检索结果-内蒙古大学图书馆

中国生态农业学报 2014年第4期22卷 375-385页

作者：贾琪吴名耀梁康迳孙新立林文雄福建农林大学作物科学学院作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室福州350002

自然环境中各种生物和非生物胁迫是影响作物产量的巨大威胁。随着现代分子生物学的发展,从分子水平研究作物抵御逆境的机理已成为生态农业研究的一个重要任务,分子遗传学与生态学的整合诞生了生态基因组学即用基因组学的技术和手段研究... 详细信息

自然环境中各种生物和非生物胁迫是影响作物产量的巨大威胁。随着现代分子生物学的发展,从分子水平研究作物抵御逆境的机理已成为生态农业研究的一个重要任务,分子遗传学与生态学的整合诞生了生态基因组学即用基因组学的技术和手段研究生态学领域的问题。基因组学按其研究内容分为功能基因组学、结构基因组学和比较基因组学,本文从这3方面分别阐述了作物抵抗生物胁迫和非生物胁迫的生态基因组学研究进展,总结了基因组学在植物抗逆性研究中的一些新技术和新手段,特别是基于近几年发展起来的二代深度测序所带来的一系列高通量的检测方法与结果。①功能基因组学包含转录组学、表观遗传学、蛋白组学、相互作用组学、代谢组学和表型组学,本文侧重从植物抗逆的功能基因表达水平上的研究展开,重点探讨了转录组学和表观遗传学在植物抗逆研究的新进展,介绍了一些转录组学和表观遗传学研究技术,如基因芯片技术、RNA测序技术、SAGE、cDNA-AFLP、SSH、亚硫酸盐法、ChIP-Chip、ChIP-seq等;例举了一些转录因子基因家族在植物抗逆反应中的作用,总结其作用共性,结果表明不少抗逆基因受到胁迫后基因转录激活上有一定相关性,大多受激素信号转导途径所调控,很多抗逆途径最终都涉及到ABA信号传导通路并与衰老相关;植物的抗逆性受多个信号通路调控,对同一逆境响应常常需要不同的转录因子共同参与,而同一转录因子也有可能参与2个以上的不同抗逆反应;表观遗传学则指在不改变基因序列前提下,对DNA甲基化修饰、组蛋白翻译后修饰及小RNA介导的信号传导等,有证据表明其存在遗传印记作用。②结构基因组学主要利用QTL定位和DNA测序技术,确定植物基因组的遗传图谱和物理图谱,二代深度测序平台的建立使许多植物的全基因组测序成为可能。迄今为止,已有超过40种植物完成全基因组测序,越来越多的植物全基因组计划正在实施中或预计实施。③比较基因组学是基于功能基因组学和结构基因组学进而比较不同物种或不同群体间的基因组差异和相关性的研究,可分析逆境响应相关基因在进化过程中及在地理位置分布中的作用和意义,也同时为QTL定位及功能基因组学研究提供丰富信息。此外,还简要介绍并列举了一些网络共享作物抗逆的生物信息资源数据库。虽然基因组学在如何正确处理海量数据等问题上还存在瓶颈,但它提供的大量作物抗逆方面的基因组信息已为植物抗逆研究提供了众多线索与依据,为今后改良作物抗逆性的遗传育种工作带来了新启示。

关键词：环境生物胁迫非生物胁迫作物基因组学生物信息学

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黄麻与其他物种HD-ZIPⅠ和LEA14蛋白序列同源性及其盐胁迫表达分析

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福建农林大学学报（自然科学版） 2022年第3期51卷 298-306页

作者：陈毓娜 Manuel Sebastian Fiallos 李静李云清祁建民徐建堂方平平林荔辉张立武陶爱芬福建农林大学作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室/福建省作物设计育种重点实验室福建农林大学金山学院福建福州350002

利用黄麻与水稻、拟南芥和大豆等的HD-ZIPⅠ和LEA14蛋白的相似性构建系统进化树,并以耐盐性不同的两个黄麻品种福农1号(较耐盐)和中黄麻1号(较敏感)为材料,利用实时荧光定量PCR分析盐胁迫下HDZ4和LEA14基因的表达情况.结果表明:在黄麻... 详细信息

