检索结果-内蒙古大学图书馆

浙江农业学报 2019年第5期31卷 777-783页

作者：张岩亓玉华鲁燕华杨乾坤何雨娟李俊敏陈剑平福建农林大学植物保护学院福建福州350002 浙江省植物有害生物防控国家重点实验室培育基地农业农村部/浙江省植保生物技术重点实验室浙江省农业科学院病毒学与生物技术研究所浙江杭州310021 宁波大学植物病毒学研究所浙江宁波315211

小麦黄花叶病毒(Wheat yellow mosaic virus,WYMV)隶属于马铃薯Y病毒科(Potyviridae)大麦黄花叶病毒属(Bymovirus),其基因组由两条正义单链RNA组成,共编码10个蛋白。先前的研究表明,马铃薯Y病毒组多种病毒编码的保守蛋白P3具有多种功能... 详细信息

小麦黄花叶病毒(Wheat yellow mosaic virus,WYMV)隶属于马铃薯Y病毒科(Potyviridae)大麦黄花叶病毒属(Bymovirus),其基因组由两条正义单链RNA组成,共编码10个蛋白。先前的研究表明,马铃薯Y病毒组多种病毒编码的保守蛋白P3具有多种功能,在病毒复制、致病性、克服宿主抗性、细胞间移动等方面均具有重要作用,而P3在大麦黄花叶病毒属中是否有类似功能目前还未见报道。本研究利用烟草脆裂病毒(Tobacco rattle virus,TRV)介导的本氏烟基因沉默系统,明确了WYMV的P3碳端在本氏烟上具有致病功能域P3-C,但完整的P3则不具有致病能力。进一步移码突变研究表明,P3-C的致病性是由其编码的多肽引起的,而非病毒来源的小干扰RNA介导的宿主基因沉默。同时P3-C的两个跨膜结构域对致病性具有重要作用,单独表达任何一个跨膜结构域P3-C均不能在本氏烟上引起明显症状。

关键词：小麦黄花叶病毒 P3蛋白致病性

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中国茶园生态经济价值的影响因素分析

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江苏农业科学 2019年第8期47卷 340-343页

作者：郑蓉蓉徐学荣福建农林大学植物病毒研究所/福建省植物病毒学重点实验室福建福州350002 福建农林大学安溪茶学院福建泉州362406 福建农林大学经济学院福建福州350002

借鉴Hartman模型构建茶园价值评价模型,并对福建省安溪县茶园生态经济价值进行实证分析。动态分析茶龄、毛茶价格、劳动力价格、贴现率、病虫受害率等因素对茶园生态经济价值的影响。结果表明,随着茶龄的增加,茶园的生态经济价值呈现出... 详细信息

借鉴Hartman模型构建茶园价值评价模型,并对福建省安溪县茶园生态经济价值进行实证分析。动态分析茶龄、毛茶价格、劳动力价格、贴现率、病虫受害率等因素对茶园生态经济价值的影响。结果表明,随着茶龄的增加,茶园的生态经济价值呈现出先上升后下降的趋势;毛茶价格与茶园生态经济价值呈正相关;劳动力价格与茶园生态经济价值呈线性负相关;贴现率越高,茶园生态经济价值越低,并缩短茶园经济有效寿命;随着病虫受害率的上升,茶园生态经济价值(综合收益最大净现值)不断下降,当病虫受害率从0增加到25%时,茶园综合收益最大净现值从43 979.27元/hm^2下降到15 649.32元/hm^2,下降率近65%。以期为推进茶产业可持续发展提供对策建议。

关键词：生态经济茶树病虫害因素分析价值评估茶产业

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福建省六种草莓病毒的分子检测

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植物保护学报 2018年第6期45卷 1433-1434页

作者：陈道丁新伦张洁谢荔岩吴祖建福建农林大学植物病毒研究所闽台作物有害生物生态防控国家重点实验室福建省植物病毒重点实验室福州350002

我国是世界上草莓栽培面积最大、产量最多的国家,草莓病毒病是影响草莓生产的重要因素之一。在我国,草莓斑驳病毒(Strawberry mottle virus,SMoV)、草莓皱缩病毒(Strawberry crinkle virus,SCV)、草莓镶脉病毒(Strawberry vein banding ... 详细信息

