检索结果-内蒙古大学图书馆

中国农业科学 2024年第5期57卷 855-867页

作者：吴期滨谢婉婕钟惠冯春燕潘浩然齐浥颖张积森王恒波福建农林大学农学院/国家甘蔗工程技术研究中心/农业农村部福建甘蔗生物学与遗传育种重点实验室广西大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室

【目的】甘蔗褐锈病是由黑顶柄锈菌（Puccinia melanocephala H. Sydow&P. Sydow）引起的最具破坏性的真菌病害之一，能造成蔗糖分降低10%—36%，严重威胁甘蔗产业发展。已有研究揭示抗褐锈病主效基因定位于Bru1区域，克隆其关键候... 详细信息

【目的】甘蔗褐锈病是由黑顶柄锈菌（Puccinia melanocephala H. Sydow&P. Sydow）引起的最具破坏性的真菌病害之一，能造成蔗糖分降低10%—36%，严重威胁甘蔗产业发展。已有研究揭示抗褐锈病主效基因定位于Bru1区域，克隆其关键候选基因，并进行功能研究，为选育抗褐锈病甘蔗新品种提供重要的候选基因资源。【方法】利用PacBio SequelⅡ测序平台获得甘蔗栽培品种ROC22的contig水平基因组信息，鉴定到抗褐锈病Bru1区域，对其进行基因注释和克隆，分析其组织特异性和抗、感褐锈病甘蔗品种中的表达模式及其在烟草叶片的亚细胞定位和瞬时表达。【结果】基于Bru1位点区域紧密连锁的标记R12H16和9O20-F4，从该区域中注释到33个基因，结合典型抗病基因结构域，共筛选获得5个候选抗病基因，分别为Brrg99、Brrg103、Brrg108、Brrg115和Brrg116。以甘蔗栽培品种ROC22的cDNA为模板，克隆获得Brrg116的全长序列729 bp，编码242个氨基酸残基。将该基因序列分别比对甘蔗热带种和割手密种及二倍体近缘种高粱的基因组数据库，发现其与热带种和割手密种的同源基因序列相似性很高，达到98%以上，而与高粱的相似性为93.77%。系统进化树揭示该基因起源甘蔗割手密种。实时荧光定量PCR检测表明，Brrg116在甘蔗栽培品种的多个组织中组成型表达，尤其是在+1叶中的表达量最高，是蔗芽的9.8倍；在褐锈病菌侵染抗、感甘蔗栽培品种的6和72 h时，呈现显著差异表达。亚细胞定位结果显示，该基因编码蛋白定位于细胞膜上。在本氏烟（Nicotiana benthamiana）叶片中瞬时过表达Brrg116，其后接种茄病镰刀菌蓝色变种，二氨基联苯胺法（3,3′-diaminobenzidine,DAB）染色逐渐加深，超敏反应相关基因、水杨酸信号和乙烯信号途径中的相关基因持续上调表达。【结论】Brrg116在甘蔗不同组织中组成型表达，且在受褐锈病菌侵染的抗病甘蔗栽培品种中呈现快速的诱导表达。此外，过表达Brrg116引发水杨酸和乙烯等激素信号通路产生防御响应，推测该基因可能在提高植物的抗病性方面发挥重要调控作用。

关键词：甘蔗 Bru1区域褐锈病候选抗病基因连锁标记

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甘蔗割手密种转录因子NAP亚家族的鉴定及SsNAP2a参与叶片衰老的功能分析

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作物学报 2024年第1期50卷 110-125页

作者：王恒波冯春燕张以星谢婉婕杜翠翠吴明星张积森福建农林大学农业农村部福建甘蔗生物学与遗传育种重点实验室/国家甘蔗工程技术研究中心/福建农林大学生命科学学院福建福州3500022 广西大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室广西南宁530004

NAP(NAC-like,activated by apetala3/pistillata)是转录因子NAC基因家族中一类参与调控植物生长发育、叶片衰老及响应激素和非生物胁迫应答的亚家族。本研究利用甘蔗割手密种基因组数据和生物信息学方法,首先,基于比较基因组学对NAP亚... 详细信息

