检索结果-内蒙古大学图书馆

基于生物信息学筛选区分人类免疫缺陷病毒感染和人类免疫缺陷病毒/结核分枝杆菌共感染的基因表达特征

疾病监测 2024年第10期39卷 1308-1313页

作者：王龙昊吕恒梁徐元勇张文义陆军军医大学军事预防医学系军队卫生统计学教研室重庆400038 中国医科大学公共卫生学院流行病学教研室辽宁沈阳110000 中国人民解放军疾病预防控制中心北京100071

目的筛选用于区分人类免疫缺陷病毒(HIV)感染和HIV/结核分枝杆菌(MTB)共感染的外周血潜在的基因表达特征。方法首先从基因表达总览(GEO)数据库下载数据集GSE50834,分为HIV感染患者和HIV/MTB共感染患者两组进行差异分析,将差异表达基因(D... 详细信息

目的筛选用于区分人类免疫缺陷病毒(HIV)感染和HIV/结核分枝杆菌(MTB)共感染的外周血潜在的基因表达特征。方法首先从基因表达总览(GEO)数据库下载数据集GSE50834,分为HIV感染患者和HIV/MTB共感染患者两组进行差异分析,将差异表达基因(DEGs)进行基因本体(GO)功能注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,然后构建蛋白质相互作用网络(PPI)并筛选关键基因,通过受试者工作特征(ROC)曲线分析关键基因的诊断价值,以及通过加权基因共表达网络(WGCNA)分析进行验证,从而得到有价值的基因表达特征。结果共筛选得到100个DEGs,其中上调基因58个,下调基因42个。GO功能注释显示,DEGs主要集中在炎症反应、细胞质膜和与碳水化合物结合等功能;KEGG通路富集分析显示,DEGs主要集中在补体凝血级联和趋化因子信号通路。从PPI网络获得4个关键基因,ROC分析显示均有较高的诊断价值,在WGCNA连接度较高的基因集中找到了CXC基序趋化因子配体2(CXCL2)、前血小板碱性蛋白(PPBP)和CXC基序趋化因子配体10(CXCL10)基因。结论CXCL2、PPBP和CXCL10基因可以作为区分HIV感染和HIV/MTB共感染重要的基因表达特征,为相关生物标志物的探索提供一定的思路。

关键词：人类免疫缺陷病毒结核分枝杆菌共感染生物信息学基因表达特征

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肿瘤相关巨噬细胞的脂质代谢重编程

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四川大学学报(医学版) 2021年第1期52卷 45-49页

作者：赵昆时荣臣缪洪明中国人民解放军陆军军医大学(第三军医大学)基础医学院生物化学与分子生物学教研室

肿瘤相关巨噬细胞(tumor associated macrophages,TAMs)是实质肿瘤中最常见的间质细胞类型之一,且与肿瘤微环境的免疫抑制状态有着紧密联系,并促进肿瘤的恶性进展。TAMs内的代谢发生了重编程,并且参与调控其自身的极化以及相应的功能表... 详细信息

肿瘤相关巨噬细胞(tumor associated macrophages,TAMs)是实质肿瘤中最常见的间质细胞类型之一,且与肿瘤微环境的免疫抑制状态有着紧密联系,并促进肿瘤的恶性进展。TAMs内的代谢发生了重编程,并且参与调控其自身的极化以及相应的功能表型。本文详细论述了TAMs中包括三酰甘油、脂肪酸及其衍生物、胆固醇和磷脂在内的脂质代谢重编程以及它们对肿瘤进展的调控。然而,肿瘤细胞与肿瘤微环境间质细胞的代谢极具异质性。肿瘤细胞与间质细胞之间脂代谢重编程的异同点以及重编程如何调控细胞活性的机制值得深入探索。同时,综合考虑肿瘤不同的组织类型、不同的发展阶段,精准靶向干预TAMs脂质代谢重编程,促进TAMs向M1样巨噬细胞极化,将成为代谢调节肿瘤免疫治疗的新策略。

关键词：肿瘤相关巨噬细胞免疫抑制脂质代谢重编程肿瘤进展

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新型NEA/Al(OH)_(3)复合佐剂系统的构建、优化及其增强MRSA重组亚单位疫苗的免疫保护效应研究

