检索结果-内蒙古大学图书馆

江苏农业科学 2021年第21期49卷 187-190页

作者：杨志坚温杭凯刘江洪许明廖素凤福建农林大学作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室福建福州350002 福建农林大学农产品品质研究所福建福州350002

研究金边龙舌兰糖类组分的最佳提取工艺及不同施肥配比对金边龙舌兰糖类组分的影响。利用正交设计筛选最佳的提取工艺为A1B3C3D3(85%乙醇,料液比为1 g∶35 mL,65℃超声提取10 min),利用该最佳提取工艺研究不同施肥配比对金边龙舌兰糖类... 详细信息

研究金边龙舌兰糖类组分的最佳提取工艺及不同施肥配比对金边龙舌兰糖类组分的影响。利用正交设计筛选最佳的提取工艺为A1B3C3D3(85%乙醇,料液比为1 g∶35 mL,65℃超声提取10 min),利用该最佳提取工艺研究不同施肥配比对金边龙舌兰糖类组分含量的影响,结果表明,在N3P3K1(N3=0.18 g/L、P3=0.07 g/L、K1=0.02 g/L)处理下蔗糖及果糖的含量最高,分别达0.66、0.09 mg/mL,葡萄糖则是在N4P3K2(N4=0.23 g/L、P3=0.07 g/L、K2=0.06 g/L)处理下含量最高,达到0.42 mg/mL,而在N3P3K1组合处理下的葡萄糖含量为0.40 mg/mL,与其相差甚小,因此要整体提高金边龙舌兰糖类组分可施用N3P3K1(N3=0.18 g/L、P3=0.07 g/L、K1=0.02 g/L)组合的氮、磷、钾(NPK)配比。

关键词：金边龙舌兰 NPK配施糖类组分提取工艺优化正交试验

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染色质可及性与植物基因表达调控

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植物学报 2021年第6期56卷 664-675页

作者：李占杰秦源福建农林大学农学院作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室福建省海峡植物应用系统生物学重点实验室福州350002 福建农林大学生命科学学院福州350002

真核生物基因组上的核小体呈现不均匀分布,转录活跃区域的染色质结构相对松散且易被调节蛋白结合,这些区域的可接近程度称为染色质可及性。随着测序技术的发展,DNase-seq、ATAC-seq、MNase-seq和NOMe-seq等组学技术的应用,全基因组范围... 详细信息

真核生物基因组上的核小体呈现不均匀分布,转录活跃区域的染色质结构相对松散且易被调节蛋白结合,这些区域的可接近程度称为染色质可及性。随着测序技术的发展,DNase-seq、ATAC-seq、MNase-seq和NOMe-seq等组学技术的应用,全基因组范围内染色质可及性检测变得简便且高效。该文主要介绍了真核生物染色质可及性的4种基本检测方法的技术原理,总结了核小体定位、组蛋白修饰以及转录因子结合与染色质可及性的关系,并综述了染色质可及性参与植物生长发育和环境响应研究进展,以期为植物领域全基因组水平染色质可及性研究、顺式调控元件挖掘及发育和环境响应过程中基因表达调控网络的解析提供借鉴。

关键词：染色质可及性组蛋白修饰 DNase-seq ATAC-seq 调控元件

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烟秆与木屑配方生物质燃料在烟叶烘烤中的应用

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福建农林大学学报（自然科学版） 2021年第1期50卷 10-15页

作者：邱志丹连宇昌卢雨王鑫林梅桂林清通余浩古力张重义福建省烟草公司龙岩市公司福建龙岩364030 福建农林大学烟草研究所福建农林大学遗传育种与综合利用教育部重点实验室福建福州350002

以木屑生物质颗粒燃料为对照,对不同配比烟秆和木屑生物质燃料的燃烧特性、烘烤过程温度拟合度以及能耗等方面进行比较分析.结果表明,烟秆与木屑配方生物质燃料在烟叶烘烤中具有一定应用可行性,最佳配比为15%烟秆+85%木屑,其低位热值为1... 详细信息

以木屑生物质颗粒燃料为对照,对不同配比烟秆和木屑生物质燃料的燃烧特性、烘烤过程温度拟合度以及能耗等方面进行比较分析.结果表明,烟秆与木屑配方生物质燃料在烟叶烘烤中具有一定应用可行性,最佳配比为15%烟秆+85%木屑,其低位热值为16731.25 J·g^(-1),烘烤过程中与目标温度的拟合度较高,能够满足烟叶烘烤需求.

