检索结果-内蒙古大学图书馆

分子植物育种 2025年第7期 2358-2363页

作者：秦霞林文津文香月吴双双徐榕青魏道智福建农林大学生命科学学院福建省农业生态过程与安全监控重点实验室福建省医学科学研究院福建省医学测试重点实验室

本研究利用Illumina HiSeq对建泽泻、川泽泻、窄叶泽泻进行了高通量测序，获得124 452条unigenes，采用MIcroSAtellite (MISA)软件对所获得的unigene进行SSR位点检测和分析，发现13 785个SSR位点分布在10 519条unigenes中，分布频率为11... 详细信息

本研究利用Illumina HiSeq对建泽泻、川泽泻、窄叶泽泻进行了高通量测序，获得124 452条unigenes，采用MIcroSAtellite (MISA)软件对所获得的unigene进行SSR位点检测和分析，发现13 785个SSR位点分布在10 519条unigenes中，分布频率为11.08%。泽泻转录组中以单、二、三核苷酸为主要重复类型，分别占比SSR总数量的33.48%、28.32%和35.57%，优势重复基元为A/T、AG/CT、AAG/CTT，占比26.99%、13.07%、4.92%，其余重复类型相对较少。SSR重复次数以5～12次重复为主，基序长度集中在10～20 bp，所占比例为84.99%。对SSR所在序列进行GO功能注释，结果显示，有6 374条序列获得了GO注释，其中生物过程涉及的GO Term最多，有19个。转录组测序结果表明，泽泻SSR数量及类型较为丰富，可为后续泽泻SSR分子标记开发、种质资源鉴定、分子辅助育种以及遗传多样性分析等方面提供参考依据。

关键词：泽泻转录组 SSR

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单壁碳纳米管载嗜水气单胞菌外膜蛋白亚单位疫苗的研制及免疫效果评价

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水产学报 2020年第9期44卷 1424-1434页

作者：姜倩雯张丽珊李小艳武瑶赵怡扬徐慧铭林向民福建农林大学生命科学学院福建农林大学福建省农业生态过程与安全监控重点实验室福建

为了筛选细菌的疫苗候选蛋白,本实验根据课题组前期的研究,挑选了2个嗜水气单胞菌外膜蛋白(A0KLQ6和A0KH89),以A0KHR9(OmpAII)为对照,通过比较外膜蛋白与碳纳米管载外膜蛋白通过腹腔注射与浸泡免疫模式,比较和评价斑马鱼的免疫反应与免... 详细信息

为了筛选细菌的疫苗候选蛋白,本实验根据课题组前期的研究,挑选了2个嗜水气单胞菌外膜蛋白(A0KLQ6和A0KH89),以A0KHR9(OmpAII)为对照,通过比较外膜蛋白与碳纳米管载外膜蛋白通过腹腔注射与浸泡免疫模式,比较和评价斑马鱼的免疫反应与免疫保护效果。结果显示,腹腔注射组和浸泡组与普通蛋白组对比,碳纳米管载蛋白能够显著提高斑马鱼免疫相关基因表达量。腹腔注射组在5μg剂量下免疫A0KHR9、A0KLQ6和A0KH89蛋白分别获得61.60%、 65.39%和84.96%相对免疫保护率(relative immune protection rate,RPS),在5μg剂量下免疫碳纳米管载蛋白SWCNTs-A0KHR9、SWCNTsA0KLQ6和SWCNTs-A0KH89分别获得68.10%、77.50%和90.43%的RPSs。浸泡组在40 mg/L剂量下免疫A0KHR9、A0KLQ6和A0KH89蛋白分别获得30.80%、25.85%和37.80%的RPSs,在40 mg/L最高剂量下免疫碳纳米管载蛋白疫苗SWCNTs-A0KHR9、SWCNTsA0KLQ6和SWCNTs-A0KH89分别获得63.60%、73.74%和68.49%的RPSs。研究表明,铁离子限制下嗜水气单胞菌外膜蛋白A0KLQ6和A0KH89等能够作为抗嗜水气单胞菌的亚单位疫苗候选蛋白,而单壁碳纳米管载蛋白通过注射免疫与浸泡免疫均能显著提升免疫疗效,是一种疫苗的适宜纳米载体。以上研究为寻找高效的嗜水气单胞菌亚单位疫苗候选蛋白及佐剂提供了理论依据。

关键词：嗜水气单胞菌外膜蛋白碳纳米管注射免疫浸泡免疫

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14-3-3蛋白在水稻籽粒灌浆过程中的互作靶蛋白鉴定及其对外源激素的响应