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免疫学杂志 2023年第2期39卷 176-184页

作者：曾小强罗兴叶演杨赟孙红武曾浩陆军军医大学药学与检验医学系微生物与生化药学教研室暨国家免疫生物制品工程技术研究中心重庆400038

目的以具有自主知识产权的纳米乳(NEA)和商品化的氢氧化铝[Al(OH)_(3)]作为配方组分,制备出新型NEA/Al(OH)_(3)复合佐剂系统,并对增强MRSA重组亚单位疫苗免疫应答效应的作用进行研究。方法以血清特异性IgG作为评价指标,将2种乳剂(NEA... 详细信息

目的以具有自主知识产权的纳米乳(NEA)和商品化的氢氧化铝[Al(OH)_(3)]作为配方组分,制备出新型NEA/Al(OH)_(3)复合佐剂系统,并对增强MRSA重组亚单位疫苗免疫应答效应的作用进行研究。方法以血清特异性IgG作为评价指标,将2种乳剂(NEA和MF59)和2种铝盐[Al(OH)_(3)和AlPO4]进行复配筛选;采用多因素实验设计,对初步筛选出的复合佐剂成分进行三因素三水平正交实验,确定优选的NEA/Al(OH)_(3)复合佐剂系统处方;采用金黄色葡萄球菌国际标准株(MRSA252)建立Balb/c小鼠脓毒血症动物感染致死模型,进一步对新型NEA/Al(OH)_(3)复合佐剂系统增强MRSA重组亚单位疫苗抗原HI的免疫应答效应(特异性体液免疫应答、细胞免疫应答、免疫保护效力)进行比较研究,评价其免疫增强的保护效果及初步机制。结果 NEA和Al(OH)_(3)的复配是优选的乳剂与铝盐复合佐剂组分;通过三因素三水平正交实验确定优化的NEA/Al(OH)_(3)复合佐剂系统处方为:HI抗原量60μg、佐剂量200μg、NEA与Al(OH)_(3)的配比为2:8(w/w);脓毒血症动物模型攻毒保护的研究结果表明:基于新型NEA/Al(OH)_(3)复合佐剂系统的MRSA重组亚单位疫苗可于首次免疫后第7天即产生特异性免疫应答,特异性IgG抗体效价最高可达1:143 360,同时诱导出高水平的特异性细胞免疫应答(IL-12P40、INF-γ),LD90的攻毒保护率为80%,具有优于单一佐剂组的良好免疫原性及保护效果。结论成功优选制备的新型NEA/Al(OH)_(3)复合佐剂系统可有效增强MRSA重组亚单位疫苗的免疫应答水平和保护效力,为新型复合佐剂在重组蛋白疫苗中的应用与开发提供了重要的实验基础。

关键词：纳米乳氢氧化铝复合佐剂系统 MRSA疫苗免疫应答

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AXIN2罕见变异与人类神经管畸形的相关性研究

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陆军军医大学学报 2023年第24期45卷 2503-2511页

作者：徐雪冰李建婷包怡华郭金王芳张霆杨淑艳潍坊医学院临床医学院儿科学教研室山东潍坊261053 山西医科大学生物化学与分子生物学教研室太原030001 首都儿科研究所生化免疫研究室北京100020

目的探索AXIN2基因变异与神经管畸形(neural tube defects,NTDs)发生的相关性。方法收集2004年6月-2013年12月山西省9家医院引产的100例NTDs胎儿肌肉组织样本,对其全基因组测序结果中的AXIN2基因的变异进行生物信息学分析,在相应的样本... 详细信息

