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福建农业学报 2018年第9期33卷 957-962页

作者：朱永生何炜连玲谢鸿光魏毅东许惠滨郑燕梅王颖姮陈丽萍蔡秋华谢华安张建福福建省农业科学院水稻研究所福建福州350003 闽台作物有害生物生态防控国家重点实验室/农业部华南杂交水稻种质创新与分子育种重点实验室/水稻国家工程实验室/福建省作物种质创新与分子育种省部共建国家重点实验室培育基地/福建省作物分子育种工程实验室/福建省水稻分子育种重点实验室福建福州350003

通过对稻瘟病抗性近等基因系的构建和评价,为抗稻瘟病基因的抗性分析和遗传学研究提供良好载体。分别以广谱抗稻瘟病品种云引和普感稻瘟病品种丽江新团黑谷(LTH)为抗病基因的供体亲本和轮回亲本,结合分子标记辅助选择和人工接种抗性鉴定... 详细信息

通过对稻瘟病抗性近等基因系的构建和评价,为抗稻瘟病基因的抗性分析和遗传学研究提供良好载体。分别以广谱抗稻瘟病品种云引和普感稻瘟病品种丽江新团黑谷(LTH)为抗病基因的供体亲本和轮回亲本,结合分子标记辅助选择和人工接种抗性鉴定,经连续4代回交和8代自交,获得7个以LTH为遗传背景的稻瘟病抗性近等基因系。选取均匀分布于水稻12条染色体上的184对SSR标记,对所获得的近等基因系进行遗传背景分析、评价。结果表明:在亲本云引和LTH之间具多态性的SSR引物有72对,标记多态性频率为39.1%。以在亲本间具有多态性的标记对7个近等基因系与LTH间的遗传多态性进行分析,发现其中W15、W17的遗传背景恢复率为97.61%,W18的遗传背景恢复率为97.22%,其他4个株系的遗传背景恢复率均大于98%。成功构建并获得了以LTH为背景的含有云引稻瘟病抗性基因的近等基因系,且近等位基因系的遗传背景与表型值均恢复良好。

关键词：水稻稻瘟病抗性近等基因系遗传背景

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红米水稻抗氧化活性成分的遗传效应与环境互作

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中国水稻科学 2024年第1期38卷 25-32页

作者：程祖锌肖长春张玉婷黄昕颖史夏蕾凌波王泓超陈小玲林荔辉福建农林大学农学院/福建省特种作物育种与利用工程技术研究中心福州350002 福建农林大学农学院/作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室福州350002 福建省(山区)作物遗传改良与创新利用重点实验室福建三明365500

【目的】剖析红米水稻总酚、总黄酮、原花青素和花色苷的遗传效应,为高营养价值红米杂交稻的培育提供参考。【方法】以8个红米恢复系为父本,6个不育系为母本,配制48个杂交组合为遗传材料,利用加性-显性遗传模型(AD模型)及统计方法,分析... 详细信息

【目的】剖析红米水稻总酚、总黄酮、原花青素和花色苷的遗传效应,为高营养价值红米杂交稻的培育提供参考。【方法】以8个红米恢复系为父本,6个不育系为母本,配制48个杂交组合为遗传材料,利用加性-显性遗传模型(AD模型)及统计方法,分析在不同环境下红米水稻抗氧化活性成分的遗传效应、杂种优势、遗传相关及其与环境互作。【结果】花色苷、原花青素、总酚和总黄酮主要受遗传主效应控制,其中原花青素、总酚和总黄酮总狭义遗传率高,以基因加性效应为主,低代选择有效;花色苷以显性效应为主,适宜中、高世代选择。这4种抗氧化活性成分的表型、遗传、加性、显性、加性×环境互作和显性×环境互作均呈正向相关,相关系数大;原花青素的基因型×环境互作效应小,稳定性好,以此为选择指标可有效提高其他3种成分,减轻工作量,提高育种效率。高温有利红米水稻杂种后代抗氧化活性成分的积累,提高群体杂种优势。此外,提高不育系抗氧化活性成分含量,有利于培育高抗氧化活性成分含量的杂交后代;恢复系18Rr174、18Rr175可有效提高后代总酚、总黄酮、原花青素含量,且受环境影响小。【结论】采用植物数量性状的加性-显性遗传模型,可有效预测亲本抗氧化活性成分的遗传效应,18Rr174、18Rr175在高抗氧化活性成分红米杂交稻的选育上具有较高应用价值。

