检索结果-内蒙古大学图书馆

化学教育(中英文) 2025年第4期46卷 108-113页

作者：何佳妮张明超潘清蔡开聪福建师范大学化学与材料学院福建省先进材料化工基础重点实验室福建福州350117 厦门大学福建省理论与计算化学重点实验室福建厦门361005

从化学键振动运动角度阐述红外光谱特征吸收峰形成的化学本质。借助势能分布(PED)分析,指认丙氨酸二肽分子内酰胺-I带的振动吸收峰并解析其振动运动的组成,进而阐明化学键的伸缩、扭转等运动方式对特征振动模式的贡献,揭示分子振动离域... 详细信息

从化学键振动运动角度阐述红外光谱特征吸收峰形成的化学本质。借助势能分布(PED)分析,指认丙氨酸二肽分子内酰胺-I带的振动吸收峰并解析其振动运动的组成,进而阐明化学键的伸缩、扭转等运动方式对特征振动模式的贡献,揭示分子振动离域化现象及不同化学环境下特征振动吸收峰的频移现象,从而深化学生对分子振动与红外光谱的认识。

关键词：红外光谱振动运动势能分布分析 VEDA程序

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

三种类石墨烯中单空位和双空位的形成：第一性原理计算

引用

计算物理 2025年

作者：吴婷婷陈为立曹昕睿吴顺情朱梓忠厦门大学物理科学与技术学院福建省理论与计算化学重点实验室

采用基于密度泛函理论的第一性原理方法，对三种类石墨烯材料（即 T 石墨烯、HOT 石墨烯和 net W 碳单层）中单空位和双空位的形成能以及电子结构性质进行了计算。结果表明，这三种类石墨烯中双空位的形成能总是低于单空位的形成能，并... 详细信息

采用基于密度泛函理论的第一性原理方法，对三种类石墨烯材料（即 T 石墨烯、HOT 石墨烯和 net W 碳单层）中单空位和双空位的形成能以及电子结构性质进行了计算。结果表明，这三种类石墨烯中双空位的形成能总是低于单空位的形成能，并且HOT石墨烯具有最小的单空位和双空位形成能。当存在单空位时，T石墨烯由金属转变为半导体，HOT石墨烯由半金属转化为金属，而net W碳单层仍为金属，双空位则不改变体系的电子性质。此外，对于这三种类石墨烯，单空位体系都具有弱磁性和平带，平带处的态密度主要来自px轨道，py轨道或px，py轨道的共同贡献。差分电荷密度图显示，空位的存在对整体电荷密度的影响是相当局域的。

关键词：空位电子结构类石墨烯第一性原理计算

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

能量分解分析方法及其在水团簇多体效应中的应用

引用

大学化学 2025年第3期40卷 100-107页

作者：陆星元姚宇涛谷俊井苏培峰厦门大学化学化工学院福建厦门361005 福建省理论与计算化学重点实验室福建厦门361005 固体表面物理化学国家重点实验室(厦门大学) 福建厦门361005

能量分解分析方法是一种研究分子相互作用的定量分析理论方法,在分子自组装、药物设计、化学反应机理、力场发展等各个领域得到广泛应用。现有化学本科教材对分子相互作用的讲授过于浅显,逐渐不适应现在化学系本科的培养要求。为深化大... 详细信息

能量分解分析方法是一种研究分子相互作用的定量分析理论方法,在分子自组装、药物设计、化学反应机理、力场发展等各个领域得到广泛应用。现有化学本科教材对分子相互作用的讲授过于浅显,逐渐不适应现在化学系本科的培养要求。为深化大学本科学生对分子相互作用的认知,本文简述了能量分解分析方法的基本概念,介绍了具有代表性的广义Kohn-Sham能量分解分析(GKS-EDA)方法及其在六聚水多体效应中的应用。

关键词：能量分解分析水团簇多体效应

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

基于轻量级深度神经网络的核磁共振波谱降噪

引用

物理化学学报 2025年第2期41卷 90-97页

作者：詹昊霖房启元刘佳伟史晓琦陈心语黄玉清陈忠合肥工业大学仪器科学与光电工程学院生物医学工程系测量理论与精密仪器安徽省重点实验室合肥230009 厦门大学电子科学系福建省等离子体与磁共振重点实验室固体表面物理化学国家重点实验室福建厦门361005

核磁共振(NMR)波谱是一种用于探测分子结构和提供定量分析的稳健的非侵入性表征技术。然而,进一步的NMR应用通常受到低灵敏度性能的限制,尤其是对于异核实验。在此,我们提出了一种轻量级的深度学习协议,用于高质量、可靠和快速的NMR波... 详细信息