关键词：烟秆生物质燃料燃烧特性烟叶烘烤

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甘蔗ScNRAMP基因家族的鉴定与生物信息学分析

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广西植物 2022年第11期42卷 1865-1874页

作者：刘营尹泽江姚兰周定港湖南科技大学生命科学学院湖南湘潭411201 经济作物遗传改良与综合利用湖南省重点实验室湖南湘潭411201 福建农林大学农业农村部福建甘蔗生物学与遗传育种重点实验室福州350002

NRAMP蛋白(natural resistance-associated macrophage proteins)家族在植物响应重金属胁迫时具有重要作用,能够转运Fe^(2+)、Mn^(2+)、Zn^(2+)和Cd^(2+)等重金属离子。为探究甘蔗ScNRAMP基因家族的特征,该文基于甘蔗割手密基因组鉴定了ScNRAMP基因家族,并进行了理化特性、基因结构、顺式作用元件、保守基序、结构域和进化关系等分析。结果表明:甘蔗ScNRAMP基因家族含有29个成员,不均匀分布在19条染色体上;编码蛋白均为不稳定蛋白,无信号肽,亚细胞均定位在质膜上;各成员保守基序有6~10个不等,跨膜数有6~12个不等,二级结构主要构成元件为α-螺旋和无规则卷曲;顺式作用元件分析表明甘蔗ScNRAMP基因家族可能通过激素代谢参与逆境胁迫和生长发育等生物过程;利用割手密的RNA-seq转录组表达数据进行的组织特异性分析发现,ScNRAMP在甘蔗不同发育阶段的叶和茎中具有时空表达特性;进化树分析将甘蔗ScNRAMP家族成员分为3个亚家族(I、Ⅱ和Ⅲ)。该研究在全基因组水平上系统地鉴定了现代栽培甘蔗祖先种之一割手密NRAMP基因家族,为进一步了解甘蔗NRAMP基因家族提供了基础,也为后续甘蔗重金属研究提供了重要候选基因。

关键词：甘蔗割手密 ScNRAMP 基因家族重金属胁迫

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黄麻应用核心种质的DNA分子身份证构建

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作物学报 2021年第1期47卷 80-93页

作者：郭艳春张力岚陈思远祁建民方平平陶爱芬张列梅张立武福建农林大学农学院作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室/福建省作物设计育种重点实验室福建福州350002 福建农林大学农业农村部东南黄红麻实验观测站/福建省麻类种质资源共享平台/福建省南方经济作物遗传育种与多用途开发国际科技合作基地福建福州350002 福建农林大学海峡联合研究院基因组与生物技术中心福建福州350002

构建并研究黄麻应用核心种质是促进黄麻遗传育种和挖掘优异基因的必要途径。在300份黄麻种质资源的农艺性状观察统计基础上,构建了黄麻应用核心种质,包含61份品种(系),可划分为高产、优质、抗病等16种应用类型。为准确鉴定这61份应用核... 详细信息

构建并研究黄麻应用核心种质是促进黄麻遗传育种和挖掘优异基因的必要途径。在300份黄麻种质资源的农艺性状观察统计基础上,构建了黄麻应用核心种质,包含61份品种(系),可划分为高产、优质、抗病等16种应用类型。为准确鉴定这61份应用核心种质,以46对核心引物为基础,筛选出12对荧光核心引物,采用荧光标记毛细管电泳分析这12对引物的多态性,共检测出140个多态性位点。将毛细管电泳得到的分子量数据以数字+英文字母方式编码,选取了12对荧光核心引物的组合,构建出该应用核心种质的字符串DNA分子身份证,进而构建了相应的条形码和二维码DNA分子身份证,可迅速被电子设备识别。这些结果可促进黄麻种质资源的高效利用及快速分子鉴定。

