检索结果-内蒙古大学图书馆

香猪CD2AP基因第1内含子282 bp插入/缺失结构变异介导的表达调控研究

农业生物技术学报 2025年第2期33卷 330-343页

作者：王丹冉雪琴王维牛熙李升黄世会王嘉福贵州大学生命科学学院/农业生物工程研究院/山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室贵州大学动物科学学院/高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室

结构变异(structural variation, SV)可以通过影响相关基因的稳定性和表达调控来影响基因表型。为探究CD2相关蛋白(CD2-associated protein, CD2AP)基因内含子1中的282 bp结构变异在香猪(Xiang pig)(Sus scrofa)群体中的多态分布以及对C... 详细信息

结构变异(structural variation, SV)可以通过影响相关基因的稳定性和表达调控来影响基因表型。为探究CD2相关蛋白(CD2-associated protein, CD2AP)基因内含子1中的282 bp结构变异在香猪(Xiang pig)(Sus scrofa)群体中的多态分布以及对CD2AP基因表达的影响，本研究以香猪、大白猪(Large White)为研究对象，采用PCR测序方法对该SV位点进行鉴定和基因分型，研究群体分布规律以及CD2AP基因结构变异与疾病的关联；采用生物信息学方法检测CD2AP基因内含子1中SV区间所包含的重复元件和转录因子结合位点；用qPCR和Western blot检测SV对CD2AP基因和蛋白表达的影响；通过构建pEGFP荧光表达载体检验CD2AP基因SV中功能元件短散在核元件(short interspersed nuclear element, SINE)对基因转录活性的影响。结果显示，CD2AP-I1-sv282结构变异片段长度为282 bp，区间存在1个260 bp的SINE元件，属于tRNA家族，位于猪基因组Chr7:42249739～42249998 bp，含有8个转录因子结合位点；在SINE元件序列片段中具有RNA聚合酶Ⅲ启动子和2个AluⅠ限制性内切酶识别位点。PCR扩增和测序分析表明，该SV在香猪和大白猪基因组中均呈现多态性，有II (纯合插入型)、ID (杂合型)和DD (纯合缺失型) 3个基因型，χ2检验表明，该SV在香猪和大白猪群体中处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)，香猪和大白猪群体之间的基因型频率差异极显著(P<0.01),D等位基因频率极显著高于I等位基因频率(P<0.001)。在肺部患病样本中，D基因型为优势等位基因；在肺部健康样本中，I基因型为优势等位基因；Kendall's tau-b相关性分析表明，该结构变异与猪的肺部疾病具有相关性，患病群体与DD基因型显著正相关。qPCR和Western blot检测发现，DD基因型的香猪脾脏中CD2AP基因的mRNA和蛋白的表达量极显著高于ID基因型(P<0.01)。针对SINE元件所在序列构建了pEGFP荧光报告载体，转染细胞后检测其荧光强度及蛋白表达量，结果显示，含SINE序列的表达载体细胞与不含SINE序列相比，荧光强度和EGFP蛋白的表达量均降低。上述结果表明，CD2AP基因内含子1中282 bp结构变异在猪群中存在，且均以缺失型为主，可以导致基因的表达发生上调，结构变异区域存在的SINE元件影响基因转录活性，CD2AP基因的结构变异与香猪易感肺部疾病存在相关性。研究结果对解析香猪疾病易感分子机制具有重要意义。

关键词：香猪 CD2AP基因结构变异(SV) 短散在核元件(SINE)

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省域铁路成网条件下列车开行方案优化

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交通运输系统工程与信息 2025年第2期25卷 282-292页

作者：龚帅宇徐行方鲁玉同济大学道路与交通工程教育部重点实验室上海201804 同济大学上海市轨道交通结构耐久与系统安全重点实验室上海201804 阜阳师范大学商学院安徽阜阳236037 阜阳师范大学区域物流规划与现代物流工程安徽省重点实验室安徽阜阳236037

省域铁路成网条件下列车开行方案涉及线路制式、等级以及列车种类等多因素影响,叠加客流选择的多样性,使优化问题更加复杂化。为刻画网络条件下客流和列车流的耦合,利用深度优先搜索(Depth First Search,DFS)算法构建客流径路备选集;基... 详细信息

