检索结果-内蒙古大学图书馆

南方农业学报 2025年第2期56卷 520-532页

作者：李晓斐冯军仁陈鹏甄伟玲郭爱王玉凤赖钟雄陈斌张掖市林业科学研究院甘肃张掖734000 福建农林大学园艺植物生物工程研究所福建福州350002

【目的】分析甘肃梨种质资源表型性状的遗传多样性,并筛选出优质资源,为甘肃梨种质资源的评价与利用提供理论依据。【方法】以53份甘肃梨种质资源为研究对象,对其29个表型性状(17个质量性状和12个数量性状)进行观测,通过遗传变异分析、... 详细信息

【目的】分析甘肃梨种质资源表型性状的遗传多样性,并筛选出优质资源,为甘肃梨种质资源的评价与利用提供理论依据。【方法】以53份甘肃梨种质资源为研究对象,对其29个表型性状(17个质量性状和12个数量性状)进行观测,通过遗传变异分析、多样性分析、相关分析、主成分分析、聚类分析对甘肃梨种质资源进行遗传多样性分析。最后,利用主成分分析及隶属函数法对甘肃省地方梨种质资源表型性状进行综合评价。【结果】53份甘肃梨种质资源遗传多样性丰富,数量性状的变异系数为4.63%~23.94%,其中,一年生枝长度的变异系数最大,为23.94%,柱头数变异系数最小,为4.63%。数量性状中,节间长度的Simpson指数(D)和Shannon-Wiener指数(H´)最高,分别为0.9857和4.099;质量性状中花蕾颜色和芽托大小的D最高,均为0.9900,皮孔数量的H´最高,为4.204。相关分析结果显示,除花蕾颜色、花瓣形状和叶尖形状与其他性状不存在相关性,其余性状间均存在一定的相关性,其中呈极显著(P<0.01)和显著(P<0.05)相关的性状分别有28对和25对。主成分分析结果显示,前5个主成分的累计贡献率达76.331%,花芽粗度和花冠直径等是影响梨表型的主要性状。综合评价结果显示,武威猪头梨、武都鸡腿梨、甘谷麻化心梨为综合表现优良的地方种质资源。聚类分析结果显示,53份梨种质源划分为六大类,各类群的表型性状表现相对一致,其中第Ⅰ类群的一年生枝长度和一年生枝粗度最大,第Ⅱ类群树姿为下垂型,第Ⅵ类群花药含紫红色。【结论】甘肃梨种质资源表型性状遗传多样性丰富,种质间亲缘关系与其原产地来源无必然联系,筛选出综合表现优良的地方品种资源可用于梨种质创新和新品种选育。

关键词：梨表型性状遗传多样性综合评价甘肃

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龙眼DlAGO7基因克隆与亚细胞定位及表达分析

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分子植物育种 2025年第2期23卷 380-386页

作者：陈荣珠王小平林美珍赖钟雄漳州卫生职业学院药学院漳州363000 福建农林大学园艺植物生物工程研究所福州350002

Argonaute7(AGO7)在植物叶和花发育过程中发挥着重要的调控作用,而AGO7蛋白如何参与调控龙眼体胚的发育却未见报道。为了深入研究龙眼AGO7基因的功能与调控作用,本研究基于龙眼基因组数据库,采用RT-PCR法克隆龙眼DlAGO7基因,对其进行生... 详细信息

Argonaute7(AGO7)在植物叶和花发育过程中发挥着重要的调控作用,而AGO7蛋白如何参与调控龙眼体胚的发育却未见报道。为了深入研究龙眼AGO7基因的功能与调控作用,本研究基于龙眼基因组数据库,采用RT-PCR法克隆龙眼DlAGO7基因,对其进行生物信息学分析,构建瞬时融合表达载体,明确其亚细胞定位,最后,利用实时荧光定量仪检测其在龙眼体胚不同阶段的相对表达情况。克隆获得DlAGO7的CDS序列为3060 bp,编码1019个氨基酸;所编码氨基酸序列含有PAZ和Piwi高度保守结构域;blastp序列比对分析表明,DlAGO7蛋白与其他植物的AGO7蛋白具有高度同源性;系统进化发育树分析显示,DlAGO7蛋白与甜橙AGO7蛋白亲缘关系最近,与单子叶植物玉米和水稻的亲缘关系最远;由亚细胞定位研究可知,龙眼DlAGO7基因为核定位基因;RT-qPCR分析表明,DlAGO7在龙眼球形胚阶段显著表达;克隆获得DlAGO7基因的5′端上游启动子序列长度为1746 bp,启动子分析共预测出9类顺式作用元件。由此推测,DlAGO7基因可能在龙眼球形胚阶段发挥着重要的调控作用,该基因主要在细胞核中发挥作用。以上研究结果可为龙眼的分子育种提供理论基础。

