检索结果-内蒙古大学图书馆

中国卫生统计 2023年第1期40卷 153-156页

作者：王文杰李康谢宏宇哈尔滨医科大学卫生统计学教研室 150086 浙江大学医学院附属妇产科医院

传统的“bulk”RNA测序通过测量一个细胞群中基因的平均表达水平来描述一个组织的整体状态,掩盖了单个细胞的信号及组织内细胞异质性。单细胞RNA测序(single-cell RNA-sequencing,scRNA-seq)是近年来新兴的检测技术,通过单个细胞的转录... 详细信息

传统的“bulk”RNA测序通过测量一个细胞群中基因的平均表达水平来描述一个组织的整体状态,掩盖了单个细胞的信号及组织内细胞异质性。单细胞RNA测序(single-cell RNA-sequencing,scRNA-seq)是近年来新兴的检测技术,通过单个细胞的转录图谱分析其分子状态[1],在描绘细胞微环境,阐述相关生物学机制,识别新的治疗靶点等方面取得了前所未有的进展[2]。scRNA-seq数据通常由多批次实验数据整合而成,批次效应主要来源于实验数据的获取时间、操作人员、试剂批次、设备及检测技术平台等方面。批次效应可能是高度非线性的,它的存在使得下游分析复杂化,结果难以解释。因此,有效地移除scRNA-seq数据批次效应至关重要。

关键词：批次效应分子状态生物学机制细胞微环境数据整合细胞群校正方法整体状态

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能谱CT深度学习图像重建与迭代重建算法图像质量对比的体模和动物模型研究

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中华放射学杂志 2023年第12期57卷 1361-1367页

作者：姜江陈勇石骁萌陆伟王柏松石博文王雯芳朱兰潘自来张欢上海交通大学医学院附属瑞金医院放射科上海200025 GE医疗(中国)CT影像研究中心上海201203 上海交通大学医学院生物统计学教研室上海200025

目的探讨基于体模和动物模型的深度学习重建算法(TF-GSI)和自适应统计迭代重建算法(ASiR-V)对于能谱CT图像质量的影响。方法使用GE Revolution Apex能谱CT对ACR 464体模和胃癌淋巴结转移小鼠模型(n=16)进行扫描。分别在体模和小鼠的70 ... 详细信息

目的探讨基于体模和动物模型的深度学习重建算法(TF-GSI)和自适应统计迭代重建算法(ASiR-V)对于能谱CT图像质量的影响。方法使用GE Revolution Apex能谱CT对ACR 464体模和胃癌淋巴结转移小鼠模型(n=16)进行扫描。分别在体模和小鼠的70 keV虚拟单能图像上重建TF-GSI和ASiR-V的中、高两档等级图像(TF-GSI-M、TF-GSI-H、ASiR-V50%和ASiR-V100%)。评价体模各组图像骨和丙烯酸的任务传递函数(TTF)、图像噪声功率谱(NPS)以及可检测能力指数(d′)。使用单因素方差分析对比小鼠图像噪声、脑组织和肝脏的信噪比(SNR)和对比噪声比(CNR)。2名医师(A和B)评价TF-GSI-H和ASiR-V100%2种重建算法图像对微小病灶检出的一致性采用Kappa检验。结果体模方面,TF-GSI-H组图像在TTF、NPS和d′的表现均最佳:相较ASiR-V100%,TF-GSI-H组图像骨和丙烯酸的TTF50%分别升高了2.4%和8.9%,TF-GSI-H组图像的NPS peak下降了54.1%,TF-GSI-H相对ASiR-V100%对骨和丙烯酸的检出能力分别提升了52.7%和59.5%。TF-GSI组相较ASiR-V组图像噪声降低,2种组织的SNR和CNR均升高,但各组图像间差异不具有统计学意义(P>0.05)。2名医师对2种重建算法图像评价的一致性良好(A,Kappa=0.875,P<0.001;B,Kappa=0.625,P=0.012)。2种重建算法图像对小鼠微小转移灶的检出方面,TF-GSI组高于ASiR-V组(准确度分别为83.5%、71.9%;灵敏度分别为77.8%、61.2%;特异度分别为85.7%、85.7%)。结论TF-GSI相对ASiR-V可以提高能谱CT虚拟单能图像的空间分辨率,改善图像噪声并具有提高微小病灶检出的潜在价值。

关键词：体层摄影术 X线计算机深度学习迭代重建图像质量

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基于深度学习的胸部X射线图像识别及分类模型研究

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中国卫生统计 2024年第3期41卷 365-369,375页