目的探索AXIN2基因变异与神经管畸形(neural tube defects,NTDs)发生的相关性。方法收集2004年6月-2013年12月山西省9家医院引产的100例NTDs胎儿肌肉组织样本,对其全基因组测序结果中的AXIN2基因的变异进行生物信息学分析,在相应的样本中利用Sanger测序证实变异结果。在NE-4C细胞系中转染AXIN2野生型及AXIN2变异型质粒,利用免疫荧光和蛋白免疫印迹实验进行基因功能验证,对携带AXIN2变异的人NTDs样本进行分析。结果在100例NTDs样本中发现AXIN2基因上有5种变异,对其中3种变异[c.959A>T(p.D320V)、c.1250C>T(p.A417V)和c.1634G>A(p.G545E)]进行功能验证。细胞蛋白免疫印迹实验表明,D320V(P<0.05)和G545E(P<0.001)变异下调AXIN2蛋白表达,但3种变异均不影响β-catenin蛋白表达水平;免疫荧光实验表明,3种变异不影响AXIN2蛋白的亚细胞定位。在携带D320V及G545E变异的NTDs胚胎肌肉组织中,AXIN2的蛋白表达水平显著低于对照[D320V(P<0.05),G545E(P<0.01)]。结论NTDs样本中鉴定到的AXIN2变异D320V及G545E下调AXIN2蛋白表达量,可能通过引起Wnt信号通路异常激活而导致神经管畸形的发生。

关键词：神经管畸形 AXIN2 遗传变异 Wnt信号通路

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下调锌指棕榈酰基转移酶9表达抑制乳腺癌进展

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中华实验外科杂志 2023年第4期40卷 630-634页

作者：李孟轩代引海訾浩毅王邑迪张瑞王廷陕西中医药大学第二附属医院肿瘤乳腺外科咸阳712099 空军军医大学西京医院甲乳血管外科西安710032 空军军医大学基础医学院免疫学教研室西安710032

目的探讨锌指棕榈酰基转移酶9(ZDHHC9)的表达对乳腺癌增殖、迁移侵袭和凋亡的影响以及其作用机制。方法利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库分析乳腺癌中ZDHHC9的表达情况及与预后的关系。用慢病毒感染方式在HCC1937细胞、MCF7细胞、SKBR3... 详细信息

目的探讨锌指棕榈酰基转移酶9(ZDHHC9)的表达对乳腺癌增殖、迁移侵袭和凋亡的影响以及其作用机制。方法利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库分析乳腺癌中ZDHHC9的表达情况及与预后的关系。用慢病毒感染方式在HCC1937细胞、MCF7细胞、SKBR3细胞中敲低ZDHHC9,每种细胞分别设置一个对照组(shNC)和两个敲低实验组(sh1、sh2),通过细胞计数试剂盒(CCK-8)检测、细胞增殖检测(EdU)、平板克隆形成实验检测ZDHHC9对乳腺癌细胞增殖影响,通过划痕实验和小室细胞侵袭实验(Transwell)验证ZDHHC9对迁移和侵袭能力的影响,细胞流式分析检测ZDHHC9对细胞凋亡的影响。蛋白质免疫印迹法(Western blot)实验观察下调ZDHHC9对磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B通路(PI3K/Akt)和细胞外调节蛋白激酶信号通路(ras/raf/MEK/Erk)的影响。采用t检验方法进行组间比较。结果TCGA数据库数据分析ZDHHC9在乳腺癌中高表达,且与不良预后相关。CCK-8实验表明下调ZDHHC9后乳腺癌细胞增殖被抑制(HCC1937-shNC比HCC1937-sh1:2.577±0.012比1.887±0.077,t=15.319,P<0.01;MCF7-shNC比MCF7-sh1:0.905±0.016比0.398±0.053,t=16.034,P<0.01;SKBR3-shNC比SKBR3-sh1:2.322±0.090比1.786±0.022,t=10.067,P<0.01);平板克隆形成实验提示敲低ZDHHC9后集落形成数量减少[HCC1937-shNC比HCC1937-sh1:(472.333±48.211)个比(362.667±43.108)个,t=7.637,P<0.01;MCF7-shNC比MCF7-sh1:(176.667±37.448)个比(79.667±27.227)个,t=3.639,P<0.01;SKBR3-shNC比SKBR3-sh1:(296.333±19.553)个比(210.667±11.676)个,t=6.515,P<0.01];划痕实验提示敲低ZDHHC9抑制乳腺癌细胞的迁移(HCC1937-shNC比HCC1937-sh1:0.536±0.046比0.235±0.010,t=10.969,P<0.01;SKBR3-shNC比SKBR3-sh1:0.429±0.021比0.231±0.060,t=5.381,P<0.01);Transwell侵袭实验表明下调ZDHHC9后乳腺癌细胞侵袭能力下降[HCC1937-shNC比HCC1937-sh1:(211.333±11.930)个比(73.667±5.508)个,t=18.146,P<0.01;SKBR3-shNC比SKBR3-sh1:(159.333±11.590)个比(45.333±7.024)个,t=14.570,P<0.01];流式细胞分析提示下调ZDHHC9导致细胞凋亡增加(HCC1937-shNC比HCC1937-sh1:0.121±0.007比0.157±0.004,t=6.634,P<0.01;SKBR3-shNC比SKBR3-sh1:0.124±0.0050.142±0.005,t=6.218,P<0.01);免疫印迹实验结果显示,敲低ZDHHC9抑制PI3K/Akt通路和ras/raf/MEK/Erk通路的激活被抑制[磷酸化蛋白激酶B(p-Akt)相对表达量:MCF7-shNC比MCF7-sh1:0.931±0.005比0.707±0.002,t=24.193,P<0.01;磷酸化细胞外信号调节激酶(p-ERK1/2)相对表达量:MCF7-shNC比MCF7-sh1:1.418±0.010比1.206±0.053,t=6.748,P<0.01]。结论敲低ZDHHC9抑制乳腺癌细胞的增殖、迁移和侵袭能力,促进细胞凋亡。