省域铁路成网条件下列车开行方案涉及线路制式、等级以及列车种类等多因素影响,叠加客流选择的多样性,使优化问题更加复杂化。为刻画网络条件下客流和列车流的耦合,利用深度优先搜索(Depth First Search,DFS)算法构建客流径路备选集;基于列车开行方案的编制原则建立列车径路备选集,以列车运行成本和旅客出行总时间最小为优化目标,构建双目标非线性优化模型,设计NSGA-II(Non-dominated Sorting Genetic Algorithm-II)算法进行求解;从列车运行、旅客出行和企业运营这3个维度建立多准则评价指标体系,利用熵权-TOPSIS(Technique for Order Preference by Similarity to Ideal Solution)方法比选Pareto前沿面上的典型解,选取相对接近度最高的解作为建议方案。依托Z省铁路网进行大规模实例研究,结果表明:模型求解得到的Pareto前沿面收敛性和分布性较好,具有较强鲁棒性,与多目标粒子群优化算法(Multi-objective Particle Swarm Optimization,MOPSO)相比取得的结果更佳。通过熵权-TOPSIS方法多准则评价比选,得到方案II为该省推荐列车开行方案,省域范围内开行列车660对·d-1,相较优化前,旅客出行时间成本和列车运行成本显著降低,线路利用率过低或过高区段比例大幅减少,运能紧张区段得到有效疏解。

关键词：铁路运输列车开行方案多目标优化多层次铁路网备选集多准则评价

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动物个体等级排名算法

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动物学杂志 2025年第1期60卷 123-135页

作者：刘梦嘉夏灿玮生物多样性与生态工程教育部重点实验室北京师范大学生命科学学院北京100875

等级是指个体的地位具有一定顺序的现象,反映着动物种群的社会结构,在动物的生存、繁殖及种群调节中具有重要意义。动物种群的等级结构包括线性与非线性两种情况。Landau(1951)提出的线性指数h(Landau’s h)可用于量化种群等级结构的线... 详细信息

等级是指个体的地位具有一定顺序的现象,反映着动物种群的社会结构,在动物的生存、繁殖及种群调节中具有重要意义。动物种群的等级结构包括线性与非线性两种情况。Landau(1951)提出的线性指数h(Landau’s h)可用于量化种群等级结构的线性程度,de Vries(1995)又对该指数的计算方式进行了优化。个体间的等级差异影响自然选择和性选择的作用强度。然而在多数动物中,个体等级在表型上的体现并不明显,需要根据观测数据,使用动物个体等级排名算法计算以确定。动物个体等级排名算法包括基于获胜概率排名的算法,基于获胜频率和对手实力的Clutton-Brock et al.’s index、David’s score算法、基于获胜次数的I&SI、Elo-rating、Randomized Elo-rating算法和基于图论的ADAGIO算法。本文介绍了这些算法的计算过程,对各自的优缺点进行了点评,并基于实际数据比较了不同算法给出的排名结果,最后对实际应用中算法的选择给出了建议。此外,本文还简要介绍了其他领域中排名算法的特点,以期为算法的引入提供借鉴。

关键词：等级结构争斗动物行为排名算法

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茶叶不同添加方式对太平猴魁绿茶啤酒风味影响

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食品与发酵工业 2025年第1期51卷 81-89页

作者：林睿吴殿辉彭政聪谢广发陆健工业生物技术教育部重点实验室粮食发酵与食品生物制造国家工程研究中心江苏省生物活性制品加工工程技术研究中心江南大学生物工程学院江苏无锡214122 浙江省污染暴露与健康干预重点实验室浙江树人学院生物与环境工程学院浙江杭州310015

绿茶作为辅料增添啤酒风味已被众多研究者们广泛关注,但绿茶的添加方式对啤酒风味的影响鲜有研究。该文将太平猴魁以3种不同投料方式加入到啤酒的发酵中,来研究清香型绿茶投料方式对啤酒挥发性风味物质的影响。采用GC-MS对不同组啤酒的... 详细信息