关键词：龙眼体胚发生 AGO7基因启动子序列亚细胞定位

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辣椒COMT转录因子家族成员全基因组鉴定与分析

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园艺与种苗 2025年第3期45卷 15-17,23页

作者：林婉盈廖万兰王晓乔英豪刘生财福建农林大学园艺植物生物工程研究所福建福州350002

[目的]鉴定辣椒COMT基因家族成员,探究其对辣椒盐胁迫的响应,为辣椒抗逆高产育种提供帮助。[方法]基于拟南芥COMT基因筛选辣椒COMT基因家族,并利用生物信息学方法对辣椒COMT基因家族进行基因染色体定位、重命名、蛋白质理化性质分析、... 详细信息

[目的]鉴定辣椒COMT基因家族成员,探究其对辣椒盐胁迫的响应,为辣椒抗逆高产育种提供帮助。[方法]基于拟南芥COMT基因筛选辣椒COMT基因家族,并利用生物信息学方法对辣椒COMT基因家族进行基因染色体定位、重命名、蛋白质理化性质分析、构建系统进化树、保守基序、蛋白结构和基因结构的分析。[结果]从辣椒基因中鉴定出59个COMT基因家族成员,分别分布于10条染色体上,蛋白质分子质量差异较大,大多数属于稳定蛋白,除一条外均属于两性蛋白。与拟南芥构建进化树后发现辣椒COMT基因家族与拟南芥COMT基因家族亲缘关系较远,可将CaCOMT分为3个亚组,亚组内各成员拥有多数相同的保守基序,基因结构上外显子数量也接近,可见亚组内成员的亲缘关系较近。[结论]该研究为研究CaCOMT基因功能奠定了基础。

关键词：辣椒咖啡酸-O-甲基转移酶(COMT) 生物信息分析盐胁迫表达

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铁皮石斛TCP基因家族鉴定及其在不同色系铁皮石斛中对光照的响应

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江苏农业科学 2025年第6期53卷 48-56页

作者：王培育张春柳李尊文颜沛沛江金兰罗维鸿叶炜三明市农业科学研究院福建沙县365051 福建省(山区)作物遗传改良与创新利用重点实验室福建沙县365051 福建省宁德市农业农村局福建宁德352100 福建农林大学园艺植物生物工程研究所福建福州350002

TCP基因家族是植物中特有的基因家族,利用生物信息学方法对铁皮石斛TCP基因家族进行全基因组鉴定,通过实时荧光定量PCR分析TCP基因家族成员在不同色系铁皮石斛对光照的响应模式。从铁皮石斛中共鉴定获得31个TCP成员。系统发育树将铁皮石... 详细信息

TCP基因家族是植物中特有的基因家族,利用生物信息学方法对铁皮石斛TCP基因家族进行全基因组鉴定,通过实时荧光定量PCR分析TCP基因家族成员在不同色系铁皮石斛对光照的响应模式。从铁皮石斛中共鉴定获得31个TCP成员。系统发育树将铁皮石斛TCP成员分为2类,每个成员均具有TCP基因家族特有的保守结构域。同时,相同亚群内TCP成员之间的保守基序相似性强,不同亚群之间保守基序差异较大。另外,启动子分析发现TCP家族成员中存在大量相同的光响应元件,但也存在特异性的元件,表明不同成员间光响应能力的差异性。转录组分析结果显示,不同色系铁皮石斛之间TCP转录因子成员的功能存在差异,同时同一品种铁皮石斛内不同TCP成员的功能存在差异。实时荧光定量PCR结果表明,在红色和绿色铁皮石斛中均存在特异性和普遍性响应光照强度变化的TCP基因家族成员,并且推测Do10016252和Do10014226这2个TCP成员可能是铁皮石斛变红的关键TCP成员。本研究初步探究了光照强度对TCP基因家族成员的影响,以期为进一步了解光照对TCP成员的作用提供参考。

