检索结果-内蒙古大学图书馆

植物遗传资源学报 2017年第1期18卷 133-138页

作者：牟少亮申磊石星辰官德义何水林福建农林大学生命科学学院/作物遗传改良与综合利用教育部重点实验室福州350002 福建农林大学作物科学学院福州350002

前人研究发现水稻Os ERF96(ethylene responsive factor 96)可应答白叶枯病病原菌的侵染,但其功能及表达调控机制仍不清楚,本研究进一步分析了该基因在水稻应答稻瘟病病原菌侵染及外源激素(SA和Me JA)处理下的转录情况,并分析了其启动... 详细信息

前人研究发现水稻Os ERF96(ethylene responsive factor 96)可应答白叶枯病病原菌的侵染,但其功能及表达调控机制仍不清楚,本研究进一步分析了该基因在水稻应答稻瘟病病原菌侵染及外源激素(SA和Me JA)处理下的转录情况,并分析了其启动子的诱导表达活性。结果表明:相对于对照组,Os ERF96在接种稻瘟病后1~4 d表达量显著上调,以第1天最高,此后逐渐下降,外源SA处理后Os ERF96表达量持续上调;利用Os ERF96启动子驱动GUS的转基因株系分析了Os ERF96启动子的诱导活性,结果表明GUS在根、茎和叶均有不同程度组成型表达,稻瘟病菌接种后4~7 d GUS活性持续升高。GUS活性定量表明,稻瘟病菌和SA处理条件下均出现了升高。综上所述,Os ERF96可应答白叶枯病或稻瘟病病原菌的浸染,其启动子是一个对病原菌侵染产生应答的诱导性启动子。

关键词：水稻 OsERF96 启动子稻瘟病菌

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地黄钙信号体系相关基因的鉴定及其在连作条件下响应特征分析

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药学学报 2017年第12期52卷 1951-1961页

作者：杨楚韵李鑫宇李明杰冯法节古力张宝陈淑强陈爱国张重义福建农林大学作物科学学院福建福州350002 河南农业大学农学院河南郑州450002 福建农林大学福建农林大学作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室福建福州350002

钙信号是植物响应胁迫的重要系统之一,前期研究发现钙信号参与了连作地黄感知、传导和响应连作胁迫的进程。为了确证钙信号在地黄连作障碍形成过程中的作用方式,本研究在前期地黄大容量转录组基础上,利用生物信息学方法详细鉴定地黄钙... 详细信息

钙信号是植物响应胁迫的重要系统之一,前期研究发现钙信号参与了连作地黄感知、传导和响应连作胁迫的进程。为了确证钙信号在地黄连作障碍形成过程中的作用方式,本研究在前期地黄大容量转录组基础上,利用生物信息学方法详细鉴定地黄钙信号转导体系相关蛋白的编码基因,并对其在连作和头茬地黄中的表达模式进行分析。同时,采用焦锑酸盐法和钙荧光染色法测定连作和头茬地黄根细胞中钙离子浓度差异。鉴定出5个CaMs、12个CBLs、21个CDPKs、21个CIPKs、16个CMLs和9个CRKs等84个钙信号体系相关基因。通过对连作和头茬地黄钙信号体系相关基因差异表达模式进行分析,发现连作效应增强了地黄钙信号体系中关键基因的表达。进一步利用qRT-PCR方法对12个关键的钙信号转导相关基因进行表达验证,确证了钙信号响应了连作胁迫进程。此外,2种钙离子浓度检测方法也均证实连作胁迫显著促进了地黄胞内钙离子的积累。本研究从分子和细胞水平上确证了钙信号在地黄连作障碍形成中扮演着重要角色,为进一步从分子水平上解读地黄连作障碍的形成机制奠定了基础。

关键词：地黄连作障碍自毒作用钙信号体系钙离子浓度

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浅析遗传学教学中关于统计思想的实践应用

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教育现代化 2019年第9期 159-161页

作者：贾琪福建农林大学作物科学学院遗传育种与综合利用教育部重点实验室

遗传学的统计部分是高等教育教学的重难点,单纯教授遗传问题中的统计分析计算部分,效果较差,学生也很难内化并灵活运用。本文解析了统计思想的内涵和其在遗传学中的重要性,从设计思想、调查思想、整理思想和分析思想方面探究了统计思想... 详细信息