作者：张晓熙王远涵杨顷落黄雪余红梅武淑琴山西医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室 030000 重大疾病风险评估山西省重点实验室山西医科大学基础医学院数学教研室

目的以深度学习中的卷积神经网络为基础搭建胸部X射线(chest X-ray,CXR)图像分类模型,为肺部疾病提供可靠的辅助诊断技术。方法经KAGGLE数据库收集新冠肺炎、轻度肺部感染、病毒性肺炎及正常的四种胸部X射线图片,按3∶1∶1的比例将数据... 详细信息

目的以深度学习中的卷积神经网络为基础搭建胸部X射线(chest X-ray,CXR)图像分类模型,为肺部疾病提供可靠的辅助诊断技术。方法经KAGGLE数据库收集新冠肺炎、轻度肺部感染、病毒性肺炎及正常的四种胸部X射线图片,按3∶1∶1的比例将数据随机划分成训练集,测试集和验证集;基于卷积神经网络架构搭建CXR图像分类模型,调节超参数对模型进行加强和优化;后通过混淆矩阵、准确率、灵敏度、K折交叉验证结果等指标对模型进行验证及评价。结果本研究模型对肺部影像图片的分类准确率为0.81、灵敏度为0.80、测试集和验证集损失值能够稳定在一个较低的水平。与相同迁移算法的模型相比,在测试数据集上的精确率、准确率、灵敏度、F1分值分别提高了1.7%、1.7%、1.3%、2.9%。结论此模型对于CXR图像的识别和分类的性能更强,可以更有效地应用于肺部疾病的辅助分析和判断。

关键词：肺部疾病模型构建深度学习影像识别

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基于心脑血管疾病发病风险预测的CatBoost算法和贝叶斯网络模型分析

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吉林大学学报（医学版） 2024年第4期50卷 1044-1054页

作者：王爱民王凤琳黄一铭徐雅琪张文婧丛显铸苏维强王素珍高梦瑶李爽孔雨佳石福艳陶恩学山东第二医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室山东潍坊261053 山东第二医科大学基础医学院山东潍坊261053

目的:筛选影响心脑血管疾病发病的主要特征变量,基于排序前10位的特征变量构建心脑血管疾病发病风险贝叶斯网络模型,为心脑血管疾病发病风险预测提供参考。方法:从英国生物样本(UK Biobank)数据库中纳入315896例参与者和相关变量,通过... 详细信息

目的:筛选影响心脑血管疾病发病的主要特征变量,基于排序前10位的特征变量构建心脑血管疾病发病风险贝叶斯网络模型,为心脑血管疾病发病风险预测提供参考。方法:从英国生物样本(UK Biobank)数据库中纳入315896例参与者和相关变量,通过类别型特征提升(CatBoost)算法进行特征选择,将所有参与者按7∶3比例随机分为训练集和测试集,并基于最大最小爬山(MMHC)算法构建贝叶斯网络模型。结果:本研究中人群心脑血管疾病患病率为28.8%。CatBoost算法筛选的排名前10位变量分别为年龄、体质量指数(BMI)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)、总胆固醇(TC)、甘油三酯-葡萄糖(TyG)指数、家族史、载脂蛋白A/B比值、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)、吸烟状态和性别。CatBoost训练集模型受试者工作特征(ROC)曲线下面积(AUC)为0.770,模型准确性为0.764;验证集模型AUC为0.759,模型准确性为0.763。临床效能分析,训练集阈值范围为0.06~0.85,验证集阈值范围为0.09~0.81。心脑血管疾病发病风险贝叶斯网络模型分析,年龄、性别、吸烟状态、家族史、BMI和载脂蛋白A/B比值与心脑血管疾病直接相关,是心脑血管疾病发生的重要风险因素,TyG指数、HDL-C、LDL-C和TC通过影响BMI和载脂蛋白A/B比值间接影响心脑血管疾病的发生风险。结论:控制BMI、载脂蛋白A/B比值和吸烟行为,可以降低心脑血管疾病的发病风险。贝叶斯网络模型可用于预测心脑血管疾病发病风险。

关键词：心脑血管疾病 CatBoost算法贝叶斯网络风险推理

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基于倾向性评分逆概率加权法的脉络膜黑色素瘤患者疗效评价研究

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眼科新进展 2023年第4期43卷 308-312,317页

作者：石丽娟李丽石福艳周希彬吴志鸿潍坊医学院临床医学院眼科学教研室山东省潍坊市261053 解放军总医院第三医学中心眼科医学部北京市100039 潍坊医学院公共卫生学院卫生统计学教研室山东省潍坊市261053

