检索结果-内蒙古大学图书馆

微生物学通报 2025年第3期52卷 1309-1322页

作者：迪力努尔·艾克帕贺怡田婷婷梁美婷陈邬锦陈晓瑜朱语秋杜满茜孙玉萍新疆医科大学基础医学院新疆乌鲁木齐830000 新疆第二医学院基础医学部新疆克拉玛依834000 新疆医科大学第五附属医院检验科新疆乌鲁木齐830000 新疆医科大学基础医学院医学微生物学教研室新疆乌鲁木齐830000 新疆医科大学新疆地方病分子生物学重点实验室新疆乌鲁木齐830000

【背景】高尿酸血症是一种尿酸生成与排泄失衡所导致的嘌呤代谢紊乱疾病,而肠道微生物在嘌呤代谢中发挥重要作用,其中1/3的尿酸通过肠道菌群分解,所以肠道益生菌能够有效降低体内尿酸水平,缓解高尿酸血症。【目的】获得人源性尿酸降解菌... 详细信息

【背景】高尿酸血症是一种尿酸生成与排泄失衡所导致的嘌呤代谢紊乱疾病,而肠道微生物在嘌呤代谢中发挥重要作用,其中1/3的尿酸通过肠道菌群分解,所以肠道益生菌能够有效降低体内尿酸水平,缓解高尿酸血症。【目的】获得人源性尿酸降解菌,并了解其与尿酸降解有关的基因及功能。【方法】通过体外尿酸强化培养和驯化,从正常低尿酸健康人群肠道粪便中获得具备尿酸降解能力的菌株,对其进行一般形态学观察、生化试验、16S rRNA基因序列测定,以及生物信息学分析和鉴定,并进行全基因组测序和功能基因挖掘。【结果】分离出一株具有较高尿酸降解功能的革兰氏阳性杆菌M2a,尿酸降解率达到82.73%,经鉴定为类干酪乳酪杆菌(Lacticaseibacillus paracasei),全基因组测序发现菌株M2a具有9个与尿酸降解相关的基因。【结论】菌株M2a具有高效降解尿酸的能力,为开发和利用微生物制剂进行尿酸治疗提供了科学依据和菌种资源。

关键词：类干酪乳酪杆菌菌株鉴定全基因组测序尿酸降解功能分析

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鸟结核分枝杆菌MAV-5183蛋白的生物信息学分析

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中国病原生物学杂志 2021年第10期16卷 1153-1157页

作者：丁寿鹏李祥芳高婧华陈晓文陈越吴利先大理大学基础医学院微生物与免疫学教研室云南大理671000

目的预测鸟结核分枝杆菌致病基因MAV-5183编码蛋白的结构和功能。方法从NCBI数据库下载MAV-5183基因编码蛋白的基因序列和氨基酸序列;采用Protparam tool分析蛋白的氨基酸数量、等电点、相对分子质量,以及氨基酸的组成比例、分子式、分... 详细信息

目的预测鸟结核分枝杆菌致病基因MAV-5183编码蛋白的结构和功能。方法从NCBI数据库下载MAV-5183基因编码蛋白的基因序列和氨基酸序列;采用Protparam tool分析蛋白的氨基酸数量、等电点、相对分子质量,以及氨基酸的组成比例、分子式、分子组成、脂肪指数;利用Phyr、SWISS-MODEL在线预测软件进行二级结构和三级结构模型预测;使用TMHMM Server2.0进行跨膜区预测;使用PortScale进行疏水性预测分析;采用SignlP5.0进行信号肽预测分析;采用IEDB在线软件进行B细胞表位以及CD4免疫原性预测分析;采用NetPHos3.1Server进行磷酸化位点分析;运用String在线软件进行蛋白质相互作用分析。结果 MAV-5183基因编码355个氨基酸,编码蛋白为Antigen 85-C,相对分子质量为38.052 79×10^(3),等电点6.74,分子式为C_(1705)H_(2570)N_(462)_O_(504)S_(14),为不稳定的疏水性蛋白;含有跨膜区与信号肽、25个磷酸化位点(其中丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸分别有14、6、5个),三级结构较为稳定,有多种蛋白与之相互作用。结论 MAV-5183含有多个磷酸化位点和B细胞优势表位,可为MAC临床血清学诊断和疫苗研发提供理论基础。

关键词：鸟结核分枝杆菌 MAV-5183 生物信息学血清学诊断

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鸟分枝杆菌MAV2928基因编码蛋白的生物信息学分析

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中国病原生物学杂志 2021年第1期16卷 17-21页