绿茶作为辅料增添啤酒风味已被众多研究者们广泛关注,但绿茶的添加方式对啤酒风味的影响鲜有研究。该文将太平猴魁以3种不同投料方式加入到啤酒的发酵中,来研究清香型绿茶投料方式对啤酒挥发性风味物质的影响。采用GC-MS对不同组啤酒的风味物进行鉴定分析,通过对多种风味物质的香味活性值(odor activity values,OAV)筛选以及偏最小二乘-判别分析(partial least squares-discriminant analysis,PLS-DA),研究不同工艺下绿茶啤酒的香气组分差异和关键香气组分标记物。结果表明,不同工艺下太平猴魁绿茶啤酒的挥发性成分差异显著(P<0.05)。在太平猴魁绿茶啤酒中,以OAV≥0.1筛选出了20种香气成分,其中β-紫罗兰酮、异戊醛、β-环柠檬醛、蘑菇醇和香茅醇这5种挥发性成分来源于太平猴魁,并且在冷萃的条件下能更多保留这类风味成分,使得啤酒具有更加丰富的风味属性。根据PLS-DA模型进一步筛选得到了9种变量投影重要性值大于1的物质,其中月桂酸乙酯、乙酸苯乙酯、月桂醇、正癸醛和壬醛这类香气化合物对啤酒的清香和花香风味属性具有重要贡献,可作为区分不同工艺下太平猴魁绿茶啤酒的香气组分标记物。

关键词：绿茶啤酒太平猴魁气相色谱-质谱联用挥发性成分偏最小二乘-判别分析

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两株芽孢杆菌脂肽粗提物对马铃薯致病疫霉抑菌效果的研究

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食品与发酵工业 2025年第3期51卷 97-103页

作者：黄满李焕梅胡靖陈智勇危俊杰龙同宋满赵锦芳湖北工业大学生命科学与健康工程学院发酵工程教育部重点实验室湖北武汉430068 湖北省生物农药工程技术研究中心湖北武汉430064

为了探究多粘类芽孢杆菌Paenibacillus polymyxa HL11和卡氏芽孢杆菌Bacillus cabrialesii ST-1的脂肽粗提物对马铃薯致病疫霉的抑菌效果,该研究通过酸沉淀法提取多粘类芽孢杆菌HL11和卡氏芽孢杆菌ST-1的脂肽粗提物,利用牛津杯法测定两... 详细信息

为了探究多粘类芽孢杆菌Paenibacillus polymyxa HL11和卡氏芽孢杆菌Bacillus cabrialesii ST-1的脂肽粗提物对马铃薯致病疫霉的抑菌效果,该研究通过酸沉淀法提取多粘类芽孢杆菌HL11和卡氏芽孢杆菌ST-1的脂肽粗提物,利用牛津杯法测定两株芽孢杆菌的脂肽粗提物对致病疫霉菌Phytophthora infesfans的抑菌效果。结果表明,当脂肽粗提物处理质量浓度为10 mg/mL时,HL11和ST-1对致病疫霉的抑制率分别为(74.79±0.52)%和(79.5±0.54)%,通过软件拟合得出两株芽孢杆菌半最大效应浓度分别为0.56 mg/mL和0.021 mg/mL。进一步利用扫描电镜观察到经脂肽粗提物处理后,致病疫霉菌丝表面出现凹陷变形或突起等现象。使用荧光显微镜观察发现,经脂肽粗提物处理后,致病疫霉菌丝结构完整性受到一定程度的破坏,细胞内的染色质出现凝聚及活性氧激增现象。经基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱分析和数据比对,脂肽类物质主要有伊枯草菌素A、表面活性素和丰原素。该研究中两株芽孢杆菌脂肽粗提物对马铃薯致病疫霉有明显的抑制作用,具有进一步研究开发潜力。

关键词：多粘类芽孢杆菌HL11 卡氏芽孢杆菌ST-1 脂肽粗提物致病疫霉抑菌率

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高速铁路隧道内双车交会瞬变压力及压力梯度特征

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中南大学学报(自然科学版) 2025年第1期56卷 384-396页

作者：赵鹏房倩马伟斌王军杜建明北京交通大学隧道及地下工程教育部工程研究中心北京100044 中国铁道科学研究院集团有限公司铁道建筑研究所北京100081 高速铁路轨道系统全国重点实验室北京100081

为加深对高速铁路隧道壁面瞬变压力及压力梯度特征的理解,基于RNG k-e两方程湍流模型与滑移网格技术,数值模拟缩尺1?1的8节编组高速列车隧道内双车交会诱发的气动特性。采用现场实测数据验证数值方法的准确性,探究隧道壁面瞬变压力的时... 详细信息

