检索结果-内蒙古大学图书馆

园艺学报 2024年第7期51卷 1695-1706页

作者：赵泽阳周雨晴林德书任慧波福建农林大学生命科学学院福州350002 福建农林大学海峡联合研究院基础林学与蛋白质组学研究中心福州350002

大多数被子植物花瓣近轴面的锥形表皮细胞可以通过影响花瓣的光吸收、光反射和疏水性使花拥有并保持对授粉昆虫的吸引力,还可以通过为授粉昆虫与花的接触提供“扶手”而提高授粉率。由于其重要的生物学功能和独特的形态,花瓣锥形表皮细... 详细信息

大多数被子植物花瓣近轴面的锥形表皮细胞可以通过影响花瓣的光吸收、光反射和疏水性使花拥有并保持对授粉昆虫的吸引力,还可以通过为授粉昆虫与花的接触提供“扶手”而提高授粉率。由于其重要的生物学功能和独特的形态,花瓣锥形表皮细胞被用作模式系统进行细胞形态建成调控机制的研究。本文中对花瓣锥形表皮细胞形态表型的分析方法进行说明,阐述MYB转录因子、TCP转录因子、锌指转录因子、生长素、周质微管的定向排列等在花瓣锥形表皮细胞形态建成中的作用和可能的调控机制,以期为园艺植物的遗传改良提供理论参考。

关键词：花瓣锥形表皮细胞转录因子生长素周质微管

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PhJAZ1蛋白对毛竹中抗虫相关代谢物和SPL家族基因的影响

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福建农林大学学报（自然科学版） 2022年第4期51卷 478-485页

作者：黄锦鹏李玉红朱腾飞任慧波苏军福建农林大学海峡联合研究院基础林学与蛋白质组学研究中心福建福州350002

PhJAZ1蛋白是不同类型毛竹叶差异应对害虫取食的核心,然而其分子信号途径的下游,特别是SPL家族,及其对抗虫相关次生代谢物的影响依然未知.本研究先在拟南芥JAZ1缺失性突变体(jaz1)背景下构建了PhJAZ1蛋白的过表达植株(PhJAZ1-OX/jaz1),... 详细信息

PhJAZ1蛋白是不同类型毛竹叶差异应对害虫取食的核心,然而其分子信号途径的下游,特别是SPL家族,及其对抗虫相关次生代谢物的影响依然未知.本研究先在拟南芥JAZ1缺失性突变体(jaz1)背景下构建了PhJAZ1蛋白的过表达植株(PhJAZ1-OX/jaz1),并检测了不同基因型植株中单宁、黄酮及生物碱等次生代谢物质的含量;然后,通过棉铃虫饲喂试验分别测定了取食不同基因型拟南芥叶片对棉铃虫2龄幼虫体重和存活率的影响;同时,通过同源表达的手段(瞬时表达体系),在毛竹幼苗中过表达了PhJAZ1蛋白,并分析了PhJAZ1对下游PhSPL家族基因表达量的影响,及其对次生代谢物含量的影响.结果表明:与携带jaz1的拟南芥植株相比,PhJAZ1-OX/jaz1植株叶片中的单宁和生物碱含量分别减少了40.5%和70.8%(P<0.01);与取食携带jaz1的拟南芥相比,取食PhJAZ1-OX/jaz1拟南芥叶片的棉铃虫2龄幼虫的体重和存活率分别提高了195.8%和36.7%(P<0.01);与野生型毛竹相比,PhJAZ1过表达毛竹中的单宁含量减少了11.7%(P<0.05);此外,毛竹中过表达PhJAZ1能显著上调24个PhSPL家族基因(PhSPL6-2、PhSPL3-3、PhSPL9-1、PhSPL9-2等)的表达.以上结果说明,毛竹中的PhJAZ1能在转录水平上影响多个PhSPL家族基因的表达,进而抑制部分抗虫相关次生代谢物质的积累,最终起到钝化毛竹抗虫性的效果.