作者：陈晓文陈越高婧华吴利先大理大学基础医学院微生物与免疫学教研室云南大理671000

目的运用生物信息学方法分析鸟分枝杆菌PPE25-MAV蛋白的结构与功能。方法从NCBI数据库获取MAV2928基因编码蛋白氨基酸序列;使用protParam和PortScale工具分析该基因编码PPE25-MAV蛋白的理化性质以及亲疏水性;分别运用SignaIP 4.1 Server... 详细信息

目的运用生物信息学方法分析鸟分枝杆菌PPE25-MAV蛋白的结构与功能。方法从NCBI数据库获取MAV2928基因编码蛋白氨基酸序列;使用protParam和PortScale工具分析该基因编码PPE25-MAV蛋白的理化性质以及亲疏水性;分别运用SignaIP 4.1 Server、TMHMM Server v.2.0和PSORT Prediction工具预测PPE25-MAV蛋白的信号肽、跨膜区、亚细胞定位;采用NetPhos 3.1 Servera预测磷酸化位点,采用NCBI-Conserved domains分析蛋白的保守域结构;采用SPOMA软件在线分析PPE25MAV蛋白二级结构,使用SWISS-MODEL建立三级结构模型。运用ABCpred软件和IEDB预测蛋白的B细胞抗原表位。结果MAV2928基因全长为1266 bp,编码蛋白PPE25-MAV含有421个氨基酸,为不稳定疏水蛋白,脂肪系数为72.66,无信号肽及跨膜区,定位于细胞质中。该蛋白含有52个磷酸位点,有1个保守域结构属于PPE超家族蛋白;二级结构以无规则卷曲为主,结构较松散。预测该蛋白含有7个B细胞优势抗原表位和24个Th细胞表位。结论PPE25-MAV蛋白含有多个磷酸化位点,参与细胞信号的转导,含有7个优势B细胞抗原表位,为该蛋白作为候选疫苗抗原提供了理论基础。

关键词：鸟分枝杆菌 MAV2928 PPE25-MAV 生物信息学分析

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中性粒细胞胞外诱捕网对糖尿病小鼠肾脏的损伤作用及其机制

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中国药理学通报 2024年第12期40卷 2262-2269页

作者：陈伟豪任小军常欣悦李关蕊王艳红山西医科大学基础医学院微生物与免疫学教研室山西太原030001 山西白求恩医院肾内科山西太原030032 教育部慢性肾脏病医药基础研究创新中心山西医科大学山西太原030001

目的研究中性粒细胞胞外诱捕网(neutrophil extracellular traps,NETs)对糖尿病肾病(diabetic kidney disease,DKD)引起的肾脏组织损伤和肠道菌群紊乱的促进作用和潜在机制。方法 C57BL/6小鼠分为:对照组(NC),DNase I对照组(DNase I),... 详细信息

目的研究中性粒细胞胞外诱捕网(neutrophil extracellular traps,NETs)对糖尿病肾病(diabetic kidney disease,DKD)引起的肾脏组织损伤和肠道菌群紊乱的促进作用和潜在机制。方法 C57BL/6小鼠分为:对照组(NC),DNase I对照组(DNase I),糖尿病肾病组(DKD),DNase I处理组(DKD+DNase I),通过PAS、MASSON和HE染色观察小鼠肾脏病理变化,免疫组织化学法观察各组小鼠肾脏组织中NETs的相关蛋白及焦亡相关蛋白的表达和分布情况。免疫印迹法检测各组小鼠肾脏组织NETs的相关指标、焦亡相关指标和NF-κB信号通路相关指标的蛋白表达情况。结果DKD组中的NETs的相关指标表达升高,在DNase I对NETs降解后其表达下降(P <0.01),病理染色结果显示,DKD小鼠肾脏结构异常,在DNase I对NETs降解后结构有所好转,免疫组织化学染色和免疫印迹法结果显示,DKD组小鼠肾脏组织的焦亡相关蛋白表达相较于对照组表达上升(P<0.01),在DNase I对NETs进行降解后其表达下降。NF-κB信号通路相关蛋白表达情况表达上升,在DNase I对NETs进行降解后其表达下降(P<0.01)。结论NETs在糖尿病肾病中生成,并促进肾脏焦亡的发生,激活NF-κB信号通路,从而加剧糖尿病导致的肾脏损伤。

关键词：中性粒细胞胞外诱捕网糖尿病肾病焦亡 NF-κB NLRP3炎症小体肾脏损伤

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噬菌体临床应用监管法规的现状及展望

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中国抗生素杂志 2024年第1期49卷 26-34页

作者：姜昕宇吴楠楠卢曙光朱同玉乐率陆军军医大学基础医学院微生物学教研室微生物工程重庆市高校重点实验室重庆400038 创噬纪(上海)生物技术有限公司上海201100 上海市公共卫生临床中心上海噬菌体与耐药研究所上海201508 复旦大学附属中山医院上海市器官移植重点实验室上海200030