NAP(NAC-like,activated by apetala3/pistillata)是转录因子NAC基因家族中一类参与调控植物生长发育、叶片衰老及响应激素和非生物胁迫应答的亚家族。本研究利用甘蔗割手密种基因组数据和生物信息学方法,首先,基于比较基因组学对NAP亚家族成员进行鉴定、系统进化分析、保守结构域及顺式调控元件预测;其次,克隆获得割手密种SsNAP2的等位基因SsNAP2a,分析该基因在不同生长发育阶段的表达及其在激素和非生物胁迫下的表达特征;最后,利用瞬时表达和亚细胞定位分析SsNAP2a基因的功能。结果表明,在割手密种基因组中共鉴定5个NAP亚家族成员,亚细胞定位预测所有成员编码蛋白均定位于细胞核上,这些基因的Ka/Ks比值均小于1,表明纯化选择在演化中起到关键作用。系统聚类分析表明,5个代表性的被子植物(拟南芥、菠萝、水稻、玉米和高粱)与已报道的12个物种及甘蔗的NAP亚家族成员,共计46个,分为4个Clade,其演化的顺序Clade I>Clade II>Clade III>Clade IV。此外,在SsNAP亚家族成员的启动子区域预测到较多响应脱落酸和茉莉酸、低温等逆境胁迫的顺式作用元件,推测其参与多种激素和非生物胁迫相关应答通路。进一步,从割手密种SES208中克隆到SsNAP2a基因,该cDNA全长序列1173 bp(GenBank登录号为OQ335094),编码390个氨基酸残基,其与等位基因SsNAP2编码蛋白的序列相似性为97.70%,有10个氨基酸残基的差异,表明同源8倍体的割手密种等位基因序列差异较大。qRT-PCR分析表明,SsNAP2a基因在割手密种不同生长发育阶段中组成型表达,尤其在衰老的蔗皮和根中的表达量最高;在乙烯利(ethylene,ET)、脱落酸(abscisic acid,ABA)、4℃低温和40℃高温处理下,其表达量呈现显著诱导表达;而在8%聚乙二醇(polyethyleneglycol,PEG)胁迫下显著下调表达。亚细胞定位表明,SsNAP2a融合蛋白定位在细胞核上。瞬时过表达SsNAP2a基因7 d后,本氏烟(Nicotianabenthamiana)叶片有明显的卷曲、皱缩等衰老现象,ET合成相关基因(NtEFE26,NtAccdeaminase)显著上调表达,而水杨酸、茉莉酸和ABA合成相关基因(NtPR-1a/c、NtPR3和NtAREB1)显著下调表达,表明SsNAP2a基因参与多种激素信号传导途径诱发叶片衰老。以上研究结果为挖掘甘蔗NAP亚家族基因成员参与叶片衰老的生物学功能奠定了研究基础,也为培育甘蔗抗衰老分子育种提供候选的基因资源。

关键词：割手密种 NAP基因叶片衰老激素胁迫基因功能甘蔗

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甘蔗割手密种糖转运蛋白基因SsSWEET11的克隆与功能分析

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作物学报 2023年第9期49卷 2385-2397页

作者：杜翠翠吴明星张雅婷谢婉婕张积森王恒波农业农村部福建甘蔗生物学与遗传育种重点实验室/国家甘蔗工程技术研究中心/福建农林大学农学院福建福州350002 广西大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室广西南宁530004

SWEET蛋白通过调控植物体内糖分的运输、分配、转化和贮藏,广泛参与植物生长发育及响应病原菌胁迫的生理生化过程。为揭示SWEET基因在甘蔗生长发育及其与赤条病菌互作中的生物学功能,本研究基于甘蔗割手密种全长转录组文库和比较基因组... 详细信息