为加深对高速铁路隧道壁面瞬变压力及压力梯度特征的理解,基于RNG k-e两方程湍流模型与滑移网格技术,数值模拟缩尺1?1的8节编组高速列车隧道内双车交会诱发的气动特性。采用现场实测数据验证数值方法的准确性,探究隧道壁面瞬变压力的时空特征,讨论双车等速及不等速交会、车隧阻塞比对隧道纵轴中截面瞬变压力及压力梯度的影响,对比双车等速交会与单车同速过隧道的差异。研究结果表明:隧道纵断面不同测点之间的距离越近,瞬变压力时程曲线差异越小,反之则越大;瞬变压力最大峰值(正峰值、负峰值与峰峰值)始终出现在隧道纵轴中截面附近;瞬变压力及压力梯度峰值随双车等速车速及车隧阻塞比增大而增加,压力梯度最大的正/负峰值与车速4次方呈线性关系,与车隧阻塞比幂次方(2.56~2.58)呈线性关系;双车等速交会时,瞬变压力最大的正、负峰值分别为单车经过的1.97倍与2.15倍,压力梯度最大的正、负峰值分别为单车经过的1.84倍与2.02倍。

关键词：高速铁路隧道双车交会瞬变压力压力梯度数值模拟

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异丙醇介质中ZSM-5分子筛催化果糖脱水制备5-HMF的工艺研究

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高校化学工程学报 2025年

作者：任傲天徐玲秦雯琪聂仁峰吕秀阳浙江大学生物质化工教育部重点实验室浙江大学化学工程与生物工程学院浙江科技大学生物与化学工程学院生物基运输燃料技术全国重点实验室郑州大学化工学院

5-羟甲基糠醛（5-HMF）是生物质基平台化合物之一。针对均相催化制备5-HMF中存在的催化剂分离困难、物耗大、污染严重等问题，本文开展了绿色溶剂异丙醇中固体酸催化果糖制备5-HMF的研究，在固体酸催化剂筛选的基础上，研究了工艺、动... 详细信息

5-羟甲基糠醛（5-HMF）是生物质基平台化合物之一。针对均相催化制备5-HMF中存在的催化剂分离困难、物耗大、污染严重等问题，本文开展了绿色溶剂异丙醇中固体酸催化果糖制备5-HMF的研究，在固体酸催化剂筛选的基础上，研究了工艺、动力学和催化剂回用。结果表明硅铝比为25的纳米级ZSM-5分子筛是异丙醇介质中果糖脱水制备5-HMF的较佳催化剂；通过优化得到较佳的工艺条件：果糖 0.04 g，ZSM-5 0.02 g，异丙醇4 mL，搅拌速率500 r·min-1，在150 ℃条件下反应4 h，5-HMF的收率达到59.1%；基于动力学研究得到异丙醇介质中果糖脱水制备5-HMF反应表观活化能为61.74 kJ·mol-1；催化剂重复使用实验表明反应的转化率有所下降，但反应的选择性基本不变；结合BET、XRD和NH3-TPD等表征，表明使用前后ZSM-5催化剂的晶体结构未发生变化，微孔和酸量有所下降，可能是由于反应生成的腐殖质覆盖了催化剂表面的部分酸性位点或孔道出现部分堵塞。研究工作将为5-HMF的绿色、高效制备提供新思路。

关键词：果糖 5-HMF 异丙醇 ZSM-5分子筛脱水

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高速铁路道岔曲尖轨疲劳裂纹萌生预测

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同济大学学报(自然科学版) 2025年第4期53卷 619-627页

作者：翁之意周宇王驰单涛涛同济大学道路与交通工程教育部重点实验室上海201804 同济大学上海市轨道交通结构耐久与系统安全重点实验室上海201804 上海申通地铁集团有限公司技术中心上海201103

针对高速铁路道岔曲尖轨疲劳裂纹与磨耗共存发展的情况,提出考虑磨耗的高速铁路道岔曲尖轨裂纹萌生预测方法。以列车侧向-逆向过岔时的轮载转移、轮轨接触状态为例,结合曲尖轨和基本轨的廓形关系,再现曲尖轨磨耗和疲劳累积过程,并分析... 详细信息

