检索结果-内蒙古大学图书馆

基因组学与应用生物学 2021年第11期40卷 3685-3693页

作者：黄小芳毕楚韵陈其俊刘江洪胡韵卓黄碧芳许明陈选阳林世强福建农林大学作物生物技术福建省高校重点实验室福州350002 福建农林大学农学院福州350002 福建省种子总站福州350003 福建农林大学生命科学学院福州350002 福建省特种作物育种与利用工程技术研究中心福州350002 福建农林大学教育部作物遗传育种与综合利用重点实验室福州350002

JAZ(jasmonate ZIM-domain,JAZ)蛋白作为茉莉酸途径的抑制因子,可通过与其他信号通路的调控因子互作来调节植物生长发育过程。为了探究甘薯[Ipomoea batatas(L.)LAM]JAZ家族基因的特征和潜在功能,本研究利用生物信息学的分析方法从甘薯... 详细信息

JAZ(jasmonate ZIM-domain,JAZ)蛋白作为茉莉酸途径的抑制因子,可通过与其他信号通路的调控因子互作来调节植物生长发育过程。为了探究甘薯[Ipomoea batatas(L.)LAM]JAZ家族基因的特征和潜在功能,本研究利用生物信息学的分析方法从甘薯全基因序列中鉴定到11个JAZ基因序列,对其进行多重序列比对、染色体定位、保守基序、系统进化树以及逆境胁迫下基因表达量变化等多方面的研究。结果表明,11个甘薯JAZ基因分布在甘薯1号、3号、6号、7号和9号染色体上,其数目分别为2个、1个、2个、1个和5个;利用MEME检索工具从甘薯JAZ家族蛋白序列中检索得到9个保守基序(motif 1~motif 9),其中motif 1和motif 7氨基酸序列组成与多重比对结果中的TIFY结构域一致,motif 2序列特征与Jas结构域一致;甘薯、拟南芥和水稻的JAZ家族系统进化树可分为5个亚组(Group1~Group 5);转录组数据分析结果表明,甘薯JAZ基因家族中有2个成员在受到尖孢镰刀菌(Fusarium oxysporum ***)侵染时表达量上调;有5个成员在低温胁迫下差异表达,其中3个表达上调、2个表达下调。以上结果可为研究甘薯JAZ家族基因的结构和功能提供参考。

关键词：甘薯 JAZ 基因家族生物信息学

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盐胁迫对水稻耐盐突变体sst芽苗期生长的影响

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亚热带农业研究 2022年第1期18卷 53-58页

作者：朱欢欢廖巧玲兰涛福建农林大学作物遗传育种与综合利用省部共建教育部重点实验室福建农林大学福建省作物设计育种重点实验室福建福州350002

[目的]通过观察盐胁迫对水稻OsSPL10突变形成的苗期耐盐突变体sst种子萌发及幼苗生长的影响,探究突变体sst在芽期是否具有耐盐优势,以期为水稻耐盐育种提供依据。[方法]对籼稻品种R401的野生型和突变体sst进行盐胁迫下的发芽试验,统计... 详细信息

[目的]通过观察盐胁迫对水稻OsSPL10突变形成的苗期耐盐突变体sst种子萌发及幼苗生长的影响,探究突变体sst在芽期是否具有耐盐优势,以期为水稻耐盐育种提供依据。[方法]对籼稻品种R401的野生型和突变体sst进行盐胁迫下的发芽试验,统计发芽势和发芽率,并比较种子萌发后芽苗期的生长状况(根长、根数、地上部长和苗鲜重)。[结果]OsSPL10突变降低了非胁迫条件下水稻种子的发芽势和发芽率,增强了芽苗期水稻侧根对盐胁迫的敏感度。盐胁迫对野生型与突变体的各项指标均有抑制作用,且突变体sst在生长初期比野生型对盐胁迫更敏感,突变体耐盐性随着生长发育逐渐提高。[结论]水稻苗期耐盐突变体sst的苗期耐盐性与芽期没有相关性,在水稻耐盐性分子机理研究和耐盐育种实践中应加以区别。