关键词：乳腺癌锌指棕榈酰基转移酶9 增殖迁移凋亡

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帕博利珠单抗联合白蛋白结合型紫杉醇及奈达铂一线治疗晚期食管鳞状细胞癌的疗效及安全性

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中国肿瘤生物治疗杂志 2022年第9期29卷 828-833页

作者：颜芳应明真陈龙佩黄静怡傅强海军军医大学附属长海医院肿瘤科上海200433 海军军医大学免疫学研究所暨医学免疫学国家重点实验室上海200433

目的:观察帕博利珠单抗联合白蛋白结合型紫杉醇及奈达铂一线治疗晚期食管鳞状细胞癌(ESCC)的临床疗效及安全性。方法:收集2020年3月至2021年9月长海医院收治的晚期ESCC且有可评价病灶的患者35例,一线给予帕博利珠单抗联合白蛋白结合型... 详细信息

目的:观察帕博利珠单抗联合白蛋白结合型紫杉醇及奈达铂一线治疗晚期食管鳞状细胞癌(ESCC)的临床疗效及安全性。方法:收集2020年3月至2021年9月长海医院收治的晚期ESCC且有可评价病灶的患者35例,一线给予帕博利珠单抗联合白蛋白结合型紫杉醇及奈达铂治疗,用药方案为:第1天,帕博利珠单抗200 mg、白蛋白结合型紫杉醇130 mg/m~2、奈达铂70 mg/m~2;第8天,白蛋白结合型紫杉醇130 mg/m~2;每3周重复1次。采用实体瘤客观疗效评价RECIST1.1标准评估疗效,按NCI-CTC5.0标准评估治疗过程中产生的不良反应。结果:全部35例患者均可评价疗效,其中完全缓解(CR)4例(11.4%)、部分缓解(PR)21例(60.0%)、疾病稳定(SD)10例(28.6%)、疾病进展(PD)0例,客观有效率(ORR)为71.4%,疾病控制率(DCR)为100%,中位无进展生存期(PFS)为13.4个月。最常见不良反应包括骨髓抑制、甲状腺功能异常、皮疹、发热、关节、肌肉酸痛及脱发,仅有3例(8.6%)患者发生Ⅲ级以上不良反应。结论:帕博利珠单抗联合白蛋白结合型紫杉醇及奈达铂一线治疗本组晚期ESCC的疗效较好,不良反应患者可耐受,有待进一步扩大样本进行随机对照临床研究验证。

关键词：食管鳞状细胞癌帕博利珠单抗白蛋白结合型紫杉醇奈达铂临床疗效安全性

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巨噬细胞在创面愈合中的调节作用及其相关机制

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中华烧伤与创面修复杂志 2023年第2期39卷 106-113页