关键词：毛竹茉莉酸 JAZ1 SPL 抗虫性

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高通量单细胞转录组数据分析方法的研究进展

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福建农林大学学报（自然科学版） 2022年第2期51卷 145-154页

作者：李涛张泽坤顾连峰福建农林大学林学院福建农林大学海峡联合研究院基础林学与蛋白质组学中心福建福州350002

单细胞转录组测序(scRNA-seq)使研究人员能够在单细胞分辨率下研究基因的表达,了解细胞的动态发育轨迹.然而,单细胞分辨率的基因表达矩阵往往具有高维度和高稀疏性的特点,使后续数据处理面临巨大的挑战.因此,本文综述了scRNA-seq数据分... 详细信息

单细胞转录组测序(scRNA-seq)使研究人员能够在单细胞分辨率下研究基因的表达,了解细胞的动态发育轨迹.然而,单细胞分辨率的基因表达矩阵往往具有高维度和高稀疏性的特点,使后续数据处理面临巨大的挑战.因此,本文综述了scRNA-seq数据分析的一般流程和常用软件,这将有助于研究人员选择更合适的分析软件和流程.

关键词：单细胞转录组测序降噪高通量聚类注释

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花瓣锥形细胞形态建成的机制研究

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分子植物育种 2018年第12期16卷 3899-3906页

作者：余佩杭刘孟红林德书福建农林大学生命科学学院福州350002 福建农林大学海峡联合研究院基础林学与蛋白质组学研究中心福州350002

植物器官表皮具有多种表皮细胞类型,不同的特化细胞行使着各自特定的生理功能。诸如根表皮毛、叶片铺板细胞和表皮毛细胞等细胞类型,因其结构简单、容易观察等优点,已被广泛研究并报道。大多数被子植物花瓣的上表皮含有一种特殊几何结... 详细信息

植物器官表皮具有多种表皮细胞类型,不同的特化细胞行使着各自特定的生理功能。诸如根表皮毛、叶片铺板细胞和表皮毛细胞等细胞类型,因其结构简单、容易观察等优点,已被广泛研究并报道。大多数被子植物花瓣的上表皮含有一种特殊几何结构的细胞-锥形细胞。这类细胞被认为在维持花瓣表面湿度、温度以及光的反射率调节中发挥着一定的作用,同时这种锥形结构利于授粉昆虫的平稳着陆和停留,从而提高授粉率,对于授粉农作物的产量提升具有重要的现实意义。然而,近年对锥形细胞的机制研究相对很少,本评述旨在总结参与锥形细胞形态建成过程的相关研究,包括转录因子、受体激酶以及细胞骨架等,以期为锥形细胞形态建成的研究提供新的思路。

关键词：锥形细胞转录因子受体激酶细胞骨架

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一个假定微管相关蛋白PEMAP1的克隆和亚细胞定位

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分子植物育种 2021年第11期19卷 3598-3604页

作者：刘晓烽林贺陈斌卿党谢林德书福建农林大学林学院福州350002 福建农林大学海峡联合研究院基础林学与蛋白质组学研究中心福州350002

微管骨架通过导向纤维素微纤丝的合成来影响细胞壁的结构,在植物生长发育和细胞形态建成过程中发挥着重要作用。微管相关蛋白(microtubule-associated protein,MAP)参与调节微管蛋白亚基的组装、微管的动态稳定以及周质微管的排列方式... 详细信息

微管骨架通过导向纤维素微纤丝的合成来影响细胞壁的结构,在植物生长发育和细胞形态建成过程中发挥着重要作用。微管相关蛋白(microtubule-associated protein,MAP)参与调节微管蛋白亚基的组装、微管的动态稳定以及周质微管的排列方式。因此,对微管相关蛋白的研究有助于更好地理解微管骨架的生物学功能。本研究克隆了一个在拟南芥花瓣中高表达的假定微管相关蛋白PEMAP1(Petal-expressed microtubuleassociated protein 1),并利用绿色荧光蛋白(GFP)和β-葡糖醛酸酶(GUS)作为报告蛋白对PEMAP1分别进行了亚细胞定位和组织表达模式分析。烟草瞬时表达实验结果表明,pSuper::PEMAP1-GFP能够与微管结合蛋白MBD-RFP共定位,拟南芥中内源启动子驱动的pPEMAP1::PEMAP1-GFP能够与微管株系m CherryTUA5共定位。GUS染色结果表明,PEMAP1启动子驱动的GUS拟南芥转基因株系在下胚轴、花萼和雌蕊的表达较强,在子叶、根部以及花瓣的表达则相对较弱。以上结果说明,PEMAP1很可能作为一个微管相关蛋白参与了拟南芥器官的生长发育与形态建成过程,相关遗传材料的获得为进一步研究PEMAP1的功能提供了工作基础。