关键词：水稻苗期耐盐突变体 OsSPL10 芽苗期盐胁迫

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龙眼成花逆转相关基因表达的cDNA-AFLP分析

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农业生物技术学报 2009年第6期17卷 1050-1055页

作者：曾志王平梁文裕唐晰谢东丽郑少泉陈伟福建农林大学作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室福建农林大学生命科学学院福建农林大学园艺学院福建省农业科学院果树研究所

以龙眼(Dimocarpus longan ***)正常成花花芽和成花逆转花芽为材料,应用cDNA-AFLP技术,通过64对引物组合的cDNA-AFLP分析获得了2560条扩增片段,选择有明显差异的片段进行回收和测序,获得了14条核苷酸序列,其中有13个片段在GenBank数据... 详细信息

以龙眼(Dimocarpus longan ***)正常成花花芽和成花逆转花芽为材料,应用cDNA-AFLP技术,通过64对引物组合的cDNA-AFLP分析获得了2560条扩增片段,选择有明显差异的片段进行回收和测序,获得了14条核苷酸序列,其中有13个片段在GenBank数据库中发现同源序列,1个功能未知。通过核酸和氨基酸比对分析,112基因片段同源于银灰杨(Populus tremula×Populusalba)中编码Nek激酶家族(NIMA related protein kinases)基因(83%),331的核苷酸序列(80%)同源于与拟南芥(Arabidopsis thaliana)中编码内切-1,4-β-葡聚糖酶(EGases)的基因,313的核苷酸序列(78%)同源于与柑橘(Citrus sinensis)中的几丁质酶(chitinase CHI1)基因。提示这些基因片段在龙眼成花逆转过程中参与器官脱落、生殖生长和营养生长等的调控。

关键词：龙眼成花逆转基因差异表达 cDNA-AFLP

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甘薯基因组TCP转录因子鉴定与逆境胁迫表达分析

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植物科学学报 2021年第2期39卷 163-171页

作者：毕楚韵黄小芳王和寿陈其俊胡韵卓黄碧芳许明杨志坚陈选阳林世强福建农林大学作物生物技术福建省高校重点实验室福州350002 福建农林大学农学院福州350002 宁德市农业农村局福建宁德352100 福建省种子总站福州350003 福建农林大学教育部作物遗传育种与综合利用重点实验室福州350002 福建农林大学生命科学学院福州350002

基于甘薯(Ipomoea batatas(L.)Lam.)全基因组序列,利用生物信息学方法鉴定筛选了全基因组中的TCP(teosinte branched1/cincinnata/proliferating cell factor)转录因子,并分析了甘薯苗期在蔓割病菌胁迫及块根储藏期低温胁迫下TCP基因的... 详细信息

基于甘薯(Ipomoea batatas(L.)Lam.)全基因组序列,利用生物信息学方法鉴定筛选了全基因组中的TCP(teosinte branched1/cincinnata/proliferating cell factor)转录因子,并分析了甘薯苗期在蔓割病菌胁迫及块根储藏期低温胁迫下TCP基因的表达差异。结果显示,甘薯基因组中共有27个TCP转录因子,其中ClassⅠ13个、ClassⅡ(CIN)8个、ClassⅡ(CYC/TB1)6个。甘薯TCP以单个基因或基因簇的形式不均匀分布在15条染色体上,其中6对基因存在潜在复制关系。甘薯ClassⅡ(CYC/TB1)转录因子含有R结构域,其氨基酸序列较为保守。在TCP家族中共发现10个保守基序(motif),基序的氨基酸序列长度为15~60个,其中motif 1含有TCP结构域,motif 3含有R结构域,TCP转录因子的保守基序种类在组间存在一定差异。逆境胁迫下甘薯的转录组数据分析结果表明,TCP转录因子在苗期受蔓割病侵染后有2个差异表达基因;在块根储藏期受低温胁迫下有11个差异表达基因。

关键词：甘薯 TCP 转录因子生物信息学

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甘薯全基因组WRKY转录因子的基因鉴定与逆境胁迫表达分析

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西北农林科技大学学报（自然科学版） 2021年第9期49卷 30-44页

