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第三届"模式生物与人类健康"发育遗传学全国学术研讨会

作者：陈松彪福建省农业科学院生物技术研究所福建省农业遗传工程重点实验室

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鸭疫里默氏杆菌TaqMan荧光定量PCR检测方法的建立

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中国预防兽医学报 2014年第6期36卷 458-461页

作者：万春和程龙飞邵周伍林刘思国黄瑜张云中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室黑龙江哈尔滨150001 福建省农业科学院畜牧兽医研究所福建省畜禽疫病防治工程技术研究中心福建福州350013

为建立鸭疫里默氏杆菌(Riemerella anatipestife,RA)定量检测方法,本研究根据RA的铁依赖抑制子基因(RaDtxR)序列,设计特异性引物和探针,建立基于TaqMan探针检测RA的荧光定量PCR方法。该方法检测RA RaDtxR在4.27×102拷贝/μL^4.27&#... 详细信息

为建立鸭疫里默氏杆菌(Riemerella anatipestife,RA)定量检测方法,本研究根据RA的铁依赖抑制子基因(RaDtxR)序列,设计特异性引物和探针,建立基于TaqMan探针检测RA的荧光定量PCR方法。该方法检测RA RaDtxR在4.27×102拷贝/μL^4.27×106拷贝/μL范围内具有良好的线性关系,其扩增相关系数为0.998,扩增效率为99%,最低检测下限为4.27×102拷贝/μL。对常见RA血清型(1型、2型、3型和10型)检测结果均为阳性;而对大肠杆菌、巴氏杆菌、沙门氏菌、Ⅰ型鸭肝炎病毒、禽坦布苏病毒和鸭圆环病毒等常见鸭群病原检测均为阴性。该方法重复性好,组内和组间变异系数分别为0.23%~0.77%和0.93%~1.32%。该方法的建立为RA感染宿主靶器官的感染程度和定量分析奠定基础。

关键词：鸭疫里默氏杆菌铁依赖抑制子基因 TaqMan探针荧光定量PCR

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缺氮与恢复供氮后水稻铵转运蛋白基因的表达特征分析

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福建农业科技 2023年第4期54卷 12-21页

作者：胡太蛟张珊珊林艳宋亚娜福建省农业科学院生物技术研究所/福建省农业遗传工程重点实验室福建福州350003 福建农林大学作物学院福建福州350000

为了解水稻吸收和利用铵态氮的分子机制,利用实时荧光定量PCR检测了水稻全部预测的12条铵转运蛋白基因在缺氮及恢复供氮处理后的表达情况。结果表明:全部铵转运蛋白基因在水稻根、茎和叶中都有表达,AMT1.1在叶中表达水平最高,其表达受... 详细信息

为了解水稻吸收和利用铵态氮的分子机制,利用实时荧光定量PCR检测了水稻全部预测的12条铵转运蛋白基因在缺氮及恢复供氮处理后的表达情况。结果表明:全部铵转运蛋白基因在水稻根、茎和叶中都有表达,AMT1.1在叶中表达水平最高,其表达受到氮缺乏和氮源类型的影响。缺氮处理后,水稻根部的表达全部大幅下调,茎中多数下调,少数上调或波动,叶中大部分先上调再回落;恢复供氮后,水稻根部多数大幅上调,茎和叶中则有所分化,部分上调或先上调再回落。这一现象与水稻氮代谢途径的整体铵转运途径有关,铵的吸收是由根到茎再到叶转运,铵代谢消耗则反向转运。

关键词：表达实时荧光定量PCR 水稻 AMT基因氮

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一个水稻Bowman-Birk家族基因功能的研究

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泉州师范学院学报 2018年第6期36卷 20-24页

作者：颜静宛林智敏苏军宋亚娜胡太蛟王锋福建省农业科学院生物技术研究所农业遗传重点实验室福建福州350003

采用荧光定量分析和过量表达的方法研究水稻Bowman-Birk家族基因BBTI-13基因的功能.结果显示,BBTI-13在野生型日本晴水稻中具有组织特异性,在胚和花药中表达最低;BBTI-13基因的烟草亚细胞表达定位表明其为组成型表达;过表达株系的田间... 详细信息

采用荧光定量分析和过量表达的方法研究水稻Bowman-Birk家族基因BBTI-13基因的功能.结果显示,BBTI-13在野生型日本晴水稻中具有组织特异性,在胚和花药中表达最低;BBTI-13基因的烟草亚细胞表达定位表明其为组成型表达;过表达株系的田间表型分析发现,过表达转基因植株与野生型相比株型矮化,粒型稍变大.并通过对水稻株形矮化相关基因的表达进一步分析表明,BBTI-13基因的过量表达会引起水稻相关矮化基因的上调和下调反馈,其中Ghd2、DTH7、Ghd7、THIS1和Ghd8表现上调,OsBZR1、OsSIN表现下调.