利用黄麻与水稻、拟南芥和大豆等的HD-ZIPⅠ和LEA14蛋白的相似性构建系统进化树,并以耐盐性不同的两个黄麻品种福农1号(较耐盐)和中黄麻1号(较敏感)为材料,利用实时荧光定量PCR分析盐胁迫下HDZ4和LEA14基因的表达情况.结果表明:在黄麻中鉴定到10个与其他作物具有同源性的HD-ZIPⅠ编码蛋白,其与大豆、拟南芥(双子叶)的蛋白序列相似度高于与水稻(单子叶)的相似度,与拟南芥的进化分歧时间明显短于与水稻的进化分歧时间,表明HD-ZIPⅠ家族基因在单子叶和双子叶植物中存在功能分化;鉴定到1个与其他作物同源性较高的LEA14编码蛋白,其与棉花的进化关系最近.在盐胁迫处理下,HDZ4在不同黄麻品种及不同时间点的表达量没有明显差异;而LEA14在中黄麻1号中的表达量随时间延长呈先下调再上调最后下调的趋势,在福农1号中的表达量呈先上调后下调的趋势,同时,在福农1号中的表达量整体高于在中黄麻1号中的表达量;LEA14在两个黄麻品种叶片中的表达量均高于在根部的表达量,并且在两个品种叶片和根部的表达量均在盐处理48 h时达到高峰.

关键词：黄麻 HD-ZIPⅠ LEA14 同源分析盐胁迫表达

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利用SSR标记对水稻7组衍生品种的遗传多样性分析

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福建农林大学学报（自然科学版） 2020年第3期49卷 289-294页

作者：马菊赵锦祥林郑希谢永波陈志伟毛大梅周彬官华忠福建农林大学作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室/福建省作物设计育种重点实验室福建福州350002

采用53对SSR引物对水稻7组衍生品种及其亲本进行遗传多样性和标记鉴定效率分析.结果表明,53对SSR引物中47对具有多态性,占88.68%;共检测到135个等位位点,每个标记平均2.8720个等位位点,变幅为2~5;多态性信息含量(PIC)平均值为0.4821,变... 详细信息

采用53对SSR引物对水稻7组衍生品种及其亲本进行遗传多样性和标记鉴定效率分析.结果表明,53对SSR引物中47对具有多态性,占88.68%;共检测到135个等位位点,每个标记平均2.8720个等位位点,变幅为2~5;多态性信息含量(PIC)平均值为0.4821,变幅为0.2142~0.7891,其中14对引物具有高的PIC值(>0.6).聚类分析表明,7组供试衍生品种能按来源被准确分类.比较24对引物(NY/T 1433-2007)和48对引物(NY/T 1433-2014)的鉴定效率发现,标记数增加能提高鉴定准确性.

关键词：水稻 SSR标记遗传多样性

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琯溪蜜柚叶片黄化与缺镁的关系及叶面补镁的矫治效果

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果树学报 2021年第8期38卷 1319-1329页

作者：张炎曹振周慧梅沈海芹苏达吴良泉叶德练福建农林大学资源与环境学院·国际镁营养研究所福州350002 福建农林大学农学院·作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室福州350002

【目的】探究琯溪蜜柚叶片黄化与营养元素丰缺的关系并进行矫正,为生产上制定合理施肥措施提供科学依据。【方法】采集了38个有代表性的琯溪蜜柚果园的不同黄化程度的叶片,研究5个黄化等级(等级为0、1、2、3和4,分别对应对照绿叶、约25%... 详细信息