作者：毕楚韵黄小芳王和寿陈其俊胡韵卓黄碧芳许明杨志坚林世强陈选阳福建农林大学作物生物技术福建省高校重点实验室福建福州350002 福建农林大学农学院福建福州350002 福建农林大学生命科学学院福建福州350002 福建农林大学教育部作物遗传育种与综合利用重点实验室福建福州350002 宁德市农业农村局福建宁德352100 福建省种子总站福建福州350003

【目的】对甘薯(Ipomoea batatas)全基因组WRKY转录因子进行基因鉴定与逆境胁迫表达分析,为甘薯WRKY基因的应用提供参考。【方法】在甘薯全基因组序列的基础上,应用生物信息学方法对WRKY基因进行挖掘,分析基因潜在复制关系、保守结构域... 详细信息

【目的】对甘薯(Ipomoea batatas)全基因组WRKY转录因子进行基因鉴定与逆境胁迫表达分析,为甘薯WRKY基因的应用提供参考。【方法】在甘薯全基因组序列的基础上,应用生物信息学方法对WRKY基因进行挖掘,分析基因潜在复制关系、保守结构域、亚家族系统进化树、保守基序和抗逆表达模式,并对甘薯SPF1基因与IbWRKY基因进行了比较和分析。【结果】甘薯全基因组上共有82个WRKY基因,可分为Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ3个类型,其中类型Ⅰ和类型Ⅲ的成员数量分别为18和5,类型Ⅱ可进一步分为Ⅱ-a、Ⅱ-b、Ⅱ-c、Ⅱ-d和Ⅱ-e 5个亚类,其成员数量分别为4,14,20,8和13。甘薯WRKY基因不均匀分布于15条染色体上,其中25对基因存在潜在复制关系。保守结构域分析发现,大部分WRKY的结构域高度保守,但个别基因存在保守结构域缺失现象。拟南芥与甘薯的WRKY转录因子在系统进化树上呈现按物种少量聚集的现象。在甘薯WRKY转录因子家族中共发现10个保守基序,包括含有WRKY七肽结构域的基序1和基序7、含有锌指结构域的基序2和基序3,其中基序3为Ⅰ类型WRKY转录因子N端WRKY结构域所特有。对逆境胁迫下的甘薯转录组数据进行分析发现,甘薯苗期在蔓割病菌(Fusarium oxysporum ***)侵染后共有19个WRKY基因差异表达,甘薯块根贮藏期在低温胁迫下有34个WRKY基因差异表达。蛋白序列比较和分析结果表明,甘薯SPF1的氨基酸序列与IbWRKY32的氨基酸序列一致度最高,为85.4%。【结论】甘薯全基因组中鉴定得到82个WRKY基因,其结构域较为保守,在蔓割病胁迫与低温胁迫条件下均存在差异表达。

关键词：甘薯 WRKY转录因子生物信息学逆境胁迫

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外源硒及脯氨酸对菜用黄麻生长和生理特性的影响

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中国麻业科学 2015年第5期37卷 239-245页

作者：陶爱芬陈娴娴祁建民方平平林荔辉徐建堂张立武吴建梅林培清福建农林大学作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室/福建省作物分子设计育种重点实验室福州350028

为明确外源硒及脯氨酸(Pro)对菜用黄麻生长和生理特性的影响,本研究以新型菜用黄麻品种福农1号为材料,测定了在水培液中添加不同浓度的硒(0、0.2、0.5、1.0、2.5、5.0 mg/L)与脯氨酸(50μmol/L)对菜用黄麻苗期生长、叶绿素、渗透调节物... 详细信息