我国是世界上草莓栽培面积最大、产量最多的国家,草莓病毒病是影响草莓生产的重要因素之一。在我国,草莓斑驳病毒(Strawberry mottle virus,SMoV)、草莓皱缩病毒(Strawberry crinkle virus,SCV)、草莓镶脉病毒(Strawberry vein banding virus,SVBV)和草莓轻型黄边病毒(Strawberry mild yellow edge virus,SMYEV)分布广、危害重(王国平等,1991);近年来草莓坏死休克病毒(Strawberry necrotic shockvirus,SNSV)(Li & Yang,2011)、黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)(Chen et al.,2014)和草莓白化病毒(Strawberry pallidosis-associated virus,SPaV)(Ding et al.,2017)也相继被报道。

关键词：草莓生产病毒病分子检测福建省草莓镶脉病毒黄瓜花叶病毒 mosaic 栽培面积

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竹花叶病毒福州分离物基因组序列分析及其侵染性克隆的构建

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林业科学 2017年第8期53卷 35-42页

作者：闫文凯林文武杨文婷杜雅馨吴祖建杨靓福建农林大学植物病毒研究所福建省植物病毒学重点实验室福州350002

【目的】研究BaMV福州分离物BaMV-TMS1及其携带的卫星RNA(satBaMV)分离物satBaMV-TMS1的全基因组特征,明确其系统发育关系;对BaMV进行c DNA侵染性克隆构建方法的改进,为其反向遗传学体系的快速建立提供简便的方法。【方法】根据已报道的... 详细信息

【目的】研究BaMV福州分离物BaMV-TMS1及其携带的卫星RNA(satBaMV)分离物satBaMV-TMS1的全基因组特征,明确其系统发育关系;对BaMV进行c DNA侵染性克隆构建方法的改进,为其反向遗传学体系的快速建立提供简便的方法。【方法】根据已报道的BaMV和satBaMV全长序列保守区分别设计2对和1对扩增引物,从感染BaMV的竹叶中扩增、克隆获得BaMV-TMS1和satBaMV-TMS1的全长序列,并进行序列特征分析和系统发育树构建。采用多片段无缝克隆方法将扩增得到的2个病毒DNA片段和载体进行连接并转化农杆菌,接种本氏烟后检验其侵染性。【结果】测序获得的BaMV-TMS1和satBaMV-TMS1分离物核苷酸序列全长分别为6 366和834 nt(不含3'端的多聚腺苷酸尾),具有典型的BaMV和satBaMV基因组结构特征。BaMV-TMS1分离物与已报道的其他分离物序列同源性为82%~83%,而satBaMV-TMS1分离物与其他分离物的序列同源性为92%~93%。系统进化树分析表明,BaMV-TMS1分离物可单独形成一簇,satBaMV-TMS1分离物也单独形成一个新的分支。侵染性克隆通过农杆菌注射接种本氏烟10天以后,RT-PCR检测以及透射电镜负染观察结果都验证病毒成功侵染。【结论】BaMV-TMS1和satBaMV-TMS1分离物与已知序列有着较高的变异度且生成新的系统发育树分支,体现了该病毒与卫星RNA较高的遗传多样性。本研究成功构建具有生物活性的BaMV侵染性克隆且构建方法相对简单快速。

关键词：竹花叶病毒卫星RNA 全基因组系统发育侵染性克隆

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水稻齿叶矮缩病毒Pns10蛋白在水稻原生质体内的表达

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中国水稻科学 2017年第3期31卷 232-237页

作者：张洁陈晓敏吴锦鸿朱重庆丁新伦吴祖建福建农林大学植物病毒研究所/福建省植物病毒学重点实验室福州350002

【目的】水稻齿叶矮缩病毒(Rice ragged stunt virus,RRSV)Pns10蛋白在介体昆虫细胞内可形成类似病毒原质(viroplasm)的内含体,是RRSV侵染介体所必需。然而Pns10蛋白在水稻寄主中是否具有类似功能及其表达情况如何未见报道。【方法】利... 详细信息

