检索结果-内蒙古大学图书馆

中国卫生统计 2006年第1期23卷 79-82页

作者：吴骋王志勇贺佳第二军医大学卫勤系卫生统计学教研室 200433 第二军医大学附属长海医院信息科 200433

目前,微阵列技术已被广泛应用于基因表达水平的录制实验。所获得的基因表达数据通常包括上万条基因的测量值,很多传统方法在处理这样的海量数据时都存在着问题。并且,由于制作工艺和经费的限制,实验所获得的数据集常含有较少的组织样本... 详细信息

目前,微阵列技术已被广泛应用于基因表达水平的录制实验。所获得的基因表达数据通常包括上万条基因的测量值,很多传统方法在处理这样的海量数据时都存在着问题。并且,由于制作工艺和经费的限制,实验所获得的数据集常含有较少的组织样本,而每一组织却包括上万条基因的表达水平,大多数有监督的方法应用效果都不理想。一种新的有监督的分析技术——支持向量机(Support Vector Machines,SVMs)已被证明十分适合处理这样的基因表达数据。大量关于基因表达数据处理的文献在肯定SVMs独特优势的同时,对于其原理与算法的具体实现却较少进行总结和详细介绍。本文将结合数据挖掘的相关知识,从SVMs的基本原理出发,详细介绍SVMs在微阵列表达数据分析中的应用。[第一段]

关键词：基因表达谱数据分析基因表达水平基因表达数据组织样本微阵列技术支持向量机制作工艺方法应用数据处理

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α-黑素细胞刺激素在自体移植皮片中的mRNA表达及意义

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中国修复重建外科杂志 2006年第5期20卷 491-494页

作者：薛春雨邢新李蠡李军辉蒋平第二军医大学长海医院整形外科上海200433 生物化学与分子生物学教研室

目的初步探索α-黑素细胞刺激素(α-melanocyte-stimulatinghormone,α-MSH)在自体移植皮片过度色素沉着中的作用。方法标本取自颈部自体中厚移植皮片术后1年,局部需再次矫正的18例患者。在切取颈部自体中厚移植皮片同时于每例移植皮片... 详细信息

目的初步探索α-黑素细胞刺激素(α-melanocyte-stimulatinghormone,α-MSH)在自体移植皮片过度色素沉着中的作用。方法标本取自颈部自体中厚移植皮片术后1年,局部需再次矫正的18例患者。在切取颈部自体中厚移植皮片同时于每例移植皮片受区及原供区腹部周围分别切取正常皮肤作对照,切取范围1.0cm×0.5cm。分别利用RT-PCR、银染-丽春红染色法计算自体中厚移植皮片、原供区及受区周围自体正常对照皮肤中α-MSHmRNA电泳条带及表皮的灰度值,测定各组中α-MSHmRNA的半定量表达及黑色素的含量。结果α-MSH在自体中厚移植皮片中的mRNA表达明显高于自体正常对照皮肤,差异有统计学意义(P<0.01);自体中厚移植皮片表皮中黑色素含量较自体正常对照皮肤表皮中的黑色素含量明显增多,差异亦有统计学意义(P<0.01);且表皮中黑色素的含量与α-MSH的mRNA表达量呈正相关。结论α-MSH在自体中厚移植皮片中的表达较在自体正常对照皮肤中显著增高,致皮片中黑色素含量升高,在自体移植皮片过度色素沉着中起重要调控作用。

关键词： α-黑素细胞刺激素自体移植皮片黑色素过度色素沉着

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采用体外侵袭实验分离侵袭性人原代肾细胞癌细胞

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第二军医大学学报 2006年第3期27卷 318-321页

作者：谭晓洁侯建国贺松琴陈北川曹广文第二军医大学卫生勤务学系流行病学教研室上海200433 第二军医大学长海医院泌尿外科上海200433

目的:体外分离肾细胞癌原代侵袭性和非侵袭性细胞。方法:消化法或植块法对32例临床新鲜肾细胞癌进行原代培养。在预实验确定铺胶浓度、消化回收时间的基础上,采用涂有M atrigel的Transwell对3例原代培养的肾细胞癌细胞进行体外侵袭实验... 详细信息