目的在平衡组间基线变量后,评价放射治疗与手术联合放射治疗两种治疗方式对脉络膜黑色素瘤患者的疗效,分析脉络膜黑色素瘤患者的预后影响因素,为脉络膜黑色素瘤的有效诊疗提供参考依据。方法对2000年1月至2019年12月在SEER数据库中登... 详细信息

目的在平衡组间基线变量后,评价放射治疗与手术联合放射治疗两种治疗方式对脉络膜黑色素瘤患者的疗效,分析脉络膜黑色素瘤患者的预后影响因素,为脉络膜黑色素瘤的有效诊疗提供参考依据。方法对2000年1月至2019年12月在SEER数据库中登记的脉络膜黑色素瘤患者进行分析,采用倾向性评分逆概率加权法(IPTW)对放射治疗和手术联合放射治疗两组患者的基线特征进行平衡。结果本研究共筛选脉络膜黑色素瘤患者5547例,其中接受放射治疗者4422例、接受手术联合放射治疗治疗者1125例。在接受放射治疗的4422例患者中,光束辐射(BR)组1155例,放射性植入物(RI)组2608例,放射性同位素(RIT)组659例。Log-rank检验结果显示,逆概率加权前后,放射治疗组患者的预后均高于手术联合放射治疗组(P<0.000 1)。多因素Cox回归分析结果显示,在控制了种族、性别、多灶性、是否为首要恶性肿瘤、婚姻状态、从诊断到治疗的时间、年龄、眼别、诊断确认、放射治疗方法等混杂因素后,与放射治疗组患者相比,手术放射治疗组患者的特异性死亡风险为HR=4.385(95%CI=3.542~5.428)。与年龄<50岁组患者相比,50~<60岁组、60~<70岁组、70~<80岁组、≥80岁组患者的特异性死亡风险分别为HR=3.083(95%CI=0.825~4.238)、HR=4.045(95%CI=2.955~5.532)、HR=4.512(95%CI=3.115~6.529)、HR=6.877(95%CI=4.151~11.398);与恶性肿瘤数为1个组患者相比,肿瘤数为2个组和>2个组患者的特异性死亡风险分别为HR=0.698(95%CI=0.449~2.944)、HR=0.538(95%CI=0.317~0.913);从诊断到治疗的时间超过1个月的患者的风险比为2.732~4.154。Log-rank检验结果表明,IPTW前后BR、RI和RIT三组脉络膜黑色素瘤患者生存曲线间差异无统计学意义(P>0.05)。结论放射治疗的长期疗效优于手术与放射治疗联合治疗;年龄、单病灶、诊断到治疗的时间和治疗方式可增加脉络膜黑色素瘤患者死亡的风险,是影响脉络膜黑色素瘤患者预后的独立影响因素。

关键词：脉络膜黑色素瘤逆概率加权疗效生存分析

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儿童超重肥胖累积效应致血压偏高发生的队列研究

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现代预防医学 2025年第9期52卷 1612-1616页

作者：陶益锋范晖川北医学院公共卫生学院川北医学院公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室川北医学院疾病监测与数智健康治理重点实验室

目的本研究旨在探明儿童超重肥胖累积效应与血压偏高发生之间的关系，为更好预防儿童血压偏高提供依据。方法数据来源2012—2018年开展的“自贡基于学校的心血管代谢风险队列研究”。调查内容包括问卷调查和体格检测。计算“超重肥胖... 详细信息

目的本研究旨在探明儿童超重肥胖累积效应与血压偏高发生之间的关系，为更好预防儿童血压偏高提供依据。方法数据来源2012—2018年开展的“自贡基于学校的心血管代谢风险队列研究”。调查内容包括问卷调查和体格检测。计算“超重肥胖年”指标以评估儿童超重肥胖累积效应。分别采用多变量调整的线性回归和logistic回归模型分析儿童超重肥胖累积效应与血压水平及其变化和血压偏高发生的关系。结果本研究包括基线时未患血压偏高且接受至少四次调查的1 637名儿童，其平均年龄6.43岁，男性占50.00%。平均随访4.57年后，共447名儿童出现血压偏高，其累积发病率为27.31%。随访期间381名儿童出现超重肥胖累积效应（累积超重肥胖年值不为0）。累积超重肥胖年分别与终点收缩压、终点舒张压、终点和基线收缩压差值以及终点和基线舒张压差值呈正相关（β1=0.25, β2=0.19, β3=0.19, β4=0.11,均P<0.05）。此外，累积超重肥胖年（OR=1.05, P<0.001）、累积超重肥胖程度（OR=1.04, P<0.001）以及累积超重肥胖持续时间（OR=1.14, P=0.014）均与儿童血压偏高发生呈正相关。结论儿童超重肥胖的累积效应增加儿童血压偏高的发生风险。对超重肥胖儿童的动态监测和及时干预是防控血压偏高出现的关键。