针对高速铁路道岔曲尖轨疲劳裂纹与磨耗共存发展的情况,提出考虑磨耗的高速铁路道岔曲尖轨裂纹萌生预测方法。以列车侧向-逆向过岔时的轮载转移、轮轨接触状态为例,结合曲尖轨和基本轨的廓形关系,再现曲尖轨磨耗和疲劳累积过程,并分析曲尖轨磨耗和疲劳损伤发展特征、轮载转移和轮轨接触变化,从而预测曲尖轨裂纹萌生寿命和位置。结果表明,考虑列车逆、侧向通过的情况,在曲尖轨裂纹萌生过程中,各磨耗阶段内达到磨耗阈值所需的通过总重呈波动变化,即磨耗发展不规则,且基本轨和曲尖轨的磨耗发展率呈相反趋势;曲尖轨顶宽35 mm断面处疲劳裂纹萌生寿命约11.7 MGT(百万吨),裂纹萌生位置在轨顶区域内距轨顶中心10~15 mm、钢轨表面1~3 mm处。

关键词：高速铁路道岔曲尖轨轮载转移滚动接触疲劳

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既有线改建市域铁路客流量低迷原因及对策

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城市轨道交通研究 2025年第1期28卷 228-232页

作者：徐行方王皓月黄洁洪世奇同济大学道路与交通工程教育部重点实验室上海201804 上海市轨道交通结构耐久与系统安全重点实验室上海201804 香港大学工业与制造系统工程系中国香港999077

[目的]针对目前由既有线改建而成的市域铁路普遍存在的客流量低迷问题,有必要系统分析其原因并提出相应对策,以提升运营效益,便利市郊旅客出行。[方法]通过对长江三角洲地区3条既有线改建的市域铁路进行调研,特别是对上海金山铁路全年... 详细信息

[目的]针对目前由既有线改建而成的市域铁路普遍存在的客流量低迷问题,有必要系统分析其原因并提出相应对策,以提升运营效益,便利市郊旅客出行。[方法]通过对长江三角洲地区3条既有线改建的市域铁路进行调研,特别是对上海金山铁路全年客流量进行多维度分析,从时间和空间两个维度总结客流分布特点。基于定量分析,归纳市域铁路客流构成及时空波动特征;结合线路工作人员长期观察,定性分析客流需求及市域铁路对沿线居民的影响。综合定量与定性分析结果,针对3条市域铁路的具体客流现状,重点分析影响市域铁路客流量的因素,并提出提高市域铁路客流量的措施。[结果及结论]我国市域铁路客流量低迷的主要原因包括:市域客流自身特征因素,线路条件的局限性,列车开行方案的局限性,出行便捷性不足,以及市场竞争力不强等。提高市域铁路客流量的措施包括:完善线网规划与建设,提升线路通过能力,优化列车开行方案,完善线路间的衔接换乘,坚持公益性票价政策,推进公交引导发展综合改造等。

关键词：市域铁路改建线路客流量低迷

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多网融合背景下轨道交通互联互通内涵与模式分析

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城市轨道交通研究 2025年第05期 12-18页

作者：刘裕行柏成张炜晗朱炜滕靖上海市轨道交通结构耐久与系统安全重点实验室同济大学道路与交通工程教育部重点实验室古斯塔夫埃菲尔大学综合交通运输理论交通运输行业重点实验室(东莞同济大学研究院)

[目的]目前，我国的区域轨道交通系统已进入多网融合发展的新阶段，其运营管理工作也呈现出多层次、多维度的协同管理与优化新特征。因此，厘清区域内不同层次轨道交通间的互联互通模式，是运营管理各项工作的前提与基础。[方法]通过对... 详细信息

[目的]目前，我国的区域轨道交通系统已进入多网融合发展的新阶段，其运营管理工作也呈现出多层次、多维度的协同管理与优化新特征。因此，厘清区域内不同层次轨道交通间的互联互通模式，是运营管理各项工作的前提与基础。[方法]通过对国内外典型区域轨道交通系统发展现状的调研、分析与总结，界定了多网融合背景下区域多层次轨道交通之间互联互通的内涵，从物理网络衔接、设施设备兼容、运输组织协调和运营管理协同等角度梳理了互联互通的模式及特征，并结合现实情况与发展趋势对各类互联互通模式的适用性进行了探讨。[结果及结论]在衔接换乘模式的基础上，对衔接形式和开行方案进行改进和协同优化，是在现有规划建设基础和发展趋势下，最适合我国各大都市圈轨道交通系统的互联互通模式方案。

关键词：区域轨道交通多网融合互联互通模式

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