【目的】探究琯溪蜜柚叶片黄化与营养元素丰缺的关系并进行矫正,为生产上制定合理施肥措施提供科学依据。【方法】采集了38个有代表性的琯溪蜜柚果园的不同黄化程度的叶片,研究5个黄化等级(等级为0、1、2、3和4,分别对应对照绿叶、约25%、50%、75%和100%黄化面积)的蜜柚叶片的SPAD值和营养元素浓度的变化;并进一步研究叶面补镁(叶面喷施2%七水硫酸镁)对蜜柚叶片黄化的矫治效果。【结果】随着黄化等级的增加,蜜柚叶片的SPAD值显著降低。蜜柚叶片氮浓度、磷浓度、钙浓度和硼浓度随着叶片黄化程度加剧而降低,其中黄化等级为3~4时的叶片氮浓度低于适宜范围,而不同黄化等级的叶片磷浓度、钙浓度和硼浓度均处于适宜范围(除了黄化等级为4时的叶片硼浓度低于适宜范围)。随着黄化等级的增加,蜜柚叶片的镁浓度随之显著降低,黄化等级为1时的叶片镁浓度较对照绿叶降低了44%,而且黄化等级为1~4的叶片镁浓度均低于适宜范围。相反,蜜柚叶片的钾浓度、铁浓度和锰浓度随着黄化等级的增加而提高,但是不同黄化等级之间的铜浓度和锌浓度均差异不显著,同时叶片的锌浓度有低于适宜范围风险。相关性分析可知,蜜柚叶片的SPAD值与叶片镁浓度(r=0.819)、氮浓度(r=0.763)、磷浓度(r=0.600)、钙浓度(r=0.476)和硼浓度(r=0.378)显著正相关,而与钾浓度(r=-0.570)、铁浓度(r=-0.495)和锰浓度(r=-0.198)显著负相关。通径分析和随机森林分析表明镁对蜜柚叶片SPAD值影响最大,其次是氮和钾。叶面喷施硫酸镁后蜜柚叶片的镁浓度和SPAD值显著提高,而叶片的钾浓度显著降低。【结论】蜜柚叶片黄化主要与缺镁有关,叶面补镁可以改善蜜柚叶片营养,缓解叶片黄化症状。

关键词：蜜柚叶片黄化缺镁叶面镁肥

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福建省马铃薯主栽品种SSR遗传多样性分析

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分子植物育种 2019年第22期17卷 7420-7427页

作者：张招娟邓跃黄泷健郭玉春陈芳育福建农林大学农学院作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室福建省作物设计育种重点实验室

福建省是中国南方重要的马铃薯冬作区,为明确福建省马铃薯主栽品种间的遗传差异,本试验利用SSR分子标记技术对19份主栽品种进行遗传多样性分析。结果表明,从分布于12对染色体的99对SSR引物中筛选出22对多态性高且条带清晰的引物,共扩增... 详细信息

福建省是中国南方重要的马铃薯冬作区,为明确福建省马铃薯主栽品种间的遗传差异,本试验利用SSR分子标记技术对19份主栽品种进行遗传多样性分析。结果表明,从分布于12对染色体的99对SSR引物中筛选出22对多态性高且条带清晰的引物,共扩增出207个等位位点,多态性比率为96.6%。每对SSR引物扩增的多态性位点数为7~22个,平均9个。19份主栽品种的遗传距离范围为0.338~0.925,平均值为0.594。聚类分析表明,在遗传距离0.724处可将所有供试材料分为A、B、C、D和E等5个类群,分别包含7份、5份、4份、1份和2份供试材料,说明供试材料具有较宽的遗传基础。研究表明,供试材料之间遗传多样性较高,为马铃薯品种知识产权保护和杂交育种提供理论依据。

关键词：马铃薯(Solanum tubersum L.) 遗传分析 SSR 指纹图谱

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植物几丁质酶和β-1,3-葡聚糖酶及其协同抗病性研究进展

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农业生物技术学报 2022年第7期30卷 1394-1411页

作者：陈燕玲岑光莉孙婷婷尤垂淮阙友雄苏亚春福建农林大学农业农村部福建甘蔗生物学与遗传育种重点实验室福建农林大学教育部作物遗传育种与综合利用重点实验室福建农林大学生命科学学院

植物几丁质酶(chitinase)和β-1,3-葡聚糖酶(β-1,3-glucanase)能够水解病原菌细胞壁的主成分几丁质、β-1,3-葡聚糖和肽聚糖，有效抑制病原菌的生长，是植物防御系统中的两个重要的防卫因子。此外，两者还具有协同抑菌作用，被广泛应... 详细信息

植物几丁质酶(chitinase)和β-1,3-葡聚糖酶(β-1,3-glucanase)能够水解病原菌细胞壁的主成分几丁质、β-1,3-葡聚糖和肽聚糖，有效抑制病原菌的生长，是植物防御系统中的两个重要的防卫因子。此外，两者还具有协同抑菌作用，被广泛应用于植物抗病基因工程。本文通过阐述植物几丁质酶和β-1,3-葡聚糖酶的结构、分类、生物学特性、表达调控机制及两者之间的协同抗病作用研究进展，为系统了解植物几丁质酶和β-1,3-葡聚糖酶的作用模式以及植物抗病遗传改良提供参考资料。