SWEET蛋白通过调控植物体内糖分的运输、分配、转化和贮藏,广泛参与植物生长发育及响应病原菌胁迫的生理生化过程。为揭示SWEET基因在甘蔗生长发育及其与赤条病菌互作中的生物学功能,本研究基于甘蔗割手密种全长转录组文库和比较基因组学,根据注释SsSWEET11基因序列设计特异引物,利用RT-PCR技术从甘蔗割手密种cDNA文库中扩增该基因的全长序列,运用多种生物信息工具分析其特征,构建系统进化树;采用不同组织和抗、感赤条病的甘蔗品种分析SsSWEET11的表达模式;利用瞬时表达和亚细胞定位分析SsSWEET11的功能。结果表明,从甘蔗割手密种克隆获得SsSWEET11基因(登录号为OP554214),该基因全长927bp,编码308个氨基酸残基,具有2个MtN3_saliva结构域和7次跨膜结构域。系统进化树分析显示,SsSWEET11属于SWEET蛋白家族第Ⅲ亚家族成员,与高粱SbSWEET11相似性高达97.41%。qRT-PCR分析表明, ShSWEET11基因在不同组织中组成型表达,在蔗叶和根中表达量显著高于其他组织;赤条病菌胁迫下,ScSWEET11基因在抗病品种ROC22和感病品种MT11-610中呈现完全不同的表达趋势,与对照相比,抗病品种中该基因的表达量显著下调,而感病品种中,在胁迫48h和72h后该基因的表达量显著上调,分别为对照的5.90倍和5.43倍。亚细胞定位表明, SsSWEET11-GFP融合蛋白定位在质膜上。瞬时过表达SsSWEET11基因1 d后,二氨基联苯胺(Diaminobenzidine, DAB)对本氏烟叶片进行染色,叶片颜色没有变化,再接种烟草青枯菌、茄病镰刀菌蓝色变种7 d后,过表达植株叶片发病比对照组严重,且过敏反应相关基因、茉莉酸和水杨酸代谢途径相关基因呈现上调表达,而乙烯通路相关基因则没有响应,表明SsSWEET11基因参与茉莉酸和水杨酸信号传导通路,且病原菌侵染本氏烟草叶片能够诱发过敏反应。研究结果不仅为开发与甘蔗抗赤条病菌性状关联的分子标记提供积累,也为深入解析赤条病侵染甘蔗的分子机制奠定一定的基础。

关键词：割手密种 SWEET基因糖转运蛋白赤条病菌基因功能甘蔗

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基于转录组及WGCNA的甘蔗干旱响应调控网络分析

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作物学报 2022年第7期48卷 1583-1600页

作者：李佩婷赵振丽黄潮华黄国强徐良年邓祖湖张玉赵新旺福建农林大学国家甘蔗工程技术研究中心福建福州350002 福建农林大学生命科学学院/福建省植物功能生物学与绿色农业重点实验室福建福州350002 广西大学广西甘蔗生物学重点实验室广西南宁530004 福建农林大学/农业农村部福建甘蔗生物学与遗传育种重点实验室福建福州350002

干旱是制约甘蔗产业发展的重要因素之一。前人研究表明,斑茅具有良好的抗性基因,可以通过远缘杂交遗传给后代。本研究以斑茅与甘蔗杂交F1代无性系YCE96-40为材料,对苗期干旱处理0 h和24 h后的叶和根进行转录组测序分析,比较了根和叶在... 详细信息

干旱是制约甘蔗产业发展的重要因素之一。前人研究表明,斑茅具有良好的抗性基因,可以通过远缘杂交遗传给后代。本研究以斑茅与甘蔗杂交F1代无性系YCE96-40为材料,对苗期干旱处理0 h和24 h后的叶和根进行转录组测序分析,比较了根和叶在转录水平上响应干旱的差异,鉴定出21,885个(DR vs CR:10176,DL vs CL:7907)差异表达基因(DEGs),根中差异表达基因多于叶中,说明根对干旱胁迫响应更为剧烈。GO功能富集分析发现,根和叶中DEGs均富集到与脱水反应相关及激素信号转导过程相关的条目,比如“对渗透胁迫生物过程的响应”和“对缺水生物过程的反应”等。与叶不同的是,根中大量DEGs显著富集到与细胞膜相关的条目。在根中鉴定出多个木质素相关DEGs,表明木质素参与了根的干旱响应。通过对所有DEGs进行WGCNA分析,共鉴定出11个基因共表达模块,其中与干旱处理后的根显著相关有5个模块,与干旱处理后的叶显著相关的有2个模块。进一步筛选出了26个转录因子为甘蔗干旱响应的候选转录因子,构建了调控网络。研究结果为进一步理解甘蔗抗旱性的分子机制及甘蔗抗旱性育种提供了理论指导。

