检索结果-内蒙古大学图书馆

菌物学报 2020年第11期39卷 2035-2043页

作者：邓宇晨李帅虎潘炜华廖万清陶丽第二军医大学长征医院皮肤科上海200433 复旦大学生命科学学院遗传工程国家重点实验室上海200438

希木龙念珠菌Candidahaemulonii是一种与耳念珠菌亲缘关系十分相近的物种。近年来,由其引发的侵袭性真菌疾病的发病率不断升高。作为一种多重耐药真菌,希木龙念珠菌对常见抗真菌药物的耐药性甚至超过耳念珠菌。体外药敏试验证实大部分... 详细信息

希木龙念珠菌Candidahaemulonii是一种与耳念珠菌亲缘关系十分相近的物种。近年来,由其引发的侵袭性真菌疾病的发病率不断升高。作为一种多重耐药真菌,希木龙念珠菌对常见抗真菌药物的耐药性甚至超过耳念珠菌。体外药敏试验证实大部分希木龙念珠菌菌株对唑类、多烯类以及棘白菌素类等抗真菌药物耐药,尤其是对两性霉素B具有天然抗性。不仅如此,临床传统的生化方法难以对该菌准确鉴定,常用的商品化鉴定产品往往将其错误鉴定为毕赤酵母或者新型隐球菌。为了进一步加深对希木龙念珠菌的认识,本文结合国内外的流行病学数据与研究进展,从感染现状、生物学特征、耐药性进行综述,同时总结该菌目前诊断、治疗和预防措施。

关键词：希木龙念珠菌流行病学多重耐药

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西红花MADS-box基因家族的生物信息学分析

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基因组学与应用生物学 2019年第7期38卷 3140-3154页

作者：张一菡李卿张磊谭何新陈祥慧第二军医大学长海医院药学部第二军医大学药学院药用植物学教研室第二军医大学长征医院药材科

西红花是中国传统中药材,以花柱入药,被誉为"植物黄金"。MADS-box转录因子家族在显花植物的花器官形成和分化过程中发挥重要作用,其有极大的可能影响西红花花器官的形成进而影响花柱发育。本研究采用生物信息学方法,对来自西... 详细信息

西红花是中国传统中药材,以花柱入药,被誉为"植物黄金"。MADS-box转录因子家族在显花植物的花器官形成和分化过程中发挥重要作用,其有极大的可能影响西红花花器官的形成进而影响花柱发育。本研究采用生物信息学方法,对来自西红花转录组数据库中的17条MADS-box转录因子的核苷酸进行解读,及对其编码的氨基酸序列的组成成分、理化性质、信号肽、导肽、跨膜结构域、亚细胞定位、亲疏水性、蛋白质的二级、三级结构及功能域进行预测分析,并将西红花和其他植物的MADS-box蛋白进行同源比对,同时构建了西红花和模式植物拟南芥MADS-box蛋白家族的系统进化树。结果表明,西红花MADS-box基因的开放阅读框在630～750 bp左右,分子量在24～29 kD之间,理论等电点(pI)均大于7,介于8.69～9.54之间,表现为碱性疏水蛋白,既不含有信号肽也没有跨膜结构,二级结构主要原件为α-螺旋和无规则卷曲,含有一个MADS-MEF结构域和K-box结构域。氨基酸同源性比对结果表明西红花和石刁柏的MADS-box蛋白同源性较高。与拟南芥的进化树分析结果显示,西红花MADS-box蛋白可聚为两大类,分属于MIKC和Mβ亚家族。本工作可为今后进一步深入研究西红花MADS-box蛋白的生物学功能提供可靠的参考依据。

关键词：西红花 MADS-box 生物信息学系统进化树

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抑囊方对慢性肾病3~4期成人型多囊肾病患者血清代谢组学影响

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中国中西医结合杂志 2021年第4期41卷 436-442页

作者：甘静吴燕升周嘉宝李东东郭亚芳张新志龚学忠郁胜强高建东上海中医药大学附属曙光医院肾病科上海中医药大学中医肾病研究所上海市中医临床重点实验室肝肾疾病病证教育部重点实验室(上海中医药大学)上海201203 上海市浦东医院复旦大学附属浦东医院中医科上海201399 上海中医药大学附属上海市中医医院肾内科上海200071 第二军医大学长征医院肾内科解放军肾脏病研究所上海200433

