检索结果-内蒙古大学图书馆

分子植物育种 2022年

作者：羊海珍巴桑玉珍曾兴权省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室西藏自治区农牧科学院农业研究所

为了探究青稞灌浆期籽粒中的miRNA及其表达特性，本研究以糯青稞‘08-1127’和非糯青稞‘藏青2000’为研究对象，分别构建开花后8、12、16和20 d籽粒样品的小RNA文库，并进行高通量测序。2个青稞材料中共鉴定到298个已知miRNA及78个新mi...

为了探究青稞灌浆期籽粒中的miRNA及其表达特性，本研究以糯青稞‘08-1127’和非糯青稞‘藏青2000’为研究对象，分别构建开花后8、12、16和20 d籽粒样品的小RNA文库，并进行高通量测序。2个青稞材料中共鉴定到298个已知miRNA及78个新miRNA。表达分析显示，‘08-1127’和‘藏青2000’在籽粒发育的4个阶段分别有133个和144个miRNA差异表达。71个miRNA在‘08-1127’和‘藏青2000’间显著差异表达，GO功能注释显示，差异表达miRNA的靶基因参与了代谢、细胞反应等生物过程，其分子功能主要为催化活性和结合；KEGG通路分析表明，靶基因参与环境适应、翻译、次生代谢物生物合成等18条通路。本研究为解析糯青稞、非糯青稞籽粒发育的分子机制提供了参考。

关键词：

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NaCl胁迫西藏青稞芽期幼苗根系生长特性及其耐盐性分析

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广东农业科学 2021年第2期48卷 26-32页

作者：杨春葆原红军省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室/西藏自治区农牧科学院农业研究所拉萨西藏850032

【目的】了解NaCl胁迫对西藏青稞芽期幼苗根系形态的影响以及与耐盐性的关系,筛选出耐盐性青稞品种(系)。【方法】以石英砂为基质,采用0、50、100、150、200、250 mmol/L NaCl溶液处理青稞,以相对活力指数为指标回归分析得到NaCl胁迫半... 详细信息

【目的】了解NaCl胁迫对西藏青稞芽期幼苗根系形态的影响以及与耐盐性的关系,筛选出耐盐性青稞品种(系)。【方法】以石英砂为基质,采用0、50、100、150、200、250 mmol/L NaCl溶液处理青稞,以相对活力指数为指标回归分析得到NaCl胁迫半致死浓度(LC_(50)),以LC_(50)为胁迫浓度处理28份青稞,研究NaCl胁迫对青稞根系形态特性影响,筛选耐盐性青稞品种(系)。【结果】西藏青稞幼苗相对活力指数随NaCl溶液浓度增加呈下降趋势,NaCl胁迫浓度与相对活力指数回归方程为:y=-0.0022x+0.9107;以LC_(50)为浓度胁迫青稞芽期幼苗,发芽率、芽长、最长根长、单株鲜重、单株干重均受到不同程度影响,其中芽长最敏感,单株鲜重最迟钝;相关性分析显示,相对活力指数与相对发芽率显著相关,与最长根长极显著相关,与单株干重极显著正相关;聚类分析结果显示,在欧式距离3处可以将青稞分为4大类,其中A类相对活力指数达到0.71,耐盐性最强。【结论】NaCl胁迫青稞半致死浓度为186.68 mmol/L;发芽率、根长、单株干重可作为青稞耐盐性材料筛选的辅助指标。结合相对活力指数及聚类分析,筛选到3份材料(WDM03018、WDM03722、WDM04526)耐盐性最强。

关键词： NaCl溶液青稞根系耐盐性半致死浓度西藏

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类乌齐牦牛C1QA、C1QB、C1QC基因克隆与组织表达分析

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华北农学报 2020年第4期35卷 211-221页

作者：钟美王吉坤柴志欣王会王嘉博武志娟信金伟张成福姬秋梅钟金城西南民族大学青藏高原研究院青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部重点实验室四川省重点实验室四川成都610041 省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室西藏拉萨850000

