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中华消化杂志 2009年第2期29卷 114-117页

作者：王迎昕张小燕张宝峰张可浩方静胡莺翟宁陈锡美郜恒骏上海同济大学附属同济医院消化疾病研究所 200065 生物芯片上海国家工程研究中心

目的探讨无淋巴结转移结肠癌微小核糖核酸（microRNA）表达谱，筛选与结肠癌早期发生、发展相关的特异性microRNA。方法选取手术、病理证实未发生淋巴结转移的结肠癌及大于癌旁5cm结肠组织标本各3例，抽提分离miRNA，与Agilent microRN... 详细信息

目的探讨无淋巴结转移结肠癌微小核糖核酸（microRNA）表达谱，筛选与结肠癌早期发生、发展相关的特异性microRNA。方法选取手术、病理证实未发生淋巴结转移的结肠癌及大于癌旁5cm结肠组织标本各3例，抽提分离miRNA，与Agilent microRNA基因芯片杂交，并进行图像和数据分析。运用microRNA特异引物对差异表达的microRNA进行荧光定量实时聚合酶链反应（RT—PCR）验证。结果筛选出在结肠癌中差异表达的microRNA有14个，其中12个microRNA表达水平增高，分别为miR-106b、miR-135b、miR-18a、miR-18b、miR-196b、miR-19a、miR-224、miR-335、miR-424、miR-20a^＊、miR-301b和miR-374a；2个microRNA表达水平降低，分别为miR-378和miR-378^＊。miR-106b和miR-19a下游存在符合要求的靶基因数目众多。检测了芯片中显示表达上调的miR-18a和miR135b在3例结肠癌组织和癌旁组织中的表达，结果显示miR-18a和miR135b在3例癌组织和癌旁组织中表达均上调；荧光定量RT-PCR结果与microRNA芯片的结果符合。结论miR-106b、miR-135b、miR-18a、miR-18b、miR-196b等microRNA在结肠癌与癌旁组织中存在差异表达，预测其下游靶基因中大部分与肿瘤相关，提示它们可能在结肠癌早期发生、发展过程中起着重要的调控作用。

关键词：结肠肿瘤微小核糖核酸芯片分析技术

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消化道肿瘤研究的新思维

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中华消化杂志 2010年第3期30卷 146-148页

作者：郜恒骏李娟同济大学附属同济医院消化科同济消化疾病研究所生物芯片上海国家工程研究中心上海200065

本文作者部恒骏教授为上海同济大学消化内科学教授、博士生导师，附属同济医院消化科教授、同济消化疾病研究所所长，生物芯片上海国家工程研究中心副主任。卫生部中国医药生物技术协会组织生物样本库分会主任委员。近8年来，主持过国家... 详细信息

本文作者部恒骏教授为上海同济大学消化内科学教授、博士生导师，附属同济医院消化科教授、同济消化疾病研究所所长，生物芯片上海国家工程研究中心副主任。卫生部中国医药生物技术协会组织生物样本库分会主任委员。近8年来，主持过国家863重大、重点课题等10余项。为十五国家863消化道肿瘤组织生物样本库与组织芯片重大项目负责人，创立了中国标准化组织库与组织芯片的国际品牌。为十一五国家863癌症基因组胰腺癌重大项目负责人，并重点参与了十一五胃癌、肝癌等重大课题。荣获上海市领军人物、优秀学科带头人等殊荣，他将近年来的工作体会结合文献撰写了本文，总结提出的肿瘤研究新思维，是广大肿瘤研究工作者良好的参考材料。

关键词：消化道肿瘤思维国家工程研究中心项目负责人医药生物技术组织芯片主任委员生物样本

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重视应用系统生物学指导消化系肿瘤的研究

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胃肠病学 2008年第11期13卷 641-644页

作者：郜恒骏同济大学附属同济医院消化疾病研究所生物芯片上海国家工程研究中心 201203

长期以来,消化系肿瘤一直被认为是单一器官的局部病变。然而,随着基因组学、功能基因组学以及高通量生物芯片等技术的发展,研究显示消化系肿瘤实际上是一种系统性疾病,是全身性疾病的局部反应。本文着重阐述系统生物学时代消化系肿瘤的... 详细信息