关键词：几丁质酶 β-1,3-葡聚糖酶结构特点功能特性协同抗病作用

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农业生态学的新视野

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中国生态农业学报 2012年第3期20卷 253-264页

作者：林文雄陈婷周明明福建农林大学作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室福州350002 福建农林大学农业生态研究所福州350002

本文综述了我国农业生态学的发展过程与演化特点,并站在国际视野上分析了现代农业生态学发展趋势,着重提出农业生态学正从宏观与微观两个层面不断拓展,并把研究引向深入。从宏观层次上讲,农业生态学正从已往的宏观农业生物学层面逐步深... 详细信息

本文综述了我国农业生态学的发展过程与演化特点,并站在国际视野上分析了现代农业生态学发展趋势,着重提出农业生态学正从宏观与微观两个层面不断拓展,并把研究引向深入。从宏观层次上讲,农业生态学正从已往的宏观农业生物学层面逐步深入到"三农"的社会学层面,研究水平从以往关注农业生态系统结构与功能的关系逐步发展到人们普遍关心的食物系统(food system),即从生态经济学角度研究农业生态系统能物流形成与运转对经济社会发展的影响以及社会政策法规对食物系统的调控作用。也就是说,现代农业生态学越来越重视人类社会生态觉醒对保护农业生态系统环境,促进无污染生产及市场营销的重要作用。因此,在当代西方国家,许多农业生态学工作者十分重视通过各种社区运动(movement)或行动(action)来促进政府、生产部门、销售部门以及相关管理部门接受农业生态学思想,自觉按照生态规律办事,保证食物生产系统健康高效运行,这已成为现代农业生态学教学科研和生产实践的重要内容,涉及科学理论研究实验示范推广各种联盟运动推进社会公众自觉参与等全过程,体现了现代农业生态学的时代特征。从微观层次上讲,现代农业生态学正进入农业分子生态学时代,它借助现代生物学的发展成就,运用系统生物学的理论与技术,深入研究农业生态系统结构与功能的关系及其分子生态学机制。特别是随着现代生物技术的不断完善,环境(宏)基因组学、蛋白组学技术的问世,极大地推进了人们对未知生物世界的认知,尤其是对生物多样性和基因多样性的深层次剖析,使得农业生态学能从分子水平上深入研究系统演化的过程与机制,促进从定性半定量描述向定量和机理性研究推进。客观上要求农业生态学工作者必须与时俱进,不断完善自己的知识结构,提高现代科学研究技能,只有这样才能自觉接受新的科学知识,促进传统科学向现代科学提升。本文特以例证分析了这一科学发展的必须性和重要性,旨在引发广大同行的反思与共鸣。

关键词：农业生态学发展过程现代视野食物系统分子农业生态学

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盐胁迫下大豆抗感品种根系微生物群落结构分析

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河南农业大学学报 2024年第1期58卷 59-68页

作者：陈昕宇张真张早立宋圆圆曾任森卢龙福建农林大学农学院作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室福建福州350002

【目的】探究盐胁迫下大豆根系微生物群落结构变化及耐盐大豆的根系微生物群落结构特征。【方法】以2种耐盐性不同的大豆品种科丰1(盐敏感)和南农1183-2(耐盐)为试验材料,通过盆栽种植,盐胁迫(120 mmol·L^(-1)NaCl)处理,利用16S扩... 详细信息

【目的】探究盐胁迫下大豆根系微生物群落结构变化及耐盐大豆的根系微生物群落结构特征。【方法】以2种耐盐性不同的大豆品种科丰1(盐敏感)和南农1183-2(耐盐)为试验材料,通过盆栽种植,盐胁迫(120 mmol·L^(-1)NaCl)处理,利用16S扩增子测序技术对其根系微生物组进行高通量测序。【结果】门一级水平上2种大豆优势菌门均为变形菌门Proteobacteria,属水平上不同大豆不同条件下的优势菌属各不相同。盐胁迫条件下,盐敏感品种根系微生物优势菌属组成无较大改变,耐盐品种根系中,根系促生菌(PGPB)假单胞菌属Pseudomonas丰度所占比例明显上升。共现性网络分析表明,盐胁迫条件下变形菌门为维持根系微生物多样性做出了最大贡献。对大豆根系微生物组的功能预测表明,耐盐大豆根际微生物在脂类以及氨基酸代谢途径等方面优于盐敏感大豆。【结论】盐胁迫下2种大豆根系微生物的多样性发生改变,假单胞菌属是盐胁迫条件下耐盐大豆根系微生物的优势菌属,大豆根际的假单胞菌属或可成为盐胁迫下大豆栽培及土壤改良的可利用资源。