关键词：拟南芥(Arabidopsis thaliana) PEMAP1 微管相关蛋白亚细胞定位组织表达模式

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微管结合蛋白IPGA1调控植物细胞形态建成概述

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分子植物育种 2023年

作者：刘敏王晓丹赵泽阳周雨晴林德书柏文婷任慧波福建农林大学生命科学学院福建农林大学海峡联合研究院基础林学与蛋白质组学研究中心福建农林大学农学院

周质微管在植物细胞形态建成和形态维持中发挥了非常重要的作用。在不同植物组织的细胞中，周质微管形成特定的组织形式，从而引导细胞壁中纤维素微纤丝合成和沉积的方向。同时，细胞壁的形成又会影响植物细胞扩张生长的方向。由于细胞... 详细信息

周质微管在植物细胞形态建成和形态维持中发挥了非常重要的作用。在不同植物组织的细胞中，周质微管形成特定的组织形式，从而引导细胞壁中纤维素微纤丝合成和沉积的方向。同时，细胞壁的形成又会影响植物细胞扩张生长的方向。由于细胞受到内外环境的压力处于不断的变化中，周质微管也表现出高度的动态性。研究发现，微管相关蛋白在周质微管的动态变化中起着关键性的作用。本文将对微管结合蛋白IPGA1通过对微管动态和微管组织形式的调控，进而参与拟南芥花瓣远轴表皮细胞和子叶表皮铺板细胞形态建成的研究进行总结。同时，也对机械力刺激下，IPGA1协同其互作蛋白调控周质微管重排的研究进展进行总结。另外，本文还对IPGA1的同源蛋白进行分析，为它们功能的研究提供理论参考。

关键词：拟南芥(Arabidopsis thaliana) IPGA1 周质微管细胞形态机械力

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大小年毛竹叶抗虫相关基因PhSPL17的表达模式

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福建农林大学学报（自然科学版） 2019年第5期48卷 597-604页

作者：李玉红林振清朱腾飞黄志明郭欣苏军福建农林大学海峡联合研究院基础林学与蛋白质组学研究中心福建福州350002 建瓯市林业局福建建瓯353100

研究大小年毛竹叶中PhSPL17基因在年龄和抗虫中的表达模式的变化,初步讨论大小年对毛竹抗虫性影响的分子生态学机制.生物信息学分析表明,毛竹有37个SPL家族蛋白,可细分为4大类,其中,PhSPL17为拟南芥AtSPL9的同源基因,且为毛竹PhmiR156... 详细信息

研究大小年毛竹叶中PhSPL17基因在年龄和抗虫中的表达模式的变化,初步讨论大小年对毛竹抗虫性影响的分子生态学机制.生物信息学分析表明,毛竹有37个SPL家族蛋白,可细分为4大类,其中,PhSPL17为拟南芥AtSPL9的同源基因,且为毛竹PhmiR156的靶基因;通过对不同组织和时间尺度的定量分析得知,PhSPL17在种子、叶部和地下茎中表达量较高,且叶片中的表达量在年龄尺度上随着换叶节律而波动上升;通过外源的激素处理后,发现毛竹PhSPL17的表达量随着细胞分裂素的处理而缓慢上升,而在外源茉莉酸甲酯处理后迅速上升,然后缓慢恢复到正常水平.以上结果表明,PhSPL17在大小年管理措施影响毛竹自身抗虫性的过程中起重要作用.

关键词：毛竹大小年年龄 miRNA156-SPL 茉莉酸途径

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拟南芥胞质磷酸甘油酸激酶(PGKc)对细胞pH稳态平衡的影响

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植物生理学报 2021年第10期57卷 1907-1914页

作者：王晓国龚萍萍厉苏宁陈伟李瑞姿卞江虎王文斐关跃峰福建农林大学生命科学学院福建省海峡植物应用系统生物学重点实验室福州350002 福建农林大学海峡联合研究院园艺植物生物学与代谢组学研究中心福州350002 福建农林大学林学院基础林学与蛋白质组学研究中心福州350002

糖酵解是细胞的主要能量来源,对维持细胞的pH稳态平衡至关重要。然而,尚未清楚糖酵解酶对pH稳态平衡的影响。本研究以拟南芥(Arabidopsis thaiana)胞质磷酸甘油酸激酶(cytosolic phosphoglycerate kinase, PGKc)为研究对象,对PGKc响应外... 详细信息