目的:体外分离肾细胞癌原代侵袭性和非侵袭性细胞。方法:消化法或植块法对32例临床新鲜肾细胞癌进行原代培养。在预实验确定铺胶浓度、消化回收时间的基础上,采用涂有M atrigel的Transwell对3例原代培养的肾细胞癌细胞进行体外侵袭实验,分离回收侵袭性和非侵袭性细胞。结果:(1)原代培养成功率为90.6%(29/32)。(2)以1.0 mg/m l、20μl/孔对Transwell铺胶,固定细胞悬液密度(5×105/m l),第5天消化回收细胞较为理想。非侵袭性细胞散在生长,侵袭性细胞多呈克隆样生长。侵袭性细胞倍增时间为36.1 h,非侵袭性细胞为50.6 h。结论:Transwell可体外快速分离及回收、培养不同侵袭性的肾癌原代细胞群。用原代肿瘤细胞进行体外侵袭实验代表性好,但难以突破肿瘤细胞的有限生存期。

关键词：癌肾细胞细胞分离体外侵袭实验

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应用基因芯片技术筛选前列腺癌转移相关基因

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第二军医大学学报 2006年第11期27卷 1273-1275页

作者：贺松琴侯建国谭晓洁常文军陈北川曹广文第二军医大学卫生勤务学系流行病学教研室上海200433 第二军医大学长海医院泌尿外科上海200433

目的:筛选前列腺癌转移相关基因,为研究前列腺癌的转移分子标志奠定基础。方法:将DU145细胞接种于裸鼠前列腺腹叶,5周后分别从原发灶和肺转移灶分离肿瘤细胞,利用cDNA芯片技术检测2种细胞中差异表达基因。结果:成功建立了前列腺癌细胞... 详细信息

目的:筛选前列腺癌转移相关基因,为研究前列腺癌的转移分子标志奠定基础。方法:将DU145细胞接种于裸鼠前列腺腹叶,5周后分别从原发灶和肺转移灶分离肿瘤细胞,利用cDNA芯片技术检测2种细胞中差异表达基因。结果:成功建立了前列腺癌细胞系原位移植自发转移裸鼠模型,经多轮筛选获得了前列腺癌原位及肺转移细胞。通过基因芯片筛选获得284条差异表达基因,基因功能涉及细胞信号转导、细胞周期、细胞凋亡、转录、黏附和代谢等。结论:基因芯片高通量筛选提示200余条基因中的某些基因可能与人前列腺癌转移有关。本研究为前列腺癌转移分子机制提供参考。

关键词：前列腺肿瘤肿瘤转移相关基因 cDNA芯片

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格列齐特缓释片治疗2型糖尿病的疗效及安全性

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药学服务与研究 2006年第1期6卷 38-41页

作者：顾明君刘颖刘春宏方瑾贺佳刘志民第二军医大学长征医院内分泌科上海200003 第二军医大学卫勤系卫生统计学教研室上海200433

目的:比较口服格列齐特缓释片和普通片治疗2型糖尿病患者的疗效和安全性。方法:在随机、双盲、双模拟、平行对照临床试验中,72例2型糖尿病患者分为两组,格列齐特片组36例,80 mg/次,2次/d;格列齐特缓释片组36例,60mg/次,1次/d,疗程均为1... 详细信息

目的:比较口服格列齐特缓释片和普通片治疗2型糖尿病患者的疗效和安全性。方法:在随机、双盲、双模拟、平行对照临床试验中,72例2型糖尿病患者分为两组,格列齐特片组36例,80 mg/次,2次/d;格列齐特缓释片组36例,60mg/次,1次/d,疗程均为12周。结果:与基线值比较;格列齐特缓释片组中,HbA1c平均下降1.19%,空腹和餐后血糖值分别下降2.162、.06 mmol/L;而格列齐特片组中,HbA1c平均下降1.08%,空腹和餐后血糖值分别下降1.87、2.28 mmol/L。两组间空腹和餐后血糖水平下降率比较没有统计学差异。未见严重不良反应及实验室证实的低血糖(血糖≤2.78 mmol/L)。结论:格列齐特缓释片能有效改善2型糖尿病患者的全天血糖及HbA1c水平。

关键词：糖尿病非胰岛素依赖性格列齐特迟效制剂

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人肾细胞癌原位移植裸鼠模型的建立及转移相关基因表达分析

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第二军医大学学报 2006年第3期27卷 263-267页

作者：谭晓洁侯建国贺松琴常文军刘世建余永伟曹广文第二军医大学卫生勤务学系流行病学教研室上海200433 第二军医大学长海医院泌尿外科上海200433 长海医院病理科

