检索结果-内蒙古大学图书馆

分子植物育种 2020年第1期18卷 65-73页

作者：李聪娜刘峰张旭任永娟汤翰臣阙友雄苏亚春福建农林大学农业部福建甘蔗生物学与遗传育种重点实验室福州350002 福建农林大学教育部作物遗传育种与综合利用重点实验室福州350002

类甜蛋白(thaumatin-like proteins,TLPs)是一类与作物抵抗真菌病害紧密相关的病程相关蛋白。本研究从课题组前期构建的甘蔗(Saccharum spp.)转录组数据库中筛选获得两个甘蔗类甜蛋白基因(ScTLP2和ScTLP3),利用生物学软件对ScTLP2和ScT... 详细信息

类甜蛋白(thaumatin-like proteins,TLPs)是一类与作物抵抗真菌病害紧密相关的病程相关蛋白。本研究从课题组前期构建的甘蔗(Saccharum spp.)转录组数据库中筛选获得两个甘蔗类甜蛋白基因(ScTLP2和ScTLP3),利用生物学软件对ScTLP2和ScTLP3基因进行序列特征、结构功能及聚类分析,采用qRT-PCR技术,检测ScTLP2和ScTLP3基因在不同甘蔗组织和黑穗病菌(Sporisorium scitamineum)胁迫下的表达情况。生物信息学分析显示,ScTLP2基因全长1835 bp,包含1个969 bp的完整开放读码框,编码322个氨基酸;ScTLP3基因全长1259 bp,包含1个765 bp的完整开放读码框,编码254个氨基酸。ScTLP2和ScTLP3编码蛋白均含有THN家族的保守结构域和糖苷水解酶家族的64结构域(GH64-TLP-SF),两者分别隶属于TLPs家族中的Ⅵ类和Ⅰ类。q RT-PCR结果表明,ScTLP2和ScTLP3基因在甘蔗中均为组成型表达,其中ScTLP2基因在蔗叶中的表达量最高,是蔗皮的11.2倍,而ScTLP3基因在蔗芽中的表达量最高,是蔗皮的45.3倍。受黑穗病菌侵染后,ScTLP2基因在甘蔗抗黑穗病品种‘崖城05-179’中上调表达,而在感黑穗病品种‘ROC22’中无明显变化;相反的,Sc TLP3基因表达量在‘崖城05-179’中无明显变化,在‘ROC22’中上调表达。以上结果为深入研究甘蔗ScTLP家族基因的结构和功能积累了基础资料。

关键词：甘蔗(Saccharum spp.) 类甜蛋白生物信息学分析 qRT-PCR 黑穗病菌

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红麻EST-SSR标记的开发及其多态性评价

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作物学报 2017年第8期43卷 1170-1180页

作者：万雪贝李东旭徐益徐建堂张力岚张列梅林荔辉祁建民张立武福建农林大学作物科学学院/作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室/福建省作物设计育种重点实验室福建农林大学海峡联合研究院基因组与生物技术中心福建福州350002

红麻是最重要的自然纤维作物之一,然而SSR标记的匮乏限制了其遗传改良。本研究从红麻90 175个EST序列中挑出含有转录因子的EST,开发了94对SSR引物。以24份不同红麻种质资源的DNA为模板,利用9%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测多态性。结果... 详细信息

红麻是最重要的自然纤维作物之一,然而SSR标记的匮乏限制了其遗传改良。本研究从红麻90 175个EST序列中挑出含有转录因子的EST,开发了94对SSR引物。以24份不同红麻种质资源的DNA为模板,利用9%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测多态性。结果表明,85对引物(占90.4%)至少在2个材料之间存在多态性,表明开发的EST-SSR具有很好的多态性。其中,三核苷酸重复所占比例最多,重复基元AAT和ATG的多态性较高。聚类分析表明,24份红麻种质资源的遗传相似系数变化在0.62~0.92之间,表现出丰富的遗传基础。这些结果不仅丰富了红麻的分子标记数量,而且为红麻的遗传分析提供资源。

关键词：红麻 SSR 遗传多样性标记开发

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植物ASK1-D3(MAX2)-D14蛋白复合体互作区特征与演化分析

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福建农林大学学报（自然科学版） 2017年第5期46卷 539-545页

作者：郑秀娟翁群清陈思雀孙新立福建农林大学作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室福建农林大学作物科学学院福建福州350002