目的观察抑囊方对慢性肾病(CKD)3~4期成人型多囊肾病(ADPKD)血清代谢组学的影响。方法选择2017年10月—2019年3月在上海中医药大学附属曙光医院、第二军医大学附属上海长征医院以及上海中医药大学附属上海市中医医院就诊的30例CKD 3~4期... 详细信息

目的观察抑囊方对慢性肾病(CKD)3~4期成人型多囊肾病(ADPKD)血清代谢组学的影响。方法选择2017年10月—2019年3月在上海中医药大学附属曙光医院、第二军医大学附属上海长征医院以及上海中医药大学附属上海市中医医院就诊的30例CKD 3~4期ADPKD患者,服用抑囊方24周。收集患者0周(治疗前组)、24周(治疗后组)血清样本,另收集同期健康人20名(健康对照组)血清样本,以GC-TOF-MS为检测手段,采用多元统计分析方法分析健康组、治疗前组与治疗后组血清中内源性代谢物的变化,筛选差异代谢物和重要代谢通路。结果三组血清代谢产物主成分均存在差异,可进行区分。共筛选出57种ADPKD患者的代谢差异物,抑囊方干预后有21种代谢物如亮氨酸、瓜氨酸、富马酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、尿苷、山梨醇、喹啉酸、半胱氨酰甘氨酸等显著回调(P<0.01,P<0.05),通路涉及丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢,嘧啶代谢,精氨酸和脯氨酸代谢,氮代谢,氨酰tRNA生物合成,半乳糖代谢。结论抑囊方可延缓CKD 3~4期ADPKD疾病进展,可能与其调节氨基酸代谢异常以减轻氧化应激对肾脏的损害,调节氮代谢及嘧啶代谢异常以促进机体内肾毒素的排泄有关。

关键词：抑囊方成人型多囊肾病慢性肾脏病3~4期代谢组学中药

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胸部CT肺结节数据标注与质量控制专家共识(2018)

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中华放射学杂志 2019年第1期53卷 9-15页

作者：中国食品药品检定研究院中华医学会放射学分会心胸学组任海萍刘士远王浩刘凯不详中国食品药品检定研究院医疗器械检定所光机电室北京102629 第二军医大学长征医院影像科上海200003

使用人工智能开展肺结节检测是医疗器械发展的热门方向,有助于帮助影像科医师快速准确地发现肺结节,增强体检和肺癌筛查在肺癌防治方面的效率和作用。为了促进行业发展,保障标注质量,中国食品药品检定研究院和中华医学会放射学分会心胸... 详细信息

使用人工智能开展肺结节检测是医疗器械发展的热门方向,有助于帮助影像科医师快速准确地发现肺结节,增强体检和肺癌筛查在肺癌防治方面的效率和作用。为了促进行业发展,保障标注质量,中国食品药品检定研究院和中华医学会放射学分会心胸学组联合研究胸部CT肺结节的数据标注与质量控制方法,用于肺结节人工智能产品的检验用标准数据集的建设实践。本文从肺结节的标注规则、标注流程、质量控制等各个方面介绍专家组达成的共识,有助于帮助业内形成统一认识,提高数据标注的一致性和数据集的质量,为人工智能的发展保驾护航。

关键词：肺结节人工智能

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铁皮石斛Csl基因家族生物信息学及表达分析

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基因组学与应用生物学 2019年第5期38卷 2159-2166页

作者：蔡璨璨李卿段承俐陈东红刘京晶浙江农林大学省部共建亚热带森林培育国家重点实验室临安311300 第二军医大学长征医院药材科上海200003

通过分析铁皮石斛类纤维素合成酶(cellulase synthase-like, Csl)的氨基酸序列特征,挖掘与多糖合成相关的Csl基因,从而为参与多糖代谢的铁皮石斛Csl蛋白的后续研究提供有力参考。本研究在生物信息学层面,对铁皮石斛21条完整Csl蛋白序列... 详细信息

