检索结果-内蒙古大学图书馆

电子显微学报 2025年第1期44卷 106-114页

作者：宋佶岭张晨辉付韵桥王宏伟刘楠清华大学生命科学学院北京生物结构前沿中心教育部蛋白质科学重点实验室北京100084 香港大学生物科学学院中国香港999077 北京石墨烯研究院有限公司北京100095

在冷冻电镜结构解析过程中,样品制备是关键限速步骤之一,经常受到气液界面等问题困扰。石墨烯支撑膜能够富集生物样品颗粒、降低电子束照射导致的样品漂移和充电效应,并且具有较低的背景噪音,已经被应用于冷冻样品的制备,缓解气液界面... 详细信息

在冷冻电镜结构解析过程中,样品制备是关键限速步骤之一,经常受到气液界面等问题困扰。石墨烯支撑膜能够富集生物样品颗粒、降低电子束照射导致的样品漂移和充电效应,并且具有较低的背景噪音,已经被应用于冷冻样品的制备,缓解气液界面等问题造成的影响,提高样品制备成功率。为了更广泛地将石墨烯载网用以冷冻电镜样品制备,本文介绍了石墨烯膜覆盖度的表征办法和对比了不同亲水化处理条件对石墨烯支撑膜产生的影响,着重针对使用石墨烯载网制备冷冻样品时出现的一些异常冰层现象进行了研究分析,并讨论了冷冻样品制备过程中溶液的扩散过程。该研究加深了对石墨烯表面液体分布和扩散过程的理解,为优化使用石墨烯载网用以冷冻电镜样品制备提供了基础。

关键词：冷冻电镜样品制备石墨烯生物大分子

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蛋白质结构预测进展

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生物化学与生物物理进展 2023年第5期50卷 1190-1194页

作者：曹卫潘宪明清华大学生命科学院蛋白质科学教育部重点实验室北京100084

蛋白质的序列决定结构,结构决定功能。新一代准确的蛋白质结构预测工具为结构生物学、结构生物信息学、药物研发和生命科学等许多领域带来了全新的机遇与挑战,单链蛋白质结构预测的准确率达到与试验方法相媲美的水平。本综述概述了蛋白... 详细信息

蛋白质的序列决定结构,结构决定功能。新一代准确的蛋白质结构预测工具为结构生物学、结构生物信息学、药物研发和生命科学等许多领域带来了全新的机遇与挑战,单链蛋白质结构预测的准确率达到与试验方法相媲美的水平。本综述概述了蛋白质结构预测领域的理论基础、发展历程与最新进展,讨论了大量预测的蛋白质结构和基于人工智能的方法如何影响实验结构生物学,最后,分析了当前蛋白质结构预测领域仍未解决的问题以及未来的研究方向。

关键词：蛋白质结构预测深度学习能量函数

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斑马鱼胚胎中受Nodal信号调控基因的鉴定

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生物化学与生物物理进展 2007年第6期34卷 595-603页

作者：孙智慧孟安明清华大学生物科学与技术系发育生物学实验室蛋白质科学教育部重点实验室北京100084

Nodal信号在脊椎动物胚胎发育的中内胚层诱导、左右不对称性的建立、神经外胚层沿前后轴线的分化等方面起着重要的作用.为鉴定受Nodal信号调控的基因,特别是那些转录因子基因,通过将来自squint过量表达、缺失Nodal信号的MZoep突变体或... 详细信息

Nodal信号在脊椎动物胚胎发育的中内胚层诱导、左右不对称性的建立、神经外胚层沿前后轴线的分化等方面起着重要的作用.为鉴定受Nodal信号调控的基因,特别是那些转录因子基因,通过将来自squint过量表达、缺失Nodal信号的MZoep突变体或野生型30%外包期胚胎的RNA与Affymetrix斑马鱼寡核苷酸芯片杂交.发现与野生型样本相比,在squint过量表达的样本中,265个转录本的表达显著增强(log2ratio>1),111个转录本的表达显著减弱(log2ratio<-1);在MZoep样本中,表达显著增强的(log2ratio>1)转录本有1495个,表达显著减弱(log2ratio<-1)的有550个.squint过量表达使26个转录因子基因的表达增强,11个转录因子基因的表达减弱;另一方面,MZoep突变体中表达增强的转录因子基因为69个,表达减弱的转录因子基因为30个.这些结果为进一步研究Nodal信号的转导机理和生物学功能提供了有益的数据.