关键词：甘蔗抗旱性转录组加权基因共表达网络转录因子

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基于SSR标记的甘蔗指纹图谱构建及遗传多样性分析

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分子植物育种 2022年

作者：张慧刘严明林萍萍黄潮华黄国强徐良年邓祖湖张木清王勤南赵新旺福建农林大学国家甘蔗工程技术研究中心农业农村部福建甘蔗生物学与遗传育种重点实验室广西大学广西甘蔗生物学重点实验室广东省科学院南繁种业研究所

为从分子水平研究中国甘蔗材料的遗传多样性差异并建立甘蔗品种(系)的DNA指纹图谱，本研究利用21对SSR引物，对中国育成、引进和本地野生资源等229份材料构成的甘蔗群体进行遗传多样性分析，并对群体材料进行指纹图谱构建。结果表明中... 详细信息

为从分子水平研究中国甘蔗材料的遗传多样性差异并建立甘蔗品种(系)的DNA指纹图谱，本研究利用21对SSR引物，对中国育成、引进和本地野生资源等229份材料构成的甘蔗群体进行遗传多样性分析，并对群体材料进行指纹图谱构建。结果表明中国甘蔗群体遗传多样性较好，群体间遗传变异占比低，野生资源利用率低。同时，构建了229份甘蔗品种、种质资源的DNA指纹图谱数据库，开发了相对应的二维码。研究结果对中国甘蔗新品种选育与推广、品种信息查询和鉴别及种质资源的开发利用提供理论支持。

关键词：甘蔗 SSR标记遗传多样性指纹图谱

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甘蔗黑穗病菌效应子SsCMU1的克隆与表达分析

甘蔗黑穗病菌效应子SsCMU1的克隆与表达分析

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中国植物病理学会2023年学术年会

作者：梁艳兰姚坤存覃丽谦王东姣阙友雄凌辉罗俊黄宁福建农林大学国家甘蔗工程技术研究中心农业农村部福建甘蔗生物学与遗传育种重点实验室玉林师范学院农学院

分支酸变位酶(chorismate mutase1,CM)是一种能将植物水杨酸合成代谢中间产物分支酸转变为预苯酸从而影响水杨酸(salicylic acid,SA)合成的酶。在玉米黑粉菌[Ustilago maydis (DC) Corola]中,Cmu1作为致病因子,通过降低寄主SA合成而增... 详细信息

分支酸变位酶(chorismate mutase1,CM)是一种能将植物水杨酸合成代谢中间产物分支酸转变为预苯酸从而影响水杨酸(salicylic acid,SA)合成的酶。在玉米黑粉菌[Ustilago maydis (DC) Corola]中,Cmu1作为致病因子,通过降低寄主SA合成而增强病原真菌致病性。本研究以甘蔗黑穗病菌(Sporisorium scitamineum)侵染甘蔗幼芽14 d后的cDNA作为模板,通过RT-PCR克隆获得SsCmu1基因序列,其编码302个氨基酸。根据生物信息学分析结果推测,SsCmu1可能为酸性稳定亲水性蛋白。亚细胞定位和转录自激活试验显示,SsCmu1为膜蛋白且无毒性无转录自激活活性。基于甘蔗-黑穗病菌表达谱芯片结果分析表明,SsCmu1基因在甘蔗易感黑穗病品种YC71-374和抗黑穗病品种NCo376中均上调表达,但在黑穗病菌侵染3d后,SsCmu1在YC71-374中的表达增加量显著高于NCo376。研究结果为深入探究SsCmu1基因对甘蔗黑穗病菌致病性的影响以及深入解析其侵染机制奠定了基础。

关键词：甘蔗黑穗病菌效应子 SsCmu1 基因表达

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施用硅肥对甘蔗抗条螟性及其产量的影响

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热带作物学报 2021年第4期42卷 1071-1079页