补体C1q(Complement 1q)蛋白由A、B、C 3条多肽链构成,在维护机体内环境稳定、氧化应激、糖脂代谢等过程发挥重要作用。为研究牦牛C1QA、C1QB、C1QC基因的分子特性及在不同组织中的表达水平,探讨该基因对牦牛高原适应性的影响,通过克隆... 详细信息

补体C1q(Complement 1q)蛋白由A、B、C 3条多肽链构成,在维护机体内环境稳定、氧化应激、糖脂代谢等过程发挥重要作用。为研究牦牛C1QA、C1QB、C1QC基因的分子特性及在不同组织中的表达水平,探讨该基因对牦牛高原适应性的影响,通过克隆获得牦牛C1QA、C1QB、C1QC基因的CDS区序列,分析其核苷酸序列相似性并构建系统进化树;利用在线软件进行功能预测分析;采用实时荧光定量PCR方法检测3个基因在牦牛心脏、肝脏、脾脏、肺脏和肾脏组织中的相对表达量。结果显示:C1QA、C1QB、C1QC基因CDS区全长分别为735,744,732 bp,分别编码244,247,243个氨基酸;3个基因编码的蛋白质均为稳定的亲水性蛋白,主要由甘氨酸(Gly)和脯氨酸(Pro)组成,含有C1Q结构域和信号肽,不存在跨膜结构域,属胞外蛋白;蛋白氨基酸序列中分别存在18,21,15个潜在的磷酸化位点,三者二级结构主要由无规则卷曲构成,比例分别为61.85%,63.97%,66.67%。荧光定量结果显示,C1QA、C1QB基因在肺脏、脾脏中表达量较高,极显著高于心脏、肝脏、肾脏组织(P<0.01),C1QC基因在肺脏的表达量极显著高于心脏、肝脏、脾脏、肾脏组织(P<0.01)。试验结果为深入研究C1QA、C1QB、C1QC基因在牦牛高原适应中的生理功能和调控机制提供了基础数据。

关键词：牦牛补体C1q 基因克隆组织表达功能预测

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类乌齐牦牛乳酸脱氢酶基因克隆及组织表达

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西北农业学报 2018年第10期27卷 1405-1415页

作者：黄兴柴志欣王会信金伟姬秋梅钟金城青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部重点实验室成都610041 西藏自治区农牧科学院省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室拉萨850009

旨在克隆西藏类乌齐牦牛乳酸脱氢酶(LDHB)基因并检测其组织表达情况,为给进一步研究LDHB在高海拔地区的极端低氧适应性及能量代谢中的调控作用提供依据。结果表明,类乌齐牦牛LDHB基因CDS区全长1 004bp,编码334个氨基酸,存在2处碱基突变... 详细信息

旨在克隆西藏类乌齐牦牛乳酸脱氢酶(LDHB)基因并检测其组织表达情况,为给进一步研究LDHB在高海拔地区的极端低氧适应性及能量代谢中的调控作用提供依据。结果表明,类乌齐牦牛LDHB基因CDS区全长1 004bp,编码334个氨基酸,存在2处碱基突变,导致密码子分别由AAG→GAG(赖氨酸→谷氨酸)、ATC→AGC(异亮氨酸→丝氨酸);编码蛋白分子质量为36.72ku,为疏水稳定性蛋白,功能预测在糖酵解及氧化还原等过程中发挥主要功能;系统进化树表明,西藏类乌齐牦牛与九龙牦牛、黄牛的氨基酸序列相似性最高,亲缘关系最近,其次为山羊、宽吻海豚、猪、马、羊驼和野生双峰骆驼,与鸡、乌鸦、非洲爪蟾和鲤鱼较远;定量分析显示,LDHB基因在牦牛肺脏中的表达水平显著高于心脏和肝脏,推测该基因与牦牛抗缺氧性状相关。

关键词：类乌齐牦牛 LDHB基因分子克隆载体构建组织表达

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PEG模拟干旱胁迫对白菜型春油菜芽期生长特性的影响

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广东农业科学 2020年第7期47卷 9-17页

作者：高雪尼玛扎西刘国一谭海运省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室/西藏自治区农牧科学院农业资源与环境研究所西藏拉萨850000