ASK1-D3-D14复合体作为E3泛素连接酶的一部分,调控水稻的形态发生等生理反应.为了揭示该复合体互作区的结构特征和演化关系,通过对不同物种中D3直系蛋白间的系统进化进行分析,发现D3基因在不同物种中表现出不同的演化进程;而对ASK1-D3和... 详细信息

ASK1-D3-D14复合体作为E3泛素连接酶的一部分,调控水稻的形态发生等生理反应.为了揭示该复合体互作区的结构特征和演化关系,通过对不同物种中D3直系蛋白间的系统进化进行分析,发现D3基因在不同物种中表现出不同的演化进程;而对ASK1-D3和D3-D14互作面的序列和空间结构分析,揭示D3直系同源蛋白质以及已知的F-box-like结构域间的序列同源性较低,而空间结构相似性较高,暗示F-box-like与ASK1类蛋白质之间的互作,空间结构的相似性重于序列的相似性.涉及D3和D14互作面的氨基酸在直系同源蛋白序列间的同源性很高,而形成互作面疏水内核的氨基酸保守性更高.这为D3复合体的进一步研究提供了依据.

关键词： ASK1-D3-D14 蛋白复合体演化互作

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利用BSA-seq快速定位水稻抗褐飞虱QTL

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分子植物育种 2021年第24期19卷 8184-8190页

作者：胡杰何龙张翔岑浩伦黄力坤吴为人福建农林大学农学院作物设计育种福建省重点实验室教育部作物遗传育种与综合利用重点实验室福州350002

褐飞虱为害是造成水稻减产的一个重要因素。对水稻抗褐飞虱基因的发掘、鉴定和克隆是水稻功能基因组学的一个研究热点领域,也为抗虫育种提供了多样化的基因资源。本研究利用两个分别来自印度和孟加拉国的农家抗虫品系ARC14544和GUIAROI... 详细信息

褐飞虱为害是造成水稻减产的一个重要因素。对水稻抗褐飞虱基因的发掘、鉴定和克隆是水稻功能基因组学的一个研究热点领域,也为抗虫育种提供了多样化的基因资源。本研究利用两个分别来自印度和孟加拉国的农家抗虫品系ARC14544和GUIAROI分别与感虫品种‘9311’和‘珍汕97’杂交,构建了两个F2:3群体,通过基于GBS简化基因组测序技术的混合分离分析法(BSA-seq)对抗褐飞虱QTL进行定位。两个群体同时在第4染色体20~22 Mb区间定位到的一个主效QTL qBPH4.5,与已克隆的褐飞虱抗性基因Bph6的位置相近。进一步利用此区间的分子标记RM5757,证实该QTL在两个群体中是真实存在的。本研究展示了BSA-seq法的有效性,为水稻褐飞虱抗性的分子标记辅助育种提供了基础。

关键词：水稻抗褐飞虱基因 QTL定位 BSA-seq

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水蕨的农田生境调查和人工繁育探索

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中国生态农业学报 2012年第6期20卷 810-812页

作者：黄碧光陈庆山林文雄福建农林大学作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室福州350002 福建农林大学农业生态研究所福州350002

水蕨（Ceratopteris thalictroides）是水蕨科（Parkeriaceae）、水蕨属（Ceratopteris）的蕨类植物[1]。中国境内有2种：水蕨和粗梗水蕨（***）[1],分布于长江以南,湿生,茎叶入药治胎毒、消痰积,嫩叶可做蔬菜[1],同时是研究性别决定和... 详细信息

水蕨（Ceratopteris thalictroides）是水蕨科（Parkeriaceae）、水蕨属（Ceratopteris）的蕨类植物[1]。中国境内有2种：水蕨和粗梗水蕨（***）[1],分布于长江以南,湿生,茎叶入药治胎毒、消痰积,嫩叶可做蔬菜[1],同时是研究性别决定和基因定位的良好材料[2]。水蕨对生存环境的质量要求较高,可用于农田环境监测,洗涤剂、除草剂。

关键词：水蕨属人工繁育农田生境环境监测蕨类植物中国境内基因定位

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施用不同种类肥料对紫色马铃薯生长、产量品质及花青素的影响

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江苏农业科学 2021年第21期49卷 94-99页

作者：张招娟黄家伟黄泷健郭玉春福建农林大学农学院/作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室/福建省作物设计育种重点实验室福建福州350002