关键词：黄麻应用核心种质 SSR 荧光分子标记 DNA分子身份证

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主要麻类作物基因组学与遗传改良:现状与展望

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作物学报 2021年第6期47卷 997-1019页

作者：徐益张力岚祁建民张列梅张立武福建农林大学农学院/作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室/福建省作物设计育种重点实验室福建福州350002 福建农林大学农业农村部东南黄红麻实验观测站/福建省麻类种质资源共享平台/福建省南方经济作物遗传育种与多用途开发国际科技合作基地福建福州350002 福建农林大学海峡联合研究院基因组与生物技术中心福建福州350002

随着测序技术的发展,主要麻类作物(黄麻、红麻、苎麻、亚麻和工业大麻)参考基因组从2011年至2020年陆续完成测序,这标志着麻类作物科学已经进入基因组时代。文章首先详细概述主要麻类作物基因组测序。其次,评述了基于基因组学的麻类作... 详细信息

随着测序技术的发展,主要麻类作物(黄麻、红麻、苎麻、亚麻和工业大麻)参考基因组从2011年至2020年陆续完成测序,这标志着麻类作物科学已经进入基因组时代。文章首先详细概述主要麻类作物基因组测序。其次,评述了基于基因组学的麻类作物重要应用价值基因挖掘。基于参考基因组和转录组测序,大量关于纤维发育、响应非生物胁迫的候选基因被挖掘,以促进麻类作物纤维的物种特性和“不与粮食争好地”的逆境农业。同时不同麻类作物特异性状候选基因陆续被报道,如红麻雄性不育、亚麻种子含油量和大麻大麻素相关候选基因等。再次,麻类作物基因组测序完成为基于组学的麻类作物遗传改良提供可能:有助于麻类作物种质资源形成和演化机制研究,系统解析纤维产量、纤维品质、抗病耐逆等农艺性状形成的分子基础;有助于建立高通量基因型-表型数据库,挖掘优异基因资源与创制新种质;有助于创新并集成分子标记辅助选择、基因组选择、转基因等技术,建立高效的快速育种技术体系。宜选育高产高效、抗逆抗病、适宜轻简化机械化、优质专用的多用途麻类作物新品种,以满足麻类作物相关产业的市场需求,适应麻类作物生产方式。尽管已经获得重要基因以及位点的信息,但如何高效率利用已有基因资源对麻类作物进行遗传改良仍需面临一系列挑战,如成熟稳定的遗传转化体系、麻类作物基因编辑体系构建及基因组选择育种等。

关键词：主要麻类作物基因组基因遗传改良

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甘薯基因组R2R3-MYB转录因子鉴定与分析

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分子植物育种 2021年第21期19卷 7000-7011页

作者：黄小芳毕楚韵黄碧芳许明杨志坚林世强陈选阳福建农林大学作物生物技术福建省高校重点实验室福州350002 福建农林大学农学院福州350002 福建农林大学生命科学学院福州350002 福建农林大学作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室福州350002

MYB是植物中数量众多且功能重要的转录因子家族。本研究通过生物信息学方法从未经注释的甘薯全基因组序列中筛选鉴定出MYB家族基因,分析了R2R3-MYB类基因的结构与功能。结果发现,甘薯基因组中含有R2R3-MYB转录因子基因88个,均含有完整... 详细信息

