号等方面,归纳总结了解决这些问题的潜在方案,并展望了规模化合成基因线路理性设计的未来发展方向。

关键词：合成基因线路基因表达噪声竞争效应理性设计

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三维基因组数据分析方法进展

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生物化学与生物物理进展 2018年第11期45卷 1093-1105页

作者：张祥林方欢汪小我清华大学自动化系合成与系统生物学研究中心生物信息学教育部重点实验室北京信息科学与技术国家研究中心生物信息学研究部北京100084

对染色质三维结构的探究逐渐成为了解基因组功能与基因调控关系的必要手段.近年来,随着高通量染色体构象捕获(Hi-C)等技术的发展和高通量测序成本的降低,全基因组交互作用的数据量快速增长,交互作用图谱分辨率不断提高.这给三维基因组... 详细信息

对染色质三维结构的探究逐渐成为了解基因组功能与基因调控关系的必要手段.近年来,随着高通量染色体构象捕获(Hi-C)等技术的发展和高通量测序成本的降低,全基因组交互作用的数据量快速增长,交互作用图谱分辨率不断提高.这给三维基因组学发展带来机遇的同时,也给计算建模带来了挑战.当前,三维基因组数据的分析方法覆盖面广,包括了数据前期处理、标准化、可视化、特征提取、三维建模等环节,但是如何从中选择高效、准确的方法却成为制约研究者们开展研究的一项关键因素.本文根据这些方法的适用场景、原理及特点进行系统地归纳,并重点关注了针对新技术或新需求的分析方法,以期促进这一领域中信息学方法的应用和开发,助力三维基因组学的研究.

关键词： Hi-C 三维基因组学基因组结构生物信息学

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深度强化学习综述:兼论计算机围棋的发展

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控制理论与应用 2016年第6期33卷 701-717页

作者：赵冬斌邵坤朱圆恒李栋陈亚冉王海涛刘德荣周彤王成红中国科学院自动化研究所复杂系统管理与控制国家重点实验室北京100190 北京科技大学自动化学院北京100083 清华大学自动化系北京100084 国家自然科学基金委信息科学部北京100085

深度强化学习将深度学习的感知能力和强化学习的决策能力相结合,可以直接根据输入的图像进行控制,是一种更接近人类思维方式的人工智能方法.自提出以来,深度强化学习在理论和应用方面均取得了显著的成果.尤其是谷歌深智(Deep Mind)团队... 详细信息

深度强化学习将深度学习的感知能力和强化学习的决策能力相结合,可以直接根据输入的图像进行控制,是一种更接近人类思维方式的人工智能方法.自提出以来,深度强化学习在理论和应用方面均取得了显著的成果.尤其是谷歌深智(Deep Mind)团队基于深度强化学习方法研发的计算机围棋"初弈号–Alpha Go",在2016年3月以4:1的大比分战胜了世界围棋顶级选手李世石(Lee Sedol),成为人工智能历史上一个新里程碑.为此,本文综述深度强化学习的发展历程,兼论计算机围棋的历史,分析算法特性,探讨未来的发展趋势和应用前景,期望能为控制理论与应用新方向的发展提供有价值的参考.

关键词：深度强化学习初弈号深度学习强化学习人工智能

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基于拷贝数变异的遗传关联研究

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科学通报 2011年第6期56卷 370-382页

作者：周雪崖张学工清华大学生物信息学教育部重点实验室清华信息科学与技术国家实验室(筹)生物信息学研究部清华大学自动化系北京100084 清华大学医学院北京100084

存在于自然群体中DNA片段的拷贝数变异(copy number variations,CNVs)是基因组结构性差异的常见形式.人们早已意识到它在人群中普遍存在,并设计出多种实验方法对其进行检测和量化.近年来,伴随着实验技术的进步,人群的CNV图谱被不断完善... 详细信息

存在于自然群体中DNA片段的拷贝数变异(copy number variations,CNVs)是基因组结构性差异的常见形式.人们早已意识到它在人群中普遍存在,并设计出多种实验方法对其进行检测和量化.近年来,伴随着实验技术的进步,人群的CNV图谱被不断完善、细化;许多CNVs和疾病的相关性被陆续报道.对复杂疾病的CNV关联研究已成为当前医学遗传学研究的重要内容.本文将总结和关联研究有关的CNV遗传特性,分析CNV与疾病关联研究的进展与问题,并探讨实验设计和数据分析策略.

关键词：拷贝数变异复杂疾病关联研究实验设计数据分析

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通过新基因计算机识别与实验确认对NCBI人类基因数据库一些模式参考序列错误的分析与纠正

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Acta Genetica Sinica 2004年第5期31卷 431-443页

作者：张德礼季梁李衍达清华大学信息科学技术学院自动化系生物信息学研究所信息科学技术国家实验室智能技术与系统国家重点实验室生物信息学教育部重点实验室北京100084 北京大学医学部北京100083

采用生物信息学分析与实验确认相结合的技术路线 ,通过所识别的基因在非冗余数据库比对发现了网上公布的计算机注释人类基因组编码序列存在各种类型的多处错误 ,包括cDNA水平的一个或一段碱基插入、缺失或突变 ,或是这些错误的不同排列... 详细信息