关键词：斑马鱼胚胎 Nodal 基因芯片转录因子

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水稻谷胱甘肽磷脂氢过氧化物酶的表达、纯化及晶体生长条件初筛

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高等学校化学学报 2007年第9期28卷 1701-1706页

作者：王丰刘进元清华大学生物科学与技术系分子生物学实验室教育部蛋白质科学重点实验室北京100084

将水稻PHGPx(OsPHGPx)的编码序列克隆到表达载体pGEX-6P-1上,并转化为大肠杆菌进行表达.通过GST亲和层析、离子交换层析和凝胶过滤层析,制备了可用于晶体学研究的OsPHGPx,其纯度超过95%,具备明显的PHGPx活性.质谱显示OsPHGPx的精确分子... 详细信息

将水稻PHGPx(OsPHGPx)的编码序列克隆到表达载体pGEX-6P-1上,并转化为大肠杆菌进行表达.通过GST亲和层析、离子交换层析和凝胶过滤层析,制备了可用于晶体学研究的OsPHGPx,其纯度超过95%,具备明显的PHGPx活性.质谱显示OsPHGPx的精确分子量为19642.5553,与理论分子量基本一致.OsPHGPx在多个晶体生长条件下出现微晶.三维结构同源建模显示OsPHGPx的结构为硫氧还蛋白折叠形式.

关键词：水稻谷胱甘肽磷脂氢过氧化物酶表达纯化晶体生长三维结构建模

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利用凝胶介质提高古菌DNA结合蛋白晶体的衍射分辨率

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生物化学与生物物理进展 2003年第3期30卷 471-473页

作者：王刚刚杨海涛饶子和清华大学生物科学与技术系教育部蛋白质科学重点实验室北京100084

在凝胶介质中结晶了极端嗜酸热菌Sulfolobus shibataeDNA结合蛋白Ssh10b ,与没有凝胶介质的条件下相比 ,晶体的出晶速度减缓 ,晶体的外形变得更规则 ,晶胞的C轴变短 ,晶体衍射分辨率从 0 65nm提高到了0 3 5nm .

关键词：凝胶介质古菌 DNA结合蛋白分辨率蛋白晶体晶体衍射

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灵芝多糖和猪苓多糖及其复方的免疫调节作用研究进展

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食品科学 2021年

作者：黄青李丽媛刘晴晴王钊清华大学药学院蛋白质科学教育部重点实验室

多糖是由多个单糖聚合而成的一类天然高分子，食用菌多糖是多糖家族中的一员，作为天然的化合物，食用菌多糖在食品、药品和保健品研发中具有良好的发展前景。灵芝和猪苓均是珍贵的食药菌，颇具风味，并有很高的营养价值。两者均有广泛... 详细信息

多糖是由多个单糖聚合而成的一类天然高分子，食用菌多糖是多糖家族中的一员，作为天然的化合物，食用菌多糖在食品、药品和保健品研发中具有良好的发展前景。灵芝和猪苓均是珍贵的食药菌，颇具风味，并有很高的营养价值。两者均有广泛的药理作用，如抗肿瘤、免疫调节、抗氧化等。灵芝和猪苓中含有多种活性成分，其中多糖成分主要发挥免疫调节的作用，能够作用于多种免疫细胞，调节机体的免疫功能。据报道，灵芝多糖和猪苓多糖组成的复合制剂能增强小鼠先天性免疫功能。本文将对多糖的性质进行简要介绍，总结概括灵芝多糖和猪苓多糖的免疫调节功能及作用机制，为灵芝多糖和猪苓多糖在免疫功能调节方面的研发和应用提供指导。

关键词：灵芝多糖猪苓多糖免疫调节

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衰老细胞清除策略与CAR细胞疗法在抗衰老治疗中的应用

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中国生物化学与分子生物学报 2024年第9期40卷 1197-1204页