【目的】采用不同浓度聚乙二醇6000(PEG6000)溶液模拟干旱胁迫,研究白菜型春油菜芽期幼苗根系形态特征及生理生化特性,评价不同白菜型春油菜品种(系)抗旱性强弱。【方法】设置不同浓度(0%、5%、10%、15%、20%、25%)PEG6000溶液,观察模... 详细信息

【目的】采用不同浓度聚乙二醇6000(PEG6000)溶液模拟干旱胁迫,研究白菜型春油菜芽期幼苗根系形态特征及生理生化特性,评价不同白菜型春油菜品种(系)抗旱性强弱。【方法】设置不同浓度(0%、5%、10%、15%、20%、25%)PEG6000溶液,观察模拟干旱胁迫下4个白菜型春油菜品种(系)芽期幼苗的生长情况及生理生化特性,同时筛选抗旱性白菜型春油菜品种(系)。【结果】PEG6000溶液对4个品种(系)白菜型春油菜芽期幼苗成苗率、主根长、苗高、单株鲜重、相对活力指数等指标具有显著抑制效应。溶液浓度为15%~20%时,4个品种(系)白菜型春油菜相对活力指数在0.50~0.60之间;浓度为0%~15%时,超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化物酶(POD)、过氧化氢酶(CAT)活性与溶液浓度呈正相关关系;浓度为15%~20%时酶活性出现峰值,超过此浓度范围酶活性下降。浓度为5%~15%时,可溶性糖(SS)、可溶性蛋白(SPr)、脯氨酸(Pro)、丙二醛(MDA)含量与溶液浓度呈正相关关系。【结论】白菜型春油菜幼苗相对活力指数及苗高可作为抗旱性筛选指标,15%~20%PEG6000溶液浓度可作为白菜型春油菜模拟干旱胁迫最适浓度,筛选出抗旱性品系104005。

关键词：聚乙二醇6000 白菜型春油菜干旱胁迫生长特性生理生化抗旱性

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基于TMT蛋白组学及生物信息学分析牦牛抗冻差异蛋白

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南方农业学报 2022年第1期53卷 1-11页

作者：贾银海张成福张强姬秋梅黄光云姜辉文信旺黄明光彭夏云吴柱月广西畜牧研究所/广西家畜遗传改良重点实验室南宁530001 西藏农牧科学院畜牧兽医研究所/省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室拉萨850000

【目的】从蛋白水平阐明牦牛抗寒性能机理,并进一步从营养学角度提高其代谢性能,为牦牛有效抵御外界恶劣气候条件提供科学依据。【方法】应用TMT蛋白组学技术对寒冷季节(1月)和温暖季节(8月)的牦牛抗冻蛋白进行挖掘,并对鉴定到的牦牛抗... 详细信息

【目的】从蛋白水平阐明牦牛抗寒性能机理,并进一步从营养学角度提高其代谢性能,为牦牛有效抵御外界恶劣气候条件提供科学依据。【方法】应用TMT蛋白组学技术对寒冷季节(1月)和温暖季节(8月)的牦牛抗冻蛋白进行挖掘,并对鉴定到的牦牛抗冻蛋白进行亚细胞定位、结构域、GO功能富集、KEGG信号通路注释、蛋白相互作用等生物信息学分析。【结果】从牦牛耳组织中共鉴定获得21856个肽段(Peptide),其中特有肽段(Unique peptide)序列为18452个,定量获得4519个蛋白,最终筛选出144个差异蛋白,其中上调蛋白89个、下调蛋白55个。144个牦牛抗冻差异蛋白亚细胞定位到7个条目上,分别是细胞核蛋白56个、细胞质蛋白51个、质膜蛋白24个、细胞外蛋白23个、线粒体蛋白18个、细胞骨架蛋白1个和溶酶体蛋白1个;共鉴定到194个结构域。GO功能富集分析结果显示,生物过程主要富集到细胞过程蛋白79个、代谢过程蛋白70个和生物调控蛋白42个等,分子功能主要富集到结合功能蛋白75个和催化活性蛋白64个等,细胞组分主要富集到细胞部分蛋白89个和细胞蛋白89个等。144个牦牛抗冻差异蛋白在KEGG数据库中注释到205条KEGG信号通路,主要涉及核糖体、氮代谢、胞质DNA感受、动物体内生热作用、氧化磷酸化、白细胞介素-17及钙离子信号等通路。牦牛抗冻差异蛋白相互作用网络分析发现L8IHE5的关联度最高,且冷诱导RNA结合蛋白(CIRP)和HSP70结合蛋白在蛋白相互作用网络中具有更多的相互作用关系。【结论】基于TMT蛋白组学对牦牛抗冻差异蛋白进行挖掘,结果鉴定获得144个抗冻差异蛋白(上调蛋白89个,下调蛋白55个),其中CIRP和HSP70在冷应激条件下呈上调趋势,能促使牦牛肌体适应低温环境,可作为牦牛抗冻性育种的候选分子标记。

