微卫星或简单序列重复（SSR）是指以1~6个碱基为单位的串联重复序列.SSR 包括完整型和不完整型两种.不完整型 SSR 是指其序列中存在个别不符合基序的碱基.SSR 作为一种用途广泛的分子标记,其多态性水平越高则应用价值越大.本研究利用模...
详细信息
微卫星或简单序列重复（SSR）是指以1~6个碱基为单位的串联重复序列.SSR 包括完整型和不完整型两种.不完整型 SSR 是指其序列中存在个别不符合基序的碱基.SSR 作为一种用途广泛的分子标记,其多态性水平越高则应用价值越大.本研究利用模式植物水稻的两个品种（籼稻93-11和粳稻日本晴）和拟南芥的两个生态型（Columbia 和 Lansberg）的基因组序列,以及稻瘟菌中245个 SSR 标记的试验结果,对 SSR 序列完整性与多态性之间的关系进行了分析.结果表明,总体上三个物种都表现为不完整型 SSR 的多态性比完整型 SSR 低,其中以稻瘟菌最为显著.水稻和拟南芥表现出相似的规律,其 SSR 序列完整性对多态性的影响都是以二核苷酸重复最为显著,而五核苷酸重复序列则基本不受影响;另外,SSR 多态性水平与序列完整程度呈正相关关系,但轻微的序列不完整一般并不会降低 SSR 的多态性,甚至在拟南芥中还提高多态性.本研究结果对 SSR 标记的开发和 SSR 进化研究提供了有用的信息,具有重要的参考价值.
从EMS诱变日本晴种子的M2代中筛选得到一个植株明显矮化、分蘖数急剧增多的突变体,命名为det1(dwarf and excessively-tillering1)。det1还显示出明显的穗型、粒型和育性等方面的生殖发育缺陷。遗传分析表明,det1受一对隐性基因控制。以...
详细信息
从EMS诱变日本晴种子的M2代中筛选得到一个植株明显矮化、分蘖数急剧增多的突变体,命名为det1(dwarf and excessively-tillering1)。det1还显示出明显的穗型、粒型和育性等方面的生殖发育缺陷。遗传分析表明,det1受一对隐性基因控制。以det1与品种DZ60杂交建立了F2定位群体,利用微卫星标记分析F2群体中的突变体,将DET1基因定位在第6染色体长臂端,标记SSR2和SSR3之间约68kb的范围内。已知该区间内存在一个与水稻株高和分蘖有关的基因D3。测序结果表明,DET1与D3是同一个基因,编码一个LRR型的F-box蛋白。与d3相比,det1还显示了新的表型特征,推测可能是等位基因的不同突变位点造成的。det1/d3的表型特征提示,DET1/D3在调节水稻生长发育过程中具有多效性。因此,利用det1开展进一步的研究将有助于全面揭示DET1/D3的分子功能。
暂无评论