遗传学的统计部分是高等教育教学的重难点,单纯教授遗传问题中的统计分析计算部分,效果较差,学生也很难内化并灵活运用。本文解析了统计思想的内涵和其在遗传学中的重要性,从设计思想、调查思想、整理思想和分析思想方面探究了统计思想在遗传学的重要性及实践应用,提出以统计思想为切入点,结合遗传实践,将统计思想的教授渗透在遗传学教学的各个方面的教学方案,使学生更容易更深入的学习遗传学中的统计知识,并能灵活运用。

关键词：统计遗传教学

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植物ASK1-D3(MAX2)-D14蛋白复合体互作区特征与演化分析

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福建农林大学学报（自然科学版） 2017年第5期46卷 539-545页

作者：郑秀娟翁群清陈思雀孙新立福建农林大学作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室福建农林大学作物科学学院福建福州350002

ASK1-D3-D14复合体作为E3泛素连接酶的一部分,调控水稻的形态发生等生理反应.为了揭示该复合体互作区的结构特征和演化关系,通过对不同物种中D3直系蛋白间的系统进化进行分析,发现D3基因在不同物种中表现出不同的演化进程;而对ASK1-D3和... 详细信息

ASK1-D3-D14复合体作为E3泛素连接酶的一部分,调控水稻的形态发生等生理反应.为了揭示该复合体互作区的结构特征和演化关系,通过对不同物种中D3直系蛋白间的系统进化进行分析,发现D3基因在不同物种中表现出不同的演化进程;而对ASK1-D3和D3-D14互作面的序列和空间结构分析,揭示D3直系同源蛋白质以及已知的F-box-like结构域间的序列同源性较低,而空间结构相似性较高,暗示F-box-like与ASK1类蛋白质之间的互作,空间结构的相似性重于序列的相似性.涉及D3和D14互作面的氨基酸在直系同源蛋白序列间的同源性很高,而形成互作面疏水内核的氨基酸保守性更高.这为D3复合体的进一步研究提供了依据.

关键词： ASK1-D3-D14 蛋白复合体演化互作

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主要麻类作物的ITS序列分析与系统进化

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作物学报 2017年第6期43卷 862-874页

作者：张力岚王俊万雪贝徐益张列梅方平平祁建民张立武福建农林大学作物科学学院/作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室/福建省作物设计育种重点实验室福建农林大学海峡联合研究院基因组与生物技术中心福建福州350002

比较主要麻类作物和测序植物间的ITS序列,可明确它们间系统位置和进化关系。本研究采用PCR扩增和搜索Gen Bank数据库,获得32份麻类作物和11份测序作物的核糖体内转录间隔区(internal transcribed spacers,ITS)序列,利用MEGE软件分析ITS... 详细信息

比较主要麻类作物和测序植物间的ITS序列,可明确它们间系统位置和进化关系。本研究采用PCR扩增和搜索Gen Bank数据库,获得32份麻类作物和11份测序作物的核糖体内转录间隔区(internal transcribed spacers,ITS)序列,利用MEGE软件分析ITS长度、G+C含量与同源性百分比差异。结果表明,黄麻属、红麻属、苎麻属和亚麻属的ITS基本序列全长分别为963、939、658和686 bp;G+C含量分别为57.87%、58.03%、59.05%和53.75%。黄麻属变异区域集中在220~386 bp间,红麻属变异区域集中在2个区段(206~347 bp,599~713 bp),苎麻属ITS变异区域分布在4个区段(158~163 bp、193~199 bp、288~333 bp和681~688 bp),亚麻属ITS变异区域分布在5个区段(219~229bp、235~240 bp、427~432 bp、468~484 bp和588~594 bp)。系统位置分析表明,红麻属与棉花亲缘关系最近,黄麻与棉花亲缘关系较近;亚麻与苎麻各为一小支。系统位置分析与传统的植物分类结果较一致。研究主要麻类作物比较基因组学时,红麻、黄麻可参考棉花,苎麻可参考杨树或蓖麻。推测红麻属的进化时间约为33.7百万年前(million years ago,MYA),黄麻属约为65.3MYA,苎麻属约为67.5MYA,亚麻属约为90.5MYA。主要麻类作物进化时间越久,同属不同种之间ITS变异区段越多。

关键词：麻类作物 ITS 系统位置进化关系

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林下种植密度和收获期对金线莲产量和品质的影响

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中国现代中药 2018年第7期20卷 837-841,865页

作者：牛欢谢卓宓古力梁莹韦坤华王建明李明杰张重义福建农林大学作物科学学院福建福州350002 广西壮族自治区药用植物园广西南宁530023 福建农林大学作物遗传育种与综合利用省部共建教育部重点实验室福建福州350002