关键词：铁皮石斛基因家族不同色系光照条件

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外源物质和光质对铁皮石斛生理效应的影响

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东南园艺 2025年第1期13卷 48-56页

作者：温思琦王晓恩王河川余宇潇谢帆刘建福吴新泉华侨大学园艺科学与工程研究所福建厦门361021 福建农林大学金山学院福建福州350002 泉州市种植业技术站福建泉州362000 泉州市泉丰生物科技有限公司福建泉州362021

【目的】通过外源物质和光质调控铁皮石斛生长发育,从而为提高铁皮石斛品质提供理论依据。【方法】分别以2年生铁皮石斛盆栽苗为试验材料,开展叶片喷施多效唑、水杨酸和钼酸钠溶液,以及照射红光、蓝光、绿光和白光处理;分析铁皮石斛中... 详细信息

【目的】通过外源物质和光质调控铁皮石斛生长发育,从而为提高铁皮石斛品质提供理论依据。【方法】分别以2年生铁皮石斛盆栽苗为试验材料,开展叶片喷施多效唑、水杨酸和钼酸钠溶液,以及照射红光、蓝光、绿光和白光处理;分析铁皮石斛中的叶绿素含量、抗氧化酶活性和活性成分含量。【结果】在外源物质的处理中,500mg/L多效唑、0.3mg/L水杨酸和300mg/L钼酸钠处理后30d,铁皮石斛中类黄酮、生物碱、多糖等次生代谢产物水平呈升高趋势。在光质的处理中,使用红光处理铁皮石斛后第30d最有利于提高叶片的叶绿素和多糖含量,使用蓝光处理铁皮石斛后第30 d最有利于促进SOD和POD活性,提高类黄酮和生物碱含量。【结论】外源物质和光质通过多种途径协同调控铁皮石斛生长,促进铁皮石斛活性成分累积,提高铁皮石斛品质。

关键词：铁皮石斛多糖水杨酸钼酸钠光质次生代谢产物活性成分

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香蕉miR408b靶基因Chemocyanin的克隆及其在低温胁迫下的表达分析

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果树学报 2020年第1期37卷 29-39页

作者：刘彦英倪珊珊项蕾蕾孙雪丽陈裕坤赖钟雄福建农林大学园艺植物生物工程研究所

【目的】研究香蕉中miR408b及其靶基因Chemocyanin在低温胁迫下的表达模式和调控机制。【方法】以三明野生蕉和‘天宝蕉’叶片为材料,利用RT-PCR和RACE技术克隆获得三明野生蕉中的MiChemocyanin基因(MiCHY)和‘天宝蕉’中的MaChemocyani... 详细信息

【目的】研究香蕉中miR408b及其靶基因Chemocyanin在低温胁迫下的表达模式和调控机制。【方法】以三明野生蕉和‘天宝蕉’叶片为材料,利用RT-PCR和RACE技术克隆获得三明野生蕉中的MiChemocyanin基因(MiCHY)和‘天宝蕉’中的MaChemocyanin基因(MaCHY),利用在线网站对MiCHY进行生物信息学分析。【结果】MiCHY基因的cDNA全长为587 bp,开放阅读框381 bp,编码126个氨基酸蛋白,具有Plantacyanin结构域,属于超铜氧化还原蛋白家族。在ORF区的4~24 bp处有一处高度匹配miR408b的结合区(GCTCAGGGAAGGGGCAGTGCG)。RLM-5’RACE分析表明,miR408b主要在靶序列的第7~8个碱基之间剪切靶基因MiCHY的mRNA。序列比对发现,MaCHY基因比MiCHY基因多了82 bp的序列,符合内含子的GT-AG剪切,推测发生了内含子驻留的可变剪接。保守结构域分析表明MaCHY没有Plantacyanin结构域,但也属于铜氧化还原蛋白家族。qRT-PCR结果表明,低温胁迫下,冷敏感的‘天宝蕉’miR408b的表达量上升,MaCHY的表达量降低;在抗寒的三明野生蕉中,miR408b的表达量下降,MiCHY表达量上升,miR408b与MiCHY表达量呈负相关。【结论】miR408b及其靶基因MiCHY可能在香蕉响应低温胁迫中发挥重要作用。

关键词：香蕉 miR408b Chemocyanin基因低温胁迫表达分析

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龙眼胚性愈伤组织DlCK2-α基因克隆、亚细胞定位及其表达特性分析

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果树学报 2019年第12期36卷 1638-1647页