【目的】水稻齿叶矮缩病毒(Rice ragged stunt virus,RRSV)Pns10蛋白在介体昆虫细胞内可形成类似病毒原质(viroplasm)的内含体,是RRSV侵染介体所必需。然而Pns10蛋白在水稻寄主中是否具有类似功能及其表达情况如何未见报道。【方法】利用大肠杆菌系统表达Pns10蛋白,免疫家兔制备多克隆抗体;通过水稻原生质体病毒侵染体系,利用免疫荧光技术分析Pns10蛋白在水稻原生质体内的分布情况,利用实时定量PCR技术和Western blot技术分别检测Pns10 RNA和Pns10蛋白在水稻原生质体内的积累情况。【结果】将Pns10基因克隆到Gateway系统原核表达载体p DEST17中,IPTG诱导表达成功后,制备融合蛋白抗血清。Western blot检测显示,该抗血清可检测感病水稻叶片中的Pns10蛋白。病毒侵染水稻原生质体后,Pns10蛋白可形成类似病毒原质的内含体;Pns10 RNA在病毒接种8 h后开始积累,24 h后达到最大值,随后开始下降;Pns10蛋白在24 h后开始表达,之后维持较高水平,60 h后略有下降。【结论】成功获得了Pns10抗血清;Pns10在水稻原生质体内成功表达,可形成类似病毒原质的内含体,并且Pns10 RNA的表达先于其蛋白的表达。

关键词：水稻齿叶矮缩病毒水稻原生质体 Pns10抗体 Pns10RNA Pns10蛋白

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利用RSV的“抓帽”鉴定TYLCV的转录起始位点

利用RSV的“抓帽”鉴定TYLCV的转录起始位点

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中国植物病理学会第十一届全国会员代表大会暨2018年学术年会

作者：林文忠丘萍金晶刘顺民吴然林晨杜振国吴祖建福建农林大学植物病毒研究所福建省植物病毒学重点实验室

多分体负义RNA病毒(segmented negative-sense RNA viruses,sNSV)普遍采取"抓帽机制"来合成含帽子结构的信使RNA(mRNA),即它们从寄主mRNA抓取一段10～20个碱基的帽子序列,然后以这段帽子序列为引物,转录自身基因组,生成在5端... 详细信息

多分体负义RNA病毒(segmented negative-sense RNA viruses,sNSV)普遍采取"抓帽机制"来合成含帽子结构的信使RNA(mRNA),即它们从寄主mRNA抓取一段10～20个碱基的帽子序列,然后以这段帽子序列为引物,转录自身基因组,生成在5端含一段"异源"帽子序列的病毒mRNA。水稻条纹病毒(Rice stripe tenuivirus,RSV)是一种重要的植物sNSV。近年,本实验室建立了一种高通量测序技术,可以方便且低成本地测取RSV抓取的帽子序列。番茄黄化曲叶病毒(Tomato yellow leaf curl virus,TYLCV)是一种重要的双生病毒。虽然已知TYLCV基因组含6个开放阅读框(ORF),但TYLCV基因组上的转录起始位点(transcription start sites,TSS),目前还不清楚。本研究首先建立了一种方法,可以稳定地获得RSV与TYLCV共侵染的本氏烟(Nicotiana benthamiana)。接着,本研究取RSV和TYLCV共侵染,或RSV单独侵染的本氏烟(阴性对照),以高通量测序技术测取了RSV抓取的帽子序列,分别获得库1(混合侵染)和库2(单独侵染)。将库1中的帽子序列Map到TYLCV基因组,获得TYLCV转录起始位点(即帽子序列第一个碱基)21个,其中,TYLCV病毒链9个,反义链12个;库1中能Map到TYLCV的帽子序列,仅有49条(4个unique)也存在于库2中,这表明多数Map到TYLCV的帽子序列来自TYLCV mRNA,而非寄主mRNA.上述结果表明RSV的"抓帽"可以作为一种工具,鉴定TYLCV的TSS。与传统的RACE实验相比,"抓帽"具有明显的优势:①不必针对每条mRNA设计和筛选不同的引物;②所有TSSs在同一高通量测序反应中获得;③在所得信息量相同的条件下,"抓帽"比传统的RACE实验花费低。

关键词：水稻条纹病毒番茄黄化曲叶病毒转录起始位点 "抓帽"

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云南致病疫霉RXLR效应子Pi02860遗传多样性分析

云南致病疫霉RXLR效应子Pi02860遗传多样性分析

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中国植物病理学会第十一届全国会员代表大会暨2018年学术年会