MYB是植物中数量众多且功能重要的转录因子家族。本研究通过生物信息学方法从未经注释的甘薯全基因组序列中筛选鉴定出MYB家族基因,分析了R2R3-MYB类基因的结构与功能。结果发现,甘薯基因组中含有R2R3-MYB转录因子基因88个,均含有完整的R2、R3保守结构域,且R2、R3保守结构域中分别含有8个和9个高度保守的碱性氨基酸。MEME分析结果表明,甘薯R2R3-MYB蛋白序列中含有10个保守基序,其中80%以上的R2R3-MYB序列中含有motif 1、motif 2、motif 3、motif 4、motif 5以及motif 7;利用circos软件定位R2R3-MYB序列在染色体上的分布情况,发现甘薯88个R2R3-MYB基因不均匀分布在15条染色体上,其中5号染色体上数量最多,达15个,4号和13号数量最少,仅2个,经序列比对分析,发现它们在染色体内和染色体间均存在复制关系,其中存在于染色体间潜在复制关系的基因有6对,染色体内有20对,且这20个基因对中有19对在染色体上成簇状分布。经序列功能预测与归类,有44个R2R3-MYB转录因子基因可归入拟南芥R2R3-MYB基因分类的13个亚组中,分别参与响应生物与非生物胁迫、花青素合成、花药发育等途径。进一步分析发现,甘薯中有36个R2R3-MYB转录因子基因可能在响应生物和非生物胁迫上发挥重要功能,其中9个基因在尖孢镰刀菌(Fusarium oxysporum ***,Fob)胁迫下表达量出现明显上调/下调变化,27个在低温胁迫下表达量出现明显上调/下调变化。甘薯R2R3-MYB转录因子结构域高度保守,R2和R3结构域中均含有较高的保守基序;进化树及转录组测序分析显示部分基因可能参与植物生长发育、代谢调控以及生物与非生物胁迫等途径,可为甘薯抗性育种提供参考。

关键词：甘薯 R2R3-MYB 转录因子生物信息学

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多胺代谢介导蓝光调控金针菇生长发育的分子机理

多胺代谢介导蓝光调控金针菇生长发育的分子机理

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中国菌物学会2024年学术年会

作者：陶永新李建杨亚永徐欣宇宋寒冰谢宝贵福建农林大学园艺学院作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室福建农林大学生命科学学院菌物研究中心农业农村部国家食用菌品种改良中心福建分中心

光照是地球上最重要的环境因子之一,影响几乎所有生物的生长发育。真菌虽然没有光合作用,但光照对大型真菌的形态建成和物质代谢起重要作用,尤以蓝光的作用效果最为显著。本研究以食用菌金针菇作为担子菌代表,系统研究了多胺代谢通路中... 详细信息

光照是地球上最重要的环境因子之一,影响几乎所有生物的生长发育。真菌虽然没有光合作用,但光照对大型真菌的形态建成和物质代谢起重要作用,尤以蓝光的作用效果最为显著。本研究以食用菌金针菇作为担子菌代表,系统研究了多胺代谢通路中的关键基因介导蓝光调控金针菇形态发育和赖氨酸生物合成的分子机理。研究结果显示:蓝光照射显著提高金针菇的整齐度和产量,以及赖氨酸的含量。构建金针菇赖氨酸生物合成通路,发现其通路第七步的酵母氨酸还原酶基因Sr与多胺代谢通路中亚精胺合酶基因Spds形成天然融合基因SpdsSr。经过PCR验证和转录本可变剪切分析,FfSpdsSr在金针菇中有唯一的转录本。进一步进化分析发现:担子菌中均为SpdsSr融合形式,而子囊菌、壶菌和卵菌中Spds和Sr为两个独立分开的基因。对粗糙脉孢菌15个RNA-Seq数据集进行分析,发现粗糙脉孢菌中Nc Spds和Nc Sr具有高度相似的共表达模式。通过遗传转化和酵母单杂交实验证明,蓝光通过光受体WCC调控C2H2转录因子,C2H2转录因子结合融合基因SpdsSr的启动子区直接调控其转录,进而协同调控胞内亚精胺和赖氨酸的生物合成,从而调控金针菇子实体的形成和菌柄伸长。本研究结果构建了"蓝光-光受体-C2H2转录因子-多胺和赖氨酸代谢-生长发育"的真菌光生物调控模型,为合理使用光照提高金针菇产量和品质提供理论依据。

