检索结果-内蒙古大学图书馆

物理化学学报 2010年第3期26卷 775-783页

作者：郑春松徐筱杰刘献祥叶蕻芝福建中医学院中西医结合研究院福州350108 北京大学化学与分子工程学院北京100871

采用分子相似性分析、化学空间、分子对接、生物网络技术和药代动力学性质预测等计算机药理学方法研究中药精制透骨消痛颗粒中514个化合物的药理学机制.结果表明:该复方所含化合物在化学结构上具有多样性及大部分化合物在化学空间上具... 详细信息

采用分子相似性分析、化学空间、分子对接、生物网络技术和药代动力学性质预测等计算机药理学方法研究中药精制透骨消痛颗粒中514个化合物的药理学机制.结果表明:该复方所含化合物在化学结构上具有多样性及大部分化合物在化学空间上具有类药性质;通过514个与35个骨性关节炎疾病相关的公认靶标的相互作用及它们在靶空间的分布上阐明了精制透骨消痛颗粒防治骨性关节炎的可能作用机理,发现了一些潜在的活性分子;通过分析药物库中骨性关节炎的药物-靶点的作用网络及精制透骨消痛颗粒中分子-靶点的作用网络的异质性值、特征路径长度等特征,揭示精制透骨消痛颗粒的多药物、多靶点、多途径分子作用机制.结果有助于理解中药精制透骨消痛颗粒的复杂作用机制.

关键词：分子对接化学空间靶空间骨性关节炎计算药理学

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透骨消痛颗粒防治骨性关节炎的计算药效学研究

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中药药理与临床 2009年第2期25卷 98-102页

作者：郑春松叶蕻芝李旭东刘献祥徐筱杰福建中西医结合研究院福州350108 北京大学化学与分子工程学院北京100871

目的:从分子水平验证透骨消痛颗粒治疗骨性关节炎疗效,为临床用药提供依据。方法:分子对接法和靶-配体空间分布,初步鉴定出透骨消痛颗粒中治疗骨关节炎疾病的有效成分群。结果:透骨消痛颗粒是通过抑制聚蛋白多糖酶的活性、降低骨内压和... 详细信息

目的:从分子水平验证透骨消痛颗粒治疗骨性关节炎疗效,为临床用药提供依据。方法:分子对接法和靶-配体空间分布,初步鉴定出透骨消痛颗粒中治疗骨关节炎疾病的有效成分群。结果:透骨消痛颗粒是通过抑制聚蛋白多糖酶的活性、降低骨内压和降低骨性关节炎细胞因子的产生等起作用,其中,有些化合物显示出多重激酶特性。结论:透骨消痛颗粒对骨性关节炎具有潜在的协同作用。

关键词：透骨消痛颗粒骨性关节炎药效学分子对接法靶-配体空间分布协同效应

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青风藤治疗骨性关节炎药效物质基础多靶导向作用的计算机模拟研究

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中国中西医结合杂志 2012年第3期32卷 375-379页

作者：郑春松徐筱杰叶蕻芝刘献祥福建中医药大学中西医结合研究院福州350108 北京大学化学与分子工程学院北京100871 福建省中西医结合老年性疾病重点实验室福州350108

目的探讨青风藤治疗骨性关节炎(osteoarthritis,OA)的药效物质基础,并对青风藤多靶导向作用做出药效学阐释。方法 (1)构建青风藤化学成分分子数据库,应用分子对接探讨其与OA重要靶标的相互作用;(2)构建青风藤所含分子配体-靶作用网络及D... 详细信息

目的探讨青风藤治疗骨性关节炎(osteoarthritis,OA)的药效物质基础,并对青风藤多靶导向作用做出药效学阐释。方法 (1)构建青风藤化学成分分子数据库,应用分子对接探讨其与OA重要靶标的相互作用;(2)构建青风藤所含分子配体-靶作用网络及DrugBank药物库中有关OA的药物分子配体-靶作用网络,分析其网络特征,阐明青风藤治疗OA作用机制和特点。结果青风藤中共有14个化学成分分子与2个及2个以上靶点相互作用,其中6个化学成分分子对4个及4个以上靶点有作用效应。青风藤分子配体-靶作用网络与药物分子配体-靶作用网络的轮廓和特征相似。结论青风藤存在多成分、多靶导向效应,且部分成分存在多靶导向效应,为青风藤治疗OA的药效学分子机制提供了解释,同时也为寻找治疗OA的新型药物提供一定的参考和借鉴。

关键词：青风藤药效物质基础计算机模拟多靶点骨性关节炎

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血府逐瘀汤在心血管疾病方面的计算机药理学探讨

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计算机与应用化学 2009年第1期26卷 9-16页

作者：郑春松黄钦李旭东刘献祥徐筱杰福建中西医结合研究院福建福州350108 广西民族大学化学与生态工程学院广西南宁530006 北京大学化学与分子工程学院北京100871