长期以来,消化系肿瘤一直被认为是单一器官的局部病变。然而,随着基因组学、功能基因组学以及高通量生物芯片等技术的发展,研究显示消化系肿瘤实际上是一种系统性疾病,是全身性疾病的局部反应。本文着重阐述系统生物学时代消化系肿瘤的研究策略和重点问题,肿瘤的早期分子水平诊断以及预测、预防和个性化治疗正成为重要研究和应用方向。

关键词：消化系统肿瘤系统生物学芯片分析技术早期诊断预测预防个性化治疗

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microRNA与结直肠癌关系的研究进展

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胃肠病学 2010年第9期15卷 571-573页

作者：李娟张小燕郜恒骏同济大学附属同济医院消化科消化疾病研究所 200065 生物芯片上海国家工程研究中心

结直肠癌的发病是一个多因素、多步骤的演进过程,基因表达异常在其中起重要作用。近年研究发现多种microRNA(miRNA)在结直肠癌中表达异常,可能参与了肿瘤的发生、发展过程,有望成为结直肠癌早期诊断、临床分期、个体化治疗、靶向治疗和... 详细信息

结直肠癌的发病是一个多因素、多步骤的演进过程,基因表达异常在其中起重要作用。近年研究发现多种microRNA(miRNA)在结直肠癌中表达异常,可能参与了肿瘤的发生、发展过程,有望成为结直肠癌早期诊断、临床分期、个体化治疗、靶向治疗和预后评估的分子标记物。本文就近年来有关miRNA与结直肠癌关系的研究进展作一综述。

关键词：微RNAs 结直肠肿瘤诊断治疗

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PIWI蛋白在人类结肠癌组织中的表达及临床意义

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中华消化杂志 2011年第4期31卷 243-248页

作者：李娟沈晓莹朱诗樟王维陈锡美杨长青郜恒骏同济大学医学院附属同济医院消化科消化疾病研究所上海200065 生物芯片上海国家工程研究中心

目的分析PIWIL1、PIWIL3和PIWIL4三种蛋白在结肠癌组织和癌旁组织中的表达与临床意义.方法选用106例结肠癌患者的癌组织和癌旁组织标本,分别制成62点和150点2份组织芯片,采用免疫组织化学方法检测结肠组织芯片中PIWIL1、PIWIL3和PIWIL... 详细信息

目的分析PIWIL1、PIWIL3和PIWIL4三种蛋白在结肠癌组织和癌旁组织中的表达与临床意义.方法选用106例结肠癌患者的癌组织和癌旁组织标本,分别制成62点和150点2份组织芯片,采用免疫组织化学方法检测结肠组织芯片中PIWIL1、PIWIL3和PIWIL4的表达.采用SPSS 17.0统计学软件,不同组织间PIWI蛋白表达差异采用配对t检验或配对Wilcoxon检验,相关性采用Pearson或Spearman等级相关分析.结果 PIWIL1、PIWIL3、PIWIL4在结肠癌组织中的表达均显著高于癌旁组织（P＜0.01）.PIWIL1、PIWIL3、PIWIL4在结肠癌和癌旁组织中的表达均呈现两两显著正相关（均P＜0.01）.癌组织PIWIL1在低分化组的表达显著高于高分化组（t=-2.840,P＜0.01）.癌组织PIWIL3表达随着临床分期的升级呈现显著升高（F=3.112,P＜0.05）.癌组织PIWIL3和PIWIL4在有远处转移组的表达显著高于无远处转移组（t=-3.349,P＜0.01;t=-2.168,P＜0.05）.癌组织PIWIL3和PIWIL4的表达均与结肠癌的发生显著相关（P值均＜0.01）.结论 PIWIL1、PIWIL3、PIWIL4在结肠癌组织中的表达与结肠癌的分化、临床分期、有无远处转移等临床指标显著相关,且PIWIL3和PIWIL4的表达是结肠癌发生的独立相关因素,有望进一步研究探讨其是否能作为结肠癌早期诊断的分子标志物及分子治疗靶点.