核磁共振(NMR)波谱是一种用于探测分子结构和提供定量分析的稳健的非侵入性表征技术。然而,进一步的NMR应用通常受到低灵敏度性能的限制,尤其是对于异核实验。在此,我们提出了一种轻量级的深度学习协议,用于高质量、可靠和快速的NMR波谱降噪。该深度学习(DL)协议具有轻量级的网络优势和快速的计算效率,有效地抑制噪声和伪峰信号,并恢复几乎完全淹没在严重噪声中的目标弱峰,从而实现了可观的信噪比提升。此外,它仅使用物理驱动的仿真NMR数据学习,在频域中实现令人满意的波谱去噪,并允许区分真实信号和噪声伪影。此外,训练的轻量级网络模型通用于一维和多维NMR波谱,并适用于不同的化学样品。因此,本研究呈现的深度学习方法在化学、生物学、材料和生命科学等领域具有应用潜力。

关键词：核磁共振波谱人工智能深度学习谱图去噪轻量级网络

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

符合独立五元环规则的C_(100)(417)Cl_(28)形成机理的密度泛函理论研究

引用

物理化学学报 2018年第3期34卷 256-262页

作者：尹凡华谭凯厦门大学化学化工学院、福建省理论与计算重点实验室福建厦门361005

实验上捕获到C_(100)(417)Cl_(28),但其形成机理仍不清楚。本文采用密度泛函理论(DFT)方法研究了生成C_(100)(417)Cl_(28)的反应机理,考虑了可能的经Stone-Wales(SW)转化、直接氯化和来自于骨架转变等反应路径。结果表明:C_(100)(417)Cl... 详细信息

实验上捕获到C_(100)(417)Cl_(28),但其形成机理仍不清楚。本文采用密度泛函理论(DFT)方法研究了生成C_(100)(417)Cl_(28)的反应机理,考虑了可能的经Stone-Wales(SW)转化、直接氯化和来自于骨架转变等反应路径。结果表明:C_(100)(417)Cl_(28)形成的最主要来源是通过C_(102)(603)骨架转变,即经历氯化、C_2失去和SW转变而来。该结果能很好解释实验结果,对富勒烯氯化物的合成提供了理论依据。

关键词：密度泛函理论富勒烯氯化物骨架转变

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

基于完全活性空间自洽场的杂化多组态密度泛函方法λ-DFCAS

引用

高等学校化学学报 2021年第7期42卷 2218-2226页

作者：应富鸣计辰儒苏培峰吴玮厦门大学固体表面物理化学国家重点实验室福建省理论与计算化学重点实验室化学化工学院厦门361005

提出了一种杂化多组态密度泛函新方法——λ-DFCAS.在λ-DFCAS方法中,电子相关能被分为静态和动态相关能.静态相关能由多组态波函数方法完全活性空间自洽场(CASSCF)得到,而动态相关能由密度泛函理论方法描述.两种相关能的杂化比例由一... 详细信息

提出了一种杂化多组态密度泛函新方法——λ-DFCAS.在λ-DFCAS方法中,电子相关能被分为静态和动态相关能.静态相关能由多组态波函数方法完全活性空间自洽场(CASSCF)得到,而动态相关能由密度泛函理论方法描述.两种相关能的杂化比例由一个可调节的参数λ控制.参数λ的取值取决于分子体系的多组态特性,在0~1之间变化,从而使得λ-DFCAS可以应用于各种强相关分子体系.该方法能够以与CASSCF相当的计算代价获得接近完全活性空间二阶微扰(CASPT2)的计算精度,并具备了大小一致性.

关键词：完全活性空间自洽场方法密度泛函理论多组态电子相关

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

单壁AlAs(111)纳米管结构和电子性质的密度泛函理论研究

引用

物理化学学报 2017年第3期33卷 548-553页

作者：王玮谭凯厦门大学化学化工学院化学系福建省理论与计算化学重点实验室福建厦门361005

通过卷曲立方AlAs(111)单层片(sheets)构造了一系列(n,0)和(n,m)一维单壁纳米管。用周期性密度泛函理论(DFT)计算并比较了不同类型AlAs纳米管在几何结构、能量及电子性质等方面的差别。计算结果表明锯齿型和椅型纳米管应变能均为负值,... 详细信息

通过卷曲立方AlAs(111)单层片(sheets)构造了一系列(n,0)和(n,m)一维单壁纳米管。用周期性密度泛函理论(DFT)计算并比较了不同类型AlAs纳米管在几何结构、能量及电子性质等方面的差别。计算结果表明锯齿型和椅型纳米管应变能均为负值,并随着管径变大而逐渐变小。然而,它们的带隙相当不同:椅型纳米管为间接带隙,随着管径的增大而带隙减小;锯齿型纳米管为直接带隙,管径为1.87 nm时存在着一个极大带隙值(2.11 eV)。这种不同主要源于锯齿型纳米管铝原子间3p轨道的耦合贡献。