作者：林兆里张华罗俊高世武姚俊丽许莉萍福建农林大学农业农村部福建甘蔗生物学与遗传育种重点实验室/福建农林大学国家甘蔗工程技术研究中心福建福州350002 福建农林大学植物保护学院福建福州350002

为明确甘蔗施用硅肥对甘蔗条螟(Chilo sacchariphagus Bojer)抗性的影响,在田间自然螟虫胁迫条件下,对甘蔗含硅量、抗条螟性指标和产量性状等进行测定。结果显示,硅肥在187.5~750 kg/hm^(2)施用量范围内能显著提高整个生长季甘蔗植株的... 详细信息

为明确甘蔗施用硅肥对甘蔗条螟(Chilo sacchariphagus Bojer)抗性的影响,在田间自然螟虫胁迫条件下,对甘蔗含硅量、抗条螟性指标和产量性状等进行测定。结果显示,硅肥在187.5~750 kg/hm^(2)施用量范围内能显著提高整个生长季甘蔗植株的硅含量,显著降低甘蔗条螟钻蛀率和为害程度。硅肥施用量、植株硅含量和抗条螟性指标间响应一致。采用因子分析对7个抗条螟性指标进行简化,可分为3个公因子,即苗期条螟为害因子、工艺成熟期条螟为害因子和条螟生长发育因子。苗期螟害枯心率、工艺成熟期螟害节率和羽化率可作为硅肥调控甘蔗对条螟抗性效应的评价指标。经逐步回归分析可知,在7个抗条螟性指标中,苗期螟害枯心率和累积蛀道长度对蔗茎产量影响最大。562.5 kg/hm^(2)硅肥施用量对甘蔗条螟防治效果和甘蔗增产效应最适宜。研究表明,硅肥能显著提升甘蔗植株硅含量,增强甘蔗植株对条螟的抗性,有效降低甘蔗条螟发生为害,促进甘蔗增产增收。

关键词：甘蔗硅肥条螟抗条螟性指标产量

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甘蔗连作障碍土壤根际关键微生物的分析与鉴定

甘蔗连作障碍土壤根际关键微生物的分析与鉴定

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中国植物病理学会2023年学术年会

作者：曹月吴故燃尤垂淮吴期滨阙友雄张华福建农林大学国家甘蔗工程技术研究中心农业农村部福建甘蔗生物学与遗传育种重点实验室福建农林大学生命科学学院

甘蔗宿根连作障碍的发生在甘蔗主产区愈发明显,但其成因尚未明确。为探究根际土壤微生物与宿根连作障碍的相关性,本研究以柳城05136和ROC22两种不同宿根性甘蔗为材料,分别进行宿根0年、1年、2年种植,并对根际土壤进行高通量测序及关键... 详细信息

甘蔗宿根连作障碍的发生在甘蔗主产区愈发明显,但其成因尚未明确。为探究根际土壤微生物与宿根连作障碍的相关性,本研究以柳城05136和ROC22两种不同宿根性甘蔗为材料,分别进行宿根0年、1年、2年种植,并对根际土壤进行高通量测序及关键微生物的分离、筛选及鉴定。结果表明:甘蔗根际的真菌群体较细菌群体丰富40%,拟青霉属(Purpureocillium spp.)和翅孢壳属(Emericellopsis spp.)在弱宿根性甘蔗根际的含量显著高于强宿根性甘蔗,与连作障碍严重性的重要指标产量成正相关,微皮伞属(Marasmillus spp.)和刺球菌属(Chaetosphaeria spp.)在弱宿根性甘蔗根际的含量显著低于强宿根性甘蔗,与连作障碍严重性的重要指标产量呈负相关关系。通过平板稀释法进行分离微生物,以功能鉴定筛选综合特性最佳的有益菌株NC29,对其进行菌落形态观察、生理生化试验及16S rDNA扩增,鉴定其为Bacillus spp.。综上所述,本研究挖掘了宿根甘蔗-根际微生物互作过程中发挥关键作用的微生物,明确了强弱宿根性甘蔗微生物间的差异,为甘蔗连作障碍的研究及缓解提供参考。