采用生物信息学分析与实验确认相结合的技术路线 ,通过所识别的基因在非冗余数据库比对发现了网上公布的计算机注释人类基因组编码序列存在各种类型的多处错误 ,包括cDNA水平的一个或一段碱基插入、缺失或突变 ,或是这些错误的不同排列组合 ,其中以错误插入为多 ,往往导致编码氨基酸的移码突变。最先举证了NCBIGENOMEAnnotationProject预测人类新基因的下列错误类型 :(1)开放读码框架 (ORF)中错误插入一个碱基造成编码氨基酸移码 ;(2 )错误拼接 ;(3)开放读框中错误插入一个或一段碱基造成该读框提前终止。只编码N 端氨基酸的cDNA序列而不完整 ;(4 )只有编码C 端氨基酸序列的cDNA而不完整 ;(5 )只是正确基因ORF中间的一段编码蛋白cDNA序列而不完整 ,缺N 端与C 端氨基酸序列 ,并且将不完整蛋白氨基酸序列的第一个非起始码氨基酸错误地预测为起始码氨基酸 ,如将L错误地预测为M ;(6 )开放读框中错误插入一个或一段碱基造成前面出现不该有的终止码 ,因而编码蛋白缺开头部分氨基酸 ;(7)可能将污染基因组序列当作完整基因cDNA序列对待而预测出所谓单一外显子基因。即便真是基因 ,也只是较长单一外显子mRNA中有一小ORF ,而ORF起始码上游同一相位确实存在终止码 ,无其他特点符合基因条件 ;(8)所预测基因只有ORF ,

关键词：人类基因组表达序列标签计算机克隆基因纠正模式参考序列生物信息学

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基于细胞—计算机交互的细胞控制方法

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自动化学报 2021年第3期47卷 489-500页

作者：颜钱明张鹏程乔榕古槿汪小我清华大学自动化系合成与系统生物学研究中心生物信息学教育部重点实验室北京100084 北京信息科学与技术国家研究中心生物信息学研究部北京100084

Wiener在控制论(Cybernetics)中强调了两大类控制对象:机器与动物.半个世纪以来,机器控制领域已形成一套较为完备且先进的控制理论,而在生物控制方面,由于生物系统的特殊性和复杂性,对生命的基本组成单位—细胞的控制仍然进展缓慢.近年... 详细信息

Wiener在控制论(Cybernetics)中强调了两大类控制对象:机器与动物.半个世纪以来,机器控制领域已形成一套较为完备且先进的控制理论,而在生物控制方面,由于生物系统的特殊性和复杂性,对生命的基本组成单位—细胞的控制仍然进展缓慢.近年来,随着合成生物学技术的发展,基于细胞—计算机交互的胞外控制手段开始引起研究者们的关注,为细胞控制带来了前所未有的机遇.胞机交互的方式能够适应生物系统的特殊性,发挥计算机控制的优势,实现细胞的自动化实时控制,为人类研究细胞内部基因调控机制与其他各项生命活动提供了大量的数据与方法支持.本文根据目前基于胞机交互的细胞控制工作,归纳与总结了胞机交互中常用的生物学工具以及控制算法,分析了细胞控制的特殊性与难点,指出研究实现细胞智能控制的可行性与重要性.

关键词：胞机交互反馈控制合成生物学人工生物系统光遗传学

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泰勒展开近似带连续性约束的L1范数方法用于多次波自适应相减(英文)

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Applied Geophysics 2009年第3期 241-247+299-300页

作者：庞廷华陆文凯马永军清华大学自动化系清华信息科学与技术国家实验室(筹)智能技术与系统国家重点实验室九江职业技术学院电子工程系

一次波L1范数最小化的多次波自适应相减方法,简称L1方法,是基于匹配滤波器设计的多次波自适应相减算法中的一种常用方法。当一次波和多次波混杂在一起时,L1方法有时会伤害一次波,导致一次波同相轴的连续性变差。本文利用预测误差滤波器... 详细信息

一次波L1范数最小化的多次波自适应相减方法,简称L1方法,是基于匹配滤波器设计的多次波自适应相减算法中的一种常用方法。当一次波和多次波混杂在一起时,L1方法有时会伤害一次波,导致一次波同相轴的连续性变差。本文利用预测误差滤波器度量一次波同相轴的连续性,在L1方法的基础上,提出一种能够在压制多次波的同时,尽量保持一次波同相轴连续性的多次波自适应相减算法,简称连续性约束L1方法。利用Pluto模型数据进行多次波相减的结果表明,连续性约束L1方法能够在有效压制多次波的同时,更好地保护一次波。

关键词：多次波压制多次波自适应相减 L1范数连续性约束

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开放式Web平台可信性:问题与对策

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武汉大学学报（理学版） 2010年第4期56卷 451-456页

作者：屈宇管晓宏郑庆华何岚吕复强王志文西安交通大学智能网络与网络安全教育部重点实验室陕西西安710049 机械制造系统工程国家重点实验室陕西西安710049 清华大学自动化系北京100084 清华大学清华信息科学与技术国家实验室北京100084

对近期出现的开放式Web平台共性特征进行了分析,提出了开放式Web平台由于其系统架构,在可用性、安全性及隐私性等方面存在的问题,并通过实验证明了上述问题的存在.对于增强此类系统可信性,本文认为应重视由RESTfulWebServices远程调用... 详细信息

对近期出现的开放式Web平台共性特征进行了分析,提出了开放式Web平台由于其系统架构,在可用性、安全性及隐私性等方面存在的问题,并通过实验证明了上述问题的存在.对于增强此类系统可信性,本文认为应重视由RESTfulWebServices远程调用所带来的时间开销,在第三方服务器暂存请求副本并增加DDoS攻击检测功能;开放式Web平台应对其与第三方应用服务器之间的通信进行加密.提出了一种基于任意测试位置的第三方应用评测算法,该算法仅使用较少的测试数据.实验表明,该算法能有效检测存在安全性及隐私性漏洞的第三方应用.

关键词： Web平台可信性开放平台测试

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