通过分析铁皮石斛类纤维素合成酶(cellulase synthase-like, Csl)的氨基酸序列特征,挖掘与多糖合成相关的Csl基因,从而为参与多糖代谢的铁皮石斛Csl蛋白的后续研究提供有力参考。本研究在生物信息学层面,对铁皮石斛21条完整Csl蛋白序列的理化性质、导肽、信号肽、疏水性/亲水性、跨膜结构域、蛋白质高级结构及功能域等进行预测分析,并与拟南芥的Csl蛋白进行了同源比对并构建系统进化树。结果表明,CslD2a/b/c、CslD4、CslG3b为酸性蛋白,其余为碱性蛋白;Leu、Ser、Ala、Phe、Val和Ille等氨基酸是铁皮石斛Csl蛋白的主要氨基酸;铁皮石斛Csl蛋白具有明显的疏水区和亲水区,都存在跨膜结构。蛋白质二级结构的主要元件是α-螺旋、无规则卷曲和延伸链。与拟南芥的进化分析显示,铁皮石斛Csl蛋白基因被分为3大分支,CslA和CslC归为一支,CslB/E/G/H归为一支,CslD归为一支。本研究系统分析了铁皮石斛Csl蛋白的序列特征,可为今后深入研究该蛋白在铁皮石斛多糖代谢上的功能提供参考。

关键词：铁皮石斛类纤维素合成酶基因家族生物信息学

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基于句子级Lattice-长短记忆神经网络的中文电子病历命名实体识别

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第二军医大学学报 2019年第5期40卷 497-506页

作者：潘璀然王青华汤步洲姜磊黄勋王理南通大学医学院医学信息学教研室南通226001 哈尔滨工业大学(深圳)计算机科学与技术学院深圳518055 海军军医大学(第二军医大学)长征医院风湿免疫科上海200433 南通大学信息科学技术学院通讯工程教研室南通226001

目的提出一种基于Re-entity新分词方法的条件随机场(CRF)模型,并与双向长短记忆神经网络(BiLSTM)-CRF和Lattice-长短记忆神经网络(LSTM)进行比较。方法比较了现有实体识别方法和模型后,针对2018年全国知识图谱与语义计算大会(CCKS2018)... 详细信息

目的提出一种基于Re-entity新分词方法的条件随机场(CRF)模型,并与双向长短记忆神经网络(BiLSTM)-CRF和Lattice-长短记忆神经网络(LSTM)进行比较。方法比较了现有实体识别方法和模型后,针对2018年全国知识图谱与语义计算大会(CCKS2018)任务一“电子病历命名实体识别”,提出基于Re-entity的CRF、BiLSTM-CRF、Lattice-LSTM方法,并在不同语料库训练不同参数级别的字符向量集。分别将各方法引入神经网络模型中进行模型性能对比实验,最后分别基于句子级和篇级输入句长进行对比研究。结果CRF模型在最优特征工程的结果下引入Re-entity方法后性能得到提高,句子级的Lattice-LSTM模型在该任务上取得了89.75%的严格F1-measure,优于CCKS2018任务一的最高结果(89.25%)。结论基于Re-entity新分词方法的CRF模型可利用中文临床药物知识库有效提高电子病历中药物的识别率,Re-entity方法可改善数据预处理阶段分词导致的错误累加,Lattice结构可以更好地结合字符和词序列的潜在语义信息,同时句子级输入能有效提高神经网络模型的识别准确率。

关键词：计算机化病案系统中文电子病历实体识别条件随机场双向长短记忆神经网络点阵长短记忆神经网络

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浆细胞样树突状细胞在宿主抵御隐球菌肺部感染中的作用及机制研究进展

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菌物学报 2018年第10期37卷 1317-1323页

作者：张克明张蕾蔡良奇刘晓刚潘炜华廖万清上海市医学真菌分子生物学重点实验室第二军医大学长征医院皮肤科上海200003 厦门大学附属第一医院福建厦门361000

肺隐球菌病是由隐球菌感染引起的常见真菌病,由于症状的非特异性,临床上诊断较为困难。作为条件致病性真菌感染,肺隐球菌病的结局主要与宿主免疫力有关。目前肺隐球菌病免疫学发病机制研究主要局限在T细胞和巨噬细胞。近年研究表明,作... 详细信息

肺隐球菌病是由隐球菌感染引起的常见真菌病,由于症状的非特异性,临床上诊断较为困难。作为条件致病性真菌感染,肺隐球菌病的结局主要与宿主免疫力有关。目前肺隐球菌病免疫学发病机制研究主要局限在T细胞和巨噬细胞。近年研究表明,作为树突状细胞亚群之一的浆细胞样树突细胞,由于其激活后可以产生大量的I型干扰素并活化相关的T细胞,所以在机体抵抗病毒和细菌免疫中发挥着重要的作用。但是浆细胞样树突细胞在真菌病,尤其是在隐球菌病的发生发展中发挥的作用尚不明确。本文将介绍肺隐球菌病的临床表现、诊治及T细胞和巨噬细胞在肺隐球菌病中的免疫机制,并通过介绍肺隐球菌病和浆细胞样树突细胞及二者之间已有报道的联系,初步阐述浆细胞样树突细胞在肺隐球菌病免疫学发病机制中的相关作用。