关键词：甘蔗宿根连作根际微生物芽孢杆菌

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甘蔗NIP水通道蛋白的鉴定与抗病功能分析

甘蔗NIP水通道蛋白的鉴定与抗病功能分析

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中国植物病理学会2023年学术年会

作者：陈瑶王东姣黄廷辰尤垂淮吴期滨阙友雄苏亚春福建农林大学国家甘蔗工程技术研究中心农业农村部福建甘蔗生物学与遗传育种重点实验室福建农林大学生命科学学院

类NOD26膜内在蛋白(nodulin 26-like intrinsic proteins,NIPs)是水通道蛋白(aquaporin proteins,AQPs)家族的一个亚家族,在响应植物生物和非生物胁迫中发挥重要作用。本研究基于甘蔗热带种(Saccharum officinarum)、甘蔗近缘野生种割手密(***)和甘蔗栽培种R570 (Sccharum hybrid cultivar R570)基因组数据库,分别鉴定到15个SsNIP、44个SoNIP及4个ShNIP基因。进化树分析表明,甘蔗NIP基因家族可分为三类。转录组分析显示,NIP基因在蔗芽中高表达,且Ⅱ类家族成员积极响应甘蔗黑穗病菌(Sporisorium scitamineum)的胁迫。进一步,从甘蔗栽培种ROC22中同源克隆到1个NIPⅡ类家族成员ScNIP1,其cDNA全长1 016 bp,编码288个氨基酸,属膜定位蛋白。在水稻中过表达ScNIP1基因,显著增强了对稻瘟病菌(Magnaporthe grisea)的抗性。该研究揭示了甘蔗NIP基因家族的系统演化、表达谱及抗病功能,为甘蔗抗病育种提供理论依据和潜在的基因资源。

关键词：甘蔗水通道蛋白全基因组分析基因克隆抗病功能

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黑穗病对甘蔗根际微生态的影响及其拮抗细菌的筛选

黑穗病对甘蔗根际微生态的影响及其拮抗细菌的筛选

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中国植物病理学会2023年学术年会

作者：张靖曹月刘俊鸿杨靖涛阙友雄尤垂淮罗俊福建农林大学国家甘蔗工程技术研究中心农业农村部福建甘蔗生物学与遗传育种重点实验室福建农林大学生命科学学院

黑穗病是甘蔗生产上最主要的真菌病害之一,能造成蔗茎产量严重损失、糖分降低和品质变劣。目前,响应甘蔗黑穗病菌(Sporisorium scitamineum)胁迫的根际土壤微生态变化的研究鲜见报道。本研究利用高通量测序对新植和宿根一年种植的健康... 详细信息

黑穗病是甘蔗生产上最主要的真菌病害之一,能造成蔗茎产量严重损失、糖分降低和品质变劣。目前,响应甘蔗黑穗病菌(Sporisorium scitamineum)胁迫的根际土壤微生态变化的研究鲜见报道。本研究利用高通量测序对新植和宿根一年种植的健康蔗株和发病蔗株的根际土壤微生物群落结构和功能多样性进行比较,并利用稀释平板法等分离、筛选和验证拮抗黑穗病菌的细菌。结果显示,健康蔗株与发病蔗株的β-多样性具有显著差异,蔗株发病后显著富集了功能菌属Pedomicrobium、Alkaliphilus和有害菌属Candida、Thanatephorus。其中,Sproisorium是富集于宿根季发病蔗株中最显著的关键致病真菌菌属。基于微生物功能预测,发现与病害胁迫密切相关的精氨酸和脯氨酸代谢通路在发病后积极响应。此外,本研究共分离到18株拮抗细菌,综合防效最佳的为洋葱伯克霍尔德氏菌(Burkholderia cepacia) RH33,其不仅对甘蔗黑穗病菌、叶枯病菌和白条病菌有抑制作用,还能促进苗期甘蔗的生长。总的来说,黑穗病对甘蔗根际微生物群落结构有影响,进一步研究可培养微生物的生防功能,有助于提供甘蔗黑穗病高效防治的方法。

关键词：甘蔗黑穗病根际微生态高通量测序拮抗细菌生物防治

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