【目的】种子大小直接影响花生的产量。前期通过QTL定位获得调控花生种仁大小的关键转录因子AhSAP1,构建花生胚酵母双杂交cDNA文库,并以AhSAP1为诱饵进行酵母双杂交筛选互作蛋白,分析候选互作蛋白基因的时空表达特征,为深入研究AhSAP1调控花生种仁发育的分子机制奠定基础。【方法】用SMART(switching mechanism at 5′end of the RNA transcript)法构建花生胚大肠杆菌cDNA文库并进行鉴定;构建诱饵载体pGBKT7-AhSAP1,并鉴定其对酵母细胞的毒性以及自激活性。将花生胚cDNA文库质粒与诱饵质粒pGBKT7-AhSAP1共转Y2H Gold酵母菌株,筛选长势较好且呈蓝色的阳性菌落,测序比对,获得候选互作蛋白基因序列,预测生物学功能。利用RNA-seq明确候选互作蛋白基因在花生不同组织器官、受外源植物激素诱导及低钙胁迫诱导下的表达特征。根据功能注释结果,选取可能参与植物种子发育的候选因子,扩增其CDS全长序列,构建到靶标载体pGADT7后,分别与pGBKT7-AhSAP1共转化酵母细胞进行点对点酵母双杂交互作验证。【结果】花生胚大肠杆菌次级cDNA文库滴度为1.05×108 cfu/mL,重组率为98%,平均插入片段大小约1 000 bp,文库质量较高;成功构建酵母双杂交诱饵载体pGBKT7-AhSAP1,在酵母细胞中没有自激活性且对酵母菌没有毒性;筛选得到68个酵母阳性克隆,经序列相似性比对,去除重复,共获得60个候选互作蛋白,主要参与能量产生与代谢、翻译、核糖体结构和生物发育、转录、信号转导机制、翻译后修饰、无机离子运输和代谢、染色质结构等。选取12个候选互作蛋白与AhSAP1进行一对一酵母双杂交验证,有8个候选互作蛋白与AhSAP1发生互作。【结论】成功构建了花生胚发育不同时期的混合cDNA文库,筛选出60个与AhSAP1互作的候选互作蛋白,主要涉及能量产生与代谢、翻译、核糖体结构和生物发生、转录、信号转导机制、翻译后修饰、无机离子运输和代谢、染色质结构等,这些候选互作蛋白基因在花生根、茎、叶、花序、果针、果皮、种皮及胚中均有表达,明确了8个候选互作蛋白与AhSAP1的互作关系。
微卫星或简单序列重复(SSR)是指以1~6个碱基为单位的串联重复序列.SSR 包括完整型和不完整型两种.不完整型 SSR 是指其序列中存在个别不符合基序的碱基.SSR 作为一种用途广泛的分子标记,其多态性水平越高则应用价值越大.本研究利用模...
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微卫星或简单序列重复(SSR)是指以1~6个碱基为单位的串联重复序列.SSR 包括完整型和不完整型两种.不完整型 SSR 是指其序列中存在个别不符合基序的碱基.SSR 作为一种用途广泛的分子标记,其多态性水平越高则应用价值越大.本研究利用模式植物水稻的两个品种(籼稻93-11和粳稻日本晴)和拟南芥的两个生态型(Columbia 和 Lansberg)的基因组序列,以及稻瘟菌中245个 SSR 标记的试验结果,对 SSR 序列完整性与多态性之间的关系进行了分析.结果表明,总体上三个物种都表现为不完整型 SSR 的多态性比完整型 SSR 低,其中以稻瘟菌最为显著.水稻和拟南芥表现出相似的规律,其 SSR 序列完整性对多态性的影响都是以二核苷酸重复最为显著,而五核苷酸重复序列则基本不受影响;另外,SSR 多态性水平与序列完整程度呈正相关关系,但轻微的序列不完整一般并不会降低 SSR 的多态性,甚至在拟南芥中还提高多态性.本研究结果对 SSR 标记的开发和 SSR 进化研究提供了有用的信息,具有重要的参考价值.
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