作者：李珊珊徐小萍陈旭陈晓慧李汉生林玉玲赖钟雄福建农林大学园艺植物生物工程研究所

【目的】克隆龙眼DlCK2-α基因,并对其表达特性进行分析。【方法】该试验通过RACE技术对DlCK2-α进行克隆,并在此基础上进行生物信息学分析和亚细胞定位以及蛋白质结构和功能的预测。对调控DlCK2-α的miRNA及顺式作用元件进行预测,并进... 详细信息

【目的】克隆龙眼DlCK2-α基因,并对其表达特性进行分析。【方法】该试验通过RACE技术对DlCK2-α进行克隆,并在此基础上进行生物信息学分析和亚细胞定位以及蛋白质结构和功能的预测。对调控DlCK2-α的miRNA及顺式作用元件进行预测,并进行亚细胞定位观察。采用QRT-PCR技术对其在龙眼体胚不同阶段胚性培养物和不同光质的表达特性进行研究。【结果】DlCK2-α基因含有开放阅读框1002 bp,共编码333个氨基酸(GenBank登录号:MG181952);DlCK2-α属亲水性蛋白,不含有信号肽和跨膜结构域,但是含有一个典型的STKc_CK2_alpha保守结构域,预测含有32个磷酸化位点;miRNA预测结果显示,共有miR2615a等10条miRNA可能调控DlCK2-α;顺式作用元件预测显示多个光响应与应激响应元件可能调控DlCK2-α;GFP荧光定位观察显示其定位于细胞质。QRT-PCR结果显示,DlCK2-α在黑暗条件下的表达量高于光处理下的表达量。在体胚不同发育阶段,DlCK2-α在不完全胚性紧实结构中的表达量最低,球形胚中表达量最高,整体呈先降后升趋势。【结论】DlCK2-α基因在龙眼光信号转导和体胚发育调控中发挥重要作用。

关键词：龙眼酪蛋白激酶基因克隆亚细胞定位 QRT-PCR

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西番莲TeMV和CMV双重RT-PCR检测体系的建立及应用

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果树学报 2019年第7期36卷 947-953页

作者：焦楠朱宁程春振林玉玲李汉生陈发兴赖钟雄福建农林大学园艺植物生物工程研究所

【目的】建立西番莲夜来香花叶病毒(Telosma mosaic virus, TeMV)和黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)的双重RT-PCR检测体系。【方法】根据TeMV和CMV的外壳蛋白(coat protein, CP)基因序列,分别设计两对特异性引物,并对引物组合... 详细信息

【目的】建立西番莲夜来香花叶病毒(Telosma mosaic virus, TeMV)和黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)的双重RT-PCR检测体系。【方法】根据TeMV和CMV的外壳蛋白(coat protein, CP)基因序列,分别设计两对特异性引物,并对引物组合浓度、退火温度和循环次数进行优化。【结果】优化结果显示:TeMV和CMV最佳引物组合浓度分别为2.0 mmol·L^-1和8.0 mmol·L^-1;最佳退火温度为57 ℃;最佳循环次数为35次。【结论】灵敏度分析结果显示,在样品cDNA原液稀释到10^-5时,仍能检测到两种病毒扩增出的目的条带。同时,以健康组培苗作为对照组,应用建立的双重RT-PCR检测技术对采集于福建省不同产地的36份西番莲样品进行了病毒检测,发现有8 份样品同时感染两种病毒,8份样品仅感染TeMV,10份样品仅感染CMV。本研究可为西番莲TeMV和CMV的检测提供便利。

关键词：西番莲夜来香花叶病毒黄瓜花叶病毒病毒检测双重RT-PCR技术

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龙眼漆酶家族成员全基因组结构与功能分析

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应用与环境生物学报 2018年第4期24卷 833-844页

作者：徐小萍陈晓慧吕科良陈旭陈裕坤林玉玲赖钟雄福建农林大学园艺植物生物工程研究所

为了解龙眼漆酶（DlLAC）家族的生物学功能,采用生物信息学分析方法进行龙眼基因组LAC基因成员鉴定,蛋白结构域及特性、启动子顺式作用元件、分子进化树分析、体胚发生过程和组织器官特异表达的FPKM分析以及可能互作的mi RNA预测.结果... 详细信息

