目的通过分析tsRNA在肺腺癌中的差异表达情况及其表达水平与患者预后的关系,进一步筛选并验证肺腺癌相关tsRNA,以了解其在肺腺癌发生和进展中的相关机制。方法基于计算医学中心数据库筛选出在肺腺癌组织和正常组织中差异表达的tsRNA;基于癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库分析tsRNA表达水平对肺腺癌患者预后的影响;基于TRFtarget2.0和tRFTar数据库预测靶基因;基于DAVID、KOBA KEGG在线网站进行基因本体论(Gene Ontology,GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路分析;基于阿拉巴马大学伯明翰分校癌症数据分析门户(the University of Alabama at Birmingham CANcer data analysis Portal,UALCAN)分析靶基因在肺腺癌组织和正常组织中的表达水平。采用增殖实验、迁移实验、侵袭实验验证tRF-19-69M8LOJX在肺腺癌细胞中的生物学功能。结果与正常组织相比,tRF-19-69M8LOJX在肺腺癌组织中表达上调(log2FC=4.28,FDR<0.05)。高表达水平的tRF-19-69M8LOJX预示着更短的无进展生存期(HR=1.565,95%CI=1.142~2.145,P=0.005);过表达tRF-19-69M8LOJX促进A549细胞的增殖、迁移(P<0.001)和侵袭(P=0.009);COL1A1(P=0.002)和VCAN(P=0.022)在tRF-19-69M8LOJX过表达细胞模型中显著上调。结论tRF-19-69M8LOJX在肺腺癌组织的表达水平上调,与患者不良预后密切相关,可能在肺腺癌的发生发展中起着重要作用。
目的研究慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)并发呼吸衰竭风险预测模型。方法检索从建库至2024年9月中国知网数据库(China national knowledge infrastructure,CNKI)、万方数据知识服务平台、维普数据库、...
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目的研究慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)并发呼吸衰竭风险预测模型。方法检索从建库至2024年9月中国知网数据库(China national knowledge infrastructure,CNKI)、万方数据知识服务平台、维普数据库、中国生物医学数据库、美国国立医学图书馆数据库(PubMed)、Cochrane循证医学数据库(Cochrane Library)、医学文摘数据库(EMbase)及Web of Science数据库收录的COPD并发呼吸衰竭风险预测模型文献。采用Revman5.3软件对纳入模型中共性预测因子进行Meta分析。结果共纳入5篇文献,文献的样本总量为177~25638例,结果事件为44~3844例,潜在预测变量为14~42个,模型间具有共性的前六位预测因子分别为血清白蛋白水平、第1秒用力呼气容积(force expiratory volume in 1 second,FEV1)、每年慢性阻塞性肺疾病急性加重期(acute exacerbation of chronic obstructive pulmonary disease,AECOPD)发生次数、白细胞计数、C反应蛋白、COPD病程。COPD患者29316例,并发呼吸衰竭4084例(13.93%)。包含5个风险预测模型,模型建模时受试者工作特征曲线下面积(area under curve,AUC)为0.645~0.950,4个模型的AUC≥0.8。预测模型研究的偏倚风险评估工具(prediction model risk of bias assessment tool,PROBAST)结果显示,纳入的5篇文献为高偏倚风险,主要原因包括未报告缺失数据的处理、模型效果评价不完整。Meta分析结果显示,白细胞计数(OR=1.97,95%CI:1.33~2.92)是COPD并发呼吸衰竭的预测因子。结论现有的COPD并发呼吸衰竭风险预测模型偏倚风险高,应参照PROBAST规范完善研究设计,开发、更新和验证模型,验证临床实践中的适用性和安全性。
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