关键词：金针菇形态发育多胺代谢赖氨酸代谢光调控

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果香味金针菇的香气成分鉴定及其代谢调控基因挖掘

果香味金针菇的香气成分鉴定及其代谢调控基因挖掘

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中国菌物学会2024年学术年会

作者：李建钟应丽陶永新福建农林大学园艺学院作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室福建农林大学生命科学学院菌物研究中心农业农村部国家食用菌品种改良中心福建分中心

香气作为影响食用菌观赏价值和食用感官的重要因素之一,是由挥发性次级代谢物决定的基本感官特征,具有高度复杂的特性。实验室前期采集到一株具有"果香味"金针菇(FYX),通过对普通金针菇(JHH)和FYX的RNA-seq和挥发性代谢组分析... 详细信息

香气作为影响食用菌观赏价值和食用感官的重要因素之一,是由挥发性次级代谢物决定的基本感官特征,具有高度复杂的特性。实验室前期采集到一株具有"果香味"金针菇(FYX),通过对普通金针菇(JHH)和FYX的RNA-seq和挥发性代谢组分析,共筛选到1749个DEGs和69种差异VOCs。其中,差异基因显著富集到萜类、氨基酸类、脂肪酸类等挥发性有机化合物合成途径;差异VOCs主要富集在萜类、醇类、醛类等物质合成通路。对RNA-seq和挥发性代谢组联合分析发现倍半萜、三萜生物、脂肪酸合成通路被显著富集,暗示它们可能是FYX呈现特殊气味主要物质。进一步,对相关通路中关键节点基因(v5-203091,v5-212765)进行沉默,结果显示许多差异VOCs含量降低,包括萜类和脂肪酸类等次级代谢物,证明萜类和脂肪酸类是FYX具有"果香味"重要组成物质。此外,还发现细胞色素P450基因(v5-213842)对挥发性代谢物起着全局调控的作用。该研究揭示"果香味"金针菇的香气物质及其生物合成的相关基因,为选育具有特殊香气金针菇或其它食用菌新品种提供分子标靶。

关键词：香气成分代谢调控金针菇萜类脂肪酸

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基于黄麻转录组序列SNP位点的CAPS标记开发与验证

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作物学报 2020年第7期46卷 987-996页

作者：陶爱芬游梓翊徐建堂林荔辉张立武祁建民方平平福建农林大学金山学院福建福州350002 福建农林大学教育部作物遗传育种与综合利用重点实验室/福建省分子设计育种实验室福建福州350002

黄麻CAPS分子标记的开发,可以为黄麻遗传多样性分析、种质资源鉴定和分子标记辅助选择等研究提供有效方法。本试验以黄麻179和爱店野生种为材料,采用IlluminaHiSeq4000测序技术进行转录组测序,对其SNP位点进行分析,设计了与木质素合成基... 详细信息

黄麻CAPS分子标记的开发,可以为黄麻遗传多样性分析、种质资源鉴定和分子标记辅助选择等研究提供有效方法。本试验以黄麻179和爱店野生种为材料,采用IlluminaHiSeq4000测序技术进行转录组测序,对其SNP位点进行分析,设计了与木质素合成基因4CL、COMT及转录因子MYB相兲的SNP引物,在此基础上,应用dCAPS Finder2.0软件开发了CAPS标记,并对其有效性进行了验证。结果表明:(1)组装后的黄麻unigene序列共72,674条,序列总长度为29,705,997 bp,检测到的SNP位点总数为67,567个,平均每440 bp有1个SNP。(2)获得了39对分别与4CL、COMT和MYB相兲的SNP引物,从中筛选获得26对CAPS标记引物,开发成功率为66.7%,其中11对CAPS标记具有多态性,多态性比例为43.2%。(3)开发的CAPS标记能较好地将12份不同类型的黄麻种质区分开来,表明CAPS是适用于黄麻研究的较理想的分子标记方法,为黄麻遗传基础研究提供了可靠工具。

关键词：黄麻转录组 SNP位点 CAPS标记开发

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