关键词：结肠肿瘤果蝇属基因,调节早期诊断基因表达

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幽门螺杆菌感染首诊个性化诊疗:首战即决战

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中华医学杂志 2022年第22期102卷 1631-1634页

作者：郜恒骏钟子劭闫利娟张小燕沈维祥同济大学附属同济医院同济大学医学院消化疾病研究所上海200065 中国幽门螺杆菌分子医学中心上海201321 生物芯片上海国家工程研究中心上海201203

随着大规模根除治疗的推进,导致幽门螺杆菌(***)耐药率不断升高,加上宿主CYP2C19基因多态性、***球形变、患者依从性、医生治疗方案不正规或经验式反复根除治疗等因素,***根除率逐渐下降。个性化治疗是实现***感染者首诊成功得以根除的... 详细信息

随着大规模根除治疗的推进,导致幽门螺杆菌(***)耐药率不断升高,加上宿主CYP2C19基因多态性、***球形变、患者依从性、医生治疗方案不正规或经验式反复根除治疗等因素,***根除率逐渐下降。个性化治疗是实现***感染者首诊成功得以根除的有效措施。随着克拉霉素耐药分子诊断试剂盒在我国首次获批与美国胃肠病协会(AGA)有关难治性***感染定义更新,遵循国际最新共识与指南、符合国情、赶超国际水平的基于耐药基因检测的***首诊个性化诊疗走向前台。

关键词：幽门螺杆菌个性化治疗细菌耐药

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兔抗人Argonaute2蛋白多克隆抗体制备及鉴定

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现代免疫学 2009年第4期29卷 312-315页

作者：陈林波郜恒骏王迎昕黄志刚陈锡美胡莺张小燕孟逊同济大学附属同济医院消化疾病研究所上海200065 生物芯片上海国家工程研究中心上海201203 Dragonfly Sciences USA

为了制备兔抗人Argonaute_2(AGO_2)的多克隆抗体,并鉴定其特异性,应用组织芯片初步探讨其在人类正常及肿瘤组织中的分布。采用合成特异性AGO_2多肽,以马来酰胺活化匙孔血蓝蛋白(KLH)作为载体构建多肽免疫原,通过致敏大白兔,制备兔抗人AG... 详细信息

为了制备兔抗人Argonaute_2(AGO_2)的多克隆抗体,并鉴定其特异性,应用组织芯片初步探讨其在人类正常及肿瘤组织中的分布。采用合成特异性AGO_2多肽,以马来酰胺活化匙孔血蓝蛋白(KLH)作为载体构建多肽免疫原,通过致敏大白兔,制备兔抗人AGO_2多克隆抗体,然后用亲和层析法纯化抗体。用ELISA和Western blot方法进行抗体验证,并应用人组织芯片进行AGO_2的免疫组化研究。结果显示,通过构建AGO_2多肽-KLH载体复合物致敏大白兔,我们制备了兔抗人AGO_2蛋白多克隆抗体,经ELISA及Western blot证实兔抗人AGO_2抗体可特异性识别AGO_2多肽,在人组织芯片中通过免疫组化染色显示该抗体在很多正常组织上皮细胞及肿瘤细胞胞浆中呈阳性染色。成功制备兔抗人AGO_2多克隆抗体,为进一步研究AGO_2在微小RNA/RNA干扰通路中的作用及在人类疾病中的意义提供了有利工具。

关键词： Argonaute 2蛋白多克隆抗体组织芯片

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幽门螺杆菌耐药相关基因突变检测芯片的建立

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胃肠病学 2011年第9期16卷 539-543页

作者：方静柴海娜徐磊郭一沈晓莹张小燕申媛媛李航盛海辉杨长青郜恒骏同济大学医学院再生医学系 200092 生物芯片上海国家工程研究中心同济大学附属同济医院消化内科消化疾病研究所