关键词：儿童超重肥胖血压偏高

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基于真实世界的肿瘤免疫治疗药物PD-1/PD-L1抑制剂使用情况分析

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中国医科大学学报 2023年第9期52卷 769-774页

作者：孙彦顺王陵姜诗瑶杨东刘青于莉莉潍坊医学院公共卫生学院卫生统计学教研室山东潍坊261053 空军军医大学军事预防医学系卫生统计学教研室西安714600 解放军第九六〇医院信息科济南250031

目的分析11种肿瘤免疫治疗药物程序性死亡受体1(PD-1)/程序性死亡受体配体1(PD-L1)抑制剂临床使用情况。方法从某医院医院信息系统与电子病历系统数据库中提取使用11种PD-1/PD-L1抑制剂患者的相关信息,运用描述性统计分析与数据挖掘等方... 详细信息

目的分析11种肿瘤免疫治疗药物程序性死亡受体1(PD-1)/程序性死亡受体配体1(PD-L1)抑制剂临床使用情况。方法从某医院医院信息系统与电子病历系统数据库中提取使用11种PD-1/PD-L1抑制剂患者的相关信息,运用描述性统计分析与数据挖掘等方法,对2018年1月至2022年3月期间11种PD-1/PD-L1抑制剂的病种分布、患者特征、药物来源、使用量等进行分析,同时对11种PD-1/PD-L1抑制剂超适应证使用情况进行分析。结果11种药物中医院有使用记录10种,其使用量逐年增高,2018年以来共使用2769人次,其中卡瑞利珠单抗使用量最高,约占52.8%;国产药物占92.3%,进口药物占7.7%;患者自备药物占95.4%,采购药物占4.6%。不同医保类型、进口/国产药物使用量比较差异均有统计学意义(P<0.05)。多种药物存在超适应证使用情况。结论PD-1/PD-L1抑制剂使用逐年增多,医院使用主要以患者自备为主,国产药物使用量大于进口药物,多存在超适应证用药情况。因此,医院管理部门应加强此类药物安全监管,完善病历书写及系统信息,为临床上有效、安全使用肿瘤免疫治疗药物提供更多真实世界证据。

关键词：肿瘤免疫治疗药物程序性死亡受体1 程序性死亡受体配体1 药物使用

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血脂、体质指数和红肉摄入的时序关系及其对高血压的影响

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临床心血管病杂志 2023年第7期39卷 521-527页

作者：张婷王琪崔小梅张煜莹郭方曦吴清锋董明华罗晓婷赣南医学院公共卫生与健康管理学院江西赣州341000 赣南医学院公共卫生与健康管理学院流行病学与卫生统计学教研室赣南医学院全科医学学院

目的:探讨血脂、BMI和红肉摄入三者之间的时间关联及其对高血压的影响。方法:研究对象来自江西赣州地区的前瞻性队列研究35~65岁人群,共1 251例受试者,平均随访时间3.6年,在基线和随访过程中测量BMI和血脂,包括总胆固醇(TC)、甘油三酯(... 详细信息

目的:探讨血脂、BMI和红肉摄入三者之间的时间关联及其对高血压的影响。方法:研究对象来自江西赣州地区的前瞻性队列研究35~65岁人群,共1 251例受试者,平均随访时间3.6年,在基线和随访过程中测量BMI和血脂,包括总胆固醇(TC)、甘油三酯(TG)、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)和低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)。红肉摄入采用食物频率问卷评估。采用交叉滞后通径分析和中介分析探讨血脂、BMI和红肉摄入的时间因果关联及其对高血压发病的影响,并且对性别、年龄、吸烟、饮酒、睡眠时间和每周运动次数进行调整。结果:TG与BMI相互影响,但TG可能先于BMI发生变化(TG→BMI路径系数:ρ1=0.141,P<0.001,BMI→TG路径系数:ρ2=0.054,P=0.018;ρ1vs ρ2,P<0.001)。HDL-C与BMI相互影响,但HDL-C可能先于BMI发生变化(HDL-C→BMI路径系数:ρ1=-0.222,P<0.001;BMI→HDL-C路径系数:ρ2=-0.053,P=0.011;ρ1vs ρ2,P<0.001)。红肉摄入与血脂和BMI的交叉滞后模型无统计学意义。基线TG对收缩压(SBP)的影响通过BMI传递的中介效应显著(βindirect=0.411 3,95%CI:0.188 3~0.753 1)。基线HDL-C对舒张压(DBP)的影响通过BMI传递的中介效应显著(βindirect=-1.128 0,95%CI:-1.783 2~-0.580 3)。红肉摄入通过血脂和BMI影响高血压的中介分析模型无统计学意义。结论:血脂(TG和HDL-C)与BMI相互影响,且TG和HDL-C先于BMI发生变化。BMI在TG影响SBP过程中存在中介效应,BMI在HDL-C影响DBP过程中存在中介效应。