关键词：水稻 Bowman-Birk 基因克隆功能分析

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禽腺病毒4型的分离与初步鉴定

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福建农业学报 2016年第10期31卷 1020-1023页

作者：陈珍施少华黄瑜韩跃松陈翠腾刘荣昌蔡国漳朱春华刘斌琼林羽福建省农业科学院畜牧兽医研究所/福建省动物生物安全三级实验室/福建省畜禽疫病防治工程技术研究中心/福建省禽病防治重点实验室福建福州350013 福州大北农生物技术有限公司福建福州350014

从疑似心包积液综合征的病死鸡组织中分离获得1株病毒,该病毒无血凝活性,提取其核酸经禽流感病毒、新城疫病毒、鸡传染性支气管炎病毒、禽脑脊髓炎病毒、禽白血病病毒、传染性法氏囊病毒、禽偏肺病毒和包涵体肝炎病毒特异引物扩增均为阴... 详细信息

从疑似心包积液综合征的病死鸡组织中分离获得1株病毒,该病毒无血凝活性,提取其核酸经禽流感病毒、新城疫病毒、鸡传染性支气管炎病毒、禽脑脊髓炎病毒、禽白血病病毒、传染性法氏囊病毒、禽偏肺病毒和包涵体肝炎病毒特异引物扩增均为阴性,而经禽腺病毒4型特异性引物检测为阳性,则将其暂命名为禽腺病毒4型FJ1674株。将其扩增产物回收后克隆,经序列测定分析表明该株病毒与国内外禽腺病毒4型毒株的同源率为99.4%~100%;经遗传进化分析表明,其与禽腺病毒4型关系密切,共处同一分支。

关键词：鸡心包积液综合征禽腺病毒4型分离鉴定

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鸭疫里默氏菌铁依赖抑制子基因的克隆及序列分析

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中国畜牧兽医 2014年第12期41卷 85-89页

作者：万春和程龙飞陈红梅傅光华施少华黄瑜福建省农业科学院畜牧兽医研究所福建省畜禽疫病防治工程技术研究中心福建福州350013 中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室黑龙江哈尔滨150001

本研究根据鸭疫里默氏菌铁依赖抑制子(RaDtxR)基因序列特征设计特异性引物,利用PCR方法从已鉴定为2型鸭疫里默氏菌RA-FJ株的基因组DNA中扩增目的基因片段,胶回收PCR扩增片段,克隆到pMD18-T载体后进行序列测定。采用生物信息学软件对测... 详细信息

本研究根据鸭疫里默氏菌铁依赖抑制子(RaDtxR)基因序列特征设计特异性引物,利用PCR方法从已鉴定为2型鸭疫里默氏菌RA-FJ株的基因组DNA中扩增目的基因片段,胶回收PCR扩增片段,克隆到pMD18-T载体后进行序列测定。采用生物信息学软件对测序结果进行分析,结果表明所获得的RaDtxR基因编码完整的开放阅读框,全基因长度为654bp,编码217个氨基酸。所编码的蛋白大小为24.82ku,理论等电点为5.69,不稳定系数为38.45,属于稳定蛋白质类。将其与GenBank中已发表的RaDtxR基因序列进行核苷酸同源性比对分析,结果显示其与鸭疫里默氏菌疫苗株RA-CH-1株(GenBank登录号:CP003787)的核苷酸同源性为100.0%,与其他4株核苷酸同源性均为99.8%,仅在186位处存在无义突变。利用该基因对福建省农业科学院畜牧兽医研究所分离鉴定的鸭大肠杆菌、禽多杀性巴氏杆菌和沙门氏菌进行扩增,结果显示均未扩增到条带,对福建省农业科学院畜牧兽医研究所分离鉴定的1型、2型、3型、11型和13型鸭疫里默氏菌均可扩增出特异性目的条带,表明RaDtxR基因可作为鸭疫里默氏菌鉴别诊断的靶基因。试验结果表明,本研究成功克隆到鸭疫里默氏菌RaDtxR基因,为研究其功能奠定基础。

关键词：鸭疫里默氏菌铁依赖抑制子基因克隆生物信息学分析

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水稻生物学特性对稻田甲烷排放的影响

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农学学报 2020年第2期10卷 75-80页

作者：沈学良田光蕾周元昌王缨福建农林大学/作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室福州350002 福建省农业遗传工程重点实验室/福建省农业科学院生物技术研究所福州350003

为了阐明水稻品种与稻田甲烷排放的关系,为培育低甲烷水稻品种提供科学依据。本研究从水稻植株形态特征和生物学特性等方面,论述水稻植株与甲烷排放的关系。水稻根系主要通过根系分泌物和根系泌氧能力二个方面影响甲烷气体的生成和氧化... 详细信息