作者：贺伟峰闫凌峰陆军军医大学(第三军医大学)第一附属医院全军烧伤研究所创伤、烧伤与复合伤国家重点实验室重庆市疾病蛋白质组学重点实验室重庆400038

创面愈合是一个被精准调控的复杂过程,包含了炎症、抗炎、再生等多个阶段。由于巨噬细胞具有明显的可塑性,可以在具有差异化的创面愈合过程中发挥重要的调节作用。巨噬细胞若未能适时表达特定功能,将会影响组织的愈合功能并导致组织病... 详细信息

创面愈合是一个被精准调控的复杂过程,包含了炎症、抗炎、再生等多个阶段。由于巨噬细胞具有明显的可塑性,可以在具有差异化的创面愈合过程中发挥重要的调节作用。巨噬细胞若未能适时表达特定功能,将会影响组织的愈合功能并导致组织病理性愈合。因此,了解巨噬细胞在创面愈合的不同阶段发挥的不同功能并进行针对性调控,对促进创伤组织的愈合再生有重要意义。该文根据创面愈合的基本过程,阐述了创面内不同类型巨噬细胞发挥的不同功能及其基本机制,并强调了未来可能应用于临床治疗的巨噬细胞调控策略。

关键词：伤口愈合 E2F1转录因子 M1型巨噬细胞 M2型巨噬细胞

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肝癌与癌旁组织间TFAM差异结合蛋白的筛选鉴定及初步功能分析

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空军军医大学学报 2025年

作者：赵鑫吴丹邢金良何显力空军军医大学唐都医院普通外科空军军医大学基础医学院生理与病理生理学教研室

目的探索线粒体转录因子（TFAM）结合蛋白在肝癌发生发展过程中的差异特征，为肝癌的发病机制及治疗策略提供新的视角和理论依据。方法利用4D-FastDIA定量蛋白质组学技术，对肝癌组织及其配对癌旁组织样本展开了全面分析，筛选出肝癌... 详细信息

目的探索线粒体转录因子（TFAM）结合蛋白在肝癌发生发展过程中的差异特征，为肝癌的发病机制及治疗策略提供新的视角和理论依据。方法利用4D-FastDIA定量蛋白质组学技术，对肝癌组织及其配对癌旁组织样本展开了全面分析，筛选出肝癌组织中与TFAM结合存在显著差异的蛋白。通过生物信息学手段，对这些差异结合蛋白开展了GO功能富集和KEGG通路富集分析；在细胞水平，利用免疫共沉淀及免疫印迹实验验证了TFAM与关键结合蛋白的相互作用关系；并通过EdU实验探究了这些关键结合蛋白在肝癌细胞增殖中的作用。结果蛋白组学分析显示，肝癌细胞中与TFAM结合的蛋白显著富集于细胞蛋白翻译及转位、嘌呤和酰胺代谢合成、细胞免疫应答及细胞分化过程相关信号通路。进一步通过免疫共沉淀和免疫印迹分析，证明了肝癌细胞SNU-739中，TFAM与抗沉默功能蛋白1同源物B（ASF1B）、醛脱氢酶家族1成员L1（ALDH1L1）、Ral相互作用蛋白质（RBP1）、BRG1相关因子180（PBRM1）、BRG1相关因子170（SMARCC2）存在互作关系。在SNU-739细胞中干涉ASF1B、RBP1、SMARCC2表达可抑制细胞增殖（P<0.01），干涉ALDH1L1和PBRM1表达则促进细胞增殖（P<0.05）。结论通过初步筛选和鉴定，发现肝癌细胞中的TFAM特异性结合蛋白ASF1B、ALDH1L1、RBP1、PBRM1、SMARCC2可能成为肝癌发生进展过程中的新型生物标志物，并为开发针对性治疗靶点提供了新的研究方向，对改善肝癌患者的诊断治疗及预后具有重要临床意义。

关键词： TFAM结合蛋白 4D-FastDIA蛋白组学肝细胞肝癌生物标志物

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复合益生元制剂对右旋葡聚糖硫酸钠诱导溃疡性结肠炎小鼠肠道菌群的影响

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中华航海医学与高气压医学杂志 2023年第1期30卷 76-81页