关键词：大豆盐胁迫根系微生物微生物多样性假单胞菌属

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基于甘蔗热带种(LA-purple)全基因组序列的SSR开发及特征分析

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作物学报 2018年第9期44卷 1400-1410页

作者：王恒波肖乃衍朱专为刘翠翠 Intikhab ALAM 陈平华卢运海福建农林大学农业部福建甘蔗生物学与遗传育种重点实验室/作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室/作物科学学院福建福州350002

现代甘蔗栽培品种(2n=100~130)是由甘蔗热带种(2n=80)与割手密(2n=40~128)种间杂交而来,形成异源多倍体、非整倍体作物,使得甘蔗栽培品种中80%~90%的染色体来源于热带种。开发热带种基因组SSR分子标记,有助于甘蔗遗传多样性分析、分子... 详细信息

现代甘蔗栽培品种(2n=100~130)是由甘蔗热带种(2n=80)与割手密(2n=40~128)种间杂交而来,形成异源多倍体、非整倍体作物,使得甘蔗栽培品种中80%~90%的染色体来源于热带种。开发热带种基因组SSR分子标记,有助于甘蔗遗传多样性分析、分子标记辅助选择、遗传图谱的构建等。本研究基于热带种LA-purple的全基因组测序数据的255 398个预测基因序列(累计总长为1 029 222 285 bp),利用Perl程序与生物信息学软件结合,发掘SSR位点,获得了153 150个SSR位点,平均每1.67个基因有1个SSR位点,其中二、三核苷酸重复基序分别为39 556个和50 072个,占总SSR位点数的58.5%。在二核苷酸重复基序中,TA/AT所占比例最高,占41.4%,CG/GC所占比例最低,占4.6%;在三核苷酸碱基重复基序中,TGT/ACA所占比例最高,为15.6%。在TA/AT重复类型中选取100个基序重复次数在60~90之间的SSR位点,进行引物设计与合成,在12个甘蔗属材料中进行PCR扩增分析,从中筛选出52对具有多态性SSR引物,其中有27对引物在研究的2个甘蔗栽培品种间表现为多态。这些基因组SSR标记的开发,不仅可以用于甘蔗栽培品种DNA指纹图谱分析,而且为甘蔗属不同种的遗传图谱构建、遗传多样性分析和重要性状的遗传机制解析奠定基础,为甘蔗分子育种研究提供重要支撑。

关键词：甘蔗基因组 SSR 标记开发多态性

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水稻苗期低温失绿基因cisc(t)的精细定位及其候选基因的确定

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科学通报 2010年第22期55卷 2183-2187页

作者：兰涛汪斌凌秋平徐春花童治军梁康迳段远霖金晶吴为人福建农林大学作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室福州350002 福建农林大学福建省水稻分子标记辅助育种重点实验室福州350002

籼稻品种Dular在低温条件下幼苗会表现失绿.前期遗传研究表明,这种低温失绿的表型是由一个隐性基因控制的,该基因初步定位在第9染色体长臂的SSR标记RM257和RM242之间,将该基因暂命名为cisc(t).本研究在前期初步定位的基础上,利用粳稻品... 详细信息

籼稻品种Dular在低温条件下幼苗会表现失绿.前期遗传研究表明,这种低温失绿的表型是由一个隐性基因控制的,该基因初步定位在第9染色体长臂的SSR标记RM257和RM242之间,将该基因暂命名为cisc(t).本研究在前期初步定位的基础上,利用粳稻品种Lemont(低温条件下幼苗表现正常绿色)与Dular杂交,构建了一个很大的F2群体,将cisc(t)基因精细定位在一个12kb的区间内.该区间只含有一个注释基因,编码一个三角状五肽重复区(PPR)蛋白.测序结果表明,Dular在该基因的第60位碱基处缺失了8个碱基,造成移码突变而失去正常功能.这与Dular表现白化突变表型相吻合.而且,前人研究表明,许多植物的幼苗失绿突变性状与PPR蛋白有关.因此,将该基因确定为cisc(t)的候选基因.

关键词：水稻幼苗低温白化精细定位 PPR蛋白

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