为了阐明水稻品种与稻田甲烷排放的关系,为培育低甲烷水稻品种提供科学依据。本研究从水稻植株形态特征和生物学特性等方面,论述水稻植株与甲烷排放的关系。水稻根系主要通过根系分泌物和根系泌氧能力二个方面影响甲烷气体的生成和氧化;水稻分蘖特性主要影响甲烷气体的排放;水稻叶片则通过光合作用和蒸腾作用二个方面分别影响甲烷气体的产生和排放;水稻籽粒的灌浆特性主要通过与根系争夺碳水化合物而影响甲烷的产量。这些因素既相互独立又相互协调影响水稻稻田的甲烷排放。

关键词：水稻甲烷生物学特性根系分蘖叶片籽粒品种

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一种适用于高通量基因分型的水稻种子切片DNA制备技术

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福建农业科技 2023年第10期54卷 40-47页

作者：林旻杨绍华林艳王月胡太蛟宋亚娜潘雷博陈在杰福建省农业科学院生物技术研究所/福建省农业遗传工程重点实验室福建福州350003 福建农林大学生命科学学院福建福州350002

建立一种高质量、低成本的水稻种子切片DNA制备方法,用于育种群体的高通量基因分型。通过对比TPS法提取水稻叶片DNA及96孔板结合磁珠法提取切片种子DNA的纯度和浓度,进一步采用STARP(Semi-thermal asymmetric PCR)标记检测验证96孔板结... 详细信息

建立一种高质量、低成本的水稻种子切片DNA制备方法,用于育种群体的高通量基因分型。通过对比TPS法提取水稻叶片DNA及96孔板结合磁珠法提取切片种子DNA的纯度和浓度,进一步采用STARP(Semi-thermal asymmetric PCR)标记检测验证96孔板结合磁珠法提取水稻切片种子DNA的质量。结果表明:96孔板结合磁珠法提取水稻种子切片的DNA质量和纯度优于TPS法提取水稻叶片的DNA质量;STARP标记检测验证结果显示96孔板结合磁珠法提取水稻切片种子DNA可适用于GS3、Wx的STARP标记基因分型,其鉴定结果与测序结果一致。研究显示96孔板结合磁珠法可以从微量水稻种子切片中提出高回收率、高纯度、高完整度、无PCR抑制物的DNA用于高通量STATP法基因单倍型分析,可获得一种96孔板结合磁珠法提取DNA的高通量基因分型操作流程。

关键词：水稻种子切片 96孔板结合磁珠法高通量基因分型 STARP技术

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水稻类病斑及早衰突变体lms1的鉴定及基因初步定位

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福建农业学报 2014年第1期29卷 29-34页

作者：林艳陈在杰田大刚杨广阔杨绍华刘华清陈松彪王锋福建省农业科学院生物技术研究所/福建省农业遗传工程重点实验室福建福州350003 福建农林大学生命科学学院福建福州350002

通过筛选籼稻恢复系明恢86的组培变异后代,获得1个类病斑及早衰突变体lms1(lesion mimic and senescence 1)。lms1植株生长至拔节期开始在叶片上出现黄褐色小斑点,随后斑点逐渐扩展至大部分叶片和茎组织;生长至抽穗期后呈现早衰,穗、茎... 详细信息

通过筛选籼稻恢复系明恢86的组培变异后代,获得1个类病斑及早衰突变体lms1(lesion mimic and senescence 1)。lms1植株生长至拔节期开始在叶片上出现黄褐色小斑点,随后斑点逐渐扩展至大部分叶片和茎组织;生长至抽穗期后呈现早衰,穗、茎、叶明显干枯,并快速衰亡。RT-PCR分析表明,在呈现类病斑性状叶片组织的lsm1中,病程相关基因PBZ1、PAL1表达明显高于其在野生型叶片组织中的水平。遗传分析表明,lms1的突变性状受单隐性核基因控制。利用9311与lms1配置的F2及F3群体进行基因定位,将lms1基因定位在水稻第11染色体长臂末端。

关键词：水稻类病斑早衰基因定位

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稻田耕作制度对CH_4气体排放影响的研究进展

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中国农学通报 2015年第29期31卷 141-147页

作者：王蕴霏福建师范大学生命科学学院福州350002 福建省农业遗传工程重点实验室/福建省农业科学院生物技术研究所福州350003

甲烷是重要的温室气体,其辐射增温效应是CO2的20~30倍。稻田是CH4的重要排放源之一。稻田CH4的排放是稻田CH4产生、氧化和传输综合作用的结果。影响稻田CH4释放的因素众多。本研究从水稻的农耕制度角度总结近年来关于稻田CH4排放的影响... 详细信息

甲烷是重要的温室气体,其辐射增温效应是CO2的20~30倍。稻田是CH4的重要排放源之一。稻田CH4的排放是稻田CH4产生、氧化和传输综合作用的结果。影响稻田CH4释放的因素众多。本研究从水稻的农耕制度角度总结近年来关于稻田CH4排放的影响因素的研究,系统地归纳了水稻生物学特性、品种栽种方式、水肥管理等方面对CH4气体排放影响,同时从耕作角度提出了稻田CH4减排的技术措施。

关键词：水稻 CH4 耕作制度

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