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中国农业科学 2021年第12期54卷 2523-2537页

作者：张志兴敏秀梅宋果陈花许海龙林文雄福建农林大学生命科学学院福建农林大学/福建省农业生态过程与安全监控重点实验室

【目的】籽粒灌浆对水稻产量及品质的形成至关重要。14-3-3蛋白是一种信号转导调节因子,在植物生长发育中发挥着重要调控作用。本研究通过分析14-3-3蛋白家族在籽粒灌浆过程中的基因表达模式及其互作靶蛋白,从而揭示其在籽粒灌浆过程中... 详细信息

【目的】籽粒灌浆对水稻产量及品质的形成至关重要。14-3-3蛋白是一种信号转导调节因子,在植物生长发育中发挥着重要调控作用。本研究通过分析14-3-3蛋白家族在籽粒灌浆过程中的基因表达模式及其互作靶蛋白,从而揭示其在籽粒灌浆过程中的功能。【方法】利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术分析水稻14-3-3基因家族在籽粒灌浆过程中的表达变化模式,并从中选取GF14b及GF14e进行后续的蛋白功能分析。利用KEGG数据库对GF14b及GF14e蛋白功能motif位点进行分析;构建GST-GF14b及GST-GF14e表达载体,利用亲和层析技术分别钓取籽粒中与GF14b及GF14e互作的靶蛋白,并借助LC-MS/MS对靶蛋白进行鉴定。采用GST pull-down方法验证靶蛋白与GF14b及GF14e间的蛋白互作关系。利用Kinasephos在线程序对靶蛋白的Ser和Thr磷酸化位点进行预测;采用MapMan 3.6.0软件对靶蛋白的功能及参与的代谢过程进行分析。在籽粒灌浆期(花后15 d),分别喷施25×10-6 mol·L-1 ABA,10×10-6 mol·L-1 IAA,100×10-6 mol·L-1 GA,50×10-6 mol·L-1 ZR和2×10-4 mol·L-1 BR,研究外源激素处理对籽粒灌浆过程中GF14b,GF14e及其互作靶基因表达的影响。【结果】14-3-3家族基因中,除GF14h外,其余7个家族成员在水稻籽粒中均有表达,其中GF14b及GF14e在籽粒灌浆过程中的表达水平较高且变化幅度较大。通过蛋白序列分析发现,GF14b与GF14e间具有3个相同,2个差异的motif功能位点。通过亲和层析试验,在籽粒中共鉴定到59个与GF14b和72个与GF14e互作的靶蛋白,其中有43个靶蛋白与2个成员均有互作,分别有16个和29个靶蛋白与GF14b和GF14e特异结合。随机选取2个靶蛋白进行体外蛋白互作验证,结果表明靶蛋白SUS3与GF14b和GF14e均存在互作关系,而靶蛋白PSA仅与GF14e有相互作用关系,验证了亲和层析结果的准确性。蛋白功能的分析表明,GF14b和GF14e通过与靶蛋白的结合,共同参与了籽粒灌浆过程中蔗糖转化、淀粉合成、糖酵解、TCA循环等碳代谢途径。同时,GF14b及GF14e还具有特异的调控功能,其中GF14b与核酸代谢及物质转运密切相关,而GF14e与C1代谢中的关键蛋白存在互作。此外,大部分靶蛋白均鉴定到具有潜在的Ser和Thr磷酸化位点。外源激素处理下,籽粒中GF14b和GF14e上调表达,而与淀粉合成代谢相关的靶基因(SUS2、 AGPS、AGPL、PPDK2、SBE)大部分呈下调表达的趋势。【结论】14-3-3基因家族成员GF14b和GF14e在水稻籽粒灌浆过程中的表达变化幅度较大,且会响应激素浓度的改变,并通过蛋白互作的形式负调控淀粉合成代谢相关基因的表达,从而对水稻籽粒淀粉的合成起到重要的调控作用。

关键词：水稻籽粒灌浆 14-3-3蛋白蛋白互作激素

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嗜水气单胞菌hfq2基因对生物被膜形成的影响

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科学通报 2019年第14期64卷 1506-1514页

作者：王贵宾蔡奇岚李泽琦赵怡扬林镇平林向民福建省农业生态过程与安全监控重点实验室作物生态与分子生理学福建省高校重点实验室福建农林大学生命科学学院福州350002

Hfq蛋白是一种进化上保守的sRNA分子伴侣蛋白,在转录后水平调控RNA翻译,涉及细菌重要生理功能的调节.嗜水气单胞菌ATCC 7966基因组中含有两个hfq基因拷贝(AHA_0924与AHA_3797),目前对AHA_3797(简称hfq2)基因功能的研究比较少.本研究首... 详细信息

