氮元素过多过少都可能导致植株表型发生明显变化,甚至影响植株的正常生长发育。为了探究西藏青稞对不同氮浓度的响应,本研究采用藏青13作为材料,利用同位素相对标记与绝对定量技术(isobaric tags for relative and absolute quantitatio...
详细信息
氮元素过多过少都可能导致植株表型发生明显变化,甚至影响植株的正常生长发育。为了探究西藏青稞对不同氮浓度的响应,本研究采用藏青13作为材料,利用同位素相对标记与绝对定量技术(isobaric tags for relative and absolute quantitation, Itraq)标记联合液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)技术并结合生物信息学和分子生物学技术对适氮、缺氮、低氮和高氮处理样品的蛋白谱进行分析。iTRAQ测序结果表明,在根组织共鉴定得到8589个蛋白质,肽链长度主要分布在6～18个氨基酸之间;在叶组织中鉴定得到4608个蛋白质,肽链长度主要分布在6～16个氨基酸之间。COG分析显示,R类蛋白数量最多,同时鉴定的蛋白涉及次生代谢生物合成、信号转导、防御机制等多个方面。在不同氮素浓度处理下,其中缺氮处理与对照(适氮处理)相比,所筛选到的差异蛋白最多,有1518个蛋白,其中810个上调,708个下调。四个处理共同筛选到的差异蛋白共富集到47个功能项中,包含20个生物过程GO功能项,15个细胞组分GO功能项,12个分子功能GO功能项。
为进一步了解冷驯化后的青稞苗对低温胁迫的响应机制,本研究采用藏青148作为材料,利用同位素相对标记与绝对定量技术(isobaric tags for relative and absolute quantitation, iTRAQ)标记联合液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)技术并结合生物...
详细信息
为进一步了解冷驯化后的青稞苗对低温胁迫的响应机制,本研究采用藏青148作为材料,利用同位素相对标记与绝对定量技术(isobaric tags for relative and absolute quantitation, iTRAQ)标记联合液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)技术并结合生物信息学和分子生物学技术对青稞低温诱导的蛋白组差异蛋白谱进行分析。结果表明,在iTRAQ测序分析的常温及冷驯化后低温处理的样品肽段图谱中,共鉴定出5111个蛋白质,肽链长度主要分布在6-24个氨基酸之间。通路分析显示,鉴定到的蛋白质被富集到126个通路。COG分析显示,R类蛋白数量最多,同时鉴定的蛋白涉及能量代谢、信号转导、防御机制等多个方面。对照常温和低温处理18h筛选到的差异蛋白有886个,存在499个上调,387个下调,且在代谢通路、乙醛酸代谢、三羧酸循环、糖酵解四条通路显著富集。
本研究旨在利用质谱技术鉴定野血牦牛与家养牦牛血清中化学衍生物的差异,以明确长期受到高原生态环境自然选择下,野血牦牛更优环境适应性的代谢机制。本研究利用串联质谱技术对西藏阿里改则县的5头野血牦牛和5头家养牦牛的血清进行代谢组功能分析,共鉴定到574个代谢相关化学衍生物质,其中比例最高的是有机酸及其衍生物和氨基酸及其衍生物,21种代谢物质差异显著,较家养牦牛,野血牦牛有7类化学代谢物(邻甲氧基苯甲酸、9,12-十八碳二烯酸、3,4,5-三甲氧基肉桂酸等)显著上调,14类化学代谢物(前列腺素E2、氧化三甲胺、羟基二十碳五烯酸等)显著下调。其中7类化学衍生物(5-羟基吲哚-3-乙酸、鸟苷、尿素、前列腺素E2、皮质醇、5-甲氧基色胺、3-甲基吲哚)富集于31个KEGG信号通路,包括组织系统(Organismal Sysyems)、代谢(Metabolism)、人类疾病(Human Disease)、环境信息过程(Environmental Information Processing)。本研究通过代谢组比较分析,进一步明确了野血牦牛优异的环境适应性代谢基础,同时鉴定到野血牦牛中富含一系列(鸟苷、5-甲基-2-脱氧饱苷、邻甲基苯甲酸等)已明确与心脑血管疾病相关药的化学衍生物,为今后开发抗高原病相关药物开发提供借鉴参考。
暂无评论