关键词：牦牛 TMT蛋白组学生物信息学抗冻性差异蛋白

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CTGF、Gprin3基因多态性及其与牦牛体尺性状的关联分析

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中国畜牧兽医 2022年第6期49卷 2216-2227页

作者：柴志欣武志娟王吉坤张成福钟金城信金伟西南民族大学青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部重点实验室成都610041 省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室拉萨850000

【目的】检测牦牛结缔组织生长因子(CTGF)和G蛋白调节诱导神经突增生家族亚型因子3(Gprin3)基因的单核苷酸多态性(SNP),并分析多态位点与牦牛体尺性状的关联性。【方法】以西藏的斯布牦牛、帕里牦牛、类乌齐牦牛、申扎牦牛及四川的麦洼... 详细信息

【目的】检测牦牛结缔组织生长因子(CTGF)和G蛋白调节诱导神经突增生家族亚型因子3(Gprin3)基因的单核苷酸多态性(SNP),并分析多态位点与牦牛体尺性状的关联性。【方法】以西藏的斯布牦牛、帕里牦牛、类乌齐牦牛、申扎牦牛及四川的麦洼牦牛5个类群260头个体为研究对象,利用基因池筛选技术检测CTGF、Gprin3基因SNP位点,分析其多态信息含量、有效等位基因数、纯合度及杂合度等指标,利用最小二乘线性模型分析不同基因型与牦牛体尺性状的关联性。【结果】牦牛CTGF基因存在3个SNPs位点,分别为T1537A、C2195T和C2421T,均位于内含子区,其中T1537A位点在斯布牦牛和麦洼牦牛中均处于Hardy-Weinberg平衡状态,而在帕里牦牛、类乌齐牦牛和申扎牦牛中均偏离Hardy-Weinberg平衡状态,该位点与牦牛体高呈显著相关(P<0.05);C2195T位点在5个牦牛类群中均处于Hardy-Weinberg平衡状态,且处于中度多态(0.25牦牛类群中均处于Hardy-Weinberg平衡状态,该位点与牦牛体重、体斜长、胸围、管围和前肢长均呈显著相关(P<0.05)。牦牛Gprin3基因共发现4个SNPs,分别为G310C、C414T、C1100T和G1213A,其中G310C、C414T及C1100T位点在5个牦牛类群中均处于Hardy-Weinberg平衡状态;G1213A位点在类乌齐牦牛中偏离Hardy-Weinberg平衡状态,在其余4个类群中均处于Hardy-Weinberg平衡状态;G310C位点在5个牦牛类群中均处于低度多态(PIC<0.25),C414T和C1100T位点在类乌齐牦牛、斯布牦牛中均处于中度多态,G1213A位点在类乌齐牦牛中处于中度多态,在其余牦牛类群中为低度多态;C414T位点与牦牛体重、体高、体斜长和胸围均呈显著相关,而在斯布牦牛和申扎牦牛中C1100T位点与其胸围和前肢长均呈显著相关(P<0.05)。【结论】牦牛CTGF和Gprin3基因具有丰富的多态性,CTGF基因T1537A、C2421T位点及Gprin3基因C414T、C1100T位点均与牦牛体尺性状有关,可作为影响生长发育性状的候选基因及基因座用于牦牛定向选育。