Hfq蛋白是一种进化上保守的sRNA分子伴侣蛋白,在转录后水平调控RNA翻译,涉及细菌重要生理功能的调节.嗜水气单胞菌ATCC 7966基因组中含有两个hfq基因拷贝(AHA_0924与AHA_3797),目前对AHA_3797(简称hfq2)基因功能的研究比较少.本研究首先利用同源重组技术敲除该基因,发现hfq2缺失后形成生物膜的能力显著降低(P<0.001),进一步通过SWATH(sequential window acquisition of all theoretical spectra)定量蛋白质组学技术比较野生型与Δhfq2在生物膜状态下的蛋白表达差异,共鉴定出1538个蛋白,其中131个蛋白表达上调, 140个蛋白表达下调.生物信息学分析表明,生物被膜状态下Δhfq2导致细菌铁离子转运相关蛋白表达上调,趋化作用相关蛋白则大幅度下调.进一步利用Western Blotting对部分差异蛋白的表达进行了验证.最后通过铁离子螯合剂添加试验证实, Hfq2蛋白可以通过影响铁离子动态平衡过程来影响细菌生物被膜的形成.了解Hfq2蛋白在细菌生物被膜形成过程的调控机理,对病原菌的防治以及新型抑菌策略的研发具有重要的科学意义.

关键词：嗜水气单胞菌 hfq2 生物被膜 SWATH 定量蛋白质组学

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嗜水气单胞菌外膜蛋白缺失株逆境响应功能评价

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浙江大学学报（农业与生命科学版） 2022年第3期48卷 303-309页

作者：李泽琦汪玉倩李小艳林向民袁军福建农林大学生命科学学院福建省农业生态过程与安全监控重点实验室福州350002

为系统评价外膜蛋白在环境胁迫条件下的生物学功能,以嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)ATCC 7966为研究对象,选取33株外膜蛋白缺失菌株,对其贴太紧在渗透压、金属离子、H_(2)O_(2)及pH等胁迫条件下的生长状态进行测定。结果发现:编码... 详细信息

为系统评价外膜蛋白在环境胁迫条件下的生物学功能,以嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)ATCC 7966为研究对象,选取33株外膜蛋白缺失菌株,对其贴太紧在渗透压、金属离子、H_(2)O_(2)及pH等胁迫条件下的生长状态进行测定。结果发现:编码TonB家族蛋白基因AHA_0461、AHA_4275被敲除的菌株在渗透压胁迫条件下较野生型菌株生长更好;编码未知功能蛋白基因AHA_2282被敲除的菌株在金属离子胁迫条件下生长较弱,而ΔAHA_0904菌株在渗透压胁迫条件下生长状况较好;编码长链脂肪酸转运蛋白基因AHA_2145被敲除的菌株在H_(2)O_(2)和金属离子胁迫条件下生长状态较弱;而编码OmpA家族蛋白基因AHA_1279、AHA_1281和分泌素家族蛋白基因pilQ、AHA_0569被敲除的菌株在H_(2)O_(2)胁迫条件下的生长均弱于野生型菌株。提示这些蛋白可能在细菌响应环境胁迫方面起重要作用。本研究结果有望为今后全面地了解嗜水气单胞菌外膜蛋白响应不同环境胁迫的机制提供思路,为该病原菌的防治提供可能的靶点。

关键词：嗜水气单胞菌外膜蛋白基因缺失逆境响应

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嗜水气单胞菌zntR调控的生理功能及其机制研究

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微生物学报 2021年第9期61卷 2765-2775页

作者：林月绪张丽珊陈加臻农添植邢方婷林向民谢小芳福建农林大学生命科学学院福建福州350002 福建农林大学福建省农业生态过程与安全监控重点实验室福建福州350002

【目的】ZntR是一种金属调控蛋白,可催化锌外排基因的转录激活,防止细胞内二价Zn离子过量,但其对细菌生理功能的影响目前尚不清楚。【方法】本研究构建了嗜水气单胞菌ATCC7966(Aeromonas hydrophila,A.h)的zntR缺失株及补救株,对菌株的... 详细信息