作者：刘浩黄艳媚范玉萍杨丽娜欧阳海兵詹家绥福建农林大学植物病毒研究所/福建省植物病毒学国家重点实验室

马铃薯是我国重要的粮食作物,由致病疫霉引起的马铃薯晚疫病是马铃薯的毁灭性病害,效应子是病原菌侵染寄主过程中分泌的、破坏寄主免疫、促进自身侵染的小分子蛋白,在病害发生和流行过程中起至关重要的作用;Pi02860是致病疫霉RXLR核心... 详细信息

马铃薯是我国重要的粮食作物,由致病疫霉引起的马铃薯晚疫病是马铃薯的毁灭性病害,效应子是病原菌侵染寄主过程中分泌的、破坏寄主免疫、促进自身侵染的小分子蛋白,在病害发生和流行过程中起至关重要的作用;Pi02860是致病疫霉RXLR核心效应子,全长136个氨基酸,在侵染寄主第二天其表达量显著上调,显著抑制寄主INF1引起的基础免疫,并显著促进自身的侵染。本研究对采自云南同一地点、不同海拔的5个致病疫霉群体354个菌株的Pi02860基因进行扩增测序,综合遗传学、生物学及生物信息学的研究方法对Pi02860进行研究。通过分析Pi02860核苷酸及氨基酸序列了解其遗传多样性、变异类型、受到的选择压力类型,通过不同温度处理,分析温度对Pi02860表达量的影响。结果发现Pi02860变异类型主要是核苷酸的替换和缺失。核苷酸多样性分布在0.001 65～0.002 74,单倍型多样性分布在0.549 9～0.679 1。354个样本中检测到21个不同单倍型,其中频率最高的单倍型为H（频率高达54.24%）,频率最低的单倍型为H-H1（频率仅0.28%）。随着海拔的增高,Pi02860多态性越来越丰富,其单倍型数、群体特有单倍型数、核苷酸多样性与海拔均呈显著正相关。使用IFEL、MEME、REL三种方法进行选择压力分析,发现第48个密码子可能受到正向选择压力。

关键词：致病疫霉效应子遗传多样性

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3种马铃薯病原菌多重PCR检测方法的建立

3种马铃薯病原菌多重PCR检测方法的建立

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中国植物病理学会第十一届全国会员代表大会暨2018年学术年会

作者：王甜沈林林谢家慧王艳平周世豪汤一凡詹家绥福建农林大学植物病毒研究所/福建省植物病毒学国家重点实验室

根据马铃薯上的3种病原菌,即致病疫霉(Phytophthora infestans)、立枯丝核菌(Rhizoctonia solani)AG3融合群和茄链格孢菌(Alternaria solani)的核苷酸保守序列,分别设计3对特异引物,从影响多重PCR扩增的因素,如退火温度和引物比例,对反... 详细信息

根据马铃薯上的3种病原菌,即致病疫霉(Phytophthora infestans)、立枯丝核菌(Rhizoctonia solani)AG3融合群和茄链格孢菌(Alternaria solani)的核苷酸保守序列,分别设计3对特异引物,从影响多重PCR扩增的因素,如退火温度和引物比例,对反应体系进行了优化,建立了一种能够同时检测致病疫霉、立枯丝核菌和茄链格孢菌的多重PCR检测体系。结果表明,该检测体系具有较高的灵敏度和良好的特异性。致病疫霉、立枯丝核菌和茄链格孢菌基因组DNA的检测限依次为:10pg/μL、1pg/μL和1pg/μL。该检测方法实现了对马铃薯上的3种病原菌的高效、快速的同时检测,提高了检测效率,降低了检测成本,具有较高的应用价值,可应用于这3种病害的早期诊断和病原菌的监测、鉴定,为防治病害提供可靠的技术和理论支持。

关键词：致病疫霉立枯丝核菌茄链格孢菌分子检测三重PCR

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不同温度下致病疫霉效应子Pi02860表达差异的研究

不同温度下致病疫霉效应子Pi02860表达差异的研究

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中国植物病理学会第十一届全国会员代表大会暨2018年学术年会

作者：欧阳海兵王艳平范玉萍谢家慧孙丹丽杨丽娜詹家绥福建农林大学植物病毒研究所福建省植物病毒学国家重点实验室

马铃薯是重要粮食作物,由致病疫霉引起的晚疫病是马铃薯上毁灭性病害,也是国际第一大作物病害,其防治难度大,危害程度高,对社会的影响深远。致病疫霉效应子是致病疫霉菌攻击马铃薯的重要武器,其快速变异和进化是马铃薯垂直抗性丧失的主... 详细信息