关键词：牦牛 CTGF基因 Gprin3基因多态性体尺性状

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西藏牛与三江牛心脏组织低氧适应相关circRNA分析

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农业生物技术学报 2021年第6期29卷 1121-1131页

作者：白佳灵王会钟金城陈智华柴志欣王吉坤王嘉博武志娟信金伟西南民族大学青藏高原动物遗传资源保护与利用四川省重点实验室/青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部重点实验室省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室

环状RNA （circle RNA, circ RNA）是一种共价封闭的内源性生物分子,在高原动物低氧适应性中具有重要作用。高通量测序技术以成本低、通量高与速度快等优势,在哺乳动物与人类疾病研究中广泛应用,然而目前对西藏牛（Bos taurus）高原适... 详细信息

环状RNA （circle RNA, circ RNA）是一种共价封闭的内源性生物分子,在高原动物低氧适应性中具有重要作用。高通量测序技术以成本低、通量高与速度快等优势,在哺乳动物与人类疾病研究中广泛应用,然而目前对西藏牛（Bos taurus）高原适应性相关circ RNA的研究鲜有报道。本研究以西藏牛和三江牛为对象,选择对高原低氧环境敏感的心脏组织,使用Illumina Hi Seq TM 4000平台对西藏牛与三江牛心脏组织circ RNA进行测序,对其差异表达谱进行分析,并预测circ RNA-mi RNA-m RNA之间的靶向关系,构建circ RNA-mi RNA-m RNA可视化调控网络。在西藏牛和三江牛的6个样本中,共筛选得到差异表达circ RNA 283个,其中显著上调的278个,显著下调的5个;GO功能富集分析显示,其来源基因被注释到45个功能条目;KEGG信号通路（pathway）功能富集分析表明,其来源基因主要显著富集在泛素介导的蛋白水解通路和c GMP-PKG信号通路等通路;novelcirc018959与mi R-142-x、mi R-144-y、mi R-1908-x、mi R-2302-y、mi R-1273-y等mi RNA存在靶向关系,而这些mi RNA的靶基因中包括ECE1、NFATC1、CAST、COX7C等低氧适应性候选基因,推测novelcirc018959很可能参与西藏牛低氧适应性调控,其具体功能及调控机制有待进一步研究。本研究结果为深入揭示circ RNA在西藏牛高原低氧适应过程中的分子机制提供了基础数据支持。

关键词：西藏牛三江牛心脏组织 circRNA 低氧适应性

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不同水平过瘤胃氨基酸对泌乳牦牛生产性能及乳成分的影响

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江西农业大学学报 2021年第3期43卷 640-648页

作者：曹涵文陈晓英信金伟朱勇张强姜辉次旦央吉孙光明洛桑顿珠达娃央拉张成福省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室西藏拉萨850000 西藏自治区农牧科学院畜牧兽医研究所西藏拉萨850009

【目的】为探究不同水平过瘤胃赖氨酸(RPLys)和过瘤胃蛋氨酸(RPMet)对泌乳牦牛生产性能及乳成分的影响。【方法】选择体尺、体质量相近的健康的泌乳牦牛40头,平均分为4组,对照组饲喂基础日粮,试验组在基础日粮中添加RPLys和RPMet组成混... 详细信息