目的:通过对比研究,确定金线莲林下仿野生栽培的适宜密度和最佳采收时期。方法:以福建省广泛种植的金线莲品种泰宁一号为实验材料,在金线莲道地产区契合金线莲原初生境的林下进行栽培,详细探究不同林下种植密度和采收期对金线莲的生物... 详细信息

目的:通过对比研究,确定金线莲林下仿野生栽培的适宜密度和最佳采收时期。方法:以福建省广泛种植的金线莲品种泰宁一号为实验材料,在金线莲道地产区契合金线莲原初生境的林下进行栽培,详细探究不同林下种植密度和采收期对金线莲的生物量和代表性药效成分的影响,为选取金线莲林下栽培合适栽培密度和最佳采收期提供重要参考依据。结果:在林下栽种密度处于4 cm(行距)×4 cm(株距)时,林下栽培金线莲的长势最佳、折干率高、多糖、生物碱和类黄酮等药用成分含量较高。通过详细分析不同采收期林下栽培金线莲的产量和品质,发现在林下种植金线莲180 d后进行采收,金线莲根、茎叶长势佳,生物量积累丰富,折干率高,同时总黄酮、多糖、总生物碱药用价值成分均达到较高值。结论:泰宁一号金线莲林下仿野生种植的适宜种植密度为4 cm×4 cm,最佳采收时期为移栽后180 d。

关键词：金线莲仿野生栽培种植密度采收期产量品质

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红麻EST-SSR标记的开发及其多态性评价

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作物学报 2017年第8期43卷 1170-1180页

作者：万雪贝李东旭徐益徐建堂张力岚张列梅林荔辉祁建民张立武福建农林大学作物科学学院/作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室/福建省作物设计育种重点实验室福建农林大学海峡联合研究院基因组与生物技术中心福建福州350002

红麻是最重要的自然纤维作物之一,然而SSR标记的匮乏限制了其遗传改良。本研究从红麻90 175个EST序列中挑出含有转录因子的EST,开发了94对SSR引物。以24份不同红麻种质资源的DNA为模板,利用9%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测多态性。结果... 详细信息

红麻是最重要的自然纤维作物之一,然而SSR标记的匮乏限制了其遗传改良。本研究从红麻90 175个EST序列中挑出含有转录因子的EST,开发了94对SSR引物。以24份不同红麻种质资源的DNA为模板,利用9%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测多态性。结果表明,85对引物(占90.4%)至少在2个材料之间存在多态性,表明开发的EST-SSR具有很好的多态性。其中,三核苷酸重复所占比例最多,重复基元AAT和ATG的多态性较高。聚类分析表明,24份红麻种质资源的遗传相似系数变化在0.62~0.92之间,表现出丰富的遗传基础。这些结果不仅丰富了红麻的分子标记数量,而且为红麻的遗传分析提供资源。

关键词：红麻 SSR 遗传多样性标记开发

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基于染色体级别参考基因组和重测序的黄麻重要性状GWAS分析

基于染色体级别参考基因组和重测序的黄麻重要性状GWAS分析

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2018全国植物生物学大会

作者：张立武福建农林大学作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室福建农林大学海峡联合研究院基因组与生物技术中心

黄麻为锦葵科黄麻属(Corchorus spp.)一年生韧皮部纤维作物,其纤维产量占世界麻类纤维总产量的80%。黄麻属有100多个种,具有栽培价值的有圆果种(***)和长果种(***),两者具有不同生长习性,存在生殖隔离,皆为二倍体(2n=14),主要在孟加拉... 详细信息