目的:建立原位移植裸鼠模型,筛选同一标本来源的转移性和非转移性肾细胞癌(RCC)。方法:采用皮下移植法、细胞悬液原位注射法、肾周筋膜内法、组织块原位移植肾包膜下法对BALB/c裸小鼠接种(或注射)RCC组织块(或细胞悬液),观察各种方法的... 详细信息

目的:建立原位移植裸鼠模型,筛选同一标本来源的转移性和非转移性肾细胞癌(RCC)。方法:采用皮下移植法、细胞悬液原位注射法、肾周筋膜内法、组织块原位移植肾包膜下法对BALB/c裸小鼠接种(或注射)RCC组织块(或细胞悬液),观察各种方法的成瘤及转移情况,并采用免疫组化方法初步对比分析了VEGF、bFGF、P16、Bc l-2、C-m et在裸小鼠体内的转移性和非转移RCC的表达情况。结果:(1)组织块原位移植肾包膜下法成瘤率及转移率最高,分别为73.3%(11/15)、20%(3/15)。(2)与原发灶相比,转移灶中VEGF表达明显升高(P<0.05),C-m et表达明显降低(P<0.05),bFGF、Bc l-2、P16表达降低但无统计学差异(P>0.05)。结论:组织块原位移植肾包膜下法是切实有效的RCC转移模型制作方法。采用该法在裸鼠中获得了人转移性和非转移RCC,免疫组化分析证实了转移性RCC中新血管生成因子VEGF表达显著增加。

关键词：癌肾细胞肿瘤转移模型动物基因表达

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人参茎叶皂苷对热损伤大鼠不同脏器糖皮质激素受体的影响

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中西医结合学报 2006年第2期4卷 156-159页

作者：李敏凌昌全黄雪强沈志雷第二军医大学海军医学系军队卫生学教研室上海200433 第二军医大学长海医院中医科上海200433

目的:观察人参茎叶皂苷(ginsenosides,GSS)对热损伤大鼠不同脏器糖皮质激素受体(glucocorticoidreceptor,GR)的影响,并探讨其作用机制。方法:雄性SD大鼠随机分为:(1)正常对照组,室温下饲养,蒸馏水灌胃;(2)GSS治疗组,室温下饲养,GSS灌胃;... 详细信息

目的:观察人参茎叶皂苷(ginsenosides,GSS)对热损伤大鼠不同脏器糖皮质激素受体(glucocorticoidreceptor,GR)的影响,并探讨其作用机制。方法:雄性SD大鼠随机分为:(1)正常对照组,室温下饲养,蒸馏水灌胃;(2)GSS治疗组,室温下饲养,GSS灌胃;(3)热损伤模型组,蒸馏水灌胃,制作热损伤模型;(4)热损伤模型GSS治疗组,GSS灌胃,制作热损伤模型。采用放射配体结合法检测大鼠脑、胸腺、肺和肝细胞液GR结合活性;逆转录聚合酶链反应法测定脑、肝细胞液GRmRNA的水平;放射免疫法测定血浆促肾上腺皮质激素(adrenocorticotropin,ACTH)和皮质酮(corticosterone,CS)的浓度。结果:热损伤模型GSS治疗组大鼠脑、肺和肝细胞液GR结合活性以及脑和肝细胞液GRmRNA表达水平均明显高于单纯热损伤模型组(P<0.05或P<0.01);热损伤模型GSS治疗组大鼠血浆ACTH和CS浓度与单纯热损伤模型组比较则无明显差异。结论:GSS可缓解热损伤大鼠不同脏器GR结合活性的下降幅度,其作用机制可能与促进GRmRNA的表达有关。

关键词：人参皂苷人参茎叶糖皮质激素受体热损伤大鼠

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关联规则及其在肝癌病人资料分析中的应用

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中国卫生统计 2006年第1期23卷 34-38页

作者：武建虎贺佳贺宪民张智坚马修强吴骋第二军医大学卫生勤务学系卫生统计学教研室 200433 第二军医大学东方肝胆外科医院 200438

目的探讨关联规则方法在肝癌病人资料分析中的应用研究。方法采用基于列联表的χ2检验和可信度提高的规则剪除方法,通过设置最小支持度和最小可信度对肝癌资料进行关联规则分析。结果设置最小支持度和最小可信度分别为0·10和0·... 详细信息