目的:探讨血府逐瘀汤在心血管疾病的药理学性质。方法:1.分子描述符的主成分分析法,研究血府逐瘀汤所含分子与药物/类药分子的化学空间分布;2.分子对接法和靶-配体空间分布,初步鉴定出血府逐瘀汤中治疗心血管疾病的有效成分群;3.药代动... 详细信息

目的:探讨血府逐瘀汤在心血管疾病的药理学性质。方法:1.分子描述符的主成分分析法,研究血府逐瘀汤所含分子与药物/类药分子的化学空间分布;2.分子对接法和靶-配体空间分布,初步鉴定出血府逐瘀汤中治疗心血管疾病的有效成分群;3.药代动力学特征预测。结果:血府逐瘀汤所含分子比药物/类药分子有更优良的多样性,通过分子对接打分,有些化合物显示出多重激酶特性,但其药代动力学特征预测与实验有差别。结论:血府逐瘀汤中分子对心血管疾病多通路、潜在协同作用的药理学性质。

关键词：中草药血府逐瘀汤心血管疾病化学空间虚拟筛选药代动力学特征预测药理学

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川芎活血化瘀和行气止痛作用的计算机模拟研究

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中华中医药杂志 2015年第5期30卷 1432-1436页

作者：郑春松徐筱杰叶蕻芝刘献祥福建中医药大学中西医结合研究院福州350122 北京大学化学与分子工程学院北京100871

目的:从分子层面研究川芎活血化瘀与行气止痛的作用特征,为其临床应用提供实验依据。方法:利用配体聚类和化学空间研究川芎所含化合物的物理化学性质;利用分子对接和生物网络研究川芎活血化瘀与行气止痛的作用特征。结果:川芎中的化合... 详细信息

目的:从分子层面研究川芎活血化瘀与行气止痛的作用特征,为其临床应用提供实验依据。方法:利用配体聚类和化学空间研究川芎所含化合物的物理化学性质;利用分子对接和生物网络研究川芎活血化瘀与行气止痛的作用特征。结果:川芎中的化合物分为10类,在化学空间具有很好的分散性;所建的网络模型中,活血化瘀与行气止痛作用网络的特征分布存在部分的相似之处,其网络中每个化合物的平均靶点数分别为2.67和2.22,而且,网络中化合物的总数为30,反映川芎的多成分-多靶点作用。结论:计算机模拟直观显示了川芎活血化瘀与行气止痛的作用特征异同点,从分子层面揭示川芎的多靶点作用,为其具有不同功效提供解释。

关键词：川芎活血化瘀行气止痛分子特征计算机模拟配体聚类分子对接

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两种治法方药治疗骨性关节炎的计算机模拟比较研究

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中国中西医结合杂志 2014年第4期34卷 480-485页

作者：郑春松徐筱杰叶蕻芝李会婷刘献祥福建中医药大学中西医结合研究院骨病研究所福州350122 北京大学化学与分子工程学院计算机模拟实验室北京100871 福建中医药大学中西医结合研究院老年性疾病重点实验室福州350122

目的从分子层面比较补肾法和活血法方药治疗骨性关节炎(osteoarthritis,OA)的作用。方法利用化学空间、分子对接、生物网络等计算机模拟方法,分析补肾法和活血法方药化学成分的物理化学性质及其与靶点作用的网络特征。结果补肾法和活血... 详细信息

目的从分子层面比较补肾法和活血法方药治疗骨性关节炎(osteoarthritis,OA)的作用。方法利用化学空间、分子对接、生物网络等计算机模拟方法,分析补肾法和活血法方药化学成分的物理化学性质及其与靶点作用的网络特征。结果补肾法和活血法方药的化学成分在化学空间中都分布离散,有较大的重叠区域;所建的网络模型中,补肾法和活血法方药的网络作用特征分布也存在部分的相似之处,其网络中每个化合物的平均靶点数分别为1.86和2.11,平均每个靶点分别与4.46和3.93个化合物相关联,反映其多成分—多靶点作用。结论计算机模拟直观地展示了补肾法和活血法方药及其在治疗OA上的异同点,从分子层面上揭示了两种方药配伍使用具有更广谱的靶作用和潜在的协同作用。

关键词：补肾法活血法骨性关节炎计算机模拟中草药

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基于计算机模拟研究治疗骨性关节炎祛风湿和活血化瘀中药的分子特征

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中华中医药杂志 2012年第9期27卷 2296-2299页

作者：郑春松叶蕻芝李西海许惠凤吴广文刘献祥徐筱杰福建中医药大学中西医结合研究院福州350122 福建省中西医结合老年性疾病重点实验室福州350122 北京大学化学与分子工程学院北京100871

目的:研究治疗骨性关节炎的祛风湿和活血化瘀中药分子特征,为其配伍提供实验依据。方法:利用分子相似性、描述符计算、主成分分析等计算方法描述祛风湿和活血化瘀中药分子的特征。结果:祛风湿和活血化瘀中药的分子在结构特征和物理化学... 详细信息