马铃薯是重要粮食作物,由致病疫霉引起的晚疫病是马铃薯上毁灭性病害,也是国际第一大作物病害,其防治难度大,危害程度高,对社会的影响深远。致病疫霉效应子是致病疫霉菌攻击马铃薯的重要武器,其快速变异和进化是马铃薯垂直抗性丧失的主要原因,分子信息学预测致病疫霉基因组内至少含有550个RXLR效应子。Pi02860是致病疫霉RXLR核心效应子,然而其抗性基因尚未发掘,而非生物因素一温度,是决定病原菌种群分化和作物病害爆发的关键因子,对植物-病原菌互作有重要影响。本文采用分子生物学方法,研究Pi02860及其15个突变体的功能,通过构建表达载体,利用农杆菌介导的方法在本氏烟草上进行瞬时表达,检测各突变体对寄主INF1引起的免疫抑制作用,对晚疫病菌侵染的促进作用以及其亚细胞定位情况。研究表明,效应子Pi02860及其突变体促进致病疫霉的侵染;对烟草免疫系统的抑制作用;突变体亚细胞定位于细胞质和细胞核中。同时研究不同温度下Pi02860表达量的差异。即用14个晚疫病菌分别在10℃、18℃、25℃三个不同温度下侵染离体马铃薯叶片,通过RT-qPCR检测效应子Pi02860的基因表达量。研究发现,不同温度下,不同单倍型的晚疫病菌株关于Pi02860表达量存在很大差别,在侵染后第二天,50%以上的菌株在10℃表达很高,20%的菌株在18℃或25℃下有所表达,但表达量相对较低,20%的菌株基本不表达,结果显示,菌株特异性表达效应子Pi02860;温度对Pi02860表达有重要影响,相对于18℃和25℃,10℃下Pi02860表达量更高。

关键词：致病疫霉效应子温度

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不同海拔马铃薯致病疫霉效应子AVR2,AVR3a,PI04314及PI02860的群体遗传结构分析

不同海拔马铃薯致病疫霉效应子AVR2,AVR3a,PI04314及PI02860的群...

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中国植物病理学会第十一届全国会员代表大会暨2018年学术年会

作者：黄艳媚李源周世豪杨丽娜欧阳海兵刘浩詹家绥福建农林大学植物病毒研究所/福建省植物病毒学国家重点实验室

致病疫霉基因组至少含有550个RXLR效应子。自从发现效应子AVR3a功能及寄主互作蛋白后,其他效应子的功能也陆续报道出来。但是对致病疫霉效应子群体遗传结构及演化的研究相对较少,且大多是对不同国家和地区的致病疫霉菌株的研究,对同一... 详细信息

致病疫霉基因组至少含有550个RXLR效应子。自从发现效应子AVR3a功能及寄主互作蛋白后,其他效应子的功能也陆续报道出来。但是对致病疫霉效应子群体遗传结构及演化的研究相对较少,且大多是对不同国家和地区的致病疫霉菌株的研究,对同一地区不同海拔高达的研究极少,不同海拔的病原菌所生存的环境差异很大,本研究以致病疫霉效应子AVR2,AVR3a,PI04314,PI02860为研究对象,了解中国云南同一山峰不同海拔致病疫霉效应子群体遗传结构、种群分化机制及种群分化与寄主的关系。(1)本研究组在2016年晚疫病发病中期于云南宣威(E 104°,N 26°)按照海拔(跨度700m)不同划分5个群体,共采集354个致病疫霉样本,后对效应子基因AVR2,AVR3a,PI04314,PI02860等进行扩增测序。(2)效应子基因的群体遗传结构:分析5个群体的AVR2,AVR3a,PI04314,PI02860效应子基因的核苷酸、氨基酸、单倍体多样性及其空间分布,估算效应子基因种群分化系数,构建效应子基因单倍体网络。(3)效应子基因种群分化机制:分析AVR2,AVR3a,PI04314,PI02860效应子基因同义与非同义突变的比例,中性检测系数,有效群体量的历史变迁,群体间遗传物质的交换程度及流向,地理间隔和遗传物质交换程度的相关性,以明确突变、自然选择、瓶颈效应和基因流在效应子基因种群分化中的作用。

关键词：致病疫霉效应子群体遗传结构海拔

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