作者：曾晨叶花瑞王钊蛋白质科学教育部重点实验室清华大学药学院北京100084

人类寿命逐渐延长,世界各国老年人口的数量和占比持续上升,但健康寿命却并未同步增长,衰老仍然是肿瘤、心血管疾病、阿尔茨海默病等疾病的主要风险因素。如何防治衰老相关疾病,延长老年人的健康寿命,仍亟待研究人员解决。细胞衰老是衰老... 详细信息

人类寿命逐渐延长,世界各国老年人口的数量和占比持续上升,但健康寿命却并未同步增长,衰老仍然是肿瘤、心血管疾病、阿尔茨海默病等疾病的主要风险因素。如何防治衰老相关疾病,延长老年人的健康寿命,仍亟待研究人员解决。细胞衰老是衰老的12大标志之一,存在于机体的整体衰老过程,可以说机体衰老的本质是组成机体的细胞的衰老,而通过转基因技术、基因重编程技术、使用新型抗衰老药物如senomorphic和senolytic等方法清除衰老细胞,已经成为目前延缓衰老、治疗衰老相关疾病、延长人类健康寿命的重要策略。免疫衰老是机体衰老的一部分,而免疫细胞是人体中最易、最先发生老化的细胞群体,针对免疫系统的抗衰老治疗例如抗体治疗、CAR细胞疗法、NK细胞疗法等是近年衰老研究的热点,研究认为,免疫疗法具有极高的临床抗衰老潜力。本文从细胞衰老和免疫衰老的特征入手,进而总结了目前衰老的非靶向干预方法和靶向衰老细胞清除的干预方法及其优缺点,并重点综述了靶向衰老细胞的免疫治疗清除策略。本文旨在阐明新兴衰老细胞清除方法的发展及局限,为防治衰老相关疾病、延长健康寿命提供新的临床应用策略。

关键词：衰老清除衰老细胞 CAR细胞疗法

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灵芝多糖和猪苓多糖及其复方的免疫调节作用研究进展

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食品科学 2020年第17期41卷 275-282页

作者：黄青李丽媛刘晴晴王钊清华大学药学院蛋白质科学教育部重点实验室北京100084 清华大学天津高端装备研究院天津300300

多糖是由多个单糖聚合而成的一类天然高分子物质,食用菌多糖是多糖家族中的一员,作为天然化合物,食用菌多糖在食品、药品和保健品研发中具有良好的发展前景。灵芝和猪苓均是珍贵的食药用菌,有很高的营养价值。两者均有广泛的药理作用,... 详细信息

多糖是由多个单糖聚合而成的一类天然高分子物质,食用菌多糖是多糖家族中的一员,作为天然化合物,食用菌多糖在食品、药品和保健品研发中具有良好的发展前景。灵芝和猪苓均是珍贵的食药用菌,有很高的营养价值。两者均有广泛的药理作用,如抗肿瘤、免疫调节、抗氧化等。灵芝和猪苓中含有多种活性成分,其中,多糖主要发挥免疫调节的作用,能够作用于多种免疫细胞,调节机体的免疫功能。据报道,灵芝多糖和猪苓多糖组成的复合制剂能增强小鼠先天性免疫功能。本文将对多糖的性质进行简要介绍,总结概括灵芝多糖和猪苓多糖的免疫调节功能及作用机制,为灵芝多糖和猪苓多糖在免疫功能调节方面的研发和应用提供指导。

关键词：灵芝多糖猪苓多糖免疫调节

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应用聚合酶链式反应快速特异鉴定假单胞菌和伯克霍尔德氏菌(R)-3-羟基酯酰载酯蛋白-辅酶A转酰基酶基因(英文)

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生物工程学报 2005年第1期21卷 19-24页

作者：郑重陈金春田鸿磊贝锋锋陈国强清华大学生物科学与技术系蛋白质科学教育部重点实验室北京100084

聚羟基脂肪酸酯 (PHA)是一类具有广泛应用前景的可降解生物塑料。因其可以以葡萄糖等廉价底物直接发酵生产PHA而日益受到重视。目前的研究表明在积累中长链PHA的假单胞菌中 ,由phaG基因编码的 (R) 3 羟基酯酰载酯蛋白辅酶A转酰基酶 (P... 详细信息