关键词：红米水稻抗氧化成分遗传效应基因型×环境互作效应

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基于EST-SSR标记的MCID法鉴定冬瓜种质资源

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核农学报 2021年第4期35卷 780-788页

作者：叶新如刘建汀李永平朱海生温庆放福建省蔬菜遗传育种重点实验室福建福州350013 福建省农业科学院作物研究所/福建省农业科学院蔬菜研究中心福建福州350013

种质资源鉴定是研究与利用冬瓜种质资源的基础。为了明确冬瓜种质资源遗传多样性,本研究基于表达序列标签-简单重复序列(EST-SSR)分子标记的人工绘制品种鉴别示意图(MCID)法鉴定40份冬瓜种质资源。利用筛选出的7对引物对冬瓜种质资源进... 详细信息

种质资源鉴定是研究与利用冬瓜种质资源的基础。为了明确冬瓜种质资源遗传多样性,本研究基于表达序列标签-简单重复序列(EST-SSR)分子标记的人工绘制品种鉴别示意图(MCID)法鉴定40份冬瓜种质资源。利用筛选出的7对引物对冬瓜种质资源进行PCR扩增,应用MCID法构建冬瓜品种鉴定图。结果表明,利用7对引物扩增的特征性谱带能够将冬瓜品种在分子水平上区分开,同时能够构建40份冬瓜种质资源的品种鉴定图。利用Ntsys2.10e软件进行聚类分析,在遗传相似系数0.77处,将冬瓜资源分为3个类群。品种鉴定图能够快速地找到区分品种的引物,比聚类图更加直观。基于EST-SSR标记的MCID法是一种有效的冬瓜资源鉴定方法。本研究对冬瓜资源鉴定具有重要意义。

关键词：冬瓜表达序列标签-简单重复序列(EST-SSR) 人工绘制品种鉴别示意图(MCID)法多态性

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与黄麻炭疽病抗性相关的SSR分子标记筛选及新型SNP标记开发

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福建农林大学学报（自然科学版） 2017年第1期46卷 27-33页

作者：陶爱芬谢丽丽祁建民方平平林荔辉徐建堂张立武林培清福建农林大学教育部作物遗传育种与综合利用重点实验室/福建省分子设计育种实验室福建福州350002

为筛选出与黄麻炭疽病抗性相关的新型分子标记,本研究在前期黄麻炭疽病抗性QTL定位结果的基础上,开发出7对可能与黄麻炭疽病抗性基因连锁的新型SNP标记.同时,在前期对重组自交系群体进行田间炭疽病抗性鉴定的基础上,分别以6个抗病株系和... 详细信息

为筛选出与黄麻炭疽病抗性相关的新型分子标记,本研究在前期黄麻炭疽病抗性QTL定位结果的基础上,开发出7对可能与黄麻炭疽病抗性基因连锁的新型SNP标记.同时,在前期对重组自交系群体进行田间炭疽病抗性鉴定的基础上,分别以6个抗病株系和6个感病株系的基因组DNA构建了抗池和感池.以抗、感池的DNA为模板,对36对SSR引物和7对SNP引物进行了多态性筛选,从中初步筛选出具有多态性的SSR引物15对,SNP引物2对.继而,分别以12份抗病和感病株系的基因组DNA为模板,对上述具有多态性的SSR和SNP引物进行进一步验证,最终获得1对与黄麻炭疽病抗性相关的SNP标记,其产生的多态性片段大小约为600 bp.