黄麻为锦葵科黄麻属(Corchorus spp.)一年生韧皮部纤维作物,其纤维产量占世界麻类纤维总产量的80%。黄麻属有100多个种,具有栽培价值的有圆果种(***)和长果种(***),两者具有不同生长习性,存在生殖隔离,皆为二倍体(2n=14),主要在孟加拉、印度和中国等国家种植。在世界范围内,黄麻的产量和种植面积仅次于棉花,是麻纺工业的重要原料,每年黄麻生产产值达到23亿美元。福建农林大学麻类室自1948年以来,坚持了80年的黄麻生物学与遗传育种研究。本研究以黄麻国家区域试验对照品种长果种"宽叶长果"和圆果种"黄麻179"为材料,以三代测序技术PacBio RSⅡ为主体,以高密度遗传图谱和Hi-C等技术辅助,获得了长果种和圆果种黄麻染色体级别的参考基因组,其基因组大小分别为361Mb和336Mb。与已发表黄麻长果种O-4和圆果种CVL-1基因组草图相比,组装指标有了极大提升。以这两个染色体级别的基因组序列为参考,通过15×的基因组重测序,构建311份黄麻种质的含411万个SNP标记的基因组变异图谱,并在3年2个地点的不同环境下发掘控制28个黄麻植物学性状和农艺性状的显著关联位点,其中纤维支数24个,形成了一个基于关联分析的黄麻功能基因发掘平台。利用发掘的SNP标记进行种间分化分析,发现了210个育种品种的选择偏好位点。这些结果为深入认识黄麻驯化和适应不同环境的分子机制,发掘黄麻重要性状的优异等位变异和设计育种,以及韧皮部纤维和种皮纤维的比较基因组学研究奠定了群体结构研究的基础。

关键词：黄麻纤维基因组重测序关联分析

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水稻雌性不育分子机理研究进展

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分子植物育种 2017年第2期15卷 672-684页

作者：官文祥邓赟李小旭吴为人郑燕福建农林大学作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室福州350002 福建省作物设计育种重点实验室福州350002 福建农林大学生命科学学院福州350002

育性是水稻的关键农艺性状,其发生机理和遗传基础是发育生物学的研究热点。不育可分为雄性不育和雌性不育。雌性不育由于性状难鉴定、突变体难获得及内部机制复杂等原因,其研究远远滞后于雄性不育。近年来,由于水稻雌性不育突变体的不... 详细信息

育性是水稻的关键农艺性状,其发生机理和遗传基础是发育生物学的研究热点。不育可分为雄性不育和雌性不育。雌性不育由于性状难鉴定、突变体难获得及内部机制复杂等原因,其研究远远滞后于雄性不育。近年来,由于水稻雌性不育突变体的不断发现及分子生物学研究手段的快速进步,一批控制水稻雌性不育的基因相继被定位和克隆,为揭示水稻雌性不育发生机理奠定了基础。本文综述了近二十年来水稻雌性不育分子遗传机理的有关研究进展,主要包括杂种不育基因,影响胚珠发育、细胞分裂和花器官发育的基因,以及转录组等方面的研究,以期加深对水稻雌性不育的认识,促进对水稻雌性不育的探索和利用。

关键词：水稻雌性不育分子机理

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显齿蛇葡萄实时荧光定量PCR内参基因的筛选与验证

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中草药 2017年第6期48卷 1192-1198页

作者：许明伊恒杰赵帅张玉文杨志坚郑金贵福建农林大学作物遗传育种与综合利用省部共建教育部重点实验室福建福州350002 福建农林大学农产品品质研究所福建福州350002 福建农林大学生命科学学院福建福州350002

目的筛选适用于显齿蛇葡萄Ampelopsis grossedentata实时荧光定量PCR(real-time fluorescence quantitative PCR,qRT-PCR)的内参基因。方法设计简并引物,采用RT-PCR从显齿蛇葡萄中克隆6个候选内参基因片段,包括肌动蛋白基因(Actin)、3-磷酸甘油醛脱氢酶基因(GAPDH)、18 S核糖体rRNA基因(18 S-rRNA)、α-微管蛋白基因(α-Tubulin)、β-微管蛋白基因(β-Tubulin)和多聚泛素酶基因(UBQ)。应用qRT-PCR技术检测这6个候选内参基因在显齿蛇葡萄不同组织器官中(茎尖、嫩叶、成熟叶、老叶、茎和根)的表达情况。借助Ge Norm、Norm Finder和Best Keeper 3种统计学软件综合评价6个内参基因的表达稳定性。通过苯丙氨酸解氨酶基因(Ag PAL)的表达分析对筛选出的内参基因进行稳定性验证。结果 18 S-rRNA、GAPDH和Actin的表达稳定性较好,适合作为显齿蛇葡萄不同组织基因表达研究的内参基因,以这3个基因为内参基因分析Ag PAL基因的相对表达量,结果发现它们在各组织器官中的表达变化趋势基本一致。结论确定显齿蛇葡萄qRT-PCR分析的合适内参基因,为后续相关基因表达研究奠定基础。

关键词：显齿蛇葡萄实时定量PCR 内参基因看家基因肌动蛋白基因 3-磷酸甘油醛脱氢酶基因 18 S核糖体rRNA基因 α-微管蛋白基因 β-微管蛋白基因多聚泛素酶基因

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