糖酵解是细胞的主要能量来源,对维持细胞的pH稳态平衡至关重要。然而,尚未清楚糖酵解酶对pH稳态平衡的影响。本研究以拟南芥(Arabidopsis thaiana)胞质磷酸甘油酸激酶(cytosolic phosphoglycerate kinase, PGKc)为研究对象,对PGKc响应外界pH胁迫的机制进行了研究。结果表明:pgkc突变体的根表现出对pH敏感的表型,其表型可被回补。pgkc分泌H+的能力减弱,液泡碱性化,影响了根系细胞的pH稳态平衡。pgkc根中,参与pH生物化学调控机制的主要有机酸含量未受显著影响,保持在稳定的水平。而ATP酶(ATPase)活性,特别是液泡ATP酶(V-ATPase)活性显著降低。说明PGKc主要通过生物物理调控机制来维持细胞pH稳态平衡。综上,本研究揭示了PGKc通过生物物理机制调控细胞pH稳态平衡,为研究植物糖酵解酶调节pH稳态平衡的作用提供基础和新的思路。

关键词：拟南芥胞质磷酸甘油酸激酶(PGKc) 糖酵解 pH稳态平衡液泡ATP酶

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RIC蛋白家族调控植物发育的分子机制研究进展

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分子植物育种 2022年第8期20卷 2637-2644页

作者：吴雪凝刘敏陈勉张勤芳林德书任慧波柏文婷福建农林大学生命科学学院福州350002 福建农林大学农学院福州350002 福建农林大学海峡联合研究院基础林学与蛋白质组学研究中心福州350002

细胞极性建立和形态建成是植物组织器官发育的关键。根毛、花粉管和子叶铺板细胞已成为研究细胞极性建立以及细胞形态建成的模式系统。植物器官中,细胞形态的形成依赖分子开关传递环境或发育信号。植物中特有的一类小G蛋白(rho of plant... 详细信息

细胞极性建立和形态建成是植物组织器官发育的关键。根毛、花粉管和子叶铺板细胞已成为研究细胞极性建立以及细胞形态建成的模式系统。植物器官中,细胞形态的形成依赖分子开关传递环境或发育信号。植物中特有的一类小G蛋白(rho of plant,ROP)在许多细胞过程中起着信号转导的作用,ROP interactive CRIB-containing proteins(RIC)蛋白家族作为ROP下游的效应蛋白,是植物中特有的蛋白家族,参与ROP介导的复杂的信号网络。目前对RIC的研究主要集中在拟南芥中。本研究通过生物信息学方法对RIC蛋白进行α-螺旋、β-折叠、延伸链、无规则卷曲比例和亚细胞定位进行分析,并总结了RIC在根毛、花粉管和子叶铺板细胞形态建成以及植物适应逆境胁迫中所起的作用。本研究是对RIC蛋白家族系统的总结,将为进一步研究RIC的生物学功能网络提供理论参考。

关键词：拟南芥(Arabidopsis thaliana) 微管微丝 RIC ROP

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工业大麻FLA基因家族的全基因组鉴定及生物信息学分析

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分子植物育种 2023年第13期21卷 4247-4255页

作者：黄素云黄小琴刘圆圆福建农林大学林学院福州350028 福建农林大学海峡联合研究院基础林学与蛋白质组学研究中心福州350028 福建农林大学生命科学学院福州350028

类成束阿拉伯半乳糖蛋白(fasciclin-like arabinogalactan proteins,FLAs)是广泛分布于植物体内的一类糖蛋白,在植物的生命活动中扮演重要角色。为更清楚地了解工业大麻FLA基因家族成员,本研究利用生物信息学手段,在全基因组范围内鉴定... 详细信息

类成束阿拉伯半乳糖蛋白(fasciclin-like arabinogalactan proteins,FLAs)是广泛分布于植物体内的一类糖蛋白,在植物的生命活动中扮演重要角色。为更清楚地了解工业大麻FLA基因家族成员,本研究利用生物信息学手段,在全基因组范围内鉴定基因,分析其理化性质、保守基序、基因结构、进化关系、启动子区顺式作用元件预测等。结果表明,在全基因组范围内鉴定到33个FLA基因家族成员,除了3个基因分布在Scaffold上,其余基因不均匀分布在10条染色体上,系统发育树将其分为4组,蛋白氨基酸在159~634个,理论等电点处于4.84~9.81,分子质量为17.16~68.54 kD。基因成员之间结构相似,存在较为保守的基序。该基因家族成员的启动子区还含有多种和植物激素应答、胁迫响应、光响应等生物学过程有关的顺式元件。上述研究结果为工业大麻FLA基因功能的深入研究提供一定的理论基础。

关键词：工业大麻 FLA基因家族生物信息学分析

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