【目的】为探究不同水平过瘤胃赖氨酸(RPLys)和过瘤胃蛋氨酸(RPMet)对泌乳牦牛生产性能及乳成分的影响。【方法】选择体尺、体质量相近的健康的泌乳牦牛40头,平均分为4组,对照组饲喂基础日粮,试验组在基础日粮中添加RPLys和RPMet组成混合氨基酸5,10,15 g/(d·头)进行饲喂,试验的预试期为7 d,正试期为42 d。分别于饲喂起始与结束时,测定泌乳牦牛体尺指标、生长性能、产奶量、乳成分及乳中的氨基酸成分。【结果】1)日粮中添加10 g/(d·头)过瘤胃氨基酸,能够提升泌乳牦牛胸围和体驱指数(P<0.05),对体高、体斜长、管围、体长指数影响不显著(P>0.05)。2)日粮中添加10 g/(d·头)过瘤胃氨基酸,能够提升泌乳牦牛总增重、平均日增重并降低料重比(P<0.05),对末质量、采食量及肥度指数影响不显著(P>0.05)。3)日粮中添加10 g/(d·头)过瘤胃氨基酸,能够提升泌乳牦牛乳蛋白含量(P<0.05),对产奶量、乳脂率、乳糖、总固形物影响不显著(P>0.05)。4)日粮中添加过瘤胃氨基酸,对泌乳牦牛乳中的氨基酸成分无影响(P>0.05)。【结论】在泌乳牦牛日粮中添加RPLys和RPMet进行饲喂,能够显著提升泌乳牦牛的生产性能和乳成分,最佳添加量为10 g/(d·头)。

关键词：过瘤胃赖氨酸过瘤胃蛋氨酸体尺指标生长性能产奶量乳成分

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牦牛骨骼肌中特异基质金属蛋白酶及其功能相关基因的表达分析

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中国畜牧兽医 2023年第5期50卷 1774-1784页

作者：武志娟柴志欣王吉坤王嘉博钟金城信金伟西南民族大学青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部重点实验室成都610041 省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室拉萨850002

【目的】筛选并鉴定在牦牛骨骼肌中特异表达的基质金属蛋白酶(matrix metalloproteinases,MMPs)家族成员及其功能相关基因,以期为研究牦牛骨骼肌结构形成机制提供依据。【方法】采集成年公牦牛臀肌和胸肌,利用组织化学染色法(HE和Masson... 详细信息

【目的】筛选并鉴定在牦牛骨骼肌中特异表达的基质金属蛋白酶(matrix metalloproteinases,MMPs)家族成员及其功能相关基因,以期为研究牦牛骨骼肌结构形成机制提供依据。【方法】采集成年公牦牛臀肌和胸肌,利用组织化学染色法(HE和Masson)分析肌纤维特征和胶原纤维数量;通过实时荧光定量PCR鉴定MMPs和基质金属蛋白酶抑制因子(TIMPs)的mRNA表达量;采用Western blotting技术和免疫组织化学法分析MMPs、Ⅰ和Ⅲ型胶原蛋白的表达量和组织分布;通过STRING网站分析MMPs及其功能相关基因之间的蛋白质互作网络;采用EnzChek TM明胶酶/胶原酶试剂盒检测牦牛臀肌和胸肌中明胶酶/胶原酶的酶活性差异。【结果】Masson染色和实时荧光定量PCR分析结果显示,牦牛臀肌中胶原纤维面积、MMP-2和MMP-14基因表达量显著低于胸肌(P<0.05),TIMP-3基因在牦牛臀肌中表达量显著高于胸肌(P<0.05)。Western blotting鉴定发现,MMP-3、MMP-14、Ⅰ和Ⅲ型胶原蛋白在牦牛臀肌中的表达量极显著或显著低于胸肌(P<0.01;P<0.05)。免疫组织化学法分析显示,MMP-2、MMP-9、MMP-14和Ⅰ型胶原蛋白在牦牛臀肌中的表达量显著或极显著低于胸肌(P<0.05;P<0.01),而MMP-16在牦牛臀肌中的表达量显著高于胸肌(P<0.05)。蛋白质功能相关性聚类分析表明,MMP-2、MMP-14、MMP-16、TIMP-2、TIMP-3、COL1A2和COL3A1可聚为一簇,MMP-3、MMP-9和TIMP-1可聚为一簇;臀肌和胸肌中明胶酶/胶原酶的酶活性变化趋势一致,且差异不显著(P>0.05)。【结论】MMPs家族成员及其功能相关基因在牦牛骨骼肌中广泛表达,且在臀肌和胸肌中的表达量存在差异,为进一步研究MMPs调控牦牛骨骼肌结构形成的作用机制提供了参考依据。

关键词：牦牛骨骼肌基质金属蛋白酶(MMPs) 胶原蛋白

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