关键词：高血压甘油三酯高密度脂蛋白胆固醇肥胖红肉交叉滞后模型

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影像诊断试验中多阅片者多病例设计的样本量估计研究

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海军军医大学学报 2025年第5期46卷 693-698页

作者：向蔓宛慧琴潘喆敏何倩秦婴逸贺佳同济大学医学院上海200092 海军军医大学(第二军医大学)卫生勤务学系军队卫生统计学教研室上海200433

目的实现影像诊断试验中多阅片者多病例设计下的样本量估计,探索阅片者和病例均随机、阅片者固定病例随机、阅片者随机病例固定3种情形下阅片者和受试者的数量组合。方法采用Van Dyke数据集中114例受试者(45例被金标准诊断为主动脉夹... 详细信息

目的实现影像诊断试验中多阅片者多病例设计下的样本量估计,探索阅片者和病例均随机、阅片者固定病例随机、阅片者随机病例固定3种情形下阅片者和受试者的数量组合。方法采用Van Dyke数据集中114例受试者(45例被金标准诊断为主动脉夹层)的影像,并由5名影像科医生在自旋回波(Spin-echo)和电影(Cine)2种序列MRI下的判读结果为预试验数据,使用Obuchowski-Rockette法估计正式试验中所需的样本量。结果医生在Spin-echo MRI、Cine MRI序列下判别主动脉夹层的平均AUC值分别为0.941(95% CI 0.899~0.983)、0.897(95% CI0.837~0.957)。当效应量取两者AUC差值0.044、阅片者数量为5时,阅片者和病例均随机、阅片者固定病例随机、阅片者随机病例固定3种情形下分别需要受试者337、162、282例。结论多阅片者多病例设计在进行样本量估计时需考虑阅片者和受试者两者数量,相同情况下,阅片者人数越多所需的受试者数量越少;3种情形中,阅片者(≥5人)和病例均随机时所需样本量最多。

关键词：影像诊断试验多阅片者多病例 Obuchowski-Rockette法样本量

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基于深度神经网络原理构建糖尿病视网膜病变辅助诊断模型

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中华疾病控制杂志 2022年第1期26卷 61-67,85页

作者：吴天柱吴学森安徽中医药高等专科学校预防医学教研室芜湖241000 蚌埠医学院公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室蚌埠233030

目的基于深度神经网络原理,通过对糖尿病视网膜病变(diabetic retinopathy, DR)的眼底图像分级,构建DR辅助诊断模型,为人群中该类疾病筛查提供方便快捷的方法。方法利用图像增强技术对图像数据进行预处理,并使用Focal Loss损失函数、余... 详细信息

目的基于深度神经网络原理,通过对糖尿病视网膜病变(diabetic retinopathy, DR)的眼底图像分级,构建DR辅助诊断模型,为人群中该类疾病筛查提供方便快捷的方法。方法利用图像增强技术对图像数据进行预处理,并使用Focal Loss损失函数、余弦退火学习率、加权随机采样、图像高斯滤波混合加权方法优化深度卷积神经网络Inceptionv4和SENet154,构建出DR的眼底图像分级模型,并用公开发表的Messidor数据集中包含的DR和糖尿病黄斑水肿(diabetic macular edema, DME)的眼底图像对所得到模型进行验证;最后用类激活图(class activation map, CAM)来标记出病灶区域,实现分级的可视化,辅助医生快速诊断。结果 DR分级模型中,经过多种优化方法后,等级为0、1、2、3类的曲线下面积(area under curve, AUC)分别为0.925(95%CI:0.898~0.952)、0.738(95%CI:0.711~0.764)、0.873(95%CI:0.848~0.898)、0.977(95%CI:0.957~0.997);DME分级模型中,等级为0、1、2类的AUC分别为0.965(95%CI:0.948~0.981)、0.881(95%CI:0.852~0.909)、0.963(95%CI:0.941~0.985),并输出眼底图像的CAM。结论通过多种优化方式构建出DR和DME模型取得了较高的AUC,模型绘制出CAM能够准确定位可疑病灶区域,能直观辅助医生方便快捷诊断。

关键词：深度神经网络糖尿病视网膜病变黄斑水肿辅助诊断

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