为了解龙眼漆酶（DlLAC）家族的生物学功能,采用生物信息学分析方法进行龙眼基因组LAC基因成员鉴定,蛋白结构域及特性、启动子顺式作用元件、分子进化树分析、体胚发生过程和组织器官特异表达的FPKM分析以及可能互作的mi RNA预测.结果显示：DlLAC家族基因包含42个基因成员,分为7大类;基因家族成员内含子数量1-8个不等,以5个为主,其中DlLAC15-1中存在600 bp短串联重复序列;DlLAC蛋白结构域共存在5种类型,均属于铜蓝蛋白,以3个铜蓝氧化酶结构域为主;DlLAC蛋白均为分泌型蛋白,亚细胞定位预测在胞外,包含2个以上糖基化位点,具有多个保守的motif;5端调控序列预测分析,DlLAC可能具有多个转录起始位点;DlLACp启动子序列均包含大量非生物胁迫应激响应元件、胚乳特异表达元件及MYB结合位点,推测MYB可能通过DlLAC进而调控龙眼胚胎发育.DlLAC9-1p、DlLAC12p、DlLAC17-2p含黄酮类化合物合成调控的MYB结合位点,可能参与龙眼生长发育过程中种子成熟和果皮成色的色素合成途径;DlLAC家族成员可能参与不同体胚发育过程和不同组织器官形态建成.42个龙眼漆酶成员共有28个受miRNA调控,13个成员受miR397调控,可能与木质素合成相关,8个成员受miR1535调控.非miR397调控的成员可能发挥其他重要的生物学功能.本研究表明,DlLAC家族成员在龙眼生长发育过程中除了参与木质素合成以外,还可能参与胚胎发育、胚乳发育、色素合成、组织器官特异表达等重要生物学功能,表现其功能上的多样性.

关键词：龙眼漆酶家族成员鉴定功能分析 miRNA预测

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龙眼SPL基因家族全基因组鉴定及表达分析

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中国农业科学 2020年第20期53卷 4259-4270页

作者：路保顺朱永静张舒婷吕煜梦李晓斐宋雨洋赖钟雄林玉玲福建农林大学园艺植物生物工程研究所

【目的】鉴定龙眼SPL(DlSPL)基因家族所有成员,并对其成员进行表达分析,为探究SPL在龙眼生长发育中的功能研究提供参考。【方法】采用生物信息学方法对龙眼SPL基因家族成员进行鉴定,并对其基本理化性质、基因结构、系统进化关系、启动... 详细信息

【目的】鉴定龙眼SPL(DlSPL)基因家族所有成员,并对其成员进行表达分析,为探究SPL在龙眼生长发育中的功能研究提供参考。【方法】采用生物信息学方法对龙眼SPL基因家族成员进行鉴定,并对其基本理化性质、基因结构、系统进化关系、启动子顺式作用元件、FPKM值进行分析;利用qRT-PCR技术检测其在非胚性愈伤组织(nonembryonic callus,NEC)、胚性培养物及不同激素处理下的胚性愈伤组织(embryonic callus,EC)中的表达情况。【结果】DlSPL基因家族共有14个成员,其基因结构和蛋白结构均高度保守且只有一个SBP结构域,DlSPL启动子存在大量的光反应元件、组织特异性调控元件、激素应答元件、胁迫响应元件和植物生长发育有关的顺式调控元件。RNA-seq表达量分析(FPKM值)表明,11个DlSPL成员在不同光质处理的EC中表达,只有DlSPL8在蓝光和白光处理下的EC中呈下调表达趋势;11个DlSPL成员在激素2,4-D和KT中表达,其中DlSPL3和DlSPL13在2,4-D和激动素(kinetin,KT)共同处理下的表达量高于2,4-D和KT分开处理;有13个DlSPL成员在非胚性及胚性培养物中表达,其中7个成员在NEC阶段表达量最高。qRT-PCR结果表明,在不同胚性培养物中,DlSPL1和DlSPL14在EC阶段表达最高,DlSPL5、DlSPL7和DlSPL13在不完全胚性紧实结构(incomplete embryonic compact structure,ICpEC)阶段表达量最高;DlSPL1、DlSPL5、DlSPL7和DlSPL13成员响应脱落酸(abscisic acid,ABA)信号并显著下调;DlSPL5响应茉莉酸甲酯(methyl jasmonate,MeJA)信号且呈上调表达趋势,其他3个成员呈下调表达趋势。【结论】共鉴定出龙眼SPL基因家族成员14个,均含有一个高度保守的SBP结构域;DlSPL可能参与龙眼体胚的形态建成,并响应ABA和MeJA的应答。

关键词：龙眼 SPL 全基因组鉴定表达分析

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