作者：徐张扬刘光盛冯旭闵天骄张建何颖蒋蓓尔海军军医大学海军特色医学中心海洋生物医药与极地医学研究室上海200433 海军军医大学基础医学院学员三大队上海200433 海军军医大学研究生院上海200433

目的研究复合益生元制剂对右旋葡聚糖硫酸钠(DSS)诱导的溃疡性结肠炎(UC)小鼠的治疗效果及其作用机制。方法将40只雄性C57BL/6小鼠按照随机数字表法分为对照组、模型组、美沙拉嗪组和益生元组,每组10只。对照组连续7 d给予饮用水,其余3... 详细信息

目的研究复合益生元制剂对右旋葡聚糖硫酸钠(DSS)诱导的溃疡性结肠炎(UC)小鼠的治疗效果及其作用机制。方法将40只雄性C57BL/6小鼠按照随机数字表法分为对照组、模型组、美沙拉嗪组和益生元组,每组10只。对照组连续7 d给予饮用水,其余3组连续7 d自由饮用3%DSS水溶液建立UC小鼠模型。造模成功后第1天起美沙拉嗪组和益生元组同步灌胃给药(10 ml/kg),对照组和模型组给予等体积生理盐水,连续9 d,每天记录小鼠体重、粪便性状及便血情况;9 d后处死小鼠,测量结肠长度,HE染色评估小鼠结肠组织病理学变化,ELISA法检测结肠组织中肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、白细胞介素-1β(IL-1β)和白细胞介素-6(IL-6)水平,并通过16S rRNA测序法检测小鼠肠道菌群的变化。结果与模型组相比,益生元组制剂给药治疗后小鼠体重降低减缓,腹泻和便血症状显著改善,差异有统计学意义(P<0.05),结肠黏膜病理损伤显著减轻(P<0.05),结肠组织TNF-α、IL-6水平均显著降低[(945.3±7.23)ng/ml vs.(1069.0±12.07)ng/ml,(178.0±1.24)ng/ml vs.(182.7±1.16)ng/ml],差异有统计学意义(P<0.05)。UC小鼠肠道菌群多样性降低,经复合益生元制剂治疗后,菌群多样性有一定的提高,在门水平上主要表现为厚壁菌门和变形菌门显著降低,拟杆菌门丰度增高,属水平上主要为Muribaculaceae_unclassified和拟杆菌属丰度增高,螺杆菌属丰度降低。结论复合益生元制剂可有效治疗UC小鼠,其通过恢复和改善肠道菌群多样性调节UC小鼠的肠道菌群组成,从而发挥治疗作用。

关键词：复合益生元溃疡性结肠炎炎症因子肠道菌群

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人源免疫重建PDX模型构建及其在肿瘤免疫治疗中的应用进展

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中国肿瘤临床 2022年第11期49卷 541-547页

作者：李宏伟高先春窦建华闫君雅聂勇战第四军医大学西京消化病医院国家消化系统疾病临床医学研究中心肿瘤生物学国家重点实验室

免疫治疗已成为肿瘤治疗领域最具潜力的手段之一。由于肿瘤存在高度异质性等特点，导致免疫治疗响应率偏低，疗效有限。因此，迫切需要具有预测性的临床前模型，用于推动合理、安全的免疫治疗策略开发。传统体内、外肿瘤研究模型受限于... 详细信息

免疫治疗已成为肿瘤治疗领域最具潜力的手段之一。由于肿瘤存在高度异质性等特点，导致免疫治疗响应率偏低，疗效有限。因此，迫切需要具有预测性的临床前模型，用于推动合理、安全的免疫治疗策略开发。传统体内、外肿瘤研究模型受限于人源免疫系统的缺失。因此，构建同时具有人源免疫系统和肿瘤的研究模型成为热点。将患者来源肿瘤移植入人源免疫系统重建小鼠体内肿瘤、免疫双人源化模型，具有可重现人体内免疫细胞与肿瘤间相互作用的优势，成为生理和病理条件下模拟人体肿瘤免疫治疗疗效的新模型。本文主要对多种类型人源化免疫重建PDX模型构建、优缺点及其在肿瘤免疫治疗研究中的最新应用进展进行综述。

关键词：免疫人源化小鼠造血干细胞肿瘤免疫学免疫治疗

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