研究复合肥、缓释肥和土壤调节剂加复合肥3种不同肥料对紫色马铃薯生长特性及花青素含量的影响。以紫色马铃薯华颂66为供试材料,施用复合肥为对照,采用随机区组排列设计,利用HPLC法定性定量分析紫色马铃薯花青素含量。结果表明,施用缓... 详细信息

研究复合肥、缓释肥和土壤调节剂加复合肥3种不同肥料对紫色马铃薯生长特性及花青素含量的影响。以紫色马铃薯华颂66为供试材料,施用复合肥为对照,采用随机区组排列设计,利用HPLC法定性定量分析紫色马铃薯花青素含量。结果表明,施用缓释肥对植株高度、叶面积指数和产量具有显著的促进作用;同时显著提高维生素C和淀粉含量;但显著降低还原糖含量。花青素含量在土壤调节剂加复合肥的施用中最高,在缓释肥施用中含量最低。高效液相色谱分析表明,施用缓释肥时,总花青素组分中缺少天竺葵色素,推测该施肥种类对天竺葵色素合成具有抑制作用。因此,在生产实践上应根据不同目标需求,合理选用不同种类肥料。

关键词：紫色马铃薯肥料生长特性品质花青素

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地黄钙信号体系相关基因的鉴定及其在连作条件下响应特征分析

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药学学报 2017年第12期52卷 1951-1961页

作者：杨楚韵李鑫宇李明杰冯法节古力张宝陈淑强陈爱国张重义福建农林大学作物科学学院福建福州350002 河南农业大学农学院河南郑州450002 福建农林大学福建农林大学作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室福建福州350002

钙信号是植物响应胁迫的重要系统之一,前期研究发现钙信号参与了连作地黄感知、传导和响应连作胁迫的进程。为了确证钙信号在地黄连作障碍形成过程中的作用方式,本研究在前期地黄大容量转录组基础上,利用生物信息学方法详细鉴定地黄钙... 详细信息

钙信号是植物响应胁迫的重要系统之一,前期研究发现钙信号参与了连作地黄感知、传导和响应连作胁迫的进程。为了确证钙信号在地黄连作障碍形成过程中的作用方式,本研究在前期地黄大容量转录组基础上,利用生物信息学方法详细鉴定地黄钙信号转导体系相关蛋白的编码基因,并对其在连作和头茬地黄中的表达模式进行分析。同时,采用焦锑酸盐法和钙荧光染色法测定连作和头茬地黄根细胞中钙离子浓度差异。鉴定出5个CaMs、12个CBLs、21个CDPKs、21个CIPKs、16个CMLs和9个CRKs等84个钙信号体系相关基因。通过对连作和头茬地黄钙信号体系相关基因差异表达模式进行分析,发现连作效应增强了地黄钙信号体系中关键基因的表达。进一步利用qRT-PCR方法对12个关键的钙信号转导相关基因进行表达验证,确证了钙信号响应了连作胁迫进程。此外,2种钙离子浓度检测方法也均证实连作胁迫显著促进了地黄胞内钙离子的积累。本研究从分子和细胞水平上确证了钙信号在地黄连作障碍形成中扮演着重要角色,为进一步从分子水平上解读地黄连作障碍的形成机制奠定了基础。

关键词：地黄连作障碍自毒作用钙信号体系钙离子浓度

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辣椒CaWRKY5启动子的分离及其调控元件分析

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应用与环境生物学报 2013年第3期19卷 389-394页

作者：刘志钦杨晟蔡金森黄雪盈马小玲石兰平王博郭吟枫陈桂信牟少亮官德义何水林福建农林大学作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室福州350002 福建农林大学生命科学学院福州350002 福建农林大学园艺学院福州350002 福建农林大学作物科学学院福州350002

采用Genome walking方法从辣椒基因组DNA中分离获得辣椒CaWRKY5基因上游的启动子序列,命名为CaWRKY5p.为了分析CaWRKY5p对病原菌和机械损伤的应答以及可能的调控区域,将该基因5’端顺序4个不同缺失片段分别与GUS报告基因相融合构成表达... 详细信息