目的探讨关联规则方法在肝癌病人资料分析中的应用研究。方法采用基于列联表的χ2检验和可信度提高的规则剪除方法,通过设置最小支持度和最小可信度对肝癌资料进行关联规则分析。结果设置最小支持度和最小可信度分别为0·10和0·60,样本例数1457例,所得结果根据列联系数C>0·45获得51条规则,作用度lift>2·4得到19条规则;考虑规则后件为肝癌是否复发得到19条规则。这些规则揭示了影响肝癌复发的变量值及变量值的组合,并且反映了数据中高度相关的变量值间的关系。结论在肝癌病人资料中应用关联规则分析可以揭示多因素间潜在的、有价值的关系。

关键词：肝癌关联规则可信度数据挖掘

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刺鼠信号蛋白对自体移植皮片中黑素细胞功能的影响

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第二军医大学学报 2006年第9期27卷 969-972页

作者：薛春雨邢新李蠡张敬德蒋平龚志锦第二军医大学长海医院整形外科上海200433 第二军医大学基础医学部生物化学与分子生物学教研室上海200433 长海医院病理科

目的:通过检测刺鼠信号蛋白对自体移植皮片中黑素细胞功能的影响,进一步认识自体移植皮片过度色素沉着的原因。方法:建立过度色素沉着的自体移植皮片动物模型,皮片下分别注射刺鼠信号蛋白和生理盐水(对照组)。利用RT-PCR方法检测刺鼠信... 详细信息

目的:通过检测刺鼠信号蛋白对自体移植皮片中黑素细胞功能的影响,进一步认识自体移植皮片过度色素沉着的原因。方法:建立过度色素沉着的自体移植皮片动物模型,皮片下分别注射刺鼠信号蛋白和生理盐水(对照组)。利用RT-PCR方法检测刺鼠信号蛋白作用后自体移植皮片(n=12)黑素细胞中酪氨酸酶mRNA的表达,银染-丽春红染色后检测皮片中黑色素的含量,并与对照组(n=13)及正常豚鼠皮肤(n=5)相比较。结果:经刺鼠信号蛋白作用后,皮片中酪氨酸酶mRNA表达和黑素含量均明显减少,与对照组皮片和正常豚鼠皮肤相比其差异具有显著性意义(P<0.01)。结论:刺鼠信号蛋白在自体移植皮片中,能竞争性拮抗α-黑素细胞刺激素的黑素合成作用,使皮片着色能力降低。进一步证明了皮片移植后表皮细胞中α-黑素细胞刺激素的表达上调是皮片呈过度色素沉着的重要原因。

关键词：刺鼠信号蛋白 α-黑素细胞刺激素酪氨酸酶皮肤移植色素沉着过多

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伴有高血压的糖尿病大鼠大血管病变SMC增殖早期基因表达谱的研究

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第二军医大学学报 2006年第1期27卷 36-40页

作者：叶勇张传森吴骋李西林吴淑梅张喜第二军医大学基础医学部人体解剖学教研室上海200433 卫生勤务学系卫生统计学教研室上海200433 解放军第85医院心内科上海200052 第二军医大学长海医院实验诊断科上海200433

目的:建立糖尿病大血管病变平滑肌细胞(SMC)增殖早期基因表达谱。方法:以自发性高血压大鼠(SHR)为对照,以STZ诱导SHR构建伴有高血压的糖尿病大鼠模型为实验组,分别在1周、2周、4周时抽提胸主动脉中膜的总RNA,获得两组cDNA的探针,与含有4... 详细信息

目的:建立糖尿病大血管病变平滑肌细胞(SMC)增殖早期基因表达谱。方法:以自发性高血压大鼠(SHR)为对照,以STZ诱导SHR构建伴有高血压的糖尿病大鼠模型为实验组,分别在1周、2周、4周时抽提胸主动脉中膜的总RNA,获得两组cDNA的探针,与含有4 096条大鼠全长基因的cDNA表达谱芯片杂交,扫描芯片荧光信号图像,对差异表达基因数据进行生物信息学分析。结果:1周时有差异表达的基因321条,160条基因表达下降(ratio<0.5),161条基因表达上升(ratio>2)。2周、4周时上述数据分别为414、238、176和403、202、201。分级聚类分析归为8类,3期全部高表达已知基因13条,其中4条持续升高的基因(CD74、Irf1、GAP43、CD36)都与细胞增殖有关。CYP2E1基因的表达大幅上调(ratio 1 w=34.54;ratio2 w=24.82;ratio 4 w=33.57)。结论:糖尿病大血管病变SMC增殖是多基因综合改变的结果,细胞增殖相关基因高表达是主要病理基础,CYP2E1基因可能是糖尿病大血管病变SMC增殖较重要或关键的基因。

关键词：糖尿病高血压肌细胞平滑肌基因表达谱

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