为明确外源硒及脯氨酸(Pro)对菜用黄麻生长和生理特性的影响,本研究以新型菜用黄麻品种福农1号为材料,测定了在水培液中添加不同浓度的硒(0、0.2、0.5、1.0、2.5、5.0 mg/L)与脯氨酸(50μmol/L)对菜用黄麻苗期生长、叶绿素、渗透调节物质及抗氧化酶活性的影响。结果表明:(1)外源硒浓度≤0.5 mg/L时,能促进菜用黄麻的株高、根长、株重及根重,而外源硒浓度≥2.5 mg/L时则会对其生长产生抑制和毒害作用;浓度为0.2 mg/L的硒最有利于菜用黄麻福农1号苗期的生长发育;硒浓度较低时,外源脯氨酸具有促进菜用黄麻生长的作用,而硒浓度较高时,脯氨酸可缓解硒对菜用黄麻生长的抑制。(2)外源硒可促进菜用黄麻中叶绿素的合成,亦能促进游离脯氨酸、可溶性糖和可溶性蛋白等渗透调节物质的形成,并且随硒浓度增加呈现先升高后降低的变化趋势;硒浓度为0.5和1.0 mg/L时,可最大程度地促进菜用黄麻叶绿素和渗透调节物质的合成;外源脯氨酸亦具有促进菜用黄麻叶绿素和渗透调节物质合成的功能,并且对高浓度硒造成的毒害有一定的缓解作用。(3)中低浓度的硒(0.5和1.0 mg/L)明显促进菜用黄麻超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化物酶(POD)、过氧化氢酶(CAT)和谷胱甘肽过氧化物酶(GSH-Px)等抗氧化酶的活性,而高浓度硒(5.0 mg/L)抑制菜用黄麻抗氧化酶的活性;随外源硒浓度增加,菜用黄麻抗氧化酶活性呈先升高后降低的趋势;外源脯氨酸能促进菜用黄麻抗氧化酶的活性,硒浓度为2.5和5.0 mg/L时,添加脯氨酸的处理POD、SOD和CAT活性高于未添加者,表明脯氨酸具有增强菜用黄麻抵抗力和自由基清除的能力,从而可以缓解高浓度硒的胁迫。以上结论对菜用黄麻这一新型蔬菜的生产具有重要的理论和实践意义。

关键词：菜用黄麻硒脯氨酸生长生理特性

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甘薯NAC转录因子家族的全基因组鉴定与分析

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热带作物学报 2021年第7期42卷 1831-1840页

作者：黄小芳毕楚韵王和寿陈其俊胡韵卓陈选阳林世强福建农林大学作物生物技术福建省高校重点实验室福建福州350002 福建农林大学农学院福建福州350002 宁德市农业农村局福建宁德352100 福建省种子总站福建福州350002 福建农林大学教育部作物遗传育种与综合利用重点实验室福建福州350002 福建农林大学生命科学学院福建福州350002

利用生物信息学方法对甘薯(Ipomoea batatas)基因组中NAC转录因子进行鉴定、保守结构域分析、motif查找、染色体定位、系统进化树分析以及逆境胁迫下基因表达分析。结果表明:甘薯全基因组序列中含有91个NAC转录因子基因,非均匀分布于甘... 详细信息

利用生物信息学方法对甘薯(Ipomoea batatas)基因组中NAC转录因子进行鉴定、保守结构域分析、motif查找、染色体定位、系统进化树分析以及逆境胁迫下基因表达分析。结果表明:甘薯全基因组序列中含有91个NAC转录因子基因,非均匀分布于甘薯15条染色体上;系统进化树及motif分析结果显示,91个甘薯NAC家族成员可分为16个亚组,共包含20个motif,其中大部分家族成员中均含有motif 2、motif 4、motif 1、motif 8和motif 3,这5个motif分别对应NAC结构域中的5个子域A、B、C、D和E。在与拟南芥(Arabidopsis thaliana)NAC转录因子共同构建的进化树中,有64个甘薯NAC家族成员被归入拟南芥NAC基因家族的14个亚组,其中,NAC2亚组包含的成员数最多,有9个,TIP和AtNAC3亚组均仅有1个。转录组数据分析结果显示,在蔓割病菌(Fusarium oxysporum ***,Fob)胁迫下甘薯NAC基因家族中有10个基因的表达量发生变化;而在低温环境下有25个NAC基因差异表达。本研究结合利用基因组与转录组数据分析,该结果为进一步研究甘薯NAC基因家族的功能提供参考。

关键词：甘薯 NAC 转录因子生物信息学

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杂交稻新品种禾两优676亲本特性和开花习性观察

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福建稻麦科技 2023年第3期41卷 12-16页

作者：卢小转李雨蝶江波毛大梅高艺津官华忠福建农林大学作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室/福建省作物设计育种重点实验室福建福州350028