目的:研究治疗骨性关节炎的祛风湿和活血化瘀中药分子特征,为其配伍提供实验依据。方法:利用分子相似性、描述符计算、主成分分析等计算方法描述祛风湿和活血化瘀中药分子的特征。结果:祛风湿和活血化瘀中药的分子在结构特征和物理化学性质上存在相似之处,在化学空间上也有相同的区域。结论:祛风湿和活血化瘀中药在骨性关节炎临床上配伍使用存在潜在的协同作用,在一定程度上揭示两者配伍的合理性。

关键词：中药祛风湿活血化瘀分子特征计算机模拟

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透骨消痛胶囊治疗骨性关节炎的多向药理学研究

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福建中医药大学学报 2011年第1期21卷 43-47页

作者：郑春松林珠灿许惠风曾建伟徐筱杰刘献祥叶蕻芝福建中医药大学中西医结合研究院福建福州350108 北京大学化学与分子工程学院北京100871

目的研究透骨消痛胶囊治疗骨性关节炎的药理学机制。方法利用生物网络的度分布、路中心、最近距离中心、特征路径长度、异质性等网络特征参数,对透骨消痛胶囊中分子配体-靶作用网络和药物库中药物分子配体-靶作用网络对照研究透骨消痛... 详细信息

目的研究透骨消痛胶囊治疗骨性关节炎的药理学机制。方法利用生物网络的度分布、路中心、最近距离中心、特征路径长度、异质性等网络特征参数,对透骨消痛胶囊中分子配体-靶作用网络和药物库中药物分子配体-靶作用网络对照研究透骨消痛胶囊的药理学机制。结果 2个网络都属于无标度网络,存在一些"关键节点",2个网络的异质性和特征路径长度值接近。结论透骨消痛胶囊和药物分子配体-靶作用网络中存在"一对多、多对一"复杂的非线性调控模式,揭示了透骨消痛胶囊的多向药理学行为。

关键词：透骨消痛胶囊分子对接网络特征多向药理学骨性关节炎

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透骨消痛胶囊防治骨性关节炎的化学空间分析

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福建中医学院学报 2010年第2期20卷 16-18,27页

作者：刘献祥郑春松叶蕻芝徐筱杰福建中医学院中西医结合研究院福建福州350108 北京大学化学与分子工程学院北京100871

目的从化学空间角度探讨透骨消痛胶囊防治骨性关节炎的作用机制。方法运用计算机方法对透骨消痛胶囊中分子组成的数据集及药物分子/类药分子数据集进行化学空间分析,对一些特征描述符的分布进行了描述,同时采用主成分分析方法将多维化... 详细信息

目的从化学空间角度探讨透骨消痛胶囊防治骨性关节炎的作用机制。方法运用计算机方法对透骨消痛胶囊中分子组成的数据集及药物分子/类药分子数据集进行化学空间分析,对一些特征描述符的分布进行了描述,同时采用主成分分析方法将多维化学空间映射到二维空间以得到更直观的图像。结果透骨消痛胶囊中分子与药物分子/类药分子在化学空间有较好的重叠。结论本方法直观地揭示了透骨消痛胶囊防治骨性关节炎的重要意义。

关键词：透骨消痛胶囊骨性关节炎化学空间分子描述符

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透骨消痛颗粒防治膝骨性关节炎的计算机药理学探讨

透骨消痛颗粒防治膝骨性关节炎的计算机药理学探讨

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福建中西医结合研究院2008年学术年会

作者：郑春松叶蕻芝黄钦李旭东徐筱杰刘献祥福建中西医结合研究院，福州，350108 福建省高校中西医结合基础重点实验室(福建中医学院)，福州 350108 广西民族大学化学与生态工程学院，广西南宁，530006 北京大学化学与分子工程学院，北京 100871 福建中西医结合研究院，福州，350108 北京大学化学与分子工程学院，北京 100871 福建中西医结合研究院，福州，350108

目的：从分子水平上探讨透骨消痛颗粒防治膝骨性关节炎的药理学性质。方法：1.分子描述符的主成分分析法，研究透骨消痛颗粒所含分子与药物/类药分子的化学空间分布;2.分子对接法和靶-配体空间分布，初步鉴定出透骨消痛颗粒中治疗... 详细信息

目的：从分子水平上探讨透骨消痛颗粒防治膝骨性关节炎的药理学性质。方法：1.分子描述符的主成分分析法，研究透骨消痛颗粒所含分子与药物/类药分子的化学空间分布;2.分子对接法和靶-配体空间分布，初步鉴定出透骨消痛颗粒中治疗骨性关节炎疾病的有效成分群。***模块预测分子的药代动力学性质。结果：透骨消痛颗粒分子具有多样性特点及其虚拟筛选的活性分子得到初步的辨识。结合药代动力学性质，揭示了透骨消痛颗粒分子的协同作用。结论：从计算机药理学角度，透骨消痛颗粒能协同抑制细胞因子、基质金属蛋白酶、氧自由基的生物效应来延缓软骨的退变。

关键词：透骨消痛颗粒骨性关节炎化学空间虚拟筛选药物化学药代动力学预测计算机药理学

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