关键词：黄麻炭疽病 SSR SNP 抗性鉴定

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水稻缺素胁迫下实时荧光定量RT-PCR的内参基因的选择

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农业生物技术学报 2013年第11期21卷 1302-1312页

作者：魏毅东陈玉郭海萍谢华安张建福王宗华福建农林大学生命科学学院农业部华南杂交水稻种质创新与分子育种重点实验室/福州(国家)水稻改良分中心/福建省作物分子育种工程实验室/福建省水稻分子育种重点实验室/福建省作物种质创新与分子育种省部共建国家重点实验室培育基地/杂交水稻国家重点实验室华南基地/水稻国家工程实验室/福建省农业科学院水稻研究所

营养元素的吸收和利用是影响水稻产量的重要决定因素。利用qRT-PCR进行缺素胁迫下水稻功能基因的表达分析时,应当筛选适合于缺素胁迫下qRT-PCR分析的内参基因。本研究以缺乏氮、磷、钾、钙、镁、硫6种大量元素1周和2周的水稻(Oryza sati... 详细信息

营养元素的吸收和利用是影响水稻产量的重要决定因素。利用qRT-PCR进行缺素胁迫下水稻功能基因的表达分析时,应当筛选适合于缺素胁迫下qRT-PCR分析的内参基因。本研究以缺乏氮、磷、钾、钙、镁、硫6种大量元素1周和2周的水稻(Oryza sativa ***)幼苗组成的缺素样品池为材料,选取12个水稻管家基因作为缺素条件下qRT-PCR的候选内参基因,利用geNorm软件分析缺素条件下各基因总体表达的稳定性并筛选出适合于缺素处理下qRT-PCR分析的内参基因eIF4a,确定用于缺素条件下内参校正的最佳基因数量组合为2个。根据比较分析多种内参基因组合在不同缺素处理下的实际校正结果,证明内参基因的最佳组合对于缺素条件下qRT-PCR分析的重要性以及校正结果的有效性。最后,验证了eIF4a单基因校正的可行性与有效性,为geNorm软件提供了有益的改进和补充,这为水稻缺素胁迫下qRT-PCR分析的提供了参考和借鉴。

关键词：荧光定量RT-PCR 内参基因水稻缺素 geNorm

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利用多重荧光定量PCR检测转基因水稻外源基因拷贝数

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农业生物技术学报 2017年第12期25卷 2072-2078页

作者：魏毅东毛小辉何炜王进兰连玲许秀宝林悦龙谢华安张建福福建省农业科学院水稻研究所农业部华南杂交水稻种质创新与分子育种重点实验室/福州(国家)水稻改良分中心/福建省作物分子育种工程实验室/福建省水稻分子育种重点实验室/福建省物种质创新与分子育种省部共建国家重点实验室培育基地/杂交水稻国家重点实验室华南研究基地水稻国家工程实验室

转基因植物中外源基因的拷贝数影响遗传稳定性和基因表达水平,因此鉴定和筛选单拷贝纯合的植株对于子代材料的功能分析是十分必须的。为了快速、准确的对含有潮霉素抗性基因-潮霉素磷酸转移酶II(hygromycin phosphotransferase II,hpt ... 详细信息

转基因植物中外源基因的拷贝数影响遗传稳定性和基因表达水平,因此鉴定和筛选单拷贝纯合的植株对于子代材料的功能分析是十分必须的。为了快速、准确的对含有潮霉素抗性基因-潮霉素磷酸转移酶II(hygromycin phosphotransferase II,hpt II)的转基因水稻材料进行拷贝数鉴定,本研究选用了稳定的组成型基因水稻转录剪切因子U2af(Oryza sativa splicing factor U2af,Os SFu2a)作为内参基因,构建基于Taqman的多重荧光定量PCR(Multiplex q RT-PCR)的拷贝数鉴定体系。通过不同引物组合进行扩增效率比较,确定了hpt II-1和Os SFu2a-2为最佳引物组合。利用该体系对10个转基因克隆进行了拷贝数鉴定,结果其中7个克隆为单拷贝植株,3个克隆为双拷贝植株。随后,通过Southern blot和转基因子代分离比统计,验证了此方法的可靠性;并通过与传统的单重荧光定量PCR(Singlex q RT-PCR)法进行比较,结果表明多重荧光定量PCR法大大提高了检测的准确性和稳定性。因此,该方法能够帮助科研人员快速,准确,高通量的鉴定水稻外源基因拷贝数与纯合体植株。