以RGD-7S和Y58S为对照,对禾两优676亲本禾9S和福恢676特性和开花习性进行观察,结果表明:福恢676植株高大(130.59 cm),穗粒数多;禾9S比福恢676矮,分蘖数多。福恢676和禾9S的播始历期变化随着播期的推迟而缩短,主茎叶片数则较稳定;2个亲... 详细信息

以RGD-7S和Y58S为对照,对禾两优676亲本禾9S和福恢676特性和开花习性进行观察,结果表明:福恢676植株高大(130.59 cm),穗粒数多;禾9S比福恢676矮,分蘖数多。福恢676和禾9S的播始历期变化随着播期的推迟而缩短,主茎叶片数则较稳定;2个亲本均含早花基因EMF1,表现为花时早,开花高峰明显且重叠,午前花多。禾9S颖花开闭时间和角度与对照Y58S相当,颖花开闭时间极显著短于RGD-7S,避免裂颖率过高;且柱头外露率高,易于接受外来花粉。

关键词：水稻特征特性开花习性

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水稻籼粳交后代的籼粳分化与杂种F_1结实率的相关分析

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福建农业学报 2016年第3期31卷 211-216页

作者：陈惠清黄荣裕王天生谢旺有陈锦文谢少和吴建梅林荔辉福建省泉州市农业科学研究所福建晋江362212 福建农林大学作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室福建福州350002

以珍汕97B/秀水13的22个F_7代株系为材料,在采用程氏指数法和SSR分子标记进行籼粳属性鉴定分析的基础上,分别与4个光温敏两系不育系配制88个杂种一代,剖析供试材料的籼粳遗传背景与其配组的F_1结实率的相关性。结果表明:22个后代品系籼... 详细信息

以珍汕97B/秀水13的22个F_7代株系为材料,在采用程氏指数法和SSR分子标记进行籼粳属性鉴定分析的基础上,分别与4个光温敏两系不育系配制88个杂种一代,剖析供试材料的籼粳遗传背景与其配组的F_1结实率的相关性。结果表明:22个后代品系籼粳分化明显,大多为籼型或偏籼型;程氏指数法与SSR分子标记对供试材料的籼粳分类结果基本相符。F_1的结实率与双亲遗传背景呈极显著负相关,逐步回归分析结果表明光温敏不育系的籼粳分化和双亲的粳稻成分指数差值是决定F_1结实率高低的重要因素,携有广亲和基因的育种群体在籼粳交杂种优势利用上具有重要应用价值。

关键词：水稻籼粳分化程氏指数法 SSR分子标记结实率

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专题导读:加强麻类作物基因组学研究,推动优异等位基因发掘及种质创新

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作物学报 2021年第6期47卷 993-996页

作者：张立武福建农林大学农学院作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室/福建省作物设计育种重点实验室福建福州350002 福建农林大学农业农村部东南黄红麻实验观测站/福建省麻类种质资源共享平台/福建省南方经济作物遗传育种与多用途开发国际科技合作基地福建福州350002 福建农林大学海峡联合研究院基因组与生物技术中心福建福州350002

麻类作物是指以收获茎秆韧皮纤维和叶纤维为主的作物,主要包括黄麻(Corchorus spp.)、红麻(Hibiscus cannabinus)、苎麻(Boehmeria spp.)、亚麻(Linum usitatissimum)、工业大麻(Cannabis sativa L.)与剑麻(Agave sisalana *** Engelm.),与粮、棉、油、菜并列为第五大作物群[1],其种植历史可追溯到远古新石器至尧舜时代。我国是麻类生产大国。2009年,作为50个农产品之一的麻产品被列入国家现代农业产业技术体系。2011—2020,以二代、三代测序技术为主体,以Hi-C等技术辅助,先后完成了主要麻类作物染色体级别的草图或参考基因组,这标志着麻类作物科学已经进入基因组时代。为加强主要麻类作物基因组学与遗传改良研究,《作物学报》以专栏形式集中刊发了8篇论文,方便相关研究工作者了解最新研究动态。

关键词：麻类作物叶纤维《作物学报》韧皮纤维尧舜时代现代农业产业技术体系麻产品基因组学

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