聚羟基脂肪酸酯 (PHA)是一类具有广泛应用前景的可降解生物塑料。因其可以以葡萄糖等廉价底物直接发酵生产PHA而日益受到重视。目前的研究表明在积累中长链PHA的假单胞菌中 ,由phaG基因编码的 (R) 3 羟基酯酰载酯蛋白辅酶A转酰基酶 (PhaG)起关键作用 ,但目前为止对该蛋白还知之甚少。通过聚合酶链式反应 (PCR)建立了一种快速、特异鉴定phaG基因的方法 ,应用该方法成功地从两株积累不同PHA的假单胞菌Pseudomonasstutzeri 1317和Pseudomonasnitroreducens0 80 2中分别克隆得到phaG基因 ,并在phaG基因突变株PseudomonasputidaPHAGN 2 1中表达成功。同时 ,还首次报道了从非假单胞菌菌株BurkholderiacaryophylliAS 1 2 74 1中鉴定得到phaG基因 ,提示PhaG介导的中长链PHA合成途径作为一种通用的代谢模式在细菌中广泛存在 ,为进一步实现从廉价的非相关底物合成中长链PHA提供了必要的分子生物学基础。

关键词：聚羟基脂肪酸酯,(R)-3-羟基酯酰载酯蛋白-辅酶A转酰基酶聚合酶链式反应,Pseudomonas stutzeri(施氏假单胞菌) Pseudomonas nitroreducens(硝基还原假单胞菌) Burkhohteria cadophylli(麝香石竹伯克霍尔德氏菌)

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棉花脱水应答元件(DRE)结合蛋白GhDBP1的原核表达、纯化及其DNA结合活性(英文)

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生物化学与生物物理进展 2006年第3期33卷 247-253页

作者：黄波刘进元清华大学生物科学与技术系分子生物学实验室及教育部蛋白质科学重点实验室北京100084

棉花是一种重要的经济作物,其生产和产量要受到干旱、低温和高盐等环境胁迫的影响,因此提高棉花对这些胁迫的抗性非常重要.脱水应答元件(DRE-dehydrationresponsiveelement)结合蛋白(DBP)在调节植物对环境胁迫的抗性中起到非常重要的作... 详细信息

棉花是一种重要的经济作物,其生产和产量要受到干旱、低温和高盐等环境胁迫的影响,因此提高棉花对这些胁迫的抗性非常重要.脱水应答元件(DRE-dehydrationresponsiveelement)结合蛋白(DBP)在调节植物对环境胁迫的抗性中起到非常重要的作用.而且过量表达DBP类基因的转基因植株能够很好抵抗这些环境胁迫,所以研究棉花中此类DRE元件结合蛋白对棉花生产有非常重要的意义.在以前的工作中,从棉花中分离一个DBP基因,命名为GhDBP1并在转录水平上分析它在棉花植株中的表达特征.在研究中,报道了GhDBP1的原核表达、纯化和它的DNA结合特性.GhDBP1基因的编码区用PCR技术扩增出来插入到原核表达载体pET28a中,并转化到大肠杆菌菌株BL21(DE3)中.经过IPTG诱导,GhDBP1融合蛋白在BL21(DE3)菌株中成功进行表达.利用Ni-NTA亲和层析技术得到了纯化的融合蛋白.在非同位素的凝胶滞留实验中,纯化的GhDBP1融合蛋白能够结合到含有DRE元件的DNA片段上.另外,用SWISS-MODEL软件对GhDBP1蛋白的DNA结合区的三维结构进行了计算机模拟.模拟的结果显示,GhDBP1蛋白的DNA结合区的主链结构和折叠模式与已知的拟南芥GCC盒结合蛋白AtERF1的DNA结合区结构很相似.这些结果显示了GhDBP1是一个脱水应答元件(DRE)结合的转录因子,并可能运用与AtERF1的DNA结合区相似的结构和它的目标序列脱水应答元件(DRE)相结合.

关键词：棉花 DRE结合蛋白原核表达纯化凝胶滞留(EMSA) 同源建模

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