【目的】ZntR是一种金属调控蛋白,可催化锌外排基因的转录激活,防止细胞内二价Zn离子过量,但其对细菌生理功能的影响目前尚不清楚。【方法】本研究构建了嗜水气单胞菌ATCC7966(Aeromonas hydrophila,A.h)的zntR缺失株及补救株,对菌株的生物被膜形成能力、溶血活性、运动能力和响应金属离子胁迫等生理表型进行评估。【结果】敲除zntR基因的菌株对锌和铬离子胁迫敏感、对钴离子胁迫耐受,并且生物被膜形成能力下降、运动能力增强,这些表型在其补救菌株中均能得到恢复。进一步利用DIA定量蛋白质组学技术比较野生株和zntR缺失株的蛋白表达差异,发现ZntR还可能参与双组分系统、细菌的趋化性等代谢通路的调控。【结论】该研究结果可为今后深入探讨zntR转录因子参与细菌生理功能的调控机制提供理论依据。

关键词：嗜水气单胞菌转录调控因子同源重组

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多肽配体R18促进水稻弱势籽粒灌浆的初步研究

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作物学报 2021年第7期47卷 1332-1341页

作者：张志兴陈花敏秀梅许海龙宋果林文雄福建农林大学生命科学学院福建福州350002 福建农林大学/福建省农业生态过程与安全监控重点实验室福建福州350002

14-3-3蛋白在植物生长发育中具有重要的调控作用,其亚型GF14f在水稻弱势籽粒中高表达是其灌浆结实差的一个重要的原因。本研究首先通过分子对接的方式,发现多肽R18与GF14f蛋白具有潜在的结合位点,进而采用体外竞争性实验,发现R18能够竞... 详细信息

14-3-3蛋白在植物生长发育中具有重要的调控作用,其亚型GF14f在水稻弱势籽粒中高表达是其灌浆结实差的一个重要的原因。本研究首先通过分子对接的方式,发现多肽R18与GF14f蛋白具有潜在的结合位点,进而采用体外竞争性实验,发现R18能够竞争性的与GF14f蛋白结合,从而导致GF14f与SuS2、SS和AGPS三个互作靶蛋白间的结合力减弱,与此同时,体外酶活实验表明,外源添加R18能够显著提高淀粉合成酶(StSase)、蔗糖合成酶(SuSase)和ADPG焦磷酸化酶(AGPase)3个酶的活性。免疫共沉淀实验表明,R18在水稻籽粒中除了能和GF14f结合外,还能与GF14b、GF14c、GF14d及GF14e结合,BiFC结果也证实了上述结果。籽粒灌浆期,外源喷施60 mg L^(-1)浓度的R18于弱势籽粒上,StSase、SuSase及AGPase酶活性显著提高,弱势籽粒千粒重及结实率也显著提高。本研究结果表明,多肽配体R18能够与14-3-3互作靶蛋白竞争性结合,减弱14-3-3与靶蛋白间的结合力,进而释放籽粒灌浆过程中蔗糖转化及淀粉合成途径中关键酶的活性,从而有利于弱势籽粒灌浆充实。

关键词：水稻弱势籽粒灌浆 14-3-3蛋白多肽配体

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稻/稗共培抑草圈法结合主成分-聚类分析法筛选化感潜力水稻品种

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应用与环境生物学报 2021年第6期27卷 1509-1515页

作者：李家玉李立冯常青张清旭张伟彬何海斌福建农林大学生命科学学院福州350002 福建省农业生态过程与安全监控重点实验室福州350002

筛选具有化感潜力的水稻是利用水稻化感作用进行杂草防控的重要工作.利用前期建立的有效种植体系——稻/稗共培抑草圈土壤盆栽法,测定14个水稻品种的6种化感潜力指标,结合主成分分析-聚类分析法进行归类分析得出潜在的化感水稻品种,再利... 详细信息

筛选具有化感潜力的水稻是利用水稻化感作用进行杂草防控的重要工作.利用前期建立的有效种植体系——稻/稗共培抑草圈土壤盆栽法,测定14个水稻品种的6种化感潜力指标,结合主成分分析-聚类分析法进行归类分析得出潜在的化感水稻品种,再利用HPLC法验证这些水稻叶片酚酸化感物质含量聚类分析的结果.结果显示,无论是哪一种化感潜力指标,国际公认的化感水稻PI312777和Taichung Native1均显著高于非化感水稻Lemont,但其他11种水稻的变化趋势不一致.经过主成分分析得到的2个主成分反映了原化感潜力测定指标信息的86.55%,进一步根据14个水稻品种的主成分得分进行聚类分析,3种水稻可以归于化感水稻一类.HPLC分析结果表明,水稻品种371叶片酚酸总量与PI312777相比无显著差异,其他两种水稻187和287与Taichung Native1相比无显著差异,与聚类分析的归类结果基本一致.本研究表明利用抑草圈种植筛选系统,结合主成分分析法和聚类分析法可以准确地筛选出化感潜力水稻,本次筛选出来的水稻品种371、187和287号均可以作为潜在的化感水稻进行后续研究.