抗生素的广泛使用使得耐药和泛耐药病原菌不断涌现,对全球公共卫生造成了巨大威胁。目前,噬菌体治疗已成为抗击多重耐药菌的重要手段之一,在欧美国家和中国已经进行了临床应用。然而,中国目前尚未形成针对噬菌体治疗的专项监管法规,研... 详细信息

抗生素的广泛使用使得耐药和泛耐药病原菌不断涌现,对全球公共卫生造成了巨大威胁。目前,噬菌体治疗已成为抗击多重耐药菌的重要手段之一,在欧美国家和中国已经进行了临床应用。然而,中国目前尚未形成针对噬菌体治疗的专项监管法规,研究者发起的临床研究成为我国开展噬菌体治疗的主要形式,这制约了我国噬菌体治疗的进一步发展和广泛应用,亟需在当前的药品监管框架下,制定适当的噬菌体监管法规。因此,本文回顾了格鲁吉亚、美国、英国、比利时和中国的噬菌体治疗现状和监管法规框架,旨在为噬菌体临床治疗的监管提供参考。完善的噬菌体临床应用监管法规将极大促进噬菌体治疗在中国的推广和应用,也必将有效地遏制细菌耐药危机,更好地维护人民群众的生命健康安全。

关键词：噬菌体治疗药品立法监管新药申报限制类医疗技术噬菌体制剂生产

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长链非编码RNA异常表达对急性髓系白血病预后影响的meta分析

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国际医药卫生导报 2022年第20期28卷 2813-2821页

作者：林红丽卢晓庆李有杰孙允霄滨州医学院烟台附属医院儿科烟台264100 滨州医学院生物化学与分子生物学教研室烟台264003

目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)异常表达对急性髓系白血病(AML)预后的影响。方法检索PubMed、Embase、Cochrane数据库截止2021年10月6日前发表的所有相关文献。结果最终纳入13项研究,共1591人。lncRNA异常表达与AML患者,尤其是与非-急... 详细信息

目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)异常表达对急性髓系白血病(AML)预后的影响。方法检索PubMed、Embase、Cochrane数据库截止2021年10月6日前发表的所有相关文献。结果最终纳入13项研究,共1591人。lncRNA异常表达与AML患者,尤其是与非-急性早幼粒细胞白血病[AML(non-M3)]患者的总体生存率(OS)降低有关,并与无复发生存率(RFS)降低有关。亚组分析显示HOX转录反义基因间RNA(HOTAIR)和牛磺酸上调基因1(TUG1)的高表达与较差的OS相关。结论lncRNA的异常表达与AML患者不良预后显著相关,其异常表达是AML患者预后不良的危险因素,可以作为预测AML患者预后的生物标志物。

关键词：长链非编码RNA 急性髓系白血病预后 meta分析

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MicroRNAs在黏膜屏障及炎症反应中的作用

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中国免疫学杂志 2021年第19期37卷 2405-2410页

作者：谭仕廉郭乐申元英大理大学基础医学院医学微生物学与免疫学教研室大理671000

黏膜屏障是机体直接接触外源性异物的主要界面,同时也是病原体入侵机体的重要位点。因此,黏膜表面需要严格的调节以维持黏膜屏障功能或平衡黏膜炎症反应。近年来研究表明,MicroRNAs(miRNAs)在调节黏膜屏障功能和黏膜炎症反应过程中起到... 详细信息

黏膜屏障是机体直接接触外源性异物的主要界面,同时也是病原体入侵机体的重要位点。因此,黏膜表面需要严格的调节以维持黏膜屏障功能或平衡黏膜炎症反应。近年来研究表明,MicroRNAs(miRNAs)在调节黏膜屏障功能和黏膜炎症反应过程中起到重要的作用。本文综述了相关miRNAs与黏膜炎症的研究,进一步理解miRNAs参与黏膜生理和炎症过程中的作用,找到具有防治黏膜炎症的新作用靶点。

关键词： MicroRNAs 黏膜炎症屏障功能

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CRISPR/Cas13技术作为病毒核酸检测工具的研究进展

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热带医学杂志 2025年第2期25卷 282-288页

作者：冯文杰王芳应旗康古天乐董宇航张俊梅李冬静贺晓龙吴兴安延安大学生命科学学院陕西延安716000 空军军医大学基础医学院微生物与病原生物学教研室陕西西安710068 重庆医科大学基础医学院病原生物学教研室重庆400016