采用Genome walking方法从辣椒基因组DNA中分离获得辣椒CaWRKY5基因上游的启动子序列,命名为CaWRKY5p.为了分析CaWRKY5p对病原菌和机械损伤的应答以及可能的调控区域,将该基因5’端顺序4个不同缺失片段分别与GUS报告基因相融合构成表达载体,在农杆菌介导的烟草叶片瞬间表达系统中表达.结果表明:启动子TATA框为起始密码子ATG上游-140 bp至-136 bp之间的TATATAA,同时含有多种与逆境胁迫相关的顺式作用元件,如W-box、S-box、MeJA应答元件和ABRE类似元件等;CaWRKYK5基因上游-936 bp启动子可以应答青枯病菌、抗病信号分子以及机械损伤;CaWRKY5p应答青枯病菌和茉莉酸甲酯(MeJA)的核心元件可能位于启动子-886 bp至-489 bp之间,应答乙烯(ET)核心调控区域位于-936 bp和-886 bp之间,而应答机械损伤的核心元件位于启动子-336 bp以及ATG之间.

关键词：辣椒 CaWRKY5启动子病原菌应答机械损伤应答烟草叶片瞬间表达

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水稻雌性不育分子机理研究进展

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分子植物育种 2017年第2期15卷 672-684页

作者：官文祥邓赟李小旭吴为人郑燕福建农林大学作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室福州350002 福建省作物设计育种重点实验室福州350002 福建农林大学生命科学学院福州350002

育性是水稻的关键农艺性状,其发生机理和遗传基础是发育生物学的研究热点。不育可分为雄性不育和雌性不育。雌性不育由于性状难鉴定、突变体难获得及内部机制复杂等原因,其研究远远滞后于雄性不育。近年来,由于水稻雌性不育突变体的不... 详细信息

育性是水稻的关键农艺性状,其发生机理和遗传基础是发育生物学的研究热点。不育可分为雄性不育和雌性不育。雌性不育由于性状难鉴定、突变体难获得及内部机制复杂等原因,其研究远远滞后于雄性不育。近年来,由于水稻雌性不育突变体的不断发现及分子生物学研究手段的快速进步,一批控制水稻雌性不育的基因相继被定位和克隆,为揭示水稻雌性不育发生机理奠定了基础。本文综述了近二十年来水稻雌性不育分子遗传机理的有关研究进展,主要包括杂种不育基因,影响胚珠发育、细胞分裂和花器官发育的基因,以及转录组等方面的研究,以期加深对水稻雌性不育的认识,促进对水稻雌性不育的探索和利用。

关键词：水稻雌性不育分子机理

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水稻单C_2H_2型锌指基因ZOS2-01的表达与功能分析

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基因组学与应用生物学 2011年第2期30卷 129-135页

作者：刁志娟段远霖赵粉李生平吴为人作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室福建农林大学福州350002 福建省水稻分子标记辅助育种重点实验室福建农林大学福州350002

拟南芥超雄基因(SUPERMAN,SUP)是一个单C2H2锌指基因。该基因突变后会造成雌蕊同源转化为雄蕊,正常的心皮发育受阻,因此SUP在控制花第3/4轮边界的建立和胚珠的发育中起重要作用。为了探知水稻中的SUP同源基因是否也存在类似的功能,我们... 详细信息

拟南芥超雄基因(SUPERMAN,SUP)是一个单C2H2锌指基因。该基因突变后会造成雌蕊同源转化为雄蕊,正常的心皮发育受阻,因此SUP在控制花第3/4轮边界的建立和胚珠的发育中起重要作用。为了探知水稻中的SUP同源基因是否也存在类似的功能,我们根据拟南芥SUP的功能结构域,从水稻中克隆了一个与SUP类似基因,命名为ZOS2-01,并对其表达和功能进行了分析。结果表明,ZOS2-01与拟南芥的SUP和矮牵牛的PhSUP1在系统进化树上处于同一分支且与SUP的功能结构域完全相同。定量PCR和GUS表达分析表明,除胚乳外,ZOS2-01几乎在所有组织和器官中表达,但在幼穗中的表达量最高,暗示它可能参与了水稻的营养生长和花器官发育的调节。然而,采用RNA干扰和过量表达的方法减少和增加ZOS2-01的表达并没有明显影响水稻的生长发育,转基因水稻的营养生长正常,花器官发育也没有明显异常且结实正常。这些结果表明,尽管水稻ZOS2-01与拟南芥SUP具有相同的功能结构域,但它们的表达和功能可能已出现了分化,或者水稻中存在多个功能冗余的SUP类似基因。

关键词：水稻(Oryza sativa L.) 锌指基因 ZOS2-01 GUS表达功能分析

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