关键词：转基因水稻拷贝数多重荧光定量PCR

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水稻稀穗突变体的遗传分析及其基因的初步定位

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分子植物育种 2016年第8期14卷 2106-2112页

作者：马洪丽温婵吕巧香张书标福建农林大学作物遗传育种研究所福建省作物分子与细胞生物学重点实验室福州350002

水稻的穗形与其产量关系密切,也是研究的一大热点。利用60Co-γ射线辐射诱变水稻68902B,筛选到一个水稻稀穗突变体,暂命名为Oslp(Oryza sativa lax panicle)。研究了该突变体的主要农艺性状与稀穗的遗传方式,并对稀穗突变基因Oslp进行... 详细信息

水稻的穗形与其产量关系密切,也是研究的一大热点。利用60Co-γ射线辐射诱变水稻68902B,筛选到一个水稻稀穗突变体,暂命名为Oslp(Oryza sativa lax panicle)。研究了该突变体的主要农艺性状与稀穗的遗传方式,并对稀穗突变基因Oslp进行了分子定位。结果显示稀穗突变体Oslp的每穗粒数为104粒、二次枝梗数目为7个,它们都显著地少于原品种68902B每穗粒数的124粒和二次枝梗数目的 20个。遗传分析揭示突变体Oslp的稀穗性状受一对隐性核基因控制。将(籼稻品种261S×稀穗突变体Oslp)F2代中的稀穗个体作为定位群体,结合BSA和SSR分子标记技术,将基因Oslp定位在第7号染色体短臂的2个分子标记FR-3和FR-4之间,基因Oslp与FR-3和FR-4的遗传距离分别为0.6 c M和0.8 c M。

关键词：水稻稀穗突变体Oslp 遗传分析基因定位

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普通丝瓜幼苗响应低温弱光核心基因共表达网络的WGCNA鉴定

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园艺学报 2023年第12期50卷 2601-2618页

作者：王炫榛陈敏氡刘建汀曾美娟叶新如李永平温庆放朱海生福建省农业科学院作物研究所蔬菜研究室福建省蔬菜遗传育种重点实验室福州350013

为研究普通丝瓜[Luffa cylindrica(L.)Roem.]在低温弱光胁迫下基因共表达网络,引入权重基因共表达分析网络的方法(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA),筛选出响应低温弱光的核心基因。以普通丝瓜低温弱光处理的15个... 详细信息

为研究普通丝瓜[Luffa cylindrica(L.)Roem.]在低温弱光胁迫下基因共表达网络,引入权重基因共表达分析网络的方法(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA),筛选出响应低温弱光的核心基因。以普通丝瓜低温弱光处理的15个转录组测序样本为基础,以低温弱光样本为处理性状,创建表型矩阵,聚类分成了29个板块,其中有13个板块与低温弱光处理性状相关。对正向相关性最高的3个板块进行预测,得到108个转录因子,其中占比前3类的分别是ERF(18个)、MYB(10个)、NAC(10个)。通过KEGG通路富集发现,3个板块分别涉及到过氧化物酶体、植物激素信号转导、光合作用以及MAPK信号通路等途径。根据TOM值(topological overlap matrix)、MM值(module member-ship)和连通度(***)在板块中筛选出3个核心基因,并经蛋白质同源性分析鉴定为ATPβ、G6PDH、PER5;对3个核心基因的上、下游差异表达基因(DEG)分析发现在G6PDH下游基因中下调表达基因数量占比达到93.97%,G6PDH基因被低温弱光诱导上调表达后可能会抑制下游关联基因表达;3个核心基因的启动子中具有低温响应、茉莉酸甲酯响应、赤霉素响应以及光响应等元件;3个核心基因的共表达网络都预测到了ERF转录因子。

关键词： WGCNA 普通丝瓜幼苗低温弱光胁迫转录组数据加权共表达网络

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一年生野生稻染色体片段代换系的构建及株高和分蘖的QTLs鉴定