关键词：水稻化感作用抑草圈品种筛选酚酸主成分分析聚类分析

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外源脱落酸对水稻苗期根系形态建成及其诱导化感作用的影响

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应用与环境生物学报 2024年第1期30卷 126-132页

作者：王艳萍范宇浍马华燕胡锦弘崔祖铭李家玉福建农林大学生命科学学院福州350002 福建省农业生态过程与安全监控重点实验室福州350002

外源添加化学物质诱导可提高水稻化感潜力,是一种可被开发利用的可持续除草模式.在透明玻璃根箱中进行水稻/稗草共培种植,研究外源脱落酸对化感水稻PI312777和非化感水稻Lemont的根系形态建成及其诱导化感作用的影响.结果表明,3μmol/L... 详细信息

外源添加化学物质诱导可提高水稻化感潜力,是一种可被开发利用的可持续除草模式.在透明玻璃根箱中进行水稻/稗草共培种植,研究外源脱落酸对化感水稻PI312777和非化感水稻Lemont的根系形态建成及其诱导化感作用的影响.结果表明,3μmol/L脱落酸诱导后的化感水稻PI和非化感水稻Le对稗草株高的总化感作用(TA)值较遗传化感作用(GA)显著提高,且Le的诱导化感作用(IA)占其TA的比值(23%-31%)趋近于PI的占比(24%-35%).诱导处理后两种水稻在地下的根系行为均由躲避模式变为侵入模式,且两种水稻的根系总根长、总表面积、总体积都显著提高.此外,诱导处理后化感水稻PI和非化感水稻Le水稻叶片中8种酚酸总含量均显著增加,分别提高了20.22%、20.47%.化感水稻PI32777根系总根长、总体积、叶片中8种酚酸总含量与稗草抑制率呈显著正相关,非化感水稻Lemont总根长、总根尖数、叶片中8种酚酸总含量与稗草抑制率呈显著正相关.上述研究结果表明外源脱落酸诱导促进了水稻的根系形态建成,提高了水稻酚酸类物质分泌释放,增加了水稻的化感潜力,更重要的是使非化感水稻的诱导化感作用趋于化感水稻.(图6表2参34)

关键词：水稻诱导化感作用根系形态根系行为酚酸激素

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OsPAL2;3对水稻化感抑制稗草能力的调控作用

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作物学报 2021年第2期47卷 197-209页

作者：李兰兰母丹严雪杨陆可林文雄方长旬福建农林大学生命科学学院农业生态研究所/福建省农业生态过程与安全监控重点实验室福建福州350002

苯丙氨酸解氨酶(phenylalanine ammonia-lyase,PAL,EC 4.3.1.5)是调控酚酸类化感物质合成的关键酶。PAL在水稻中为多基因家族,化感水稻PI312777和非化感水稻Lemont中,相同PAL基因成员的启动子组成序列均存在差异,并以OsPAL2;3、OsPAL2;... 详细信息

苯丙氨酸解氨酶(phenylalanine ammonia-lyase,PAL,EC 4.3.1.5)是调控酚酸类化感物质合成的关键酶。PAL在水稻中为多基因家族,化感水稻PI312777和非化感水稻Lemont中,相同PAL基因成员的启动子组成序列均存在差异,并以OsPAL2;3、OsPAL2;4基因启动子序列的差异最大,且PI321777的OsPAL2;3基因启动子的驱动活性高于Lemont。过表达OsPAL2;3基因,使PI312777和Lemont的抑草率分别提高11.11%和5.56%。过表达OsPAL2;3同时增强OsPAL2;3、OsC4H、OsCCA、OsCOL、OsOMT等基因的表达,增加水稻的原儿茶酸和香草酸含量。Co-IP结合质谱鉴定结果显示,OsPAL2;3蛋白与转酮醇酶、碳酸酐酶、果糖二磷酸醛缩酶、ATP合酶α亚基、ATP合酶β亚基等相互作用,调控水稻的苯丙氨酸代谢途径。本研究表明,OsPAL2;3的转录水平高低是P1312777和Lemont化感抑草能力差异的原因之一;OsPAL2;3与多个蛋白互作共同调控酚酸类化合物合成,该基因可用于提高水稻化感抑草能力的育种研究。

关键词：水稻化感作用 PAL基因启动子酚酸蛋白互作

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