背景:幽门螺杆菌(***)感染与慢性胃炎、消化性溃疡、胃癌之间的相关性已得到确认。***对抗生素耐药是导致根除治疗失败的主要原因。目的:建立***耐药相关基因突变检测芯片,用于指导临床个体化治疗。方法:根据文献数据筛选出7个与根除治... 详细信息

背景:幽门螺杆菌(***)感染与慢性胃炎、消化性溃疡、胃癌之间的相关性已得到确认。***对抗生素耐药是导致根除治疗失败的主要原因。目的:建立***耐药相关基因突变检测芯片,用于指导临床个体化治疗。方法:根据文献数据筛选出7个与根除治疗常用抗生素(克拉霉素、甲硝唑、阿莫西林、喹诺酮类、四环素、呋喃唑酮)耐药相关的基因及其单核苷酸多态性(SNP)位点,优化芯片探针设计和反应条件,采用多重PCR技术联合所建立的芯片,检测25例胃黏膜样本的***耐药相关基因突变情况。测序验证芯片检测结果。结果:25例***阳性胃黏膜样本的芯片检测结果均与测序结果相符。包括DNA抽提、多重PCR、芯片杂交、数据分析等在内的整个检测流程仅需6 h,且重复性和灵敏度十分理想。结论:***耐药相关基因突变检测芯片能快速、平行、高通量地检测***耐药相关突变位点,结果准确、可靠。

关键词：螺杆菌,幽门抗生素抗药性突变微阵列分析

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重视肿瘤组织库的标准化建设和应用

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中华病理学杂志 2008年第12期37卷 797-798页

作者：郜恒骏朱明华生物芯片上海国家工程研究中心同济大学附属同济医院消化疾病研究所 201203 第二军医大学附属长海医院病理科

中国是具有13亿人口的多民族大国，有着世界上最为丰富的病理组织资源。长期以来由于各种因素的影响，组织样本特别是各种肿瘤组织样本在做出病理诊断后，基本上均作为废弃物处理了，而没有作为一种珍贵的资源有效地保存并加以充分利用... 详细信息

中国是具有13亿人口的多民族大国，有着世界上最为丰富的病理组织资源。长期以来由于各种因素的影响，组织样本特别是各种肿瘤组织样本在做出病理诊断后，基本上均作为废弃物处理了，而没有作为一种珍贵的资源有效地保存并加以充分利用。直到近几年随着肿瘤生物学研究的快速发展，人类基因组计划草图的完成，肿瘤基因组及蛋白质组计划的启动等，才逐步认识到肿瘤组织资源的价值，一些单位已开始收集和保存肿瘤组织，着手组织库的建设。

关键词：肿瘤组织库标准化人类基因组计划蛋白质组计划组织样本废弃物处理肿瘤生物学肿瘤基因组

来源：评论

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转移性结肠癌癌旁组织miRNA谱研究

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中国实用内科杂志 2009年第5期29卷 464-465页

作者：杨霁黄智铭沈晓莹张小燕郜恒骏温州医学院附属第一医院浙江温州325003 生物芯片上海国家工程研究中心上海201203 同济大学附属同济医院消化疾病研究所上海200092

近年来,对miRNA研究不断深入,miRNA表达谱芯片应运而生,其凭借高通量、快速检测miRNA表达水平的优点,迅速成为了研究肿瘤发病机制、早期诊断、病理特征、预测转移及评估预后的全新方法。本研究利用miRNA表达谱芯片技术对比分析结肠癌伴... 详细信息

近年来,对miRNA研究不断深入,miRNA表达谱芯片应运而生,其凭借高通量、快速检测miRNA表达水平的优点,迅速成为了研究肿瘤发病机制、早期诊断、病理特征、预测转移及评估预后的全新方法。本研究利用miRNA表达谱芯片技术对比分析结肠癌伴淋巴结转移与无转移患者癌旁组织miRNA表达的差异,并对差异表达的miRNA行实时荧光定量PCR验证,[第一段]

关键词：结肠癌癌旁组织淋巴结转移 hsa—miR-137

来源：评论

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