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农业生物技术学报 2024年第9期32卷 1959-1970页

作者：蒋家焕蔡秋华魏毅东刘峰陈丽萍朱永生张建福福建省农业科学院水稻研究所福建省农业科学院闽台作物有害生物生态防控国家重点实验室水稻国家工程实验室/杂交水稻国家重点实验室华南研究基地/福建省作物种质创新与分子育种省部共建国家重点实验室培育基地/国家水稻改良中心福州分中心/农业农村部华南杂交水稻种质创新与分子育种重点实验室/福建省作物分子育种工程实验室/福建省水稻分子育种重点实验室福建省尤溪县农业农村局农业推广中心

利用野生稻优良基因改良水稻(Oryza sativa)，提高水稻的产量和品质具有重要意义。本研究以一年生尼瓦拉野生稻(Oryza nivara)为供体亲本，籼型杂交水稻恢复系'福恢676'('FH676')为受体亲本，构建了一套水稻染色体片段... 详细信息

利用野生稻优良基因改良水稻(Oryza sativa)，提高水稻的产量和品质具有重要意义。本研究以一年生尼瓦拉野生稻(Oryza nivara)为供体亲本，籼型杂交水稻恢复系'福恢676'('FH676')为受体亲本，构建了一套水稻染色体片段代换系。两亲本经过1次杂交、3次回交和多代自交后，对中选的502个BC3F7个体用全基因组SNP芯片进行检测，最终确定了474个含有供亲本基因组片段的株系作为建系群体。检测结果表明，遗传图谱中的SNP标记数多达1 429个，每条染色体的SNP标记数平均有119个。利用72个导入系(导入片段数≤4个)就可以基本覆盖全基因组，72个导入系中，野生稻片段总长度为581.84 Mb；其中代换片段总长度为306.56 Mb，覆盖基因组的82.75%。在海南三亚和福建尤溪两地考察了整套系的株高和有效分蘖穗，结合基因型，利用完备区间作图法对株高和有效分蘖穗进行QTL分析，2个环境中共检测到9个影响株高的QTL，分布在2、3、7、8、11号染色体上，其中3号染色体上的q PH-3在2个环境中均检测到；最终定位到1个与株高显著相关的QTL qPH-8-1,LOD值16.79，表型贡献率9.16%。同时，检测到14个有效分蘖穗的QTLs，分布在2、3、4、5、6、7号染色体上，qETN-7-3、q ETN-7-4、qETN-7-8在2个环境中均检测到；并最终定位到1个与有效分蘖数显著相关的QTL qETN-7-6,LOD值58.28，表型贡献率为32.86%。本研究为进一步对株高和分蘖的QTL精细定位提供了理论基础。

关键词：一年生野生稻 '福恢676' 染色体片段代换系株高有效分蘖数

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设施番茄新品种‘闽农科2号’

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园艺学报 2022年第S1期49卷 73-74页

作者：张前荣李大忠裘波音林珲马慧斐叶新如刘建汀朱海生温庆放福建省农业科学院作物研究所福建省蔬菜工程技术研究中心福建省蔬菜遗传育种重点实验室福州350013

番茄新品种‘闽农科2号’是以自交系105-2-1-3-1-1-1作母本,SH2-1-1-1-1-1-1为父本选育的一代杂种。生长势强,高抗番茄黄化曲叶病毒病。果实扁圆形或近圆形,大红色,鲜艳有光泽,果脐小,果面光滑无棱沟,不易产生畸裂果,耐贮藏,平均单果质... 详细信息

番茄新品种‘闽农科2号’是以自交系105-2-1-3-1-1-1作母本,SH2-1-1-1-1-1-1为父本选育的一代杂种。生长势强,高抗番茄黄化曲叶病毒病。果实扁圆形或近圆形,大红色,鲜艳有光泽,果脐小,果面光滑无棱沟,不易产生畸裂果,耐贮藏,平均单果质量200 g,完熟果可溶性固形物含量4.1%。适合福建沿海地区秋冬季设施栽培。

关键词：番茄品种

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