关键词：肺隐球菌病浆细胞样树突细胞免疫

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肝源性糖尿病的发病机制及诊治进展

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药学服务与研究 2017年第3期17卷 161-166页

作者：吴梦莎张鑫蒋忠新姚定康刘志民第二军医大学海军医学系第二军医大学长征医院内科教研室上海200001 第二军医大学长征医院内分泌科上海200001

肝源性糖尿病是指继发于慢性肝实质损伤的糖尿病,病人多饮、多食、多尿、体重减轻症状不明显,临床上以餐后血糖升高和糖耐量降低为主要特点。其相关并发症不但加重肝细胞损伤,还会破坏机体葡萄糖稳态,临床上发病率较高但诊治不够规范。... 详细信息

肝源性糖尿病是指继发于慢性肝实质损伤的糖尿病,病人多饮、多食、多尿、体重减轻症状不明显,临床上以餐后血糖升高和糖耐量降低为主要特点。其相关并发症不但加重肝细胞损伤,还会破坏机体葡萄糖稳态,临床上发病率较高但诊治不够规范。本文介绍了肝脏疾病对葡萄糖稳态的影响、近年来国内外肝源性糖尿病的诊治进展,以及肝源性糖尿病降糖药物的选择。

关键词：肝源性糖尿病诊断治疗综述

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医学影像人工智能产业现状和发展需求调研报告

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中华放射学杂志 2019年第6期53卷 507-511页

作者：张惠茅萧毅洪楠孙晓伟刘玉林刘再毅田捷李睿刘士远金征宇吉林大学第一医院放射科长春130021 第二军医大学附属长征医院影像医学与核医学科上海200003 北京大学人民医院放射科 100044 北京大学第一医院放射科 100034 湖北省肿瘤医院放射科医学信息分析与肿瘤诊疗湖北省重点实验室武汉430074 广东省人民医院放射科广州510080 中国科学院自动化研究所分子影像重点实验室复杂系统管理与控制国家重点实验室北京100190 清华大学医学院生物医学工程系北京100084 中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院放射科 100073

2018年10月,中华医学会放射学分会(CSR)和中国医学影像AI产学研用创新联盟(CAIERA)发起,携手中国医学装备人工智能联盟影像委员会共同展开医学影像AI产业现状和发展需求调研。本文中发布了此次调研的统计数据,并对此调研结果进行解读。... 详细信息

2018年10月,中华医学会放射学分会(CSR)和中国医学影像AI产学研用创新联盟(CAIERA)发起,携手中国医学装备人工智能联盟影像委员会共同展开医学影像AI产业现状和发展需求调研。本文中发布了此次调研的统计数据,并对此调研结果进行解读。调研结果显示,医学影像AI产业在中国处于蓄势待发阶段,机遇与挑战并存,加快信息化建设步伐、完善患者隐私和数据安全、数据分享等行业政策和法规,加强AI相关知识培训和宣传,搭建产学研用合作交流平台和相关转化机制,将有利于中国医学影像AI产业向着标准化和规范化的方向发展。

关键词：医学影像人工智能调研报告

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耳道念珠菌感染现状与研究进展

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中国真菌学杂志 2018年第1期13卷 53-56页

作者：雷岩张超潘炜华廖万清上海市医学真菌分子生物学重点实验室上海市医学真菌研究所全军真菌病重点实验室第二军医大学长征医院皮肤科上海200003

耳道念珠菌(Candida auris)自从2009年被发现至今,已对全球性人类健康构成了严重威胁。该病原体难以用常规的表型和生物化学方法鉴定。该菌株对3种主要类型的抗真菌药物耐药,这种类型的多重耐药菌之前在其他种类的念珠菌并没有报道过。... 详细信息

耳道念珠菌(Candida auris)自从2009年被发现至今,已对全球性人类健康构成了严重威胁。该病原体难以用常规的表型和生物化学方法鉴定。该菌株对3种主要类型的抗真菌药物耐药,这种类型的多重耐药菌之前在其他种类的念珠菌并没有报道过。在本综述中,我们探讨了当今世界耳道念珠菌感染的现状与研究进展,希望能够引起有关学者和相关部门重视,及时制定感染预防策略和治疗方案。

关键词：耳道念珠菌多重耐药菌致病性感染

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