目的基于网络药理学和分子对接技术探讨马兜铃致急性肾损伤(acute kidney injury,AKI)的作用机制。方法2022年,通过查询中药系统药理学数据库及分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis plat...
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目的基于网络药理学和分子对接技术探讨马兜铃致急性肾损伤(acute kidney injury,AKI)的作用机制。方法2022年,通过查询中药系统药理学数据库及分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)获取马兜铃活性成分,在蛋白质资源(universal protein,UniProt)数据库和瑞士目标预测(Swiss target prediction,Swiss)数据库检索马兜铃活性成分的预测靶标,在人类基因数据库(the human gene database,GeneCards)和人类疾病相关的基因与突变位点信息的数据库(diseaseassociated genes and variants,DisGeNET)检索得到AKI相关靶点;利用Cytoscape软件构建“药物-活性成分-靶点-AKI”的复杂关系网络;借助基因、蛋白质相互作用关系检索工具(search tool for the retrieval of interacting genes/proteins,STRING)平台进一步绘制蛋白质之间的相互作用关系网络;利用R软件对共有靶点基因功能进行富集分析;利用分子对接进行半柔性对接反向验证。结果共得到马兜铃活性成分9个、靶点292个,AKI作用靶点734个,映射后得到马兜铃致AKI潜在靶点84个;马兜铃“成分-靶点-疾病”相互作用关系网络和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集表明马兜铃致AKI是基于多成分、多基因、多靶点的协同复杂作用;分子对接结果表明由马兜铃中筛选出的活性成分与对应的蛋白靶点具有良好的结合能力。结论马兜铃不仅调节脂质代谢、内分泌代谢通路,还可以通过调节衰老、肿瘤等通路影响AKI进程。
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