关键词：密度泛函理论砷化铝锯齿型椅型纳米管

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

乳胶清除蛋白LcpK30催化氧气裂解聚顺-1,4异戊二烯机理

引用

科学通报 2021年第22期66卷 2887-2897页

作者：吴鹏陈倩倩王斌举厦门大学化学化工学院固体表面物理化学国家重点实验室厦门361005 福建省理论与计算化学重点实验室厦门361005

乳胶清除蛋白LcpK30是一种内型双加氧酶,其通过活化分子氧催化裂解化学惰性的聚顺-1,4异戊二烯,进而生成醛和酮.实验发现活性区域的谷氨酸148对活性有重大影响,然而其作用机制和整个反应机理仍然存在争议.本研究使用量子力学/分子力学... 详细信息

乳胶清除蛋白LcpK30是一种内型双加氧酶,其通过活化分子氧催化裂解化学惰性的聚顺-1,4异戊二烯,进而生成醛和酮.实验发现活性区域的谷氨酸148对活性有重大影响,然而其作用机制和整个反应机理仍然存在争议.本研究使用量子力学/分子力学组合方法研究了乳胶清除蛋白催化分子氧氧化裂解天然橡胶模型化合物的反应机理.计算结果显示谷氨酸148在反应过程中为质子化态,并与铁(Ⅲ)-超氧物种形成稳定氢键,因此其作用可能与调节铁(Ⅲ)-超氧物种与底物的位置有关.可能反应机理为:(1)铁(Ⅲ)-超氧物种的远端氧进攻底物碳碳双键,形成过氧烃自由基中间体;(2)近端氧回弹到碳自由基,形成过氧化物中间体和铁(Ⅱ)中心;(3)铁(Ⅱ)调节的过氧化物中间体O–O键还原裂解,生成邻二醇自由基负离子中间体;(4)邻二醇自由基负离子C–C键断裂,生成产物醛和酮.此外,计算发现,过氧化物中间体O–O键直接断裂反应能垒超过160 kJ/mol,表明铁(Ⅱ)的催化对于过氧化物中间体的后续转化至关重要.因此,本研究结果不仅加深对于Lcp_(K30)反应机理的理解,而且为Lcp酶降解合成橡胶材料的设计和工程化提供有用信息.

关键词：乳胶清除蛋白催化量子力学/分子力学组合方法反应机理橡胶降解血红素酶

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

经典价键理论的从头算计算方法

引用

化学进展 2012年第6期24卷 1001-1007页

作者：苏培峰吴玮固体表面国家重点实验室、厦门大学化学化工学院、福建省理论与计算化学重点实验室厦门361005

价键理论是两大现代化学键理论之一,广泛应用于化学键本质和化学反应机理的研究。由于计算困难,价键理论应用局限于定性的讨论而无法有效地开展从头计算研究。现代经典价键理论在经典价键理论的理论基础上,引入合理有效的计算方法,提高... 详细信息

价键理论是两大现代化学键理论之一,广泛应用于化学键本质和化学反应机理的研究。由于计算困难,价键理论应用局限于定性的讨论而无法有效地开展从头计算研究。现代经典价键理论在经典价键理论的理论基础上,引入合理有效的计算方法,提高了价键计算的效率。本文回顾近年来经典价键理论从头算方法在提高计算精度和拓展研究范围方面的发展,并简要展望价键理论方法的发展趋势。

关键词：从头算价键方法发展复杂体系

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

甘氨酸二肽分子酰胺-Ⅰ带光谱与结构相关性

引用

物理化学学报 2016年第5期32卷 1289-1296页

作者：蔡开聪郑轩刘亚男留珊红杜芬芬福建师范大学化学与化工学院福州350007 福建省理论与计算化学重点实验室福建厦门361005

系统探索了蛋白质二肽模型分子——甘氨酸二肽(GLYD)在气相与水溶液中的结构与光谱特性。从分子动力学轨迹中提取具有代表性结构的GLYD-D_2O聚集体的瞬态结构开展简正模式分析,获取了对蛋白质二级结构敏感的酰胺-Ⅰ带的振动光谱参数,建... 详细信息

系统探索了蛋白质二肽模型分子——甘氨酸二肽(GLYD)在气相与水溶液中的结构与光谱特性。从分子动力学轨迹中提取具有代表性结构的GLYD-D_2O聚集体的瞬态结构开展简正模式分析,获取了对蛋白质二级结构敏感的酰胺-Ⅰ带的振动光谱参数,建立起振动光谱与特征基团结构间的相关性。将溶剂作用以静电势场的形式投影至二肽分子骨架中,与酰胺-Ⅰ带在气/液相中的频率差相关联,并引入酰胺-Ⅰ带简正模式随二级结构变化的规律,将各个构象态可能存在的振动耦合包含在内,构建具有二级结构敏感性的静电频率转换图,实现溶液相中多肽骨架酰胺-Ⅰ带的快速准确预测。

关键词：甘氨酸二肽酰胺-Ⅰ带振动光谱静电频率图

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：

通借通还

建议与咨询 留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

请选择保存的检索档案： 新增检索档案 确定 取消

请选择收藏分类： 新增自定义分类 确定 取消

通借通还

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：