病毒感染性疾病一直是人类生命健康所面临的威胁之一,建立一个快速、精准的病毒核酸检测平台对于控制病毒的传播以及应对重大公共卫生安全事件具有重要意义。基于成簇规律间隔短回文重复序列(CRISPR)以及CRISPR相关蛋白Cas13组成的CRISP... 详细信息

病毒感染性疾病一直是人类生命健康所面临的威胁之一,建立一个快速、精准的病毒核酸检测平台对于控制病毒的传播以及应对重大公共卫生安全事件具有重要意义。基于成簇规律间隔短回文重复序列(CRISPR)以及CRISPR相关蛋白Cas13组成的CRISPR/Cas13系统开发出的核酸检测技术可以特异性识别特定的病毒核酸序列,激活Cas13蛋白活性,顺式切割靶标RNA的同时反式切割RNA检测探针实现检测结果的可视化,达到检测的目的。本文综述了基于CRISPR/Cas13开发出多种高特异性和高灵敏度的核酸检测技术,并且总结了这些检测技术在人类、动物以及植物感染性病毒中的应用;同时介绍了基于这些检测技术开发出的简便样品处理方法和高效的结果判读方法,实现在较短的时间内获得准确的结果。CRISPR/Cas13检测技术的不断改进和完善有助于在病毒大流行期间提供可行方案遏制病毒传播。

关键词：基于成簇规律间隔短回文重复序列 Cas13 切割活性病毒核酸检测

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Ⅱ型内含子及其生物技术应用研究进展

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生物工程学报 2022年第3期38卷 915-924页

作者：崔古贞花登雄谷俊莹陈峥宏贵州医科大学基础医学院微生物学教研室贵州贵阳550025 贵州医科大学医学检验学院贵州贵阳550004 贵州医科大学基础医学院病原生物学重点实验室贵州贵阳550025

型内含子(groupⅡintrons)是一类具有自我剪接功能的核酶,能够通过“归巢”(retrohoming)机制高频插入到DNA靶位点。Ⅱ型内含子对DNA靶位点的识别和剪接具有高度专一性和高效性,这种特性使其在基因工程中具有重要的应用价值。文中首先... 详细信息

型内含子(groupⅡintrons)是一类具有自我剪接功能的核酶,能够通过“归巢”(retrohoming)机制高频插入到DNA靶位点。Ⅱ型内含子对DNA靶位点的识别和剪接具有高度专一性和高效性,这种特性使其在基因工程中具有重要的应用价值。文中首先综述了Ⅱ型内含子基因打靶原理及其在微生物遗传改造中的应用;然后,根据Ⅱ型内含子“归巢”特点及其依赖高浓度Mg2+的特性,分析了Ⅱ型内含子在多功能基因编辑及真核生物应用中的局限性;最后,以笔者课题组研究工作为基础,结合Ⅱ型内含子自身结构特点,分析了Ⅱ型内含子在新型基因编辑工具开发方面的潜能,为Ⅱ型内含子生物技术应用提供借鉴。

关键词： Ⅱ型内含子 Targetron 基因编辑生物技术应用

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短链脂肪酸对肠黏膜屏障的影响

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中国微生态学杂志 2022年第12期34卷 1471-1475页

作者：王春敏韩桂华马淑霞佳木斯大学基础医学院微生物教研室黑龙江佳木斯154007 佳木斯大学第一附属医院

肠黏膜屏障具有将致病性抗原等肠内物质与内环境隔离的功能,以维持内环境的相对稳定和机体的正常生命活动。其功能的维持依赖于人肠黏膜上皮细胞、肠道内正常菌群、肠道内分泌物和肠相关免疫细胞之间的功能协调,而其功能的发挥又受体内... 详细信息

肠黏膜屏障具有将致病性抗原等肠内物质与内环境隔离的功能,以维持内环境的相对稳定和机体的正常生命活动。其功能的维持依赖于人肠黏膜上皮细胞、肠道内正常菌群、肠道内分泌物和肠相关免疫细胞之间的功能协调,而其功能的发挥又受体内许多信号分子的影响。短链脂肪酸(short-chain fatty acids,SCFAs)就是其中一种重要的信号分子。SCFAs是肠道菌群的主要代谢产物之一,是肠道菌群与宿主代谢相互作用的媒介。宿主体内的SCFAs主要来自肠道菌群对膳食纤维的酵解,越来越多的研究证实,SCFAs不仅可以被肠道菌群利用,还可调节肠黏膜屏障及多种组织器官的代谢。本文主要就SCFAs对肠黏膜屏障的影响进行综述。

关键词